PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=961-9P-JHD)

Interfaces in PDB 4p1v crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.55 Å

STRUCTURE OF THE P DOMAIN FROM A GI.7 NOROVIRUS VARIANT IN COMPLEX WITH H-TYPE 2 HBGA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`164`	`48`	`12934`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`155`	`50`	`12633`	`1472.6`	`-16.2`	`0.166`	`12`	`3`	`0`	`1.000`
	`2`		B	`159`	`50`	`12142`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`156`	`47`	`12737`	`1423.2`	`-16.2`	`0.163`	`15`	`2`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1447.9`	`-16.2`	`0.164`	`14`	`3`	`0`	`1.000`
2	`3`		D	`53`	`17`	`12934`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`57`	`17`	`12737`	`528.0`	`-7.9`	`0.139`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		A	`45`	`14`	`12737`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`43`	`12`	`12633`	`413.2`	`-5.2`	`0.239`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`43`	`14`	`12934`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`45`	`13`	`12633`	`368.4`	`-2.3`	`0.544`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		D	`36`	`12`	`12934`	`◊`	A	x,y-1,z+1	`1_546`	`36`	`12`	`12737`	`357.2`	`-3.1`	`0.405`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		C	`36`	`13`	`12633`	`◊`	A	x-1,y,z+1	`1_456`	`33`	`10`	`12737`	`322.7`	`-3.1`	`0.376`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		B	`37`	`9`	`12142`	`◊`	A	x-1,y+1,z	`1_465`	`34`	`11`	`12737`	`296.0`	`-3.3`	`0.369`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		D	`24`	`9`	`12934`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`7`	`12142`	`235.7`	`-2.5`	`0.340`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		D	`15`	`5`	`12934`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`12142`	`183.9`	`-0.4`	`0.525`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		C	`17`	`7`	`12633`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`12737`	`142.0`	`-1.8`	`0.299`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[GAL]C:602	`10`	`1`	`304`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`12633`	`122.7`	`2.4`	`0.397`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[GAL]B:602	`9`	`1`	`303`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`12142`	`120.5`	`2.3`	`0.458`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[GAL]D:602	`9`	`1`	`302`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`12934`	`120.3`	`2.4`	`0.488`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[GAL]A:602	`10`	`1`	`306`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`12737`	`113.5`	`2.2`	`0.399`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`119.3`	`2.3`	`0.435`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		B	`13`	`5`	`12142`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`5`	`12142`	`119.6`	`-0.6`	`0.486`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
13	`17`		D	`12`	`6`	`12934`	`◊`	[NAG]A:603	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`1`	`357`	`109.7`	`1.5`	`0.149`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[FUC]D:601	`7`	`1`	`278`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`12934`	`94.6`	`1.0`	`0.283`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[FUC]B:601	`7`	`1`	`276`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`12142`	`94.3`	`0.9`	`0.282`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[FUC]C:601	`7`	`1`	`280`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`12633`	`92.5`	`1.6`	`0.365`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[FUC]A:601	`7`	`1`	`279`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`12737`	`89.9`	`1.6`	`0.361`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`92.8`	`1.3`	`0.323`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`22`		D	`11`	`5`	`12934`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`5`	`12737`	`85.1`	`-0.4`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		[NAG]D:603	`9`	`1`	`354`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`3`	`12737`	`76.1`	`1.6`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`24`		C	`7`	`3`	`12633`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`12633`	`74.3`	`1.6`	`0.877`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`25`		D	`7`	`4`	`12934`	`◊`	[NAG]B:603	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`1`	`358`	`73.3`	`1.6`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		[GAL]C:602	`6`	`1`	`304`	`cf`	[FUC]C:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`280`	`65.1`	`2.6`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[GAL]B:602	`5`	`1`	`303`	`cf`	[FUC]B:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`276`	`64.4`	`2.6`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[GAL]A:602	`6`	`1`	`306`	`cf`	[FUC]A:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`279`	`63.4`	`2.6`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`64.3`	`2.6`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		C	`8`	`4`	`12633`	`◊`	B	x,y-1,z+1	`1_546`	`9`	`6`	`12142`	`65.1`	`-1.4`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		[GAL]D:602	`6`	`1`	`302`	`cf`	[FUC]D:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`278`	`64.4`	