PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=272-B1-39C)

Interfaces in PDB 4oit crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.24 Å

STRUCTURE, INTERACTIONS AND EVOLUTIONARY IMPLICATIONS OF A DOMAIN- SWAPPED LECTIN DIMER FROM MYCOBACTERIUM SMEGMATIS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`244`	`63`	`7580`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`246`	`63`	`7504`	`2376.9`	`-35.2`	`0.026`	`48`	`4`	`0`	`0.956`
	`2`		B	`242`	`62`	`7578`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`241`	`62`	`7612`	`2358.6`	`-33.2`	`0.020`	`48`	`4`	`0`	`0.956`
	*Average:*													`2367.8`	`-34.2`	`0.023`	`48`	`4`	`0`	`0.956`
2	`3`		C	`60`	`20`	`7504`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`18`	`7612`	`486.0`	`2.6`	`0.881`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`47`	`16`	`7504`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`34`	`8`	`7612`	`356.3`	`0.0`	`0.741`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`44`	`12`	`7580`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`32`	`11`	`7578`	`346.3`	`-0.2`	`0.667`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`25`	`7`	`7612`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`34`	`8`	`7580`	`276.1`	`0.5`	`0.659`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
6	`7`		D	`26`	`8`	`7580`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`35`	`12`	`7578`	`261.4`	`0.5`	`0.722`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
7	`8`		C	`16`	`6`	`7504`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`33`	`9`	`7578`	`185.6`	`0.5`	`0.729`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
8	`9`		[MAN]D:201	`11`	`1`	`304`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`7580`	`139.5`	`2.8`	`0.402`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[MAN]C:201	`10`	`1`	`303`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`7504`	`139.2`	`2.4`	`0.437`	`6`	`0`	`0`	`0.018`
	`11`		[MAN]A:201	`10`	`1`	`302`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`7612`	`136.9`	`2.3`	`0.383`	`6`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`138.0`	`2.3`	`0.410`	`6`	`0`	`0`	`0.018`
10	`12`		[MAN]B:201	`10`	`1`	`300`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`7578`	`138.7`	`2.4`	`0.339`	`7`	`0`	`0`	`0.056`
	`13`		[MAN]D:202	`10`	`1`	`301`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`7580`	`131.7`	`2.3`	`0.349`	`7`	`0`	`0`	`0.056`
	*Average:*													`135.2`	`2.3`	`0.344`	`7`	`0`	`0`	`0.056`
11	`14`		D	`26`	`13`	`7580`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`7578`	`136.7`	`-0.2`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[MAN]A:203	`10`	`1`	`302`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`7612`	`136.3`	`2.2`	`0.380`	`6`	`0`	`0`	`0.045`
	`16`		[MAN]C:202	`10`	`1`	`302`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`7504`	`133.1`	`2.1`	`0.342`	`7`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`134.7`	`2.1`	`0.361`	`7`	`0`	`0`	`0.045`
13	`17`		[BMA]B:202	`10`	`1`	`307`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`7612`	`131.2`	`0.2`	`0.142`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		C	`16`	`6`	`7504`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`7578`	`122.1`	`1.2`	`0.795`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		D	`14`	`5`	`7580`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`7612`	`103.0`	`0.3`	`0.673`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`112.5`	`0.7`	`0.734`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[MAN]D:203	`10`	`1`	`301`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`7504`	`118.7`	`0.4`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[MAN]C:203	`10`	`1`	`301`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`7580`	`117.2`	`0.5`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[MAN]A:202	`9`	`1`	`301`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`7578`	`113.1`	`0.6`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`115.2`	`0.6`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[BMA]B:202	`10`	`1`	`307`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`7578`	`107.1`	`2.0`	`0.309`	`6`	`0`	`0`	`0.046`
18	`24`		[MAN]D:203	`8`	`1`	`301`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`7580`	`102.0`	`1.7`	`0.355`	`6`	`0`	`0`	`0.053`
19	`25`		C	`14`	`3`	`7504`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`10`	`3`	`7578`	`101.1`	`-0.3`	`0.595`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
20	`26`		[MAN]A:202	`8`	`1`	`301`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`7612`	`100.3`	`1.5`	`0.315`	`6`	`0`	`0`	`0.058`
