PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=427-0B-1EB)

Interfaces in PDB 4tzw crystal.
Space symmetry group: P 43 21 2. Resolution: 4.67 Å

CO-CRYSTALS OF THE TERNARY COMPLEX CONTAINING A T-BOX STEM I RNA, ITS COGNATE TRNAGLY, AND B. SUBTILIS YBXF PROTEIN, TREATED BY REMOVING LITHIUM SULFATE AND REPLACING MG2+ WITH SR2+ POST CRYSTALLIZATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`88`	`17`	`17559`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`79`	`13`	`12414`	`571.6`	`-0.6`	`0.996`	`12`	`0`	`0`	`0.006`
2	`2`		C	`58`	`8`	`17559`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`38`	`15`	`4273`	`438.9`	`-12.5`	`0.428`	`5`	`0`	`0`	`0.024`
3	`3`		C	`40`	`9`	`17559`	`x`	C	y,x-1,-z	`6_545`	`42`	`5`	`17559`	`313.7`	`-3.7`	`0.923`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		C	`34`	`7`	`17559`	`◊`	B	y,x,-z	`6_555`	`24`	`5`	`12414`	`267.5`	`-2.1`	`0.889`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
5	`5`		B	`34`	`11`	`12414`	`◊`	B	y,x,-z	`6_555`	`34`	`11`	`12414`	`220.7`	`-9.5`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
6	`6`		[SR]C:205	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`17559`	`132.4`	`-34.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
7	`7`		[SR]C:207	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`17559`	`126.5`	`-28.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
8	`8`		[SR]B:110	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`12414`	`125.3`	`-31.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.078`
9	`9`		[SR]B:102	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`12414`	`118.7`	`-29.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
10	`10`		[SR]C:212	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`17559`	`117.3`	`-29.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
11	`11`		[SR]C:220	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`17559`	`114.5`	`-33.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
12	`12`		[SR]C:218	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`17559`	`114.2`	`-27.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
13	`13`		[SR]B:115	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`12414`	`112.9`	`-30.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
14	`14`		[SR]C:213	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`17559`	`112.6`	`-27.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
15	`15`		[SR]C:210	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`17559`	`110.8`	`-28.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
16	`16`		[SR]C:203	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`17559`	`108.6`	`-28.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
	`17`		[SR]C:214	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`17559`	`100.8`	`-26.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
	*Average:*													`104.7`	`-27.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
17	`18`		C	`21`	`9`	`17559`	`◊`	[SR]C:221	y,x-1,-z	`6_545`	`1`	`1`	`206`	`108.0`	`-24.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`22`	`9`	`17559`	`◊`	[SR]C:202	y,x-1,-z	`6_545`	`1`	`1`	`206`	`104.5`	`-24.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`106.2`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		[SR]B:111	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`12414`	`107.0`	`-30.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
19	`21`		[SR]C:204	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`17559`	`106.3`	`-29.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
20	`22`		[SR]C:201	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`17559`	`105.5`	`-29.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
21	`23`		[SR]C:209	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`17559`	`105.3`	`-28.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
22	`24`		C	`21`	`3`	`17559`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`19`	`2`	`12414`	`101.3`	`2.4`	`0.961`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[SR]B:109	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`12414`	`100.4`	`-24.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
24	`26`		[SR]B:112	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`12414`	`99.0`	`-24.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
	`27`		[SR]B:104	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`12414`	`88.6`	`-22.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
	*Average:*													`93.8`	`-23.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
25	`28`		[SR]C:206	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`17559`	`92.8`	`-25.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
26	`29`		[SR]B:103	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`12414`	`92.6`	`-23.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
27	`30`		[SR]B:108	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`12414`	`91.6`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
28	`31`		[SR]B:105	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`12414`	`89.4`	`-22.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
29	`32`		[SR]C:208	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`17559`	`88.3`	`-23.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
30	`33`		[SR]B:106	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12414`	`86.6`	`-22.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
31	`34`		[SR]C:217	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`17559`	`84.3`	`-19.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
