PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=113-HO-57A)

Interfaces in PDB 4bl5 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN GDP-L-FUCOSE SYNTHASE WITH BOUND NADP AND PRODUCT GDP-L-FUCOSE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`129`	`31`	`13130`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`126`	`31`	`13503`	`1183.3`	`-13.2`	`0.362`	`10`	`6`	`0`	`0.402`
	`2`		E	`132`	`31`	`13907`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`121`	`30`	`13317`	`1182.0`	`-13.2`	`0.307`	`11`	`7`	`0`	`0.402`
	`3`		L	`133`	`31`	`13763`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`123`	`30`	`13252`	`1178.8`	`-11.7`	`0.448`	`12`	`8`	`0`	`0.402`
	`4`		J	`134`	`30`	`13200`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`126`	`29`	`13883`	`1177.6`	`-13.2`	`0.344`	`11`	`7`	`0`	`0.402`
	`5`		F	`127`	`30`	`13119`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`119`	`30`	`13988`	`1138.6`	`-13.7`	`0.247`	`11`	`8`	`0`	`0.402`
	`6`		I	`120`	`30`	`13969`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`122`	`30`	`13265`	`1135.8`	`-14.3`	`0.213`	`10`	`7`	`0`	`0.402`
	*Average:*													`1166.0`	`-13.2`	`0.320`	`11`	`7`	`0`	`0.402`
2	`7`		[NAP]L:901	`47`	`1`	`890`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`89`	`33`	`13763`	`631.6`	`-6.8`	`0.525`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	`8`		[NAP]I:901	`46`	`1`	`894`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`89`	`32`	`13969`	`619.1`	`-6.9`	`0.498`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	`9`		[NAP]H:901	`46`	`1`	`891`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`90`	`34`	`13265`	`617.6`	`-6.9`	`0.495`	`15`	`0`	`0`	`0.581`
	`10`		[NAP]B:901	`46`	`1`	`893`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`89`	`34`	`13503`	`615.4`	`-7.0`	`0.521`	`16`	`0`	`0`	`0.581`
	`11`		[NAP]E:901	`46`	`1`	`894`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`84`	`34`	`13907`	`613.9`	`-6.8`	`0.487`	`16`	`0`	`0`	`0.581`
	`12`		[NAP]D:901	`46`	`1`	`893`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`84`	`32`	`13130`	`613.9`	`-6.5`	`0.506`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	`13`		[NAP]J:901	`46`	`1`	`890`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`87`	`34`	`13200`	`612.9`	`-7.2`	`0.457`	`15`	`0`	`0`	`0.581`
	`14`		[NAP]F:901	`45`	`1`	`890`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`92`	`34`	`13119`	`612.5`	`-6.5`	`0.508`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	`15`		[NAP]A:901	`46`	`1`	`891`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`87`	`34`	`13317`	`611.7`	`-6.8`	`0.492`	`18`	`0`	`0`	`0.581`
	`16`		[NAP]G:901	`45`	`1`	`888`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`85`	`33`	`13883`	`611.3`	`-6.4`	`0.536`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	`17`		[NAP]C:901	`46`	`1`	`888`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`88`	`33`	`13988`	`610.5`	`-6.5`	`0.492`	`18`	`0`	`0`	`0.581`
	`18`		[NAP]K:901	`46`	`1`	`892`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`87`	`34`	`13252`	`607.9`	`-6.0`	`0.524`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
	*Average:*													`614.9`	`-6.7`	`0.503`	`17`	`0`	`0`	`0.581`
3	`19`		[GFB]E:902	`37`	`1`	`695`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`86`	`33`	`13907`	`511.2`	`0.8`	`0.545`	`10`	`0`	`0`	`0.183`
	`20`		[GFB]C:902	`37`	`1`	`694`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`88`	`33`	`13988`	`509.8`	`2.3`	`0.624`	`12`	`0`	`0`	`0.183`
	`21`		[GFB]A:902	`38`	`1`	`692`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`87`	`33`	`13317`	`508.0`	`2.3`	`0.619`	`11`	`0`	`0`	`0.183`
	`22`		[GFB]B:902	`37`	`1`	`693`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`84`	`33`	`13503`	`506.4`	`2.2`	`0.638`	`10`	`0`	`0`	`0.183`
	`23`		[GFB]G:902	`37`	`1`	`694`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`82`	`31`	`13883`	`506.1`	`0.9`	`0.572`	`12`	`0`	`0`	`0.183`
	`24`		[GFB]F:902	`37`	`1`	`692`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`79`	`32`	`13119`	`505.8`	`2.5`	`0.615`	`11`	`0`	`0`	`0.183`
	`25`		[GFB]J:902	`37`	`1`	`691`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`83`	`31`	`13200`	`505.1`	`-0.0`	`0.462`	`13`	`0`	`0`	`0.183`
	`26`		[GFB]D:902	`37`	`1`	`693`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`80`	`32`	`13130`	`502.7`	`1.3`	`0.572`	`12`	`0`	`0`	`0.183`
	`27`		[GFB]L:902	`37`	`1`	`694`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`81`	`32`	`13763`	`502.6`	`2.7`	`0.641`	`11`	`0`	`0`	`0.183`
	`28`		[GFB]H:902	`37`	`1`	`693`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`82`	`33`	`13265`	`502.6`	`0.7`	`0.536`	`12`	`0`	`0`	`0.183`
	`29`		[GFB]I:902	`37`	`1`	`696`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`81`	`33`	`13969`	`501.5`	`2.2`	`0.634`	`11`	`0`	`0`	`0.183`
	`30`		[GFB]K:902	`37`	`1`	`690`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`84`	`33`	`13252`	`500.7`	`2.5`	`0.622`	`12`	`0`	`0`	`0.183`
	*Average:*													`505.2`	`1.7`	`0.590`	`11`	`0`	`0`	`0.183`
4	`31`		K	`60`	`19`	`13252`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`52`	`15`	`13988`	`509.7`	`-3.7`	`0.452`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
5	`32`		J	`54`	`16`	`13200`	`◊`	L	x-1,y+1,z	`1_465`	`50`	`13`	`13763`	`479.1`	`-6.9`	`0.241`	`3`	`0`	`0`	`0.015`
	`33`		E	`53`	`15`	`13907`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`53`	`15`	`13119`	`477.3`	`-8.5`	`0.136`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
