PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=162-0D-4OE)

Interfaces in PDB 4rvo crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.41 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A PUTATIVE ACYL-COA LIGASE (BT_0428) FROM BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 AT 2.41 A RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`186`	`46`	`19188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`186`	`52`	`19456`	`1739.9`	`-19.5`	`0.069`	`21`	`6`	`0`	`0.076`
	`2`		D	`182`	`45`	`19380`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`187`	`52`	`19689`	`1738.2`	`-20.9`	`0.048`	`19`	`6`	`0`	`0.076`
	*Average:*													`1739.0`	`-20.2`	`0.058`	`20`	`6`	`0`	`0.076`
2	`3`		B	`64`	`18`	`19188`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`70`	`18`	`19689`	`557.5`	`-5.6`	`0.307`	`4`	`0`	`0`	`0.026`
	`4`		D	`59`	`16`	`19380`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`64`	`17`	`19456`	`533.8`	`-3.4`	`0.427`	`6`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`545.6`	`-4.5`	`0.367`	`5`	`0`	`0`	`0.026`
3	`5`		D	`45`	`18`	`19380`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`47`	`14`	`19689`	`439.9`	`1.2`	`0.729`	`6`	`7`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`47`	`14`	`19456`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`47`	`17`	`19188`	`413.5`	`1.0`	`0.753`	`3`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`426.7`	`1.1`	`0.741`	`5`	`7`	`0`	`0.000`
4	`7`		[ADP]B:502	`27`	`1`	`565`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`65`	`24`	`19188`	`430.6`	`-5.9`	`0.641`	`11`	`0`	`0`	`0.037`
	`8`		[ADP]D:501	`27`	`1`	`563`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`65`	`23`	`19380`	`420.0`	`-4.3`	`0.703`	`6`	`0`	`0`	`0.037`
	*Average:*													`425.3`	`-5.1`	`0.672`	`9`	`0`	`0`	`0.037`
5	`9`		D	`50`	`16`	`19380`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`50`	`17`	`19188`	`420.8`	`3.2`	`0.864`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
6	`10`		[ADP]C:502	`27`	`1`	`557`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`66`	`25`	`19689`	`409.4`	`-4.8`	`0.681`	`7`	`0`	`0`	`0.027`
	`11`		[ADP]A:502	`27`	`1`	`557`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`27`	`19456`	`408.3`	`-5.6`	`0.627`	`7`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`408.9`	`-5.2`	`0.654`	`7`	`0`	`0`	`0.027`
7	`12`		C	`40`	`18`	`19689`	`◊`	C	-x+1,-y,z	`2_655`	`41`	`18`	`19689`	`327.4`	`-2.9`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		B	`36`	`11`	`19188`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`39`	`14`	`19456`	`293.9`	`-0.0`	`0.670`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		A	`27`	`9`	`19456`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`20`	`8`	`19456`	`237.4`	`-0.0`	`0.348`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		B	`22`	`6`	`19188`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`4_457`	`23`	`7`	`19689`	`204.7`	`-1.1`	`0.512`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
11	`16`		D	`22`	`7`	`19380`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`21`	`5`	`19456`	`193.7`	`-0.6`	`0.525`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		C	`18`	`7`	`19689`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`24`	`8`	`19456`	`170.4`	`1.1`	`0.780`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		D	`16`	`6`	`19380`	`◊`	A	-x,-y,z	`2_555`	`23`	`9`	`19456`	`162.0`	`1.9`	`0.835`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
14	`19`		[PG4]A:510	`12`	`1`	`405`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`19456`	`132.4`	`1.7`	`0.184`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[PEG]B:506	`7`	`1`	`260`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`19188`	`130.1`	`3.3`	`0.401`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[PGE]C:507	`9`	`1`	`331`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`19689`	`126.6`	`4.3`	`0.235`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[PGE]A:512	`9`	`1`	`307`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`19456`	`121.5`	`2.4`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`23`		[EDO]C:510	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`19689`	`119.4`	`3.2`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		[EDO]A:515	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`19456`	`112.2`	`3.2`	`0.495`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
20	`25`		[EDO]A:514	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`19456`	`97.6`	`3.0`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		D	`16`	`5`	`19380`	`◊`	[PG4]A:510	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`9`	`1`	`405`	`96.3`	`3.1`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`27`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`19456`	`95.8`	`-65.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.225`
	`28`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`19689`	`93.9`	`-65.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.225`
	*Average:*													`94.8`	`-65.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.225`
23	`29`		[PEG]A:511	`5`	`1`	`257`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`19456`	`93.3`	`2.6`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		C	`13`	`5`	`19689`	`◊`	[PGE]A:512	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`8`	`1`	`307`	`93.2`	`2.6`	`0.174`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		D	`13`	`5`	`19380`	`◊`	D	-x,-y,z	`2_555`	`14`	`5`	`19380`	`91.3`	`0.2`	`0.666`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[EDO]D:507	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`19380`	`90.9`	`2.3`	`0.448`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[K]D:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`19689`	`89.9`	`-58.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.202`
	`34`		[K]A:504	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`19456`	`88.2`	`-58.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.202`
	*Average:*													`89.0`	`-58.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.202`
28	`35`		[K]C:504	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`19380`	`89.7`	`-58.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.199`
	`36`		[K]A:505	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`19188`	`86.7`	`-57.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.199`
	*Average:*													`88.2`	`-57.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.199`
29	`37`		[EDO]A:516	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`19456`	`89.2`	`2.4`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`38`		B	`8`	`3`	`19188`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`4_457`	`8`	`3`	`19188`	`84.9`	`0.0`	`0.617`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		[SO4]B:504	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`19188`	`84.3`	`-12.1`	`0.860`	`5`	`0`	`0`	`0.050`
