PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=383-07-BPC)

Interfaces in PDB 4jam crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.65 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF BROADLY NEUTRALIZING ANTI-HIV-1 ANTIBODY CH103

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`209`	`54`	`11069`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`179`	`49`	`11989`	`1758.5`	`-29.5`	`0.018`	`2`	`1`	`0`	`0.258`
	`2`		L	`205`	`53`	`10897`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`181`	`50`	`12001`	`1740.6`	`-28.4`	`0.022`	`2`	`1`	`0`	`0.258`
	*Average:*													`1749.5`	`-28.9`	`0.020`	`2`	`1`	`0`	`0.258`
2	`3`		H	`67`	`21`	`12001`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`58`	`16`	`11069`	`566.9`	`0.9`	`0.803`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		L	`56`	`15`	`10897`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`61`	`21`	`11989`	`514.5`	`1.2`	`0.852`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
4	`5`		H	`40`	`11`	`12001`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`39`	`11`	`11989`	`354.7`	`1.3`	`0.845`	`5`	`0`	`0`	`0.010`
5	`6`		B	`32`	`11`	`11069`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`41`	`17`	`11989`	`345.2`	`-5.5`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
6	`7`		H	`34`	`11`	`12001`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`33`	`10`	`11069`	`336.7`	`0.3`	`0.687`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`8`		L	`27`	`8`	`10897`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`11989`	`236.6`	`-2.7`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`30`	`8`	`11069`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`12001`	`222.6`	`-0.8`	`0.593`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`229.6`	`-1.8`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		L	`27`	`12`	`10897`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`24`	`11`	`11989`	`222.1`	`-4.1`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
9	`11`		L	`19`	`7`	`10897`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`11069`	`189.0`	`-0.4`	`0.634`	`4`	`0`	`0`	`0.001`
10	`12`		L	`17`	`3`	`10897`	`x`	L	x-1,y,z	`1_455`	`24`	`9`	`10897`	`170.6`	`-3.2`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		H	`24`	`7`	`12001`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`18`	`4`	`11069`	`164.6`	`-0.9`	`0.524`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`14`		L	`17`	`4`	`10897`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`22`	`7`	`11989`	`146.9`	`-1.0`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`155.8`	`-0.9`	`0.537`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
12	`15`		B	`12`	`5`	`11069`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`4`	`11069`	`122.2`	`-1.3`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[SO4]B:301	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`11069`	`118.9`	`-16.0`	`0.858`	`1`	`0`	`0`	`0.119`
14	`17`		[EDO]L:302	`4`	`1`	`184`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`10897`	`108.0`	`3.4`	`0.532`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[EDO]H:308	`4`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`12001`	`95.8`	`2.7`	`0.463`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		H	`8`	`5`	`12001`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`5`	`11989`	`94.1`	`-0.4`	`0.582`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[EDO]H:309	`4`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`12001`	`92.6`	`2.7`	`0.445`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[EDO]B:307	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`11069`	`86.2`	`3.1`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[SO4]H:303	`5`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`12001`	`82.9`	`-12.3`	`0.812`	`2`	`0`	`0`	`0.144`
20	`23`		[EDO]A:304	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`11989`	`80.9`	`1.8`	`0.288`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[EDO]H:311	`4`	`1`	`184`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`12001`	`75.0`	`1.4`	`0.736`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		H	`8`	`4`	`12001`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`4`	`11069`	`74.5`	`0.4`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[EDO]B:308	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`11069`	`73.4`	`2.6`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[SO4]H:304	`5`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10897`	`73.1`	`-9.6`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
25	`28`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11989`	`73.0`	`1.8`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[EDO]H:307	`4`	`1`	`184`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`12001`	`68.2`	`1.7`	`0.438`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.6`	`1.8`	`0.448`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[SO4]H:306	`5`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`12001`	`72.7`	`-8.9`	`0.920`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
27	`31`		[SO4]B:302	`5`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11069`	`72.2`	`-9.2`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
