PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=251-IO-5M5)

Interfaces in PDB 4cdr crystal.
Space symmetry group: P 3 2 1. Resolution: 3.15 Å

HUMAN O-GLCNAC TRANSFERASE IN COMPLEX WITH A BISUBSTRATE INHIBITOR, GOBLIN1

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`98`	`30`	`28422`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`97`	`29`	`28447`	`945.4`	`-4.4`	`0.467`	`9`	`4`	`0`	`0.043`
	`2`		D	`94`	`27`	`28413`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`93`	`27`	`28417`	`921.2`	`-4.5`	`0.452`	`8`	`3`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`933.3`	`-4.4`	`0.459`	`9`	`4`	`0`	`0.043`
2	`3`		D	`64`	`19`	`28413`	`x`	B	-x+1,-x+y,-z	`5_655`	`76`	`29`	`28447`	`676.2`	`-8.6`	`0.095`	`6`	`0`	`0`	`0.146`
	`4`		B	`66`	`19`	`28447`	`x`	A	x-y,-y,-z	`6_555`	`77`	`29`	`28417`	`670.8`	`-8.5`	`0.103`	`4`	`0`	`0`	`0.146`
	`5`		A	`62`	`19`	`28417`	`x`	D	-y,x-y-1,z	`2_545`	`73`	`29`	`28413`	`657.5`	`-8.5`	`0.092`	`5`	`0`	`0`	`0.146`
	`6`		C	`74`	`29`	`28422`	`x`	C	-y+1,x-y,z	`2_655`	`59`	`18`	`28422`	`633.2`	`-9.2`	`0.074`	`4`	`0`	`0`	`0.146`
	*Average:*													`659.4`	`-8.7`	`0.091`	`5`	`0`	`0`	`0.146`
3	`7`		C	`62`	`18`	`28422`	`◊`	A	x-y,-y,-z+1	`6_556`	`57`	`21`	`28417`	`566.8`	`-3.5`	`0.396`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		B	`65`	`16`	`28447`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`15`	`28417`	`496.3`	`-4.5`	`0.331`	`2`	`3`	`0`	`0.032`
5	`9`		H	`36`	`7`	`1027`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`65`	`24`	`28413`	`465.6`	`-5.5`	`0.683`	`2`	`0`	`0`	`0.069`
	`10`		G	`36`	`7`	`1026`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`65`	`25`	`28422`	`463.9`	`-5.4`	`0.678`	`3`	`0`	`0`	`0.069`
	`11`		F	`36`	`7`	`1029`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`64`	`24`	`28447`	`463.8`	`-5.0`	`0.675`	`2`	`0`	`0`	`0.069`
	`12`		E	`36`	`7`	`1021`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`66`	`24`	`28417`	`460.7`	`-4.9`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`463.5`	`-5.2`	`0.685`	`2`	`0`	`0`	`0.069`
6	`13`		[UDP]E:1001	`24`	`1`	`533`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`43`	`18`	`28417`	`313.2`	`-7.6`	`0.446`	`13`	`0`	`0`	`0.141`
	`14`		[UDP]H:1001	`24`	`1`	`533`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`18`	`28413`	`312.8`	`-7.5`	`0.444`	`13`	`0`	`0`	`0.141`
	`15`		[UDP]G:1001	`25`	`1`	`532`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`41`	`18`	`28422`	`310.6`	`-7.6`	`0.422`	`14`	`0`	`0`	`0.141`
	`16`		[UDP]F:1001	`24`	`1`	`530`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`43`	`18`	`28447`	`309.9`	`-7.6`	`0.438`	`13`	`0`	`0`	`0.141`
	*Average:*													`311.6`	`-7.6`	`0.438`	`13`	`0`	`0`	`0.141`
7	`17`		[UDP]H:1001	`16`	`1`	`533`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`1027`	`129.3`	`-4.0`	`0.780`	`2`	`0`	`0`	`0.097`
	`18`		[UDP]E:1001	`19`	`1`	`533`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`1021`	`128.6`	`-3.8`	`0.776`	`1`	`0`	`0`	`0.097`
	`19`		[UDP]G:1001	`19`	`1`	`532`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`1026`	`128.0`	`-3.9`	`0.809`	`1`	`0`	`0`	`0.097`
	`20`		[UDP]F:1001	`18`	`1`	`530`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`1029`	`126.5`	`-3.8`	`0.766`	`1`	`0`	`0`	`0.097`
	*Average:*													`128.1`	`-3.9`	`0.783`	`1`	`0`	`0`	`0.097`
8	`21`		A	`8`	`4`	`28417`	`◊`	C	-x+1,-x+y,-z+1	`5_656`	`17`	`6`	`28422`	`99.3`	`-0.8`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`22`		D	`12`	`4`	`28413`	`◊`	F	-x+1,-x+y,-z	`5_655`	`6`	`1`	`1029`	`84.3`	`-1.8`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`23`		E	`6`	`1`	`1021`	`◊`	B	x-y,-y,-z	`6_555`	`11`	`3`	`28447`	`79.9`	`-1.5`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
	`24`		A	`12`	`3`	`28417`	`◊`	H	-y,x-y-1,z	`2_545`	`5`	`1`	`1027`	`75.1`	`-1.6`	`0.431`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`25`		G	`5`	`1`	`1026`	`◊`	C	-y+1,x-y,z	`2_655`	`11`	`3`	`28422`	`59.4`	`-1.3`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`74.6`	`-1.5`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
10	`26`		[SO4]D:2035	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`28413`	`84.3`	`-12.6`	`0.705`	`3`	`0`	`0`	`0.113`
11	`27`		[SO4]C:2034	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`28422`	`81.5`	`-11.4`	`0.731`	`2`	`0`	`0`	`0.163`
12	`28`		[SO4]B:2035	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`28447`	`81.4`	`-11.6`	`0.724`	`2`	`0`	`0`	`0.108`
