PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=521-0C-O4G)

Interfaces in PDB 4dkr crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.80 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF CLADE A/E 93TH057 HIV-1 GP120 CORE IN COMPLEX WITH AWS-I-169

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`47`	`17`	`16204`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`38`	`12`	`16035`	`394.8`	`1.2`	`0.771`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`41`	`21`	`16035`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`44`	`15`	`16035`	`393.8`	`-6.4`	`0.081`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`31`	`14`	`16204`	`x`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`44`	`14`	`16204`	`365.6`	`-3.8`	`0.202`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`379.7`	`-5.1`	`0.142`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		[0LJ]C:513	`27`	`1`	`608`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`51`	`23`	`16204`	`354.5`	`-6.2`	`0.296`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		[0LJ]A:513	`25`	`1`	`607`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`23`	`16035`	`343.6`	`-5.8`	`0.345`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`349.0`	`-6.0`	`0.321`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		[NAG]A:503	`14`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`12`	`16035`	`221.8`	`6.0`	`0.559`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[NAG]C:503	`14`	`1`	`359`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`12`	`16204`	`207.8`	`5.6`	`0.522`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`214.8`	`5.8`	`0.541`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		[EPE]C:512	`13`	`1`	`401`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`16204`	`177.5`	`6.4`	`0.270`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[EPE]A:512	`13`	`1`	`401`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`10`	`16035`	`174.7`	`6.2`	`0.266`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`176.1`	`6.3`	`0.268`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		[NAG]C:505	`13`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`29`	`8`	`16204`	`175.8`	`4.5`	`0.417`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[NAG]A:505	`13`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`16035`	`168.1`	`4.4`	`0.437`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`171.9`	`4.5`	`0.427`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		[NAG]C:502	`11`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`16204`	`167.1`	`5.1`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[NAG]A:501	`10`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`16035`	`162.8`	`5.6`	`0.685`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`165.0`	`5.4`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		[NAG]C:506	`12`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`16204`	`159.1`	`4.8`	`0.476`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`15`		[NAG]A:506	`10`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`16035`	`135.4`	`3.7`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[NAG]A:511	`9`	`1`	`353`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`16035`	`131.9`	`3.7`	`0.493`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		A	`17`	`5`	`16035`	`f`	[EPE]A:512	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`10`	`1`	`401`	`131.5`	`3.6`	`0.103`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		C	`21`	`6`	`16204`	`f`	[EPE]C:512	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`1`	`401`	`130.4`	`3.1`	`0.072`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`131.0`	`3.3`	`0.088`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
12	`19`		[NAG]C:507	`12`	`1`	`357`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`16204`	`128.3`	`2.9`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		[NAG]C:509	`10`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`16204`	`125.5`	`3.6`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]A:509	`10`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`16035`	`124.7`	`3.5`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`125.1`	`3.6`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		[NAG]A:510	`9`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`16035`	`118.3`	`2.3`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		[NAG]A:507	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`16035`	`117.2`	`3.2`	`0.317`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		[NAG]C:501	`12`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`16204`	`114.4`	`2.7`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`25`		[NAG]C:511	`11`	`1`	`356`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`16204`	`113.2`	`3.3`	`0.355`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`26`		[NAG]A:502	`9`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`16035`	`112.4`	`2.8`	`0.422`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`27`		[NAG]C:510	`9`	`1`	`354`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`16204`	`106.5`	`2.8`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`28`		[NAG]A:504	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`16035`	`99.0`	`2.3`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[NAG]C:504	`11`	`1`	`360`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`16204`	`98.9`	`2.3`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`98.9`	`2.3`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		C	`11`	`4`	`16204`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`4`	`16035`	`98.3`	`0.1`	`0.625`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		C	`15`	`5`	`16204`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`10`	`3`	`16035`	`95.3`	`-0.7`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[NAG]C:505	`10`	`1`	`361`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`10`	`3`	`16035`	`94.9`	`1.0`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		[NAG]C:508	`10`	`1`	`364`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`16204`	`94.7`	`2.4`	`0.301`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[NAG]A:508	`6`	`1`	`354`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`16035`	`92.9`	`2.8`	`0.581`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`35`		[NAG]A:507	`9`	`1`	`359`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`14`	`4`	`16035`	`89.7`	`0.8`	`0.173`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`36`		[NAG]A:508	`8`	`1`	`354`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`16204`	`89.5`	`1.8`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`37`		[NAG]C:511	`7`	`1`	`356`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`16035`	`80.1`	`1.4`	`0.357`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`38`		[NAG]C:503	`6`	`1`	`359`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`16035`	`78.5`	`1.2`	`0.379`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		[NAG]A:504	`8`	`1`	`359`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`16204`	`69.5`	`1.2`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		[NAG]C:506	`4`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`16035`	`45.5`	`1.7`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`41`		C	`5`	`2`	`16204`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`16035`	`32.7`	`0.6`	`0.787`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		[NAG]C:511	`3`	`1`	`356`	`◊`	[NAG]A:508	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`354`	`32.2`	`1.5`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`43`		[NAG]C:511	`3`	`1`	`356`	`f`	[NAG]C:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`359`	`30.1`	`1.0`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`44`		A	`2`	`1`	`16035`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`2`	`16035`	`29.1`	`0.4`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`45`		[NAG]A:511	`3`	`1`	`353`	`f`	[NAG]A:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`358`	`29.0`	`0.7`	`0.212`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`46`		[NAG]C:509	`5`	`1`	`361`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`16204`	`27.3`	`0.6`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		[NAG]A:501	`1`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16204`	`14.8`	`-0.0`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[NAG]C:504	`4`	`1`	`360`	`◊`	C	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`1`	`1`	`16204`	`12.2`	`0.4`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`49`		[NAG]A:510	`2`	`1`	`356`	`f`	[NAG]A:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`361`	`8.4`	`0.5`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`50`		[NAG]C:503	`3`	`1`	`359`	`◊`	[NAG]A:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`354`	`7.6`	`0.4`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`51`		C	`3`	`1`	`16204`	`◊`	[NAG]A:506	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`362`	`4.3`	`0.0`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`52`		[NAG]A:502	`1`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16204`	`1.4`	`0.1`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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