32	`35`		[SR]C:211	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`17559`	`84.0`	`-21.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
33	`36`		[SR]B:107	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`12414`	`78.9`	`-19.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
34	`37`		[SR]C:219	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`17559`	`78.4`	`-20.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
35	`38`		[SR]C:215	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17559`	`71.7`	`-17.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
36	`39`		[SR]B:112	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]B:104	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`69.2`	`-27.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
37	`40`		[SR]C:214	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]C:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`61.4`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
38	`41`		[SR]B:101	`1`	`1`	`206`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`12414`	`59.2`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
39	`42`		[SR]C:216	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`17559`	`53.7`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
40	`43`		[SR]B:113	`1`	`1`	`206`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`12414`	`53.3`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
41	`44`		[SR]B:114	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17559`	`51.0`	`-10.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
42	`45`		[SR]B:111	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]B:105	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`49.6`	`-19.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
43	`46`		[SR]C:221	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]C:202	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`48.9`	`-19.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
44	`47`		C	`8`	`3`	`17559`	`◊`	[SR]C:215	-y-1/2,x-1/2,z-1/4	`2_444`	`1`	`1`	`206`	`46.8`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		[SR]B:114	`1`	`1`	`206`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`12414`	`46.3`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
46	`49`		[SR]C:221	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`17559`	`44.9`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	`50`		[SR]C:202	`1`	`1`	`206`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17559`	`39.7`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`42.3`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
47	`51`		C	`6`	`3`	`17559`	`◊`	B	y,x-1,-z	`6_545`	`7`	`3`	`12414`	`43.8`	`-0.4`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`52`		[SR]B:113	`1`	`1`	`206`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17559`	`43.7`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
49	`53`		[SR]B:108	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]B:104	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`41.5`	`-16.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
50	`54`		[SR]C:206	`1`	`1`	`206`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4273`	`40.9`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
51	`55`		C	`5`	`2`	`17559`	`◊`	A	-y+1/2,x-1/2,z-1/4	`2_544`	`2`	`1`	`4273`	`39.8`	`-1.0`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`56`		A	`4`	`2`	`4273`	`◊`	A	-y,-x,-z+1/2	`8_555`	`4`	`2`	`4273`	`37.7`	`0.2`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`57`		[SR]C:212	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`30.1`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
54	`58`		[SR]C:212	`1`	`1`	`206`	`◊`	[SR]C:202	y,x-1,-z	`6_545`	`1`	`1`	`206`	`17.3`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`59`		[SR]B:112	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]B:108	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`16.7`	`-6.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
56	`60`		B	`4`	`1`	`12414`	`◊`	A	-y+1/2,x-1/2,z-1/4	`2_544`	`1`	`1`	`4273`	`15.8`	`-0.6`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`61`		[SR]C:213	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]C:205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`13.0`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
58	`62`		C	`3`	`1`	`17559`	`◊`	[SR]B:107	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`206`	`11.0`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`63`		C	`4`	`1`	`17559`	`x`	C	-y-1/2,x-1/2,z-1/4	`2_444`	`2`	`1`	`17559`	`8.7`	`-0.2`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`64`		[SR]C:212	`1`	`1`	`206`	`◊`	[SR]C:221	y,x-1,-z	`6_545`	`1`	`1`	`206`	`8.2`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`65`		[SR]C:219	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`5.1`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
62	`66`		[SR]C:221	`1`	`1`	`206`	`◊`	B	y,x,-z	`6_555`	`2`	`1`	`12414`	`4.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[SR]C:202	`1`	`1`	`206`	`◊`	B	y,x,-z	`6_555`	`2`	`1`	`12414`	`1.8`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`3.3`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
63	`68`		[SR]C:220	`1`	`1`	`206`	`f`	[SR]B:114	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`206`	`1.8`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
64	`69`		[SR]C:211	`1`	`1`	`206`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4273`	`1.3`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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