	`34`		G	`52`	`16`	`13883`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`54`	`17`	`13265`	`474.8`	`-8.5`	`0.146`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
	`35`		D	`49`	`14`	`13130`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`53`	`15`	`13988`	`474.6`	`-7.7`	`0.166`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
	`36`		K	`49`	`14`	`13252`	`◊`	I	x,y-1,z	`1_545`	`51`	`16`	`13969`	`456.2`	`-7.6`	`0.174`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
	`37`		B	`51`	`14`	`13503`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`13`	`13317`	`450.4`	`-8.3`	`0.140`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`468.7`	`-7.9`	`0.167`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
6	`38`		G	`44`	`10`	`13883`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`47`	`20`	`13317`	`426.0`	`-5.1`	`0.339`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
7	`39`		I	`42`	`12`	`13969`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`56`	`18`	`13119`	`409.8`	`-4.1`	`0.451`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		D	`40`	`15`	`13130`	`◊`	L	x-1,y,z+1	`1_456`	`34`	`10`	`13763`	`349.5`	`-3.5`	`0.455`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`379.7`	`-3.8`	`0.453`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`41`		H	`48`	`17`	`13265`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`39`	`11`	`13907`	`378.6`	`-3.8`	`0.464`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		J	`35`	`13`	`13200`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`10`	`13503`	`331.1`	`-4.0`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`354.9`	`-3.9`	`0.358`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`43`		C	`27`	`8`	`13988`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`10`	`13503`	`237.9`	`-1.9`	`0.579`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		C	`27`	`9`	`13988`	`◊`	E	x-1,y+1,z	`1_465`	`21`	`5`	`13907`	`201.7`	`-1.8`	`0.518`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		B	`17`	`6`	`13503`	`◊`	E	x-1,y+1,z	`1_465`	`24`	`8`	`13907`	`166.7`	`-1.6`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`202.1`	`-1.8`	`0.532`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`46`		G	`22`	`8`	`13883`	`◊`	L	x-2,y+1,z	`1_365`	`21`	`7`	`13763`	`175.7`	`0.1`	`0.693`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`47`		G	`18`	`5`	`13883`	`◊`	I	x-1,y-1,z	`1_445`	`18`	`6`	`13969`	`145.6`	`0.1`	`0.682`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`48`		I	`15`	`5`	`13969`	`◊`	L	x-1,y+2,z	`1_475`	`20`	`7`	`13763`	`143.1`	`-0.4`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		K	`13`	`5`	`13252`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`13265`	`110.2`	`-1.1`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		K	`14`	`7`	`13252`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`13200`	`101.0`	`-0.9`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`135.1`	`-0.4`	`0.600`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`51`		E	`26`	`10`	`13907`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`7`	`13988`	`171.3`	`-0.4`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`52`		E	`19`	`6`	`13907`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`13503`	`149.0`	`-0.7`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`53`		G	`21`	`8`	`13883`	`◊`	I	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`7`	`13969`	`148.3`	`-0.7`	`0.674`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	`54`		J	`19`	`6`	`13200`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`8`	`13265`	`146.1`	`-1.0`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`55`		K	`18`	`9`	`13252`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`17`	`6`	`13265`	`144.3`	`-1.0`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`56`		B	`18`	`7`	`13503`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`23`	`10`	`13988`	`139.2`	`-0.7`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`57`		G	`16`	`5`	`13883`	`◊`	L	x-1,y+1,z	`1_465`	`20`	`7`	`13763`	`133.3`	`-0.0`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	`58`		D	`16`	`7`	`13130`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`4`	`13119`	`115.7`	`-0.6`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`59`		L	`14`	`4`	`13763`	`◊`	I	x,y-1,z	`1_545`	`17`	`5`	`13969`	`114.2`	`-0.0`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`60`		A	`16`	`5`	`13317`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`18`	`6`	`13119`	`112.5`	`-0.2`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`61`		J	`17`	`5`	`13200`	`◊`	K	x-1,y+1,z	`1_465`	`15`	`4`	`13252`	`110.7`	`-0.4`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`62`		D	`14`	`4`	`13130`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13317`	`106.7`	`-0.1`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`132.6`	`-0.5`	`0.640`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
