PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=673-9O-81C)

Interfaces in PDB 4z7q crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.70 Å

INTEGRIN ALPHAIIBBETA3 IN COMPLEX WITH AGDV-NH2 PEPTIDE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`214`	`61`	`11755`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`217`	`55`	`11866`	`1998.3`	`-33.4`	`0.015`	`3`	`0`	`1`	`1.000`
	`2`		L	`211`	`60`	`11614`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`206`	`56`	`11955`	`1967.1`	`-32.2`	`0.022`	`6`	`0`	`1`	`1.000`
	*Average:*													`1982.7`	`-32.8`	`0.018`	`5`	`0`	`1`	`1.000`
2	`3`		D	`157`	`50`	`22565`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`194`	`50`	`18936`	`1744.4`	`-16.1`	`0.091`	`9`	`4`	`0`	`0.559`
	`4`		B	`159`	`51`	`22244`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`184`	`52`	`18988`	`1713.2`	`-16.3`	`0.096`	`10`	`4`	`0`	`0.559`
	*Average:*													`1728.8`	`-16.2`	`0.093`	`10`	`4`	`0`	`0.559`
3	`5`		A	`88`	`27`	`18988`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`99`	`29`	`18936`	`942.6`	`-5.6`	`0.314`	`3`	`0`	`0`	`0.069`
4	`6`		A	`86`	`30`	`18988`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`75`	`27`	`22565`	`675.6`	`-2.2`	`0.542`	`0`	`1`	`0`	`0.025`
	`7`		B	`67`	`22`	`22244`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`74`	`25`	`18936`	`605.9`	`-0.3`	`0.665`	`1`	`1`	`0`	`0.025`
	*Average:*													`640.7`	`-1.2`	`0.604`	`1`	`1`	`0`	`0.025`
5	`8`		E	`67`	`17`	`11866`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`69`	`23`	`18936`	`583.4`	`-3.6`	`0.507`	`6`	`5`	`0`	`0.069`
	`9`		H	`66`	`15`	`11955`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`66`	`21`	`18988`	`576.1`	`-3.7`	`0.500`	`6`	`4`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`579.7`	`-3.6`	`0.504`	`6`	`5`	`0`	`0.069`
6	`10`		L	`44`	`12`	`11614`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`38`	`11`	`18988`	`350.0`	`0.3`	`0.723`	`5`	`0`	`0`	`0.019`
	`11`		F	`42`	`12`	`11755`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`39`	`11`	`18936`	`347.6`	`0.1`	`0.695`	`4`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`348.8`	`0.2`	`0.709`	`5`	`0`	`0`	`0.019`
7	`12`		A	`30`	`10`	`18988`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`34`	`10`	`22244`	`317.3`	`1.4`	`0.768`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		L	`29`	`10`	`11614`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`26`	`7`	`18936`	`237.7`	`-0.9`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		D	`22`	`9`	`22565`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`18988`	`224.8`	`-0.8`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		G	`17`	`4`	`522`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`22244`	`172.4`	`-1.2`	`0.534`	`5`	`0`	`0`	`0.041`
	`16`		I	`17`	`4`	`516`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`22565`	`158.9`	`-1.1`	`0.526`	`2`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`165.7`	`-1.2`	`0.530`	`4`	`0`	`0`	`0.041`
11	`17`		D	`14`	`5`	`22565`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`21`	`7`	`11755`	`166.5`	`2.3`	`0.838`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		L	`19`	`7`	`11614`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`20`	`5`	`22565`	`161.4`	`-1.7`	`0.396`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
	`19`		B	`18`	`5`	`22244`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`16`	`6`	`11755`	`127.3`	`-0.5`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`144.3`	`-1.1`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
13	`20`		[NAG]B:2010	`12`	`1`	`365`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`22244`	`156.7`	`4.4`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]D:507	`13`	`1`	`359`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`22565`	`155.6`	`4.8`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`156.1`	`4.6`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		E	`18`	`5`	`11866`	`◊`	E	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`18`	`5`	`11866`	`155.4`	`-1.8`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		D	`16`	`5`	`22565`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`22244`	`133.5`	`-1.4`	`0.365`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
16	`24`		[NAG]D:503	`9`	`1`	`358`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`22565`	`115.1`	`3.8`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]B:2004	`8`	`1`	`358`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`22244`	`112.5`	`3.7`	`0.541`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`113.8`	`3.7`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[SO4]A:507	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`18988`	`103.6`	`-14.4`	`0.843`	`1`	`0`	`0`	`0.388`
18	`27`		[SO4]A:505	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18988`	`103.5`	`-15.5`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.418`
19	`28`		H	`11`	`6`	`11955`	`◊`	D	-x,-y+1,z	`2_565`	`11`	`3`	`22565`	`102.7`	`1.8`	`0.887`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[NAG]B:2005	`10`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`22244`	`102.3`	`2.4`	`0.342`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		[NAG]D:504	`10`	`1`	`356`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`22565`	`102.0`	`2.5`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		A	`14`	`4`	`18988`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`14`	`5`	`11755`	`100.6`	`0.1`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[SO4]C:507	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`18936`	`99.3`	`-13.5`	`0.826`	`1`	`0`	`0`	`0.271`
