PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=743-H9-334)

Interfaces in PDB 4d5e crystal.
Space symmetry group: P 41 21 2. Resolution: 1.43 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT WILDTYPE CDH

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`524`	`131`	`24975`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`519`	`130`	`24491`	`4845.7`	`-66.0`	`0.001`	`35`	`10`	`0`	`0.542`
2	`2`		B	`190`	`54`	`24975`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`192`	`54`	`24491`	`1726.1`	`-9.8`	`0.501`	`24`	`20`	`0`	`0.241`
3	`3`		A	`157`	`47`	`24491`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`154`	`47`	`24491`	`1400.7`	`-1.3`	`0.811`	`18`	`6`	`0`	`0.059`
	`4`		B	`160`	`47`	`24975`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`157`	`47`	`24975`	`1262.5`	`-1.8`	`0.740`	`18`	`4`	`0`	`0.059`
	*Average:*													`1331.6`	`-1.6`	`0.776`	`18`	`5`	`0`	`0.059`
4	`5`		[FAD]B:1589	`53`	`1`	`986`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`114`	`43`	`24975`	`734.1`	`-10.7`	`0.467`	`16`	`0`	`0`	`0.356`
	`6`		[FAD]A:1588	`52`	`1`	`983`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`118`	`43`	`24491`	`732.8`	`-9.7`	`0.525`	`16`	`0`	`0`	`0.356`
	*Average:*													`733.5`	`-10.2`	`0.496`	`16`	`0`	`0`	`0.356`
5	`7`		A	`91`	`28`	`24491`	`x`	A	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`70`	`20`	`24491`	`661.7`	`1.7`	`0.777`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
6	`8`		B	`41`	`15`	`24975`	`◊`	A	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`44`	`18`	`24491`	`334.6`	`-0.8`	`0.648`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`9`		[2PE]B:1597	`22`	`1`	`623`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`24975`	`295.5`	`2.8`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		[TPP]B:1590	`26`	`1`	`594`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`21`	`24975`	`293.4`	`-7.7`	`0.455`	`14`	`0`	`0`	`0.286`
	`11`		[TPP]A:1589	`26`	`1`	`593`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`20`	`24491`	`292.5`	`-7.7`	`0.442`	`14`	`0`	`0`	`0.286`
	*Average:*													`292.9`	`-7.7`	`0.449`	`14`	`0`	`0`	`0.286`
9	`12`		B	`31`	`10`	`24975`	`◊`	B	-y-1,-x-1,-z-1/2	`8_444`	`33`	`11`	`24975`	`283.0`	`2.8`	`0.900`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
10	`13`		B	`33`	`10`	`24975`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z+1/4	`5_445`	`34`	`13`	`24491`	`277.9`	`-0.6`	`0.630`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
11	`14`		[P6G]A:1595	`17`	`1`	`514`	`◊`	A	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`41`	`13`	`24491`	`258.4`	`3.2`	`0.704`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[MES]A:1590	`12`	`1`	`333`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`12`	`24491`	`197.9`	`6.4`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[PG4]B:1602	`8`	`1`	`304`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`34`	`9`	`24975`	`194.6`	`5.6`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		A	`34`	`11`	`24491`	`◊`	[2PE]A:1598	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`13`	`1`	`423`	`181.2`	`2.5`	`0.516`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[2PE]B:1595	`17`	`1`	`565`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`30`	`11`	`24975`	`172.7`	`-1.3`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
16	`19`		[PG4]A:1596	`11`	`1`	`351`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`24491`	`171.2`	`5.5`	`0.163`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[2PE]B:1595	`17`	`1`	`565`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`12`	`24975`	`169.5`	`1.6`	`0.515`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[PG4]B:1599	`10`	`1`	`372`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`24975`	`165.7`	`5.0`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[2PE]B:1595	`19`	`1`	`565`	`◊`	[2PE]B:1595	y,x,-z	`7_555`	`19`	`1`	`565`	`162.5`	`1.4`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[P6G]A:1593	`12`	`1`	`400`	`◊`	A	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`23`	`8`	`24491`	`160.2`	`2.2`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[MES]B:1591	`11`	`1`	`344`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`24975`	`153.8`	`4.1`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[1PG]A:1594	`12`	`1`	`391`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`24491`	`149.0`	`5.3`	`0.047`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[PG4]B:1600	`8`	`1`	`294`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`24975`	`147.7`	`4.2`	`0.381`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[TPP]B:1590	`13`	`1`	`594`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`24491`	`135.8`	`1.2`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[TPP]A:1589	`13`	`1`	`593`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`24975`	`135.1`	`1.1`	`0.705`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`135.5`	`1.1`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		[PG4]B:1601	`9`	`1`	`324`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`24975`	`125.7`	`5.9`	`0.113`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[PG4]A:1600	`9`	`1`	`382`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`24491`	`121.9`	`4.2`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[P6G]A:1593	`10`	`1`	`400`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`24491`	`118.6`	`-1.