PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=376-H0-3HN)

Interfaces in PDB 4l8k crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.26 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A PUTATIVE PEPTIDASE (PARMER_02772) FROM PARABACTEROIDES MERDAE ATCC 43184 AT 2.26 A RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`96`	`26`	`13699`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`101`	`26`	`14038`	`925.2`	`-3.8`	`0.440`	`14`	`0`	`0`	`0.107`
	`2`		B	`86`	`26`	`14595`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`85`	`24`	`14811`	`833.1`	`-2.2`	`0.540`	`14`	`0`	`0`	`0.107`
	*Average:*													`879.2`	`-3.0`	`0.490`	`14`	`0`	`0`	`0.107`
2	`3`		D	`71`	`17`	`13699`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`12`	`14811`	`548.7`	`-1.2`	`0.476`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`54`	`13`	`14038`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`41`	`11`	`14595`	`418.0`	`0.3`	`0.580`	`9`	`1`	`0`	`0.000`
4	`5`		C	`42`	`13`	`14038`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`11`	`14595`	`383.6`	`-2.9`	`0.295`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
5	`6`		B	`45`	`14`	`14595`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`42`	`14`	`13699`	`367.9`	`-0.7`	`0.438`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		D	`36`	`10`	`13699`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`40`	`12`	`14811`	`365.4`	`-3.1`	`0.322`	`0`	`3`	`0`	`0.000`
7	`8`		A	`29`	`8`	`14811`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`31`	`11`	`14811`	`299.8`	`-5.4`	`0.085`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`29`	`11`	`14038`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`6`	`14038`	`277.5`	`-5.6`	`0.044`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`288.7`	`-5.5`	`0.065`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
8	`10`		D	`24`	`6`	`13699`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`27`	`7`	`14595`	`218.0`	`1.4`	`0.686`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
9	`11`		C	`25`	`8`	`14038`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`14811`	`214.7`	`2.7`	`0.787`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
10	`12`		B	`22`	`6`	`14595`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`21`	`9`	`13699`	`200.7`	`3.6`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[MPD]A:403	`7`	`1`	`280`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`14811`	`170.6`	`-12.8`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
12	`14`		[MPD]B:403	`7`	`1`	`280`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`14595`	`164.5`	`-10.7`	`0.729`	`6`	`0`	`0`	`0.034`
13	`15`		[MPD]A:402	`7`	`1`	`279`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`14811`	`164.2`	`-10.9`	`0.728`	`6`	`0`	`0`	`0.028`
14	`16`		[MPD]C:404	`7`	`1`	`282`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`14038`	`154.6`	`-10.7`	`0.493`	`3`	`0`	`0`	`0.129`
15	`17`		[MRD]C:405	`7`	`1`	`278`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`14038`	`147.5`	`1.9`	`0.310`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		B	`13`	`5`	`14595`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`9`	`14595`	`121.1`	`0.7`	`0.697`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
17	`19`		[MRD]B:405	`6`	`1`	`281`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`14595`	`119.5`	`0.7`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		[MRD]C:406	`7`	`1`	`277`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`14038`	`118.9`	`3.6`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		[PO4]D:402	`5`	`1`	`191`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`13699`	`114.9`	`-8.6`	`0.723`	`10`	`0`	`0`	`0.140`
20	`22`		[PO4]C:401	`5`	`1`	`191`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`14038`	`113.9`	`-8.7`	`0.708`	`12`	`0`	`0`	`0.150`
21	`23`		[PO4]D:401	`5`	`1`	`193`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`13699`	`113.4`	`-7.5`	`0.705`	`3`	`0`	`0`	`0.095`
22	`24`		[PO4]C:402	`5`	`1`	`192`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`14038`	`113.3`	`-6.9`	`0.755`	`4`	`0`	`0`	`0.093`
23	`25`		[MPD]D:403	`6`	`1`	`278`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`13699`	`113.2`	`-7.2`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.082`
24	`26`		[PO4]A:401	`5`	`1`	`191`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`14811`	`104.5`	`-7.4`	`0.746`	`8`	`0`	`0`	`0.023`
25	`27`		[PO4]B:401	`5`	`1`	`192`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`14595`	`103.3`	`-7.1`	`0.748`	`10`	`0`	`0`	`0.030`
26	`28`		[PO4]B:402	`5`	`1`	`192`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`14595`	`79.9`	`-4.7`	`0.741`	`4`	`0`	`0`	`0.017`
27	`29`		[MPD]B:404	`5`	`1`	`284`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14595`	`75.4`	`-3.8`	`0.718`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
28	`30`		[MPD]D:404	`6`	`1`	`281`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`13699`	`72.7`	`-3.5`	`0.838`	`2`	`0`	`0`	`0.047`
29	`31`		[MPD]B:404	`4`	`1`	`284`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`14038`	`68.9`	`-3.4`	`0.872`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[MPD]D:404	`4`	`1`	`281`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`13699`	`67.3`	`-1.3`	`0.984`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[PO4]C:403	`5`	`1`	`191`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14038`	`63.9`	`-2.0`	`0.963`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
32	`34`		[CL]C:407	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14038`	`57.0`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
33	`35`		[CL]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14811`	`56.2`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
34	`36`		B	`7`	`3`	`14595`	`◊`	[PO4]B:402	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`192`	`54.4`	`-1.9`	`0.935`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[MRD]B:405	`3`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`14811`	`44.3`	`0.2`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[MRD]C:405	`4`	`1`	`278`	`f`	[MPD]C:404	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`282`	`42.9`	`-1.8`	`0.000`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
37	`39`		C	`6`	`2`	`14038`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`2`	`14811`	`40.7`	`0.0`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		A	`7`	`2`	`14811`	`◊`	[MPD]A:403	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`280`	`39.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[MRD]C:405	`3`	`1`	`278`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`14038`	`37.0`	`0.2`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[MPD]D:404	`4`	`1`	`281`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14038`	`36.1`	`-1.5`	`0.852`	`2`	`0`	`0`	`0.025`
41	`43`		[MPD]C:404	`4`	`1`	`282`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`14038`	`35.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		[MPD]B:403	`2`	`1`	`280`	`f`	[PO4]B:401	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`192`	`31.4`	`-3.0`	`0.937`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
43	`45`		[PO4]C:403	`4`	`1`	`191`	`f`	[PO4]C:402	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`192`	`31.1`	`-3.0`	`0.982`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
44	`46`		[MPD]D:403	`3`	`1`	`278`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14038`	`29.5`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
45	`47`		[MPD]A:402	`3`	`1`	`279`	`f`	[PO4]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`191`	`26.3`	`-2.5`	`0.986`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
46	`48`		[PO4]C:403	`1`	`1`	`191`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`14595`	`21.6`	`-0.4`	`0.875`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[MRD]B:405	`2`	`1`	`281`	`f`	[MPD]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`279`	`20.8`	`-0.6`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
48	`50`		B	`2`	`2`	`14595`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`14811`	`11.9`	`0.4`	`0.841`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		C	`2`	`2`	`14038`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`3`	`13699`	`10.6`	`0.3`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		D	`2`	`2`	`13699`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`2`	`14811`	`10.5`	`0.2`	`0.754`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		[PO4]B:402	`3`	`1`	`192`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14811`	`8.5`	`-0.4`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		C	`1`	`1`	`14038`	`◊`	A	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`1`	`1`	`14811`	`2.4`	`-0.0`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[CL]C:407	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`14595`	`2.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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