PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=494-I5-410)

Interfaces in PDB 4doc crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.95 Å

TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOCHLOROROMETHYLENE TRIPHOSPHATE:BINDING OF S-ISOMER

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`77`	`8`	`3788`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`26`	`17152`	`687.0`	`-4.4`	`0.452`	`12`	`0`	`0`	`0.093`
`2`		P	`43`	`9`	`2194`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`44`	`10`	`3788`	`431.8`	`-5.6`	`0.537`	`24`	`0`	`0`	`1.000`
`3`		D	`36`	`4`	`1361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`17152`	`366.4`	`-8.3`	`0.299`	`7`	`0`	`0`	`0.104`
`4`		[G1C]A:410	`31`	`1`	`609`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`19`	`17152`	`311.8`	`0.8`	`0.666`	`8`	`0`	`0`	`0.026`
`5`		A	`30`	`8`	`17152`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`24`	`7`	`17152`	`241.9`	`2.3`	`0.797`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
`6`		A	`25`	`9`	`17152`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`10`	`17152`	`238.4`	`4.6`	`0.931`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
`7`		D	`22`	`5`	`1361`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`23`	`5`	`3788`	`235.1`	`-3.6`	`0.532`	`16`	`0`	`0`	`1.000`
`8`		P	`25`	`3`	`2194`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`16`	`17152`	`229.6`	`-6.3`	`0.225`	`4`	`0`	`0`	`0.078`
`9`		A	`28`	`11`	`17152`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`26`	`10`	`17152`	`224.7`	`-2.7`	`0.209`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		A	`24`	`9`	`17152`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`2`	`2194`	`195.6`	`1.6`	`0.523`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`19`	`10`	`17152`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`6`	`17152`	`168.4`	`3.7`	`0.883`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
`12`		A	`15`	`8`	`17152`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`17`	`2`	`3788`	`156.6`	`-0.1`	`0.614`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`13`		[DOC]P:10	`10`	`1`	`422`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`17152`	`116.4`	`0.5`	`0.401`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
`14`		[DOC]P:10	`14`	`1`	`422`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`2194`	`113.0`	`2.6`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		A	`12`	`4`	`17152`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`8`	`3`	`17152`	`102.1`	`-1.8`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		D	`14`	`1`	`1361`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`3`	`17152`	`100.1`	`1.9`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		[DOC]P:10	`12`	`1`	`422`	`◊`	[G1C]A:410	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`609`	`93.0`	`2.8`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		T	`10`	`2`	`3788`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`3`	`17152`	`82.7`	`-1.2`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		[G1C]A:410	`8`	`1`	`609`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`3788`	`76.0`	`0.8`	`0.630`	`3`	`0`	`0`	`0.005`
`20`		[CL]A:407	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`17152`	`74.5`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.107`
`21`		[CL]A:405	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17152`	`73.4`	`-12.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
`22`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`17152`	`67.9`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
`23`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17152`	`64.0`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
`24`		A	`6`	`2`	`17152`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`8`	`2`	`3788`	`62.7`	`-1.7`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`25`		[CL]A:409	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17152`	`62.3`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
`26`		[DOC]P:10	`5`	`1`	`422`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3788`	`61.3`	`0.1`	`0.443`	`3`	`0`	`0`	`0.083`
`27`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17152`	`59.7`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.091`
`28`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17152`	`56.9`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
`29`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`17152`	`40.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
`30`		D	`5`	`1`	`1361`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`5`	`1`	`3788`	`35.2`	`0.4`	`0.600`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`31`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2194`	`33.9`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
`32`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17152`	`33.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
`33`		[G1C]A:410	`5`	`1`	`609`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.4`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
`34`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1361`	`28.0`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
`35`		[DOC]P:10	`6`	`1`	`422`	`◊`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`26.7`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
`36`		[G1C]A:410	`4`	`1`	`609`	`f`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`25.8`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
`37`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1361`	`16.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
`38`		A	`2`	`1`	`17152`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`3788`	`11.2`	`-0.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`39`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.1`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
`40`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3788`	`6.8`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
`41`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3788`	`6.4`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
`42`		A	`2`	`1`	`17152`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`17152`	`4.0`	`-0.1`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`43`		A	`1`	`1`	`17152`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`17152`	`1.9`	`-0.1`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`44`		A	`1`	`1`	`17152`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2194`	`1.4`	`-0.1`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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