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[PEG]A:1597	`7`	`1`	`262`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`24491`	`114.3`	`4.8`	`0.454`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		B	`11`	`3`	`24975`	`x`	B	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`11`	`4`	`24975`	`107.4`	`0.3`	`0.613`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[PG4]A:1599	`6`	`1`	`251`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`24491`	`102.9`	`4.0`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[PG4]B:1596	`10`	`1`	`364`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`24491`	`98.7`	`3.5`	`0.144`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[2PE]A:1598	`7`	`1`	`423`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24491`	`98.4`	`3.0`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[PG4]B:1596	`9`	`1`	`364`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`15`	`7`	`24975`	`93.1`	`3.0`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		[PG4]B:1598	`5`	`1`	`249`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`24975`	`79.8`	`2.3`	`0.160`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[P6G]A:1595	`8`	`1`	`514`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24491`	`78.6`	`-0.6`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
36	`40`		[PG4]B:1596	`8`	`1`	`364`	`f`	A	y,x,-z	`7_555`	`8`	`3`	`24491`	`77.8`	`1.2`	`0.058`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[PG4]B:1596	`4`	`1`	`364`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`24975`	`77.2`	`2.2`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`42`		B	`9`	`3`	`24975`	`f`	[PG4]A:1600	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`10`	`1`	`382`	`76.5`	`1.5`	`0.162`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`43`		A	`12`	`3`	`24491`	`◊`	[PG4]A:1600	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`6`	`1`	`382`	`74.3`	`1.7`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[PG4]B:1598	`6`	`1`	`249`	`◊`	B	x-1/2,-y-3/2,-z-1/4	`6_434`	`12`	`5`	`24975`	`73.1`	`2.5`	`0.067`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`45`		[P6G]A:1595	`8`	`1`	`514`	`◊`	[2PE]A:1598	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`5`	`1`	`423`	`62.1`	`0.0`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		A	`10`	`3`	`24491`	`f`	[1PG]A:1594	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`4`	`1`	`391`	`58.5`	`1.7`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		A	`3`	`1`	`24491`	`◊`	[MES]B:1591	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`7`	`1`	`344`	`52.7`	`1.7`	`0.064`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		A	`7`	`3`	`24491`	`◊`	[PG4]A:1599	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`2`	`1`	`251`	`47.8`	`1.5`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		[P6G]A:1593	`2`	`1`	`400`	`f`	[2PE]A:1598	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`4`	`1`	`423`	`44.6`	`-1.7`	`0.175`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
46	`50`		[PG4]A:1596	`4`	`1`	`351`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`9`	`4`	`24975`	`44.5`	`1.4`	`0.217`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`51`		[MG]B:1593	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`24975`	`42.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
48	`52`		[CL]A:1591	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24491`	`40.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
	`53`		[CL]B:1592	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24975`	`40.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
	*Average:*													`40.5`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
49	`54`		[P6G]A:1595	`2`	`1`	`514`	`◊`	[P6G]A:1593	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`400`	`37.3`	`1.9`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[MG]B:1594	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`24975`	`37.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
	`56`		[MG]A:1592	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`24491`	`37.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
	*Average:*													`37.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.127`
51	`57`		[PEG]A:1597	`5`	`1`	`262`	`f`	[PEG]A:1597	y,x,-z	`7_555`	`5`	`1`	`262`	`35.6`	`1.7`	`0.103`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`58`		[CL]B:1592	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`24491`	`35.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	`59`		[CL]A:1591	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`24975`	`35.2`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	*Average:*													`35.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
53	`60`		[PG4]B:1599	`3`	`1`	`372`	`◊`	B	-y-1,-x-1,-z-1/2	`8_444`	`6`	`2`	`24975`	`35.5`	`1.2`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[CL]B:1592	`1`	`1`	`125`	`◊`	[TPP]A:1589	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`593`	`33.1`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
