PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=312-9B-PIP)

Interfaces in PDB 4dw3 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.35 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLYCOPROTEIN ERNS FROM THE PESTIVIRUS BVDV-1 IN COMPLEX WITH 5'-CMP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`84`	`20`	`8958`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`84`	`20`	`8958`	`772.8`	`-6.2`	`0.358`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`52`	`19`	`8958`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`17`	`9015`	`481.9`	`-8.0`	`0.109`	`4`	`2`	`0`	`0.316`
3	`3`		B	`29`	`10`	`8958`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`26`	`10`	`9015`	`266.7`	`-2.3`	`0.405`	`2`	`4`	`0`	`0.111`
4	`4`		B	`30`	`11`	`8958`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`25`	`7`	`9015`	`244.0`	`-2.4`	`0.376`	`0`	`2`	`0`	`0.059`
5	`5`		[C5P]B:1114	`17`	`1`	`452`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`17`	`8958`	`223.1`	`-5.7`	`0.387`	`6`	`0`	`0`	`0.262`
6	`6`		[C5P]A:1117	`18`	`1`	`444`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`13`	`9015`	`207.6`	`-3.9`	`0.524`	`7`	`0`	`0`	`0.218`
7	`7`		A	`21`	`8`	`9015`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`17`	`5`	`9015`	`195.2`	`-3.7`	`0.163`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		B	`19`	`6`	`8958`	`◊`	B	-x+1,-y,z	`2_655`	`20`	`6`	`8958`	`184.0`	`-5.0`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
9	`9`		[NAG]A:1107	`11`	`1`	`367`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`9015`	`150.2`	`2.8`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[NAG]B:1107	`11`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`8958`	`143.1`	`1.9`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[NAG]B:1108	`12`	`1`	`368`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`8958`	`140.2`	`4.5`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[NAG]A:1108	`11`	`1`	`368`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`9015`	`137.6`	`3.5`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`138.9`	`4.0`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[NAG]B:1101	`12`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`8958`	`139.5`	`3.1`	`0.297`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]A:1101	`12`	`1`	`364`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`9015`	`138.6`	`3.1`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`139.1`	`3.1`	`0.320`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[NAG]A:1106	`10`	`1`	`367`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`9015`	`133.5`	`3.6`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]B:1106	`10`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`8958`	`133.3`	`3.6`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`133.4`	`3.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[NAG]A:1102	`11`	`1`	`364`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`9015`	`126.5`	`2.2`	`0.298`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]B:1102	`11`	`1`	`363`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`8958`	`125.7`	`2.2`	`0.299`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`126.1`	`2.2`	`0.299`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		[NAG]A:1109	`10`	`1`	`367`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`9015`	`103.5`	`2.6`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[NAG]B:1110	`10`	`1`	`371`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`8958`	`103.4`	`2.6`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.4`	`2.6`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[NAG]B:1110	`6`	`1`	`371`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`13`	`3`	`9015`	`96.0`	`1.8`	`0.392`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[MAN]A:1105	`9`	`1`	`296`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`9015`	`93.6`	`1.3`	`0.265`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[MAN]B:1105	`9`	`1`	`298`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`8958`	`92.3`	`1.3`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`93.0`	`1.3`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[BMA]B:1103	`8`	`1`	`298`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`8958`	`90.5`	`1.1`	`0.291`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[BMA]A:1103	`8`	`1`	`296`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`9015`	`90.0`	`1.1`	`0.289`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`90.3`	`1.1`	`0.290`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		B	`12`	`3`	`8958`	`◊`	[NAG]A:1110	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`9`	`1`	`367`	`85.0`	`0.6`	`0.180`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		B	`11`	`5`	`8958`	`◊`	[MAN]A:1112	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`8`	`1`	`292`	`83.2`	`1.3`	`0.253`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		[SO4]B:1113	`5`	`1`	`187`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`15`	`6`	`9015`	`82.3`	`-11.7`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.344`