	`27`		[MAN]C:203	`8`	`1`	`301`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`7504`	`99.4`	`1.7`	`0.370`	`6`	`0`	`0`	`0.058`
	*Average:*													`99.9`	`1.6`	`0.342`	`6`	`0`	`0`	`0.058`
21	`28`		D	`10`	`3`	`7580`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`14`	`4`	`7612`	`96.3`	`0.4`	`0.658`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
22	`29`		[MAN]C:201	`8`	`1`	`303`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`7612`	`91.8`	`0.7`	`0.301`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[MAN]A:201	`8`	`1`	`302`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`7504`	`89.7`	`0.6`	`0.279`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`90.8`	`0.6`	`0.290`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`31`		A	`13`	`5`	`7612`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`9`	`3`	`7612`	`90.4`	`-1.1`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		[MAN]A:203	`7`	`1`	`302`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`9`	`3`	`7578`	`65.8`	`0.7`	`0.297`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`33`		C	`7`	`5`	`7504`	`x`	C	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`11`	`3`	`7504`	`59.9`	`-0.1`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`34`		[MAN]D:202	`5`	`1`	`301`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`8`	`3`	`7578`	`54.0`	`0.8`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		D	`8`	`4`	`7580`	`◊`	[MAN]B:201	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`5`	`1`	`300`	`53.6`	`1.3`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`53.8`	`1.0`	`0.324`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`36`		D	`8`	`3`	`7580`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`7`	`3`	`7578`	`52.8`	`0.4`	`0.704`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`37`		[MAN]D:203	`5`	`1`	`301`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`7578`	`48.0`	`1.3`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`38`		C	`5`	`2`	`7504`	`◊`	[MAN]C:202	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`5`	`1`	`302`	`45.8`	`0.6`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		B	`6`	`2`	`7578`	`◊`	D	x-1,y,z+1	`1_456`	`4`	`2`	`7580`	`45.0`	`-0.4`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		D	`6`	`3`	`7580`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`2`	`7578`	`40.3`	`0.0`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`41`		A	`4`	`3`	`7612`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`1`	`7578`	`29.3`	`0.3`	`0.664`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		A	`1`	`1`	`7612`	`◊`	D	x-1,y,z+1	`1_456`	`3`	`1`	`7580`	`20.7`	`0.4`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		B	`2`	`1`	`7578`	`◊`	C	x-1,y,z+1	`1_456`	`3`	`1`	`7504`	`15.9`	`0.1`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.3`	`0.2`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		A	`2`	`1`	`7612`	`◊`	[MAN]D:201	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`304`	`20.1`	`0.8`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		[BMA]B:202	`1`	`1`	`307`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`7580`	`19.6`	`0.4`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		[MAN]D:201	`1`	`1`	`304`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`7578`	`19.2`	`0.0`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[BMA]B:202	`1`	`1`	`307`	`◊`	[MAN]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`303`	`19.0`	`0.4`	`0.204`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		B	`1`	`1`	`7578`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`2`	`7612`	`17.3`	`0.4`	`0.788`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		C	`5`	`3`	`7504`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`3`	`7578`	`16.7`	`-0.1`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[MAN]D:203	`2`	`1`	`301`	`◊`	[MAN]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`302`	`16.7`	`0.4`	`0.264`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[MAN]A:203	`3`	`1`	`302`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`2`	`7612`	`16.3`	`0.6`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		D	`2`	`1`	`7580`	`◊`	[MAN]C:202	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`302`	`7.2`	`0.0`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		B	`1`	`1`	`7578`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`7580`	`2.8`	`-0.1`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		D	`1`	`1`	`7580`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`7612`	`1.9`	`-0.0`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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