13	`29`		[SO4]A:2033	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`28417`	`81.3`	`-10.5`	`0.857`	`4`	`0`	`0`	`0.108`
14	`30`		[SO4]A:2035	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`28417`	`80.7`	`-11.9`	`0.729`	`1`	`0`	`0`	`0.108`
15	`31`		[SO4]B:2030	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`28447`	`80.4`	`-11.4`	`0.842`	`3`	`0`	`0`	`0.110`
16	`32`		[SO4]D:2030	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`28413`	`79.2`	`-11.0`	`0.840`	`2`	`0`	`0`	`0.097`
17	`33`		[SO4]A:2030	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`28417`	`79.1`	`-10.6`	`0.855`	`3`	`0`	`0`	`0.104`
18	`34`		[SO4]C:2031	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`28422`	`76.9`	`-10.6`	`0.849`	`3`	`0`	`0`	`0.159`
19	`35`		[SO4]B:2032	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`28447`	`75.6`	`-8.9`	`0.918`	`3`	`0`	`0`	`0.088`
20	`36`		[SO4]C:2033	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`28422`	`75.3`	`-10.3`	`0.830`	`3`	`0`	`0`	`0.155`
21	`37`		[SO4]D:2033	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`28413`	`75.0`	`-10.0`	`0.838`	`3`	`0`	`0`	`0.092`
22	`38`		[SO4]D:2029	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`28413`	`72.2`	`-9.9`	`0.849`	`4`	`0`	`0`	`0.095`
23	`39`		[SO4]B:2029	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`28447`	`71.5`	`-10.2`	`0.849`	`5`	`0`	`0`	`0.107`
24	`40`		[SO4]A:2029	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`28417`	`70.8`	`-9.5`	`0.835`	`3`	`0`	`0`	`0.095`
25	`41`		[SO4]B:2033	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`28447`	`70.2`	`-9.4`	`0.844`	`3`	`0`	`0`	`0.093`
26	`42`		[SO4]C:2029	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`28422`	`68.0`	`-9.5`	`0.831`	`4`	`0`	`0`	`0.150`
27	`43`		[SO4]A:2032	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`28417`	`67.9`	`-8.0`	`0.911`	`3`	`0`	`0`	`0.082`
28	`44`		[SO4]E:1009	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`28417`	`67.0`	`-9.3`	`0.799`	`4`	`0`	`0`	`0.121`
	`45`		[SO4]F:1009	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`28447`	`63.4`	`-8.9`	`0.781`	`4`	`0`	`0`	`0.121`
	*Average:*													`65.2`	`-9.1`	`0.790`	`4`	`0`	`0`	`0.121`
29	`46`		[SO4]C:2030	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`28422`	`66.4`	`-9.3`	`0.800`	`3`	`0`	`0`	`0.141`
30	`47`		[SO4]H:1009	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`28413`	`66.1`	`-9.4`	`0.780`	`3`	`0`	`0`	`0.087`
31	`48`		[SO4]B:2032	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`28417`	`65.1`	`-8.8`	`0.612`	`1`	`0`	`0`	`0.051`
32	`49`		[SO4]D:2032	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`28413`	`63.9`	`-7.5`	`0.917`	`3`	`0`	`0`	`0.072`
33	`50`		[ACE]E:1	`3`	`1`	`173`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`1021`	`63.9`	`-0.4`	`0.896`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
34	`51`		[SO4]F:1009	`4`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`1029`	`63.6`	`-9.3`	`0.874`	`1`	`0`	`0`	`0.084`
	`52`		[SO4]E:1009	`4`	`1`	`186`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`1021`	`62.7`	`-9.1`	`0.887`	`1`	`0`	`0`	`0.084`
	*Average:*													`63.2`	`-9.2`	`0.880`	`1`	`0`	`0`	`0.084`
35	`53`		[SO4]C:2030	`4`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`1026`	`63.2`	`-8.9`	`0.881`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
36	`54`		[ACE]G:1	`3`	`1`	`173`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`1026`	`62.9`	`-0.3`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`55`		[ACE]F:1	`3`	`1`	`173`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1029`	`61.5`	`-0.3`	`0.887`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`62.2`	`-0.3`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
37	`56`		[SO4]B:2034	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`28447`	`62.0`	`-8.0`	`0.842`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
38	`57`		[SO4]H:1009	`4`	`1`	`184`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`1027`	`61.9`	`-9.1`	`0.901`	`1`	`0`	`0`	`0.077`
39	`58`		[SO4]A:2036	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`28417`	`61.8`	`-7.0`	`0.891`	`2`	`0`	`0`	`0.026`
40	`59`		[ACE]H:1	`3`	`1`	`172`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`1027`	`61.8`	`-0.3`	`0.899`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
41	`60`		[SO4]A:2036	`4`	`1`	`187`	`f`	D	-y,x-y-1,z	`2_545`	`10`	`4`	`28413`	`60.9`	`-7.1`	`0.886`	`2`	`0`	`0`	`0.065`