12	`63`		F	`13`	`3`	`13119`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13317`	`113.3`	`-1.4`	`0.359`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		D	`6`	`2`	`13130`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`3`	`13317`	`80.4`	`-1.8`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		D	`7`	`2`	`13130`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`13119`	`43.8`	`-0.9`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`79.2`	`-1.4`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`66`		J	`12`	`5`	`13200`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13265`	`92.9`	`0.0`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`67`		J	`10`	`4`	`13200`	`◊`	K	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`4`	`13252`	`91.8`	`1.3`	`0.884`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		G	`11`	`4`	`13883`	`◊`	L	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`13763`	`69.5`	`1.4`	`0.890`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		H	`1`	`1`	`13265`	`◊`	K	x-1,y+1,z	`1_465`	`1`	`1`	`13252`	`2.7`	`-0.0`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.7`	`0.9`	`0.773`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`70`		[EDO]F:1321	`4`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13119`	`81.7`	`2.6`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`71`		I	`11`	`4`	`13969`	`◊`	L	x-1,y+1,z	`1_465`	`11`	`4`	`13763`	`79.2`	`0.5`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		J	`5`	`2`	`13200`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`2`	`13265`	`27.0`	`0.9`	`0.883`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`53.1`	`0.7`	`0.847`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`73`		F	`7`	`2`	`13119`	`◊`	L	x-1,y+1,z+1	`1_466`	`11`	`4`	`13763`	`75.6`	`-2.0`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		A	`4`	`2`	`13317`	`◊`	I	x,y-1,z+1	`1_546`	`12`	`6`	`13969`	`74.7`	`-1.8`	`0.156`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		G	`8`	`4`	`13883`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`13130`	`61.4`	`-1.2`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.6`	`-1.7`	`0.175`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`76`		H	`6`	`3`	`13265`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`13988`	`70.4`	`-0.8`	`0.265`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		B	`8`	`3`	`13503`	`◊`	K	x-1,y+1,z	`1_465`	`6`	`2`	`13252`	`62.4`	`-0.8`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.4`	`-0.8`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`78`		D	`11`	`4`	`13130`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`3`	`13317`	`64.3`	`0.2`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		D	`7`	`3`	`13130`	`◊`	F	x-1,y-1,z	`1_445`	`6`	`4`	`13119`	`41.3`	`-0.4`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		A	`4`	`3`	`13317`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`13119`	`31.3`	`0.1`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`45.6`	`-0.0`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`81`		[GFB]H:902	`4`	`1`	`693`	`f`	[NAP]H:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`891`	`40.2`	`0.5`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		[GFB]E:902	`4`	`1`	`695`	`f`	[NAP]E:901	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`894`	`40.2`	`0.5`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		[GFB]G:902	`4`	`1`	`694`	`f`	[NAP]G:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`888`	`40.1`	`0.5`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		[GFB]I:902	`4`	`1`	`696`	`f`	[NAP]I:901	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`894`	`40.0`	`0.5`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`85`		[GFB]J:902	`4`	`1`	`691`	`f`	[NAP]J:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`890`	`39.9`	`0.5`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		[GFB]D:902	`4`	`1`	`693`	`f`	[NAP]D:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`893`	`39.9`	`0.5`	`0.538`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		[GFB]A:902	`4`	`1`	`692`	`f`	[NAP]A:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`891`	`39.7`	`0.5`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`88`		[GFB]B:902	`4`	`1`	`693`	`f`	[NAP]B:901	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`893`	`39.3`	`0.5`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		[GFB]K:902	`4`	`1`	`690`	`f`	[NAP]K:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`892`	`38.9`	`0.6`	`0.542`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		[GFB]F:902	`4`	`1`	`692`	`f`	[NAP]F:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`890`	`38.9`	`0.5`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`91`		[GFB]C:902	`4`	`1`	`694`	`f`	[NAP]C:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`888`	`38.8`	`0.5`	`0.538`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		[GFB]L:902	`4`	`1`	`694`	`f`	[NAP]L:901	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`890`	`38.8`	`0.5`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`39.6`	`0.5`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`93`		[EDO]F:1321	`2`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13988`	`31.1`	`1.0`	`0.886`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`94`		[NAP]A:901	`3`	`1`	`891`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13119`	`19.1`	`0.4`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`95`		J	`2`	`1`	`13200`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`13907`	`12.7`	`-0.1`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`96`		K	`3`	`1`	`13252`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13907`	`7.5`	`-0.1`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`97`		H	`1`	`1`	`13265`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13503`	`3.0`	`-0.1`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.2`	`-0.1`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`98`		E	`1`	`1`	`13907`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13988`	`1.4`	`-0.0`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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