PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=226-I4-94P)

Interfaces in PDB 4dmt crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.39 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A VWF BINDING COLLAGEN III DERIVED TRIPLE HELICAL PEPTIDE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`94`	`30`	`3636`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`104`	`30`	`3636`	`819.3`	`-8.8`	`0.981`	`10`	`0`	`0`	`0.276`
2	`2`		B	`93`	`30`	`3636`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`103`	`30`	`3611`	`809.9`	`-9.6`	`0.978`	`10`	`0`	`0`	`0.292`
3	`3`		C	`96`	`29`	`3636`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`83`	`29`	`3611`	`741.0`	`-7.7`	`0.981`	`11`	`0`	`0`	`0.261`
4	`4`		A	`28`	`9`	`3611`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`26`	`9`	`3636`	`224.6`	`-3.8`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`20`	`7`	`3611`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`19`	`8`	`3611`	`185.4`	`-3.6`	`0.756`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		B	`19`	`7`	`3636`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`7`	`3636`	`136.7`	`-3.1`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		C	`10`	`3`	`3636`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`21`	`7`	`3636`	`132.0`	`-0.9`	`0.907`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`18`	`6`	`3611`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`5`	`3611`	`131.0`	`-1.7`	`0.839`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`14`	`5`	`3636`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`5`	`3636`	`113.1`	`-2.0`	`0.786`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		B	`14`	`6`	`3636`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`15`	`5`	`3611`	`99.0`	`-2.3`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		B	`15`	`5`	`3636`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`13`	`4`	`3636`	`98.3`	`-2.3`	`0.709`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`10`	`3`	`3636`	`◊`	A	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`13`	`5`	`3611`	`96.4`	`-2.7`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[GOL]C:101	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`3636`	`87.6`	`-0.9`	`0.673`	`2`	`0`	`0`	`0.093`
14	`14`		C	`12`	`5`	`3636`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`3`	`3636`	`83.5`	`-0.3`	`0.886`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		B	`6`	`3`	`3636`	`◊`	C	x-2,y,z-1	`1_354`	`8`	`3`	`3636`	`75.7`	`-1.8`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		C	`12`	`5`	`3636`	`x`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`3`	`3636`	`74.2`	`0.2`	`0.927`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		C	`10`	`4`	`3636`	`x`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`6`	`3`	`3636`	`73.1`	`-2.3`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		A	`9`	`5`	`3611`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`3636`	`71.9`	`-1.8`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[GOL]B:101	`4`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`3636`	`68.6`	`-0.7`	`0.636`	`1`	`0`	`0`	`0.042`
20	`20`		B	`13`	`5`	`3636`	`f`	[GOL]C:102	x-2,y,z-1	`1_354`	`6`	`1`	`218`	`63.0`	`-0.5`	`0.711`	`2`	`0`	`0`	`0.053`
21	`21`		[GOL]A:101	`5`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`3611`	`59.3`	`-0.2`	`0.698`	`3`	`0`	`0`	`0.102`
22	`22`		B	`10`	`3`	`3636`	`◊`	[GOL]B:101	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`219`	`57.3`	`-0.6`	`0.684`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		A	`7`	`3`	`3611`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`7`	`3`	`3636`	`54.1`	`-0.7`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		[GOL]C:102	`5`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`3636`	`53.0`	`-0.1`	`0.728`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		[NH2]C:31	`1`	`1`	`117`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3636`	`50.2`	`0.2`	`0.791`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NH2]B:31	`1`	`1`	`117`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3636`	`34.3`	`0.0`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[NH2]A:31	`1`	`1`	`117`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3611`	`32.9`	`0.0`	`0.807`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`39.1`	`0.1`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		C	`5`	`2`	`3636`	`◊`	A	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`6`	`2`	`3611`	`50.0`	`-1.4`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		B	`11`	`5`	`3636`	`◊`	[GOL]A:101	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`3`	`1`	`219`	`49.6`	`-0.3`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		C	`5`	`1`	`3636`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`6`	`2`	`3611`	`44.3`	`-0.0`	`0.843`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		B	`5`	`1`	`3636`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`3611`	`41.4`	`-0.4`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		C	`4`	`2`	`3636`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`3611`	`39.4`	`-1.0`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		A	`4`	`2`	`3611`	`◊`	C	x-2,y,z-1	`1_354`	`8`	`4`	`3636`	`39.3`	`-0.5`	`0.784`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		B	`5`	`2`	`3636`	`◊`	A	x-2,y,z-1	`1_354`	`3`	`2`	`3611`	`37.8`	`-1.0`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`171`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3636`	`36.8`	`-0.2`	`0.888`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
34	`36`		B	`6`	`2`	`3636`	`x`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`9`	`4`	`3636`	`34.7`	`-0.8`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[ACE]C:0	`2`	`1`	`172`	`c`	[ACE]B:0	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`171`	`34.7`	`-0.9`	`0.615`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
36	`38`		C	`9`	`4`	`3636`	`◊`	[GOL]C:101	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`2`	`1`	`220`	`34.4`	`-0.3`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		C	`4`	`2`	`3636`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`4`	`2`	`3636`	`32.6`	`-1.0`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		B	`5`	`2`	`3636`	`◊`	[GOL]A:101	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`4`	`1`	`219`	`31.1`	`-0.4`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[GOL]C:102	`4`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]C:101	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`5`	`1`	`220`	`30.9`	`0.1`	`0.585`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[GOL]B:101	`3`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3611`	`30.5`	`-0.2`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