42	`61`		[SO4]C:2032	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`28422`	`57.7`	`-6.1`	`0.946`	`1`	`0`	`0`	`0.086`
43	`62`		[SO4]D:2034	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`28413`	`56.8`	`-7.5`	`0.853`	`2`	`0`	`0`	`0.068`
44	`63`		[SO4]A:2031	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`28417`	`55.9`	`-5.6`	`0.954`	`1`	`0`	`0`	`0.053`
45	`64`		[SO4]A:2034	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`28417`	`55.8`	`-7.3`	`0.861`	`2`	`0`	`0`	`0.071`
46	`65`		[SO4]A:2036	`4`	`1`	`187`	`◊`	B	x-y,-y,-z	`6_555`	`8`	`3`	`28447`	`54.3`	`-5.8`	`0.900`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
47	`66`		[NH2]E:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`28417`	`52.2`	`1.0`	`0.840`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[NH2]H:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`28413`	`51.8`	`1.0`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[NH2]G:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`28422`	`51.7`	`0.9`	`0.835`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NH2]F:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`28447`	`51.4`	`0.9`	`0.841`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.8`	`1.0`	`0.841`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`70`		[SO4]D:2031	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`28413`	`46.5`	`-4.4`	`0.961`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
49	`71`		[SO4]A:2032	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x-y,-y,-z+1	`6_556`	`5`	`1`	`28422`	`43.4`	`-4.8`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`72`		[NH2]G:9	`1`	`1`	`117`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1026`	`42.7`	`0.1`	`0.823`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		[NH2]H:9	`1`	`1`	`117`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1027`	`42.4`	`0.1`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		[NH2]F:9	`1`	`1`	`117`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1029`	`42.3`	`0.1`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		[NH2]E:9	`1`	`1`	`117`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1021`	`41.3`	`0.1`	`0.807`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`42.2`	`0.1`	`0.811`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`76`		[SO4]B:2031	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`28447`	`41.8`	`-4.9`	`0.897`	`1`	`0`	`0`	`0.046`
52	`77`		[SO4]B:2031	`3`	`1`	`185`	`◊`	C	-y+1,x-y,z	`2_655`	`2`	`1`	`28422`	`26.2`	`-3.2`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
53	`78`		[SO4]D:2031	`3`	`1`	`186`	`◊`	B	x-y,-y,-z	`6_555`	`2`	`1`	`28447`	`17.5`	`-1.8`	`0.882`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
54	`79`		D	`2`	`1`	`28413`	`◊`	[SO4]C:2032	-x+1,-x+y,-z	`5_655`	`3`	`1`	`185`	`15.9`	`-1.9`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
55	`80`		D	`1`	`1`	`28413`	`◊`	[SO4]C:2034	-x+1,-x+y,-z+1	`5_656`	`3`	`1`	`186`	`14.6`	`-1.5`	`0.929`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`81`		A	`2`	`1`	`28417`	`◊`	[SO4]A:2031	-y,x-y-1,z	`2_545`	`1`	`1`	`185`	`11.9`	`-1.5`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
57	`82`		B	`1`	`1`	`28447`	`◊`	C	-y+1,x-y,z	`2_655`	`1`	`1`	`28422`	`5.6`	`0.1`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`83`		[SO4]A:2034	`1`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`28447`	`4.6`	`-0.4`	`0.834`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
59	`84`		D	`1`	`1`	`28413`	`◊`	C	-x+1,-x+y,-z+1	`5_656`	`1`	`1`	`28422`	`4.0`	`-0.0`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`85`		[NH2]F:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	[SO4]F:1009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`3.0`	`-0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`86`		[NH2]E:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	[SO4]E:1009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`2.9`	`-0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`87`		[NH2]H:9	`1`	`1`	`117`	`◊`	[SO4]H:1009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`1.4`	`-0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`2.4`	`-0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
61	`88`		B	`1`	`1`	`28447`	`◊`	B	x-y,-y,-z	`6_555`	`1`	`1`	`28447`	`0.4`	`0.0`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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