22	`29`		[SO4]B:1112	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`8958`	`80.9`	`-11.4`	`0.785`	`3`	`0`	`0`	`0.398`
23	`30`		B	`11`	`4`	`8958`	`◊`	[BMA]A:1113	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`7`	`1`	`297`	`77.6`	`1.3`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`31`		[NAG]A:1110	`9`	`1`	`367`	`cf`	[NAG]A:1109	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`367`	`76.0`	`1.8`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`32`		[SO4]A:1116	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`9015`	`75.5`	`-9.5`	`0.915`	`3`	`0`	`0`	`0.339`
26	`33`		[SO4]B:1113	`4`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`8958`	`74.7`	`-10.8`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.337`
27	`34`		[NAG]B:1109	`10`	`1`	`374`	`cf`	[NAG]B:1108	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`368`	`73.1`	`2.0`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[NAG]A:1102	`9`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]A:1101	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`72.8`	`1.7`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[NAG]B:1102	`9`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]B:1101	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`72.7`	`1.7`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`72.8`	`1.7`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`37`		[SO4]B:1111	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`8958`	`72.2`	`-10.5`	`0.711`	`4`	`0`	`0`	`0.385`
30	`38`		B	`9`	`3`	`8958`	`◊`	[NAG]A:1109	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`8`	`1`	`367`	`70.8`	`0.5`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		[SO4]A:1114	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`9015`	`70.0`	`-9.9`	`0.732`	`3`	`0`	`0`	`0.351`
32	`40`		B	`5`	`2`	`8958`	`◊`	[NAG]A:1107	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`6`	`1`	`367`	`68.0`	`1.2`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`41`		A	`8`	`3`	`9015`	`◊`	[NAG]A:1108	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`5`	`1`	`368`	`64.8`	`0.4`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`42`		[SO4]A:1115	`5`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`9015`	`63.3`	`-7.1`	`0.921`	`1`	`0`	`0`	`0.237`
35	`43`		[BMA]B:1103	`7`	`1`	`298`	`cf`	[NAG]B:1102	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`62.7`	`0.9`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[BMA]A:1103	`7`	`1`	`296`	`cf`	[NAG]A:1102	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`364`	`62.1`	`0.9`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.4`	`0.9`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`45`		[BMA]A:1111	`7`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]A:1110	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`367`	`62.4`	`1.2`	`0.111`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`46`		B	`7`	`2`	`8958`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`10`	`3`	`9015`	`61.2`	`-0.8`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		[MAN]A:1112	`6`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]A:1111	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`295`	`61.0`	`2.7`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[MAN]A:1105	`6`	`1`	`296`	`cf`	[BMA]A:1103	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`296`	`59.6`	`2.5`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[MAN]B:1105	`6`	`1`	`298`	`cf`	[BMA]B:1103	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`298`	`59.5`	`2.5`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.5`	`2.5`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[BMA]A:1113	`8`	`1`	`297`	`f`	[NAG]A:1110	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`367`	`58.7`	`1.7`	`0.146`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[SO4]A:1115	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8958`	`58.7`	`-7.6`	`0.736`	`2`	`0`	`0`	`0.265`
42	`52`		[C5P]B:1114	`11`	`1`	`452`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`9015`	`56.5`	`0.8`	`0.794`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[BMA]A:1113	`7`	`1`	`297`	`cf`	[BMA]A:1111	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`295`	`54.6`	`1.4`	`0.212`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		[BMA]B:1104	`6`	`1`	`298`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`8958`	`54.4`	`0.1`	`0.260`	`2`	`0`	`0`	`0.047`
	`55`		[BMA]A:1104	`6`	`1`	`298`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`9015`	`53.2`	`0.1`	`0.262`	`2`	`0`	`0`	`0.047`
	*Average:*													`53.8`	`0.1`	`0.261`	`2`	`0`	`0`	`0.047`
