PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=257-I5-29F)

Interfaces in PDB 3wpc crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HORSE TLR9 IN COMPLEX WITH AGONISTIC DNA1668_12MER

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`199`	`61`	`31260`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`209`	`61`	`31148`	`2021.5`	`-14.5`	`0.182`	`17`	`1`	`0`	`0.000`
2	`2`		F	`122`	`10`	`3044`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`123`	`35`	`31260`	`1100.9`	`-10.6`	`0.537`	`22`	`0`	`0`	`0.849`
	`3`		E	`122`	`10`	`3041`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`122`	`35`	`31148`	`1089.4`	`-10.4`	`0.569`	`20`	`0`	`0`	`0.849`
	*Average:*													`1095.2`	`-10.5`	`0.553`	`21`	`0`	`0`	`0.849`
3	`4`		B	`78`	`36`	`31260`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`79`	`37`	`31148`	`665.1`	`7.8`	`0.942`	`9`	`4`	`0`	`0.000`
4	`5`		B	`68`	`18`	`31260`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`53`	`17`	`31260`	`576.2`	`-6.3`	`0.057`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`57`	`18`	`31148`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`63`	`18`	`31148`	`573.9`	`-5.5`	`0.089`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`575.0`	`-5.9`	`0.073`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
5	`7`		B	`44`	`10`	`31260`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`48`	`5`	`3041`	`380.5`	`0.5`	`0.755`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		F	`47`	`4`	`3044`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`45`	`11`	`31148`	`369.6`	`-0.4`	`0.694`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`375.0`	`0.0`	`0.724`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		B	`28`	`11`	`31260`	`◊`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`32`	`9`	`31148`	`297.5`	`-0.9`	`0.496`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		E	`29`	`6`	`3041`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`11`	`31260`	`259.2`	`-7.9`	`0.254`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		F	`27`	`6`	`3044`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`31148`	`256.0`	`-7.2`	`0.259`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`257.6`	`-7.5`	`0.256`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		B	`21`	`8`	`31260`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`9`	`31260`	`157.6`	`0.2`	`0.617`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`19`	`7`	`31148`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`22`	`7`	`31148`	`149.4`	`-0.0`	`0.609`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.5`	`0.1`	`0.613`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
9	`14`		A	`22`	`8`	`31148`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`14`	`2`	`3041`	`156.3`	`2.5`	`0.696`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		F	`14`	`2`	`3044`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`8`	`31260`	`153.0`	`2.4`	`0.692`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`154.7`	`2.4`	`0.694`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[NAG]A:907	`11`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`31148`	`151.1`	`4.5`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[NAG]B:908	`11`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`31260`	`150.0`	`4.4`	`0.456`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`150.6`	`4.4`	`0.465`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		[NAG]A:902	`11`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`31148`	`149.8`	`3.4`	`0.394`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[NAG]B:902	`10`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`31260`	`149.3`	`3.3`	`0.415`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`149.6`	`3.4`	`0.404`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`20`		[GOL]B:912	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`11`	`31260`	`144.7`	`-0.5`	`0.566`	`2`	`0`	`0`	`0.048`
13	`21`		[NAG]B:904	`11`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`31260`	`133.3`	`3.5`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		[SO4]B:911	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`12`	`31260`	`129.5`	`-21.7`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.736`
15	`23`		[SO4]A:909	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`12`	`31148`	`127.3`	`-21.7`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.954`
16	`24`		[NAG]A:904	`11`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`31148`	`126.9`	`3.8`	`0.418`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]B:905	`11`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`31260`	`121.8`	`4.4`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`124.3`	`4.1`	`0.447`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[NAG]B:901	`10`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`31260`	`125.6`	`2.8`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]B:906	`10`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`31260`	`122.8`	`3.0`	`0.397`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[NAG]A:905	`10`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`31148`	`121.2`	`3.4`	`0.454`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[NAG]A:903	`8`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`31148`	`114.0`	`3.1`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[NAG]B:903	`9`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`31260`	`113.3`	`3.1`	`0.446`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`113.6`	`3.1`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[NAG]A:906	`10`	`1`	`364`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`31148`	`113.9`	`2.2`	`0.315`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[NAG]B:907	`10`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`31260`	`105.7`	`2.1`	`0.301`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`109.8`	`2.1`	`0.308`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		[NAG]A:901	`11`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`31148`	`106.0`	`2.0`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`34`		B	`15`	`3`	`31260`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`5`	`31148`	`101.6`	`-0.5`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`35`		[NAG]A:906	`6`	`1`	`364`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`3044`	`76.7`	`1.6`	`0.473`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[NAG]B:907	`7`	`1`	`361`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`3041`	`76.2`	`1.7`	`0.413`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`76.4`	`1.6`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`37`		[NAG]B:904	`8`	`1`	`359`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`3`	`31148`	`76.4`	`0.7`	`0.194`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		[NA]B:910	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31260`	`76.2`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.302`
27	`39`		[NAG]B:909	`8`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]B:908	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`361`	`71.1`	`1.4`	`0.055`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NAG]A:908	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:907	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`69.0`	`1.3`	`0.055`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.1`	`1.4`	`0.055`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		B	`9`	`4`	`31260`	`◊`	[NAG]B:905	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`362`	`67.5`	`0.9`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[NAG]A:904	`5`	`1`	`363`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`4`	`31148`	`67.3`	`0.9`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.4`	`0.9`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		B	`10`	`3`	`31260`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`31148`	`61.8`	`1.2`	`0.779`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		B	`5`	`2`	`31260`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`12`	`3`	`31148`	`56.4`	`0.9`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.1`	`1.0`	`0.741`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`45`		B	`4`	`2`	`31260`	`◊`	[NAG]A:901	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`363`	`40.0`	`0.2`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`46`		F	`9`	`2`	`3044`	`◊`	[NAG]B:905	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`362`	`39.7`	`-0.1`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[NAG]A:904	`7`	`1`	`363`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`2`	`3041`	`33.2`	`-0.1`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.4`	`-0.1`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`48`		[NAG]A:906	`2`	`1`	`364`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31260`	`17.5`	`0.5`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[NAG]B:907	`2`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31148`	`14.3`	`0.3`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.9`	`0.4`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`50`		[NA]B:910	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`31148`	`14.6`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`51`		[NAG]A:908	`3`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`31148`	`13.9`	`0.3`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]B:909	`2`	`1`	`360`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`31260`	`10.0`	`0.1`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`12.0`	`0.2`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`53`		[NAG]B:901	`2`	`1`	`364`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`31148`	`3.6`	`0.1`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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