PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=343-06-EFK)

Interfaces in PDB 3rad crystal.
Space symmetry group: P 31 2 1. Resolution: 3.35 Å

QUINOLONE(CLINAFLOXACIN)-DNA CLEAVAGE COMPLEX OF TYPE IV TOPOISOMERASE FROM S. PNEUMONIAE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`151`	`37`	`23182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`144`	`36`	`23131`	`1433.4`	`-19.9`	`0.094`	`13`	`6`	`0`	`0.623`
2	`2`		D	`155`	`47`	`10504`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`145`	`36`	`23182`	`1376.7`	`-22.5`	`0.159`	`13`	`2`	`0`	`0.558`
	`3`		C	`143`	`42`	`10789`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`140`	`36`	`23131`	`1344.0`	`-23.2`	`0.053`	`11`	`2`	`0`	`0.558`
	*Average:*													`1360.3`	`-22.8`	`0.106`	`12`	`2`	`0`	`0.558`
3	`4`		C	`76`	`24`	`10789`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`81`	`23`	`23182`	`651.5`	`-0.3`	`0.919`	`5`	`1`	`0`	`0.051`
	`5`		D	`73`	`24`	`10504`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`78`	`21`	`23131`	`608.5`	`0.8`	`0.913`	`11`	`1`	`0`	`0.051`
	*Average:*													`630.0`	`0.3`	`0.916`	`8`	`1`	`0`	`0.051`
4	`6`		E	`65`	`6`	`1722`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`79`	`24`	`23131`	`556.4`	`-6.4`	`0.514`	`8`	`0`	`0`	`0.554`
5	`7`		G	`61`	`6`	`1734`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`72`	`23`	`23182`	`525.5`	`-7.6`	`0.495`	`9`	`0`	`0`	`0.590`
6	`8`		F	`62`	`8`	`2766`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`53`	`19`	`23131`	`484.6`	`-0.5`	`0.695`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
7	`9`		H	`61`	`8`	`2818`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`54`	`20`	`23182`	`473.5`	`-2.2`	`0.677`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
8	`10`		B	`54`	`22`	`23182`	`◊`	A	-y,x-y+1,z+1/3	`2_565`	`48`	`16`	`23131`	`455.9`	`1.0`	`0.840`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
9	`11`		F	`39`	`6`	`2766`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`41`	`18`	`10789`	`392.1`	`-8.8`	`0.408`	`10`	`0`	`0`	`0.540`
10	`12`		H	`46`	`6`	`2818`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`45`	`19`	`10504`	`378.6`	`-8.3`	`0.486`	`6`	`0`	`0`	`0.440`
11	`13`		H	`30`	`7`	`2818`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`34`	`7`	`1734`	`316.6`	`-2.1`	`0.619`	`17`	`0`	`0`	`1.000`
12	`14`		F	`28`	`7`	`2766`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`30`	`7`	`1722`	`291.2`	`-3.4`	`0.541`	`13`	`0`	`0`	`1.000`
13	`15`		B	`32`	`11`	`23182`	`x`	B	y-1,x,-z	`4_455`	`27`	`8`	`23182`	`261.4`	`-0.3`	`0.686`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		B	`26`	`7`	`23182`	`◊`	A	x-y,-y+1,-z-1/3	`5_564`	`20`	`6`	`23131`	`210.9`	`1.7`	`0.874`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		H	`17`	`4`	`2818`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`2766`	`166.1`	`-3.9`	`0.461`	`12`	`0`	`0`	`0.488`
16	`18`		A	`15`	`5`	`23131`	`◊`	B	y-1,x,-z	`4_455`	`21`	`7`	`23182`	`161.1`	`-0.2`	`0.680`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		[NFX]F:101	`20`	`1`	`515`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`2`	`2766`	`148.9`	`2.1`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		G	`16`	`2`	`1734`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`10504`	`137.7`	`0.6`	`0.732`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		[NFX]H:101	`19`	`1`	`511`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`21`	`2`	`2818`	`136.1`	`-0.4`	`0.797`	`1`	`0`	`0`	`0.033`
20	`22`		E	`15`	`2`	`1722`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`10789`	`120.3`	`-0.1`	`0.683`	`1`	`0`	`0`	`0.014`
21	`23`		[NFX]F:101	`22`	`1`	`515`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`2818`	`118.8`	`-1.6`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
22	`24`		F	`11`	`2`	`2766`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`10504`	`116.5`	`-2.4`	`0.503`	`3`	`0`	`0`	`0.067`
23	`25`		A	`13`	`6`	`23131`	`x`	A	x-y,-y+1,-z-1/3	`5_564`	`12`	`3`	`23131`	`110.3`	`1.4`	`0.829`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		H	`11`	`2`	`2818`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10789`	`108.2`	`-3.0`	`0.411`	`2`	`0`	`0`	`0.055`
25	`27`		[NFX]H:101	`21`	`1`	`511`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`2766`	`103.5`	`-0.7`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
26	`28`		[NFX]H:101	`15`	`1`	`511`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`2`	`1734`	`74.8`	`-1.0`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
27	`29`		[NFX]H:101	`5`	`1`	`511`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10504`	`74.2`	`-1.5`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.107`
	`30`		[NFX]F:101	`6`	`1