PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=717-HI-3MD)

Interfaces in PDB 4d0t crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.45 Å

GALNAC-T2 CRYSTAL SOAKED WITH UDP-GALNAC, EA2 PEPTIDE AND MANGANESE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`164`	`51`	`21673`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`168`	`50`	`21688`	`1605.3`	`-10.7`	`0.228`	`15`	`1`	`0`	`0.315`
	`2`		D	`167`	`53`	`21634`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`154`	`50`	`21628`	`1509.5`	`-11.0`	`0.228`	`14`	`0`	`0`	`0.315`
	`3`		E	`149`	`46`	`21416`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`147`	`44`	`21545`	`1358.0`	`-8.2`	`0.338`	`13`	`0`	`0`	`0.315`
	*Average:*													`1490.9`	`-10.0`	`0.265`	`14`	`0`	`0`	`0.315`
2	`4`		[UD2]F:1567	`39`	`1`	`724`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`72`	`28`	`21673`	`504.1`	`-6.8`	`0.404`	`20`	`0`	`0`	`0.506`
	`5`		[UD2]E:1571	`38`	`1`	`724`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`69`	`28`	`21416`	`503.2`	`-6.5`	`0.438`	`21`	`0`	`0`	`0.506`
	`6`		[UD2]D:1571	`38`	`1`	`725`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`71`	`27`	`21634`	`500.0`	`-6.4`	`0.441`	`19`	`0`	`0`	`0.506`
	`7`		[UD2]A:1574	`38`	`1`	`717`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`27`	`21628`	`498.4`	`-7.0`	`0.411`	`21`	`0`	`0`	`0.506`
	`8`		[UD2]B:1573	`39`	`1`	`723`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`72`	`28`	`21545`	`474.7`	`-5.8`	`0.433`	`20`	`0`	`0`	`0.506`
	*Average:*													`496.1`	`-6.5`	`0.426`	`20`	`0`	`0`	`0.506`
3	`9`		P	`44`	`7`	`955`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`67`	`22`	`21688`	`482.0`	`-7.3`	`0.274`	`3`	`0`	`0`	`0.346`
4	`10`		Z	`35`	`6`	`818`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`66`	`22`	`21545`	`464.0`	`-6.9`	`0.345`	`5`	`0`	`0`	`0.298`
5	`11`		F	`59`	`15`	`21673`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`12`	`21545`	`410.3`	`1.4`	`0.754`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`44`	`13`	`21634`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`4_644`	`54`	`15`	`21628`	`402.7`	`0.1`	`0.674`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		E	`55`	`13`	`21416`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`45`	`13`	`21688`	`396.3`	`2.0`	`0.786`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`403.1`	`1.2`	`0.738`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
6	`14`		E	`51`	`18`	`21416`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`16`	`21628`	`403.3`	`-5.5`	`0.192`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`15`		B	`48`	`17`	`21545`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`41`	`14`	`21634`	`401.0`	`2.3`	`0.827`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
8	`16`		D	`48`	`10`	`21634`	`◊`	F	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`51`	`15`	`21673`	`391.6`	`0.9`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		C	`42`	`12`	`21688`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`37`	`13`	`21628`	`316.3`	`0.4`	`0.688`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`18`		E	`29`	`10`	`21416`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`4_644`	`31`	`9`	`21634`	`222.6`	`-0.9`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`269.5`	`-0.3`	`0.615`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`19`		[UDP]C:1571	`24`	`1`	`512`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`52`	`21`	`21688`	`298.6`	`-5.8`	`0.579`	`13`	`0`	`0`	`0.466`
11	`20`		C	`25`	`10`	`21688`	`x`	C	x-1/2,-y+1/2,-z	`3_455`	`31`	`7`	`21688`	`269.2`	`-4.2`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		F	`30`	`10`	`21673`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`34`	`11`	`21545`	`243.7`	`1.0`	`0.730`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
13	`22`		E	`24`	`8`	`21416`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`11`	`21634`	`242.3`	`-0.1`	`0.625`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`23`		B	`27`	`10`	`21545`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`21628`	`240.0`	`-0.2`	`0.608`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`241.2`	`-0.2`	`0.616`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
14	`24`		E	`31`	`9`	`21416`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`27`	`8`	`21628`	`241.9`	`4.5`	`0.940`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
15	`25`		A	`23`	`7`	`21628`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`21`	`9`	`21688`	`190.4`	`0.6`	`0.617`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
16	`26`		[NGA]P:1572	`14`	`1`	`364`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`37`	`15`	`21688`	`173.8`	`3.0`	`0.412`	`8`	`0`	`0`	`0.023`
17	`27`		B	`24`	`5`	`21545`	`x`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`18`	`5`	`21545`	`149.0`	`-1.6`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`28`		[EDO]D:1572	`4`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`21634`	`112.7`	`3.6`	`0.505`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
19	`29`		[EDO]E:1572	`4`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`21416`	`109.9`	`3.0`	`0.445`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		[EDO]A:1572	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`21628`	`93.8`	`2.5`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[EDO]C:1573	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`21688`	`89.2`	`2.2`	`0.421`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`32`		[EDO]B:1572	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`21545`	`89.1`	`1.9`	`0.229`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`33`		[EDO]C:1574	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`21688`	`89.0`	`2.4`	`0.262`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`34`		[EDO]A:1573	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`21628`	`80.5`	`1.2`	`0.546`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`35`		[EDO]E:1573	`4`	`1`	`188`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`21416`	`80.1`	`2.2`	`0.298`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		C	`10`	`7`	`21688`	`◊`	F	x-1/2,-y+1/2,-z	`3_455`	`8`	`4`	`21673`	`76.1`	`-0.5`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[EDO]E:1573	`4`	`1`	`188`	`f`	C	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`6`	`21688`	`75.1`	`2.2`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[EDO]D:1573	`4`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`21634`	`71.4`	`1.4`	`0.178`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`39`		P	`5`	`2`	`955`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21673`	`70.9`	`-0.8`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