`2.6`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		[NAG]B:603	`6`	`1`	`358`	`cf`	[GAL]B:602	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`303`	`63.8`	`2.2`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[NAG]D:603	`6`	`1`	`354`	`cf`	[GAL]D:602	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`302`	`61.9`	`2.2`	`0.103`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.8`	`2.2`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`33`		[NAG]C:603	`6`	`1`	`361`	`cf`	[GAL]C:602	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`304`	`61.9`	`2.2`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`34`		C	`7`	`3`	`12633`	`◊`	A	x,y-1,z+1	`1_546`	`9`	`2`	`12737`	`60.3`	`-0.9`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		D	`3`	`2`	`12934`	`◊`	B	x,y-1,z+1	`1_546`	`3`	`2`	`12142`	`14.4`	`-0.4`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.4`	`-0.7`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		[NAG]A:603	`5`	`1`	`357`	`cf`	[GAL]A:602	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`306`	`58.1`	`2.0`	`0.141`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`37`		[NAG]C:603	`5`	`1`	`361`	`f`	[FUC]C:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`280`	`53.6`	`3.4`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`38`		[NAG]A:603	`6`	`1`	`357`	`f`	[FUC]A:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`279`	`52.3`	`3.3`	`0.198`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`39`		[NAG]B:603	`5`	`1`	`358`	`f`	[FUC]B:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`276`	`48.4`	`3.2`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NAG]D:603	`5`	`1`	`354`	`f`	[FUC]D:601	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`278`	`47.2`	`3.1`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`47.8`	`3.1`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`41`		[FUC]A:601	`3`	`1`	`279`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12142`	`47.8`	`-0.4`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.200`
	`42`		[FUC]D:601	`3`	`1`	`278`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12633`	`47.6`	`-0.1`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.200`
	`43`		[FUC]C:601	`3`	`1`	`280`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12934`	`47.2`	`-0.4`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.200`
	`44`		[FUC]B:601	`3`	`1`	`276`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12737`	`46.3`	`-0.1`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.200`
	*Average:*													`47.2`	`-0.3`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.200`
30	`45`		D	`2`	`1`	`12934`	`◊`	[GAL]A:602	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`306`	`33.0`	`0.2`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`46`		[NAG]C:603	`5`	`1`	`361`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`12934`	`26.9`	`0.5`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`47`		C	`2`	`2`	`12633`	`◊`	D	x-1,y+1,z	`1_465`	`3`	`2`	`12934`	`23.1`	`0.6`	`0.847`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
33	`48`		[NAG]D:603	`2`	`1`	`354`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12934`	`19.9`	`0.8`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`49`		D	`7`	`1`	`12934`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`12737`	`18.7`	`-0.6`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`50`		[NAG]A:603	`3`	`1`	`357`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`12142`	`18.3`	`0.3`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`51`		[NAG]A:603	`2`	`1`	`357`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`12737`	`17.1`	`0.4`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`52`		[NAG]B:603	`1`	`1`	`358`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12737`	`7.5`	`0.1`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`53`		[NAG]D:603	`1`	`1`	`354`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12633`	`6.2`	`0.1`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`54`		[GAL]D:602	`3`	`1`	`302`	`◊`	[NAG]A:603	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`357`	`4.9`	`0.2`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`55`		[GAL]C:602	`1`	`1`	`304`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12934`	`3.2`	`-0.0`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`56`		[GAL]A:602	`1`	`1`	`306`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12142`	`2.4`	`-0.0`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`57`		[GAL]B:602	`1`	`1`	`303`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12737`	`1.6`	`-0.0`	`0.276`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`2.4`	`-0.0`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
41	`58`		[NAG]C:603	`2`	`1`	`361`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12633`	`3.0`	`-0.0`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
42	`59`		D	`1`	`1`	`12934`	`◊`	[GAL]B:602	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`303`	`1.5`	`0.0`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`60`		[NAG]B:603	`1`	`1`	`358`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12142`	`1.3`	`0.0`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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