24	`33`		[SO4]C:506	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`18936`	`98.8`	`-13.8`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.269`
25	`34`		[GOL]A:508	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`18988`	`90.0`	`0.7`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`35`		[SO4]C:508	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`18936`	`82.0`	`-10.4`	`0.889`	`0`	`0`	`0`	`0.201`
27	`36`		[SO4]A:506	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`18988`	`78.2`	`-11.1`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.292`
28	`37`		[SO4]L:301	`5`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11614`	`76.5`	`-11.2`	`0.577`	`1`	`0`	`0`	`0.231`
29	`38`		G	`7`	`3`	`522`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`18988`	`74.7`	`-0.5`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`39`		I	`7`	`3`	`516`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`18936`	`73.9`	`-0.6`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`74.3`	`-0.6`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
30	`40`		[NAG]D:508	`9`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]D:507	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`359`	`73.7`	`1.5`	`0.061`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		[NAG]B:2011	`9`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]B:2010	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`365`	`72.3`	`1.3`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[NAG]B:2006	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]B:2005	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`72.0`	`1.6`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		[NAG]D:504	`6`	`1`	`356`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`18936`	`71.1`	`0.6`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[NAG]B:2005	`6`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18988`	`70.0`	`0.4`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.6`	`0.5`	`0.195`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`45`		[NAG]D:505	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]D:504	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`356`	`68.7`	`1.5`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`46`		[MN]B:2002	`1`	`1`	`123`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`22244`	`67.6`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	`47`		[MN]B:2001	`1`	`1`	`123`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`22244`	`49.8`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	`48`		[MN]D:509	`1`	`1`	`123`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`22565`	`47.1`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	*Average:*													`54.8`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
36	`49`		[MN]D:501	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`22565`	`65.2`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
37	`50`		[MAN]B:2008	`7`	`1`	`293`	`cf`	[BMA]B:2007	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`293`	`63.3`	`2.8`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`51`		[MAN]C:505	`7`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]D:506	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`293`	`61.0`	`2.8`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`52`		[BMA]B:2007	`6`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]B:2006	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`362`	`60.6`	`1.2`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`53`		[BMA]D:506	`7`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`59.5`	`1.1`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`54`		[CL]C:509	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`18936`	`54.9`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
42	`55`		H	`8`	`5`	`11955`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`22565`	`53.6`	`0.8`	`0.783`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`56`		[NH2]I:412	`1`	`1`	`117`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`516`	`53.0`	`0.5`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NH2]G:412	`1`	`1`	`117`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`522`	`52.7`	`0.5`	`0.704`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`52.8`	`0.5`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`58`		[MAN]B:2009	`4`	`1`	`291`	`cf`	[BMA]B:2007	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`293`	`51.3`	`2.5`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`59`		[MAN]B:2009	`7`	`1`	`291`	`f`	[NAG]B:2006	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`48.6`	`1.5`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`60`		[MAN]C:505	`3`	`1`	`292`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`18936`	`46.9`	`1.2`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`61`		H	`5`	`4`	`11955`	`◊`	H	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`4`	`11955`	`45.5`	`1.6`	`0.938`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`62`		[MAN]B:2008	`3`	`1`	`293`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`18988`	`42.0`	`1.0`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`63`		[MN]D:509	`1`	`1`	`123`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`516`	`37.5`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	`64`		[MN]B:2001	`1`	`1`	`123`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`522`	`31.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	*Average:*													`34.4`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