30	`40`		[UD2]B:1573	`12`	`1`	`723`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`818`	`70.6`	`-1.7`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
31	`41`		Z	`7`	`2`	`818`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`21416`	`68.2`	`-1.4`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
32	`42`		[EDO]B:1571	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`21545`	`63.5`	`2.5`	`0.969`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		F	`9`	`2`	`21673`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`3_455`	`10`	`4`	`21634`	`58.8`	`0.3`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		C	`7`	`2`	`21688`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`3`	`21634`	`57.5`	`0.2`	`0.647`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		[NGA]P:1572	`7`	`1`	`364`	`◊`	[UDP]C:1571	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`512`	`51.5`	`-0.3`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
36	`46`		[MN]D:1570	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21634`	`47.0`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`47`		[MN]F:1566	`1`	`1`	`123`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21673`	`46.7`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`48`		[MN]E:1570	`1`	`1`	`123`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21416`	`46.3`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`49`		[MN]A:1571	`1`	`1`	`123`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21628`	`46.2`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`50`		[MN]B:1570	`1`	`1`	`123`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21545`	`43.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	`51`		[MN]C:1570	`1`	`1`	`123`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21688`	`41.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
	*Average:*													`45.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
37	`52`		[UD2]E:1571	`9`	`1`	`724`	`cf`	[MN]E:1570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`46.2`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`53`		[UD2]F:1567	`10`	`1`	`724`	`f`	[MN]F:1566	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`45.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`54`		[UD2]A:1574	`8`	`1`	`717`	`f`	[MN]A:1571	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`45.2`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`55`		[UD2]D:1571	`9`	`1`	`725`	`f`	[MN]D:1570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`44.9`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`56`		[UD2]B:1573	`11`	`1`	`723`	`cf`	[MN]B:1570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`42.0`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`44.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
38	`57`		[UDP]C:1571	`6`	`1`	`512`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`955`	`44.7`	`-2.8`	`0.472`	`1`	`0`	`0`	`0.129`
39	`58`		[NGA]P:1572	`7`	`1`	`364`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`955`	`41.5`	`1.0`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`59`		[EDO]C:1573	`3`	`1`	`185`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`955`	`35.8`	`0.8`	`0.902`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`60`		[UDP]C:1571	`5`	`1`	`512`	`f`	[MN]C:1570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`35.4`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.137`
42	`61`		F	`5`	`2`	`21673`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`3_455`	`2`	`1`	`21628`	`31.6`	`0.0`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`62`		[NGA]P:1572	`4`	`1`	`364`	`◊`	[EDO]C:1573	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`27.1`	`1.2`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`63`		C	`3`	`1`	`21688`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`3`	`1`	`21545`	`26.3`	`0.4`	`0.793`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`64`		D	`4`	`2`	`21634`	`f`	[EDO]A:1572	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`4_644`	`2`	`1`	`186`	`21.6`	`0.5`	`0.827`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`65`		[NGA]P:1572	`5`	`1`	`364`	`◊`	[MN]C:1570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`17.9`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
47	`66`		P	`1`	`1`	`955`	`◊`	F	x-1/2,-y+1/2,-z	`3_455`	`2`	`1`	`21673`	`13.5`	`0.5`	`0.820`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`67`		[MN]B:1570	`1`	`1`	`123`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`818`	`11.0`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
49	`68`		F	`2`	`1`	`21673`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`4`	`4`	`21416`	`7.4`	`0.2`	`0.677`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`69`		E	`3`	`2`	`21416`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`21634`	`6.0`	`-0.1`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`70`		[UDP]C:1571	`1`	`1`	`512`	`f`	[EDO]C:1573	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`2.1`	`-0.1`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.003`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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