32	`40`		[SO4]D:505	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`19380`	`83.2`	`-12.0`	`0.831`	`4`	`0`	`0`	`0.034`
33	`41`		[EDO]B:509	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`19188`	`83.0`	`2.8`	`0.310`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`42`		[K]A:505	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`19456`	`81.8`	`-50.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
	`43`		[K]C:504	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`19689`	`78.8`	`-50.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
	*Average:*													`80.3`	`-50.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
35	`44`		[K]D:503	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`19380`	`80.7`	`-50.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`45`		[K]A:504	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`19188`	`80.2`	`-49.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`80.4`	`-49.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
36	`46`		[SO4]C:506	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`19689`	`78.8`	`-11.4`	`0.834`	`7`	`0`	`0`	`0.050`
37	`47`		[EDO]D:508	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`19380`	`78.6`	`1.8`	`0.825`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		[EDO]B:507	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`19188`	`78.3`	`2.8`	`0.315`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		[SO4]A:508	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`19456`	`78.3`	`-11.4`	`0.839`	`5`	`0`	`0`	`0.034`
40	`50`		[EDO]C:509	`3`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`19689`	`78.1`	`2.8`	`0.589`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	[ADP]C:502	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`557`	`75.8`	`-44.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`52`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	[ADP]A:502	x,y,z	`1_555`	`11`	`1`	`557`	`75.3`	`-44.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	*Average:*													`75.6`	`-44.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
42	`53`		[SO4]A:507	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`19456`	`74.6`	`-10.4`	`0.850`	`3`	`0`	`0`	`0.029`
43	`54`		[EDO]D:506	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`19380`	`74.0`	`1.9`	`0.274`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
44	`55`		[SO4]A:509	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`19456`	`70.2`	`-8.3`	`0.955`	`4`	`0`	`0`	`0.025`
45	`56`		[EDO]A:513	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`10`	`6`	`19456`	`69.1`	`1.2`	`0.750`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`57`		[EDO]C:508	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`19689`	`68.0`	`1.8`	`0.256`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
47	`58`		[EDO]B:508	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`19188`	`67.6`	`1.9`	`0.276`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`59`		[EDO]A:513	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`19456`	`67.5`	`2.4`	`0.276`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`60`		[EDO]A:517	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`19456`	`65.8`	`1.7`	`0.265`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`61`		[SO4]B:505	`5`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`19188`	`65.0`	`-7.1`	`0.977`	`3`	`0`	`0`	`0.029`
51	`62`		[SO4]B:505	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`19689`	`62.7`	`-7.6`	`0.935`	`3`	`0`	`0`	`0.031`
52	`63`		[SO4]A:509	`5`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`19380`	`59.4`	`-6.3`	`0.974`	`3`	`0`	`0`	`0.009`
53	`64`		C	`6`	`2`	`19689`	`◊`	[SO4]A:507	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`4`	`1`	`186`	`58.8`	`-7.3`	`0.929`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
54	`65`		C	`6`	`2`	`19689`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+2	`3_547`	`7`	`5`	`19188`	`45.9`	`-0.1`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`66`		[PGE]C:507	`4`	`1`	`331`	`f`	B	-x,-y,z	`2_555`	`7`	`3`	`19188`	`40.6`	`0.9`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`67`		[EDO]A:516	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`19188`	`40.4`	`1.2`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`68`		A	`6`	`3`	`19456`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`5`	`3`	`19380`	`33.7`	`0.9`	`0.831`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
58	`69`		[EDO]C:508	`2`	`1`	`185`	`◊`	[PGE]C:507	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`331`	`32.6`	`2.1`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`70`		[PEG]B:506	`4`	`1`	`260`	`◊`	C	-x,-y,z	`2_555`	`3`	`1`	`19689`	`28.1`	`0.9`	`0.337`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`71`		[EDO]D:506	`2`	`1`	`183`	`◊`	[PG4]A:510	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`3`	`1`	`405`	`27.0`	`1.2`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`72`		[EDO]D:507	`3`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`19689`	`27.0`	`0.8`	`0.825`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`73`		A	`5`	`3`	`19456`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`7`	`4`	`19689`	`24.9`	`0.0`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`74`		[EDO]B:509	`1`	`1`	`186`	`f`	[EDO]B:508	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`23.6`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`75`		B	`3`	`2`	`19188`	`◊`	C	-x,-y,z	`2_555`	`1`	`1`	`19689`	`20.2`	`1.0`	`0.881`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
65	`76`		[SO4]D:505	`3`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19689`	`16.5`	`-2.0`	`0.785`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
66	`77`		[SO4]B:504	`2`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`19456`	`11.2`	`-1.3`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
67	`78`		D	`1`	`1`	`19380`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19188`	`11.1`	`-0.4`	`0.181`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`79`		[EDO]B:507	`2`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`19456`	`8.5`	`0.3`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`80`		[SO4]C:506	`1`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19188`	`8.0`	`-1.1`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
70	`81`		[EDO]B:508	`1`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`2.0`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`82`		[PEG]B:506	`1`	`1`	`260`	`f`	D	-x,-y,z	`2_555`	`1`	`1`	`19380`	`1.2`	`0.0`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe