PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=542-CN-H42)

Interfaces in PDB 4dvs crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF CLADE A/E 93TH057 HIV-1 GP120 CORE IN COMPLEX WITH NBD-557

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`50`	`18`	`16065`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`13`	`16199`	`437.5`	`3.4`	`0.862`	`14`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`42`	`19`	`16199`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`51`	`16`	`16199`	`411.9`	`-6.2`	`0.092`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`39`	`18`	`16065`	`x`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`42`	`13`	`16065`	`386.4`	`-4.8`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`399.2`	`-5.5`	`0.121`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		[0LY]B:512	`20`	`1`	`572`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`20`	`16065`	`318.6`	`0.2`	`0.317`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		[0LY]A:512	`20`	`1`	`566`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`20`	`16199`	`301.9`	`0.2`	`0.293`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		[NAG]B:503	`14`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`16065`	`215.8`	`5.8`	`0.532`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[NAG]A:503	`14`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`12`	`16199`	`212.8`	`5.1`	`0.443`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`214.3`	`5.4`	`0.488`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[EPE]A:513	`13`	`1`	`407`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`11`	`16199`	`185.3`	`6.2`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[EPE]B:513	`13`	`1`	`407`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`11`	`16065`	`177.5`	`6.0`	`0.245`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`181.4`	`6.1`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		[NAG]A:501	`12`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`16199`	`171.9`	`5.1`	`0.541`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[NAG]B:501	`10`	`1`	`358`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`16065`	`165.9`	`5.7`	`0.701`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`168.9`	`5.4`	`0.621`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[NAG]B:505	`13`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`8`	`16065`	`168.9`	`4.3`	`0.407`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[NAG]A:505	`13`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`8`	`16199`	`167.7`	`4.1`	`0.392`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`168.3`	`4.2`	`0.400`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		[NAG]B:506	`12`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`16065`	`151.5`	`3.8`	`0.375`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[NAG]A:506	`12`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`16199`	`141.5`	`3.8`	`0.403`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`146.5`	`3.8`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[NAG]B:507	`11`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`16065`	`137.4`	`3.9`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		B	`20`	`6`	`16065`	`f`	[EPE]B:513	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`1`	`407`	`134.9`	`2.7`	`0.093`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		[NAG]A:507	`12`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`16199`	`134.9`	`3.9`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		A	`24`	`6`	`16199`	`f`	[EPE]A:513	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`10`	`1`	`407`	`134.8`	`2.9`	`0.116`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]A:511	`10`	`1`	`354`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`16199`	`132.8`	`3.7`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]B:511	`9`	`1`	`355`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`16065`	`126.7`	`3.2`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`129.8`	`3.4`	`0.460`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`22`		[NAG]A:509	`11`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`16199`	`127.4`	`3.3`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[NAG]B:509	`10`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`16065`	`125.0`	`3.4`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`126.2`	`3.3`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		[NAG]B:510	`9`	`1`	`354`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`16065`	`124.3`	`2.6`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`25`		[NAG]B:502	`12`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`16065`	`121.4`	`4.0`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NAG]A:502	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`16199`	`106.8`	`2.4`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`114.1`	`3.2`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]A:510	`9`	`1`	`353`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`16199`	`117.7`	`2.9`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[NAG]A:508	`7`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`16199`	`101.9`	`3.7`	`0.625`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[NAG]A:504	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`16199`	`99.9`	`2.3`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[NAG]B:504	`11`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`16065`	`93.8`	`2.3`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`96.8`	`2.3`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[NAG]A:508	`9`	`1`	`361`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`16065`	`94.2`	`1.2`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`32`		[NAG]A:507	`8`	`1`	`360`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`13`	`4`	`16199`	`90.4`	`1.5`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`33`		B	`11`	`3`	`16065`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`9`	`3`	`16199`	`89.8`	`-0.8`	`0.403`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`34`		B	`14`	`4`	`16065`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`9`	`3`	`16199`	`86.3`	`-0.7`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`35`		[NAG]B:508	`9`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`16065`	`80.3`	`1.6`	`0.231`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		[NAG]B:503	`6`	`1`	`360`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`16199`	`78.1`	`1.0`	`0.371`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[NAG]A:504	`8`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`16065`	`76.1`	`2.1`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[NAG]B:511	`6`	`1`	`355`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16199`	`58.1`	`1.2`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`39`		A	`5`	`4`	`16199`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`8`	`4`	`16199`	`56.2`	`1.7`	`0.827`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`40`		[NAG]B:505	`5`	`1`	`361`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`6`	`3`	`16199`	`55.0`	`0.8`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		B	`5`	`3`	`16065`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`16199`	`48.5`	`0.4`	`0.647`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[NAG]B:511	`4`	`1`	`355`	`◊`	[NAG]A:508	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`48.2`	`1.7`	`0.164`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		[NAG]A:507	`5`	`1`	`360`	`◊`	[NAG]A:502	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`1`	`359`	`39.4`	`0.7`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		[NAG]B:506	`4`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`16199`	`38.7`	`1.4`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		[NAG]B:504	`4`	`1`	`360`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`2`	`2`	`16065`	`30.0`	`1.4`	`0.389`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		[NAG]A:511	`3`	`1`	`354`	`f`	[NAG]A:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`27.3`	`0.5`	`0.141`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[NAG]B:511	`1`	`1`	`355`	`f`	[NAG]B:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`360`	`25.5`	`0.7`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		A	`5`	`2`	`16199`	`◊`	[NAG]A:502	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`1`	`359`	`23.7`	`-0.2`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		[NAG]B:509	`5`	`1`	`359`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`6`	`3`	`16065`	`17.7`	`-0.1`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[NAG]A:505	`1`	`1`	`360`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`16199`	`6.3`	`0.3`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[NAG]B:510	`2`	`1`	`354`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`16199`	`5.6`	`0.2`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		[NAG]B:507	`1`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`16199`	`3.5`	`0.2`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		B	`4`	`1`	`16065`	`◊`	[NAG]A:506	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`361`	`3.3`	`0.1`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		[NAG]A:501	`1`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16065`	`2.9`	`-0.0`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`55`		[NAG]B:510	`1`	`1`	`354`	`f`	[NAG]B:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`359`	`2.8`	`0.2`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`56`		[NAG]B:502	`1`	`1`	`359`	`◊`	[0LY]A:512	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`566`	`2.3`	`0.0`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`57`		[NAG]B:510	`1`	`1`	`354`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`16065`	`0.5`	`0.0`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`58`		[NAG]A:509	`1`	`1`	`358`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`16199`	`0.4`	`0.0`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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