28	`32`		[SO4]H:301	`4`	`1`	`184`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12001`	`71.4`	`-10.0`	`0.864`	`2`	`0`	`0`	`0.119`
29	`33`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`11069`	`70.6`	`1.1`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[EDO]H:307	`4`	`1`	`184`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10897`	`68.1`	`1.6`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.4`	`1.3`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`35`		[SO4]A:303	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11989`	`70.0`	`-9.5`	`0.880`	`2`	`0`	`0`	`0.114`
31	`36`		[SO4]B:305	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`11069`	`69.2`	`-8.3`	`0.852`	`1`	`0`	`0`	`0.064`
32	`37`		[EDO]A:306	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11989`	`65.9`	`2.3`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`38`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`11069`	`64.6`	`-8.9`	`0.686`	`1`	`0`	`0`	`0.068`
34	`39`		H	`9`	`3`	`12001`	`x`	H	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`5`	`2`	`12001`	`63.4`	`-0.4`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		H	`12`	`4`	`12001`	`◊`	[SO4]B:303	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`1`	`185`	`62.7`	`-7.7`	`0.867`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
36	`41`		[EDO]H:310	`3`	`1`	`183`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`12001`	`62.2`	`1.7`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		[SO4]A:303	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11069`	`62.2`	`-7.3`	`0.857`	`1`	`0`	`0`	`0.056`
38	`43`		[EDO]A:307	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`11989`	`61.7`	`2.5`	`0.335`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[SO4]B:302	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`11989`	`61.4`	`-8.6`	`0.786`	`2`	`0`	`0`	`0.104`
40	`45`		[SO4]H:305	`5`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`10897`	`61.0`	`-7.8`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
41	`46`		[SO4]H:304	`5`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`12001`	`60.1`	`-8.1`	`0.849`	`3`	`0`	`0`	`0.083`
42	`47`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11989`	`59.9`	`-8.1`	`0.882`	`1`	`0`	`0`	`0.093`
43	`48`		[SO4]H:301	`4`	`1`	`184`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10897`	`59.7`	`-7.2`	`0.820`	`1`	`0`	`0`	`0.067`
44	`49`		[GOL]H:312	`5`	`1`	`218`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`12001`	`57.7`	`0.2`	`0.718`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
45	`50`		[GOL]H:312	`5`	`1`	`218`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`4`	`11989`	`56.1`	`0.2`	`0.650`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		H	`9`	`3`	`12001`	`◊`	[SO4]B:305	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`184`	`55.6`	`-6.8`	`0.846`	`1`	`0`	`0`	`0.046`
47	`52`		H	`5`	`2`	`12001`	`◊`	[SO4]A:301	x-1,y,z-1	`1_454`	`5`	`1`	`185`	`54.0`	`-6.1`	`0.953`	`1`	`0`	`0`	`0.072`
48	`53`		[EDO]H:310	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`7`	`5`	`11989`	`53.3`	`1.2`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[SO4]H:305	`4`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`12001`	`52.9`	`-6.8`	`0.793`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
50	`55`		[SO4]A:301	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11989`	`52.5`	`-6.2`	`0.907`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
51	`56`		B	`8`	`5`	`11069`	`f`	[SO4]B:304	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`185`	`52.2`	`-6.4`	`0.836`	`3`	`0`	`0`	`0.057`
52	`57`		[SO4]B:304	`5`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`11069`	`52.0`	`-6.2`	`0.745`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`58`		B	`7`	`4`	`11069`	`f`	[EDO]A:306	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`185`	`51.8`	`1.0`	`0.797`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`59`		H	`12`	`5`	`12001`	`◊`	[SO4]A:302	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`1`	`186`	`49.5`	`-7.3`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
55	`60`		[SO4]H:302	`5`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`12001`	`47.3`	`-5.9`	`0.913`	`1`	`0`	`0`	`0.070`
56	`61`		B	`7`	`3`	`11069`	`◊`	[SO4]A:301	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`185`	`44.8`	`-5.8`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
57	`62`		[SO4]A:302	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11069`	`44.5`	`-5.7`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
58	`63`		[EDO]A:304	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`11069`	`43.9`	`1.2`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`64`		[SO4]H:302	`5`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`4`	`11989`	`42.7`	`-5.7`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
60	`65`		[SO4]B:306	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11069`	`42.6`	`-4.3`	`0.939`	`1`	`0`	`0`	`0.034`
61	`66`		H	`5`	`3`	`12001`	`◊`	[EDO]A:307	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`3`	`1`	`184`	`42.3`	`2.0`	`0.956`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`67`		[EDO]H:311	`4`	`1`	`184`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`10897`	`41.7`	`1.1`	`0.731`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`68`		[SO4]L:301	`4`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10897`	`38.6`	`-3.7`	`0.958`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
