PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=464-1M-JCG)

Interfaces in PDB 4dvt crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF CLADE A/E 93TH057 HIV-1 GP120 CORE IN COMPLEX WITH AS-II-37

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`36`	`18`	`16220`	`x`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`46`	`15`	`16220`	`426.0`	`-2.4`	`0.414`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`39`	`18`	`16341`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`48`	`16`	`16341`	`418.2`	`-4.4`	`0.212`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`422.1`	`-3.4`	`0.313`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		B	`49`	`17`	`16220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`11`	`16341`	`407.4`	`1.2`	`0.772`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		[0LZ]B:512	`24`	`1`	`578`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`49`	`21`	`16220`	`344.8`	`-8.0`	`0.262`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		[0LZ]A:512	`25`	`1`	`574`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`21`	`16341`	`341.3`	`-7.8`	`0.298`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`343.1`	`-7.9`	`0.280`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		[NAG]A:503	`14`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`16341`	`228.4`	`5.9`	`0.531`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		[NAG]B:503	`14`	`1`	`358`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`16220`	`214.7`	`5.7`	`0.542`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[EPE]B:513	`13`	`1`	`406`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`16220`	`181.7`	`6.1`	`0.218`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		[EPE]A:513	`14`	`1`	`407`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`11`	`16341`	`178.7`	`5.9`	`0.129`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		[NAG]A:505	`13`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`16341`	`173.1`	`5.0`	`0.459`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[NAG]B:505	`14`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`16220`	`170.2`	`4.5`	`0.417`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[NAG]A:510	`14`	`1`	`352`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`16341`	`168.1`	`3.4`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[NAG]B:501	`11`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`16220`	`167.8`	`6.0`	`0.679`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[NAG]A:501	`10`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`16341`	`166.4`	`5.7`	`0.681`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[NAG]B:506	`12`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`16220`	`157.9`	`4.6`	`0.454`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]A:506	`12`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`16341`	`148.7`	`4.3`	`0.456`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.3`	`4.4`	`0.455`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[NAG]B:510	`13`	`1`	`352`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`16220`	`155.2`	`3.0`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[NAG]A:502	`12`	`1`	`355`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`16341`	`142.8`	`2.7`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		A	`21`	`6`	`16341`	`f`	[EPE]A:513	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`11`	`1`	`407`	`140.4`	`3.6`	`0.059`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		B	`20`	`6`	`16220`	`f`	[EPE]B:513	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`1`	`406`	`138.2`	`3.3`	`0.077`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[NAG]A:511	`10`	`1`	`354`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`16341`	`135.1`	`3.5`	`0.457`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[NAG]B:507	`11`	`1`	`352`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`16220`	`128.3`	`3.6`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[NAG]A:507	`11`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`16341`	`120.6`	`2.4`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`124.4`	`3.0`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[NAG]B:509	`9`	`1`	`354`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`16220`	`122.5`	`2.4`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[NAG]B:511	`9`	`1`	`355`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`16220`	`115.0`	`3.2`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[NAG]A:509	`10`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`16341`	`112.0`	`1.7`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		[NAG]B:502	`11`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`16220`	`111.4`	`3.5`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[NAG]A:507	`10`	`1`	`360`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`14`	`5`	`16341`	`104.8`	`0.8`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		[NAG]A:504	`12`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`16341`	`103.1`	`2.4`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[NAG]B:504	`10`	`1`	`358`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`16220`	`90.4`	`2.4`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`96.7`	`2.4`	`0.307`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		[NAG]A:508	`7`	`1`	`354`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`16341`	`98.9`	`3.4`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		[NAG]B:508	`9`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`16220`	`91.6`	`2.8`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		[NAG]A:508	`8`	`1`	`354`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`16220`	`89.7`	`2.2`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		[NAG]B:505	`9`	`1`	`357`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`8`	`3`	`16341`	`86.9`	`2.7`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`35`		B	`13`	`4`	`16220`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`7`	`1`	`16341`	`81.9`	`-0.5`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`36`		B	`11`	`3`	`16220`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`8`	`3`	`16341`	`80.1`	`-1.4`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`37`		[NAG]B:503	`7`	`1`	`358`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`16341`	`78.4`	`1.0`	`0.323`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`38`		[NAG]B:511	`7`	`1`	`355`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`16341`	`74.4`	`0.8`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		[NAG]A:504	`8`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`16220`	`73.4`	`1.4`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		A	`6`	`3`	`16341`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`10`	`3`	`16341`	`69.8`	`0.3`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		[NAG]B:509	`8`	`1`	`354`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`11`	`4`	`16220`	`54.9`	`0.6`	`0.198`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		[NAG]B:506	`4`	`1`	`359`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`16341`	`31.3`	`1.1`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		[NAG]B:511	`3`	`1`	`355`	`◊`	[NAG]A:508	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`354`	`30.9`	`1.0`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[NAG]B:511	`3`	`1`	`355`	`f`	[NAG]B:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`358`	`29.0`	`0.8`	`0.218`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		B	`4`	`3`	`16220`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`16341`	`24.8`	`0.7`	`0.814`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[NAG]B:504	`4`	`1`	`358`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`1`	`1`	`16220`	`24.4`	`1.2`	`0.370`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[NAG]A:511	`3`	`1`	`354`	`f`	[NAG]A:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`23.3`	`0.4`	`0.148`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`48`		[NAG]A:501	`2`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`16220`	`18.7`	`0.7`	`0.428`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`49`		B	`2`	`1`	`16220`	`◊`	[NAG]A:506	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`1`	`360`	`10.3`	`0.3`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[NAG]B:510	`2`	`1`	`352`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`16341`	`9.9`	`-0.2`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[NAG]B:510	`1`	`1`	`352`	`f`	[NAG]B:509	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`354`	`9.9`	`0.6`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		[NAG]A:505	`1`	`1`	`362`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`16341`	`5.9`	`0.3`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		[NAG]B:510	`1`	`1`	`352`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`16220`	`1.9`	`0.1`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[NAG]A:506	`1`	`1`	`360`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`16341`	`1.3`	`0.0`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[NAG]B:503	`1`	`1`	`358`	`◊`	[NAG]A:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`354`	`0.8`	`0.0`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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