41	`43`		B	`4`	`2`	`3636`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`2`	`3636`	`30.2`	`-0.7`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		A	`3`	`1`	`3611`	`x`	A	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`5`	`2`	`3611`	`30.1`	`-1.5`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		[NH2]A:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3636`	`30.0`	`0.5`	`0.946`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`172`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3636`	`29.6`	`-0.3`	`0.811`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
45	`47`		A	`3`	`2`	`3611`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`3636`	`29.4`	`0.0`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`172`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`3611`	`28.9`	`-0.6`	`0.791`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
47	`49`		A	`5`	`2`	`3611`	`x`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`3`	`2`	`3611`	`28.6`	`-0.9`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[ACE]C:0	`2`	`1`	`172`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3636`	`28.1`	`-0.2`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
49	`51`		[ACE]B:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`3636`	`27.2`	`-0.6`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		[ACE]B:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3611`	`27.1`	`-0.2`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
51	`53`		[NH2]B:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3636`	`27.0`	`0.3`	`0.941`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NH2]A:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3636`	`23.5`	`0.2`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.2`	`0.3`	`0.937`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		C	`3`	`2`	`3636`	`◊`	[GOL]C:102	x-2,y,z-1	`1_354`	`2`	`1`	`218`	`25.6`	`-0.4`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
53	`56`		C	`2`	`1`	`3636`	`◊`	[GOL]A:101	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`3`	`1`	`219`	`24.8`	`-0.4`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[GOL]C:102	`3`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`3611`	`24.0`	`-0.3`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`3636`	`23.9`	`-0.4`	`0.819`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
56	`59`		A	`2`	`1`	`3611`	`◊`	[GOL]A:101	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`4`	`1`	`219`	`23.4`	`-0.7`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		[GOL]A:101	`3`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`3636`	`22.6`	`-0.6`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
58	`61`		C	`4`	`2`	`3636`	`x`	C	x-2,y,z-1	`1_354`	`5`	`2`	`3636`	`22.5`	`-0.5`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`62`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`172`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`3636`	`22.5`	`-0.5`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`63`		C	`4`	`1`	`3636`	`◊`	[GOL]B:101	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`219`	`20.9`	`-0.0`	`0.593`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`64`		[NH2]C:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	[NH2]B:31	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`117`	`20.3`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`65`		B	`2`	`1`	`3636`	`x`	B	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`3`	`1`	`3636`	`20.0`	`-0.4`	`0.581`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`66`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`172`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`3636`	`19.7`	`0.4`	`0.952`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
64	`67`		B	`4`	`2`	`3636`	`◊`	A	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`2`	`2`	`3611`	`19.1`	`-0.2`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`68`		[NH2]C:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3636`	`19.1`	`0.0`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	`69`		[NH2]B:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3611`	`14.9`	`-0.1`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`17.0`	`-0.0`	`0.782`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
66	`70`		A	`3`	`1`	`3611`	`◊`	[ACE]C:0	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`3`	`1`	`172`	`17.0`	`0.3`	`0.945`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
67	`71`		C	`3`	`2`	`3636`	`◊`	B	-x+3,y-1/2,-z+1	`2_846`	`3`	`2`	`3636`	`16.9`	`-0.5`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`72`		B	`2`	`1`	`3636`	`◊`	[GOL]C:102	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`2`	`1`	`218`	`16.8`	`-0.5`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`73`		[GOL]C:101	`3`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3636`	`16.7`	`-0.5`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
70	`74`		B	`2`	`1`	`3636`	`◊`	[GOL]C:101	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`220`	`16.1`	`-0.4`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`75`		[NH2]B:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	[NH2]A:31	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`117`	`15.5`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`76`		[GOL]C:101	`1`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`3611`	`14.5`	`-0.1`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
73	`77`		[ACE]B:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`3636`	`12.9`	`-0.3`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`78`		A	`3`	`1`	`3611`	`◊`	[ACE]B:0	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`2`	`1`	`171`	`10.9`	`0.1`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`79`		A	`2`	`2`	`3611`	`◊`	C	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`2`	`2`	`3636`	`8.9`	`0.0`	`0.746`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`80`		B	`4`	`2`	`3636`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`3636`	`8.7`	`-0.1`	`0.760`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`81`		[GOL]B:101	`1`	`1`	`219`	`◊`	[GOL]A:101	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`219`	`7.2`	`0.1`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`82`		C	`1`	`1`	`3636`	`◊`	[NH2]B:31	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`117`	`4.5`	`-0.0`	`0.731`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`83`		[GOL]C:102	`1`	`1`	`218`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`1`	`1`	`3636`	`3.9`	`-0.1`	`0.520`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`84`		C	`1`	`1`	`3636`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`2`	`1`	`3611`	`2.8`	`-0.1`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`85`		[NH2]C:31	`1`	`1`	`117`	`◊`	[NH2]A:31	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`117`	`2.5`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`86`		C	`1`	`1`	`3636`	`◊`	[NH2]C:31	x-2,y,z-1	`1_354`	`1`	`1`	`117`	`0.5`	`-0.0`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`87`		A	`1`	`1`	`3611`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`3636`	`0.3`	`-0.0`	`0.706`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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