45	`56`		[NAG]B:1108	`5`	`1`	`368`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`6`	`3`	`8958`	`53.6`	`0.3`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`57`		[BMA]A:1104	`6`	`1`	`298`	`cf`	[BMA]A:1103	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`296`	`53.5`	`2.4`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[BMA]B:1104	`6`	`1`	`298`	`cf`	[BMA]B:1103	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`298`	`53.5`	`2.4`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`53.5`	`2.4`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`59`		B	`8`	`2`	`8958`	`◊`	[BMA]A:1111	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`5`	`1`	`295`	`53.2`	`0.3`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`60`		[SO4]B:1111	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`6`	`3`	`9015`	`52.9`	`-7.1`	`0.625`	`1`	`0`	`0`	`0.166`
49	`61`		[BMA]A:1104	`5`	`1`	`298`	`f`	[NAG]A:1102	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`52.8`	`1.9`	`0.198`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[BMA]B:1104	`4`	`1`	`298`	`f`	[NAG]B:1102	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`52.5`	`1.8`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`52.6`	`1.8`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`63`		[C5P]A:1117	`4`	`1`	`444`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8958`	`46.7`	`0.9`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`64`		[NAG]B:1107	`5`	`1`	`366`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`3`	`2`	`9015`	`43.7`	`0.8`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`65`		[MAN]B:1105	`5`	`1`	`298`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`6`	`2`	`9015`	`42.9`	`0.4`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		B	`2`	`1`	`8958`	`◊`	[MAN]A:1105	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`3`	`1`	`296`	`24.9`	`0.4`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`33.9`	`0.4`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`67`		A	`3`	`1`	`9015`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`3`	`1`	`9015`	`40.7`	`-1.3`	`0.119`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
54	`68`		[NAG]B:1109	`4`	`1`	`374`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`7`	`3`	`8958`	`39.8`	`1.3`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`69`		[NAG]A:1110	`3`	`1`	`367`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`9015`	`23.1`	`1.2`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`70`		[NAG]B:1106	`3`	`1`	`366`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`3`	`1`	`8958`	`22.8`	`0.5`	`0.423`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`71`		B	`3`	`2`	`8958`	`◊`	[SO4]A:1114	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`3`	`1`	`185`	`22.1`	`-2.5`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
58	`72`		[MAN]A:1112	`4`	`1`	`292`	`f`	[NAG]A:1110	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`367`	`17.7`	`0.8`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`73`		[SO4]B:1111	`3`	`1`	`187`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`2`	`1`	`9015`	`16.2`	`-1.9`	`0.607`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
60	`74`		[MAN]A:1112	`2`	`1`	`292`	`◊`	[MAN]A:1105	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`296`	`12.2`	`0.4`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`75`		[SO4]B:1113	`4`	`1`	`187`	`◊`	[NAG]A:1107	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`1`	`1`	`367`	`8.8`	`-0.5`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
62	`76`		[NAG]B:1102	`2`	`1`	`363`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`9015`	`8.5`	`0.4`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`77`		[NAG]B:1107	`1`	`1`	`366`	`◊`	[NAG]A:1107	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`1`	`1`	`367`	`6.3`	`0.1`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`78`		[BMA]B:1104	`2`	`1`	`298`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`9015`	`5.5`	`0.1`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`79`		[BMA]A:1113	`1`	`1`	`297`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`9015`	`4.3`	`0.1`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`80`		[NAG]B:1106	`1`	`1`	`366`	`◊`	[NAG]A:1109	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`1`	`1`	`367`	`2.1`	`0.1`	`0.175`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`81`		[MAN]B:1105	`1`	`1`	`298`	`f`	[NAG]B:1102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`363`	`1.4`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		[MAN]A:1105	`1`	`1`	`296`	`f`	[NAG]A:1102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`364`	`1.3`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.3`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`83`		[NAG]B:1107	`1`	`1`	`366`	`◊`	[MAN]A:1112	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`2`	`1`	`292`	`1.2`	`-0.0`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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