50	`65`		[SO4]A:506	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`18936`	`31.3`	`-3.8`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
51	`66`		[NAG]D:508	`2`	`1`	`358`	`f`	[NAG]D:503	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`358`	`30.9`	`1.1`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`67`		[NAG]D:505	`2`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`18936`	`29.2`	`1.7`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`68`		[SO4]C:506	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`22565`	`26.9`	`-3.5`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
54	`69`		[NH2]I:412	`1`	`1`	`117`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`22565`	`26.1`	`0.1`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[NH2]G:412	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`22244`	`24.6`	`0.0`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.3`	`0.1`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`71`		[MAN]C:505	`5`	`1`	`292`	`f`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`360`	`26.1`	`0.7`	`0.158`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`72`		A	`5`	`2`	`18988`	`◊`	[SO4]C:507	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`185`	`25.2`	`-3.4`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
57	`73`		[SO4]A:505	`4`	`1`	`184`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11955`	`24.3`	`-3.1`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
58	`74`		[MAN]B:2008	`4`	`1`	`293`	`f`	[NAG]B:2006	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`362`	`23.3`	`0.6`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`75`		[NAG]B:2006	`2`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`18988`	`22.9`	`1.4`	`0.770`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`76`		C	`3`	`3`	`18936`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+2	`3_547`	`6`	`2`	`22244`	`17.0`	`0.5`	`0.770`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`77`		[NAG]D:507	`2`	`1`	`359`	`f`	[NAG]D:503	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`358`	`13.6`	`0.3`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`78`		D	`4`	`3`	`22565`	`◊`	D	-x,-y+1,z	`2_565`	`4`	`3`	`22565`	`13.5`	`-0.1`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`79`		L	`3`	`2`	`11614`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`3`	`2`	`11755`	`9.5`	`-0.2`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`80`		[MN]B:2002	`1`	`1`	`123`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`522`	`8.3`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
65	`81`		[NAG]B:2011	`2`	`1`	`361`	`f`	[NAG]B:2004	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`358`	`7.0`	`0.3`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`82`		[MN]B:2003	`1`	`1`	`123`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`522`	`6.8`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`83`		[MN]D:502	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`516`	`6.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`6.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
67	`84`		G	`2`	`2`	`522`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`22565`	`6.5`	`-0.0`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`85`		[NH2]G:412	`1`	`1`	`117`	`f`	[MN]B:2002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`5.4`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
69	`86`		[NH2]G:412	`1`	`1`	`117`	`f`	[MN]B:2001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`4.4`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
70	`87`		[MN]D:509	`1`	`1`	`123`	`f`	[MN]D:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`3.3`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
71	`88`		A	`1`	`1`	`18988`	`◊`	[CL]C:509	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`125`	`2.8`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
72	`89`		[MN]B:2003	`1`	`1`	`123`	`f`	[MN]B:2001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`2.1`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
73	`90`		[NAG]D:508	`1`	`1`	`358`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`22565`	`1.2`	`0.1`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`91`		[NAG]B:2010	`1`	`1`	`365`	`f`	[NAG]B:2004	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`358`	`1.1`	`0.0`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`92`		[NH2]I:412	`1`	`1`	`117`	`f`	[MN]D:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`0.9`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
76	`93`		L	`1`	`1`	`11614`	`◊`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`1`	`1`	`22244`	`0.3`	`0.0`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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