	`62`		[CL]A:1591	`1`	`1`	`125`	`◊`	[TPP]B:1590	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`594`	`32.8`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
	*Average:*													`33.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
55	`63`		[PG4]B:1601	`2`	`1`	`324`	`◊`	[PG4]A:1596	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`351`	`33.0`	`2.0`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		[PG4]B:1600	`3`	`1`	`294`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`7`	`3`	`24491`	`32.8`	`0.7`	`0.343`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`65`		A	`2`	`1`	`24491`	`◊`	B	-y-1/2,x+1/2,z+1/4	`3_455`	`5`	`1`	`24975`	`31.4`	`0.4`	`0.780`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
58	`66`		[MG]A:1592	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]A:1589	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`593`	`30.5`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`67`		[MG]B:1594	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]B:1590	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`594`	`30.3`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	*Average:*													`30.4`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
59	`68`		[2PE]B:1595	`3`	`1`	`565`	`◊`	[PG4]B:1602	y,x,-z	`7_555`	`4`	`1`	`304`	`29.0`	`1.0`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`69`		[PG4]B:1601	`5`	`1`	`324`	`◊`	[PG4]B:1601	y,x,-z	`7_555`	`5`	`1`	`324`	`28.0`	`1.2`	`0.002`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`70`		[2PE]B:1597	`2`	`1`	`623`	`◊`	A	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`2`	`1`	`24491`	`25.3`	`0.1`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`71`		[MG]B:1593	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`7`	`4`	`24975`	`24.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
63	`72`		[2PE]B:1595	`3`	`1`	`565`	`f`	[PG4]B:1602	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`304`	`20.4`	`1.1`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`73`		[PG4]B:1602	`1`	`1`	`304`	`f`	[MG]B:1593	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
65	`74`		B	`3`	`2`	`24975`	`x`	B	x-1/2,-y-3/2,-z-1/4	`6_434`	`5`	`3`	`24975`	`19.6`	`-0.2`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`75`		[PG4]A:1599	`2`	`1`	`251`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`24975`	`14.3`	`0.5`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`76`		[MES]B:1591	`4`	`1`	`344`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`24491`	`14.2`	`0.3`	`0.075`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`77`		[PG4]B:1602	`3`	`1`	`304`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`4`	`3`	`24975`	`13.0`	`0.4`	`0.154`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`78`		[PG4]A:1599	`2`	`1`	`251`	`f`	[MES]B:1591	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`344`	`11.2`	`0.3`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`79`		[2PE]B:1595	`2`	`1`	`565`	`◊`	[MG]B:1593	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`98`	`8.6`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
71	`80`		[FAD]B:1589	`1`	`1`	`986`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24491`	`6.7`	`-0.5`	`0.238`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`81`		[FAD]A:1588	`1`	`1`	`983`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24975`	`6.1`	`-0.5`	`0.251`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`6.4`	`-0.5`	`0.244`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
72	`82`		A	`1`	`1`	`24491`	`◊`	B	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`1`	`1`	`24975`	`5.2`	`0.2`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`83`		[PG4]A:1596	`1`	`1`	`351`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`24975`	`4.8`	`0.2`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`84`		[PG4]B:1600	`1`	`1`	`294`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`24491`	`4.0`	`0.2`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`85`		A	`1`	`1`	`24491`	`x`	A	-x-1/2,y-1/2,-z+1/4	`5_445`	`1`	`1`	`24491`	`2.5`	`-0.1`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`86`		[PG4]B:1601	`1`	`1`	`324`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24491`	`1.7`	`0.0`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`87`		[PG4]B:1599	`1`	`1`	`372`	`f`	[PG4]B:1599	-y-1,-x-1,-z-1/2	`8_444`	`1`	`1`	`372`	`1.6`	`0.1`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`88`		[2PE]B:1595	`2`	`1`	`565`	`f`	[MG]B:1593	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.3`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`89`		[2PE]B:1597	`1`	`1`	`623`	`f`	B	-y-1/2,x-1/2,z+1/4	`3_445`	`1`	`1`	`24975`	`1.0`	`-0.1`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`90`		[PG4]B:1602	`1`	`1`	`304`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z+1/4	`5_445`	`1`	`1`	`24491`	`0.4`	`0.0`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`91`		[PG4]B:1601	`1`	`1`	`324`	`f`	B	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`24975`	`0.4`	`0.0`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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