64	`69`		[EDO]A:306	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]B:304	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`38.2`	`-3.3`	`0.999`	`2`	`0`	`0`	`0.031`
65	`70`		[SO4]B:304	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11989`	`37.9`	`-4.1`	`0.826`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
66	`71`		[SO4]H:302	`4`	`1`	`185`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10897`	`37.0`	`-4.7`	`0.702`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
67	`72`		[SO4]L:301	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`11069`	`36.9`	`-3.6`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
68	`73`		[EDO]H:309	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]H:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`36.1`	`-2.7`	`0.999`	`1`	`0`	`0`	`0.034`
69	`74`		[EDO]B:308	`2`	`1`	`184`	`f`	B	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`11069`	`34.5`	`0.4`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`75`		[EDO]H:308	`4`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10897`	`34.0`	`1.1`	`0.939`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
71	`76`		[GOL]H:312	`4`	`1`	`218`	`f`	[EDO]H:310	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`33.7`	`0.7`	`0.685`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`77`		[SO4]H:306	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`11069`	`32.9`	`-2.1`	`0.990`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
73	`78`		[EDO]B:307	`3`	`1`	`185`	`f`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`11989`	`32.6`	`1.7`	`0.956`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`79`		H	`3`	`1`	`12001`	`◊`	[EDO]B:308	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`1`	`184`	`32.3`	`0.8`	`0.925`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`80`		[GOL]H:312	`4`	`1`	`218`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`10897`	`31.1`	`-0.2`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
76	`81`		[SO4]L:301	`2`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`12001`	`27.5`	`-2.7`	`0.962`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
77	`82`		H	`3`	`1`	`12001`	`◊`	L	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`10897`	`26.6`	`-0.8`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`83`		[SO4]B:306	`4`	`1`	`186`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10897`	`25.5`	`-3.1`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
79	`84`		[SO4]B:303	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11989`	`23.2`	`-2.5`	`0.945`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
80	`85`		H	`2`	`2`	`12001`	`◊`	[SO4]B:302	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`186`	`17.0`	`-2.1`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`86`		L	`3`	`1`	`10897`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`12001`	`16.6`	`0.4`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`87`		[EDO]H:307	`2`	`1`	`184`	`f`	[SO4]H:304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`12.1`	`-1.5`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
83	`88`		[EDO]H:308	`2`	`1`	`185`	`f`	[SO4]H:304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`12.0`	`-1.0`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
84	`89`		[EDO]H:309	`2`	`1`	`185`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`10897`	`10.1`	`0.2`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`90`		[GOL]H:312	`2`	`1`	`218`	`f`	[SO4]H:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`8.8`	`-1.0`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
86	`91`		[EDO]A:305	`2`	`1`	`185`	`◊`	[SO4]B:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`186`	`8.3`	`-1.0`	`0.980`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
87	`92`		H	`1`	`1`	`12001`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`11989`	`7.8`	`0.4`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`93`		[EDO]H:307	`3`	`1`	`184`	`◊`	[SO4]H:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`6.9`	`-0.9`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
89	`94`		[EDO]A:305	`2`	`1`	`185`	`◊`	[SO4]A:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`6.7`	`-0.9`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
90	`95`		[EDO]H:309	`1`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`2`	`11989`	`6.6`	`0.1`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
91	`96`		L	`2`	`1`	`10897`	`f`	[EDO]A:307	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`1`	`1`	`184`	`4.4`	`0.1`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
92	`97`		[SO4]B:302	`1`	`1`	`186`	`f`	[SO4]A:303	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`186`	`4.0`	`-1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
93	`98`		[SO4]H:304	`1`	`1`	`185`	`◊`	[SO4]H:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`1.5`	`-0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
94	`99`		L	`1`	`1`	`10897`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`11069`	`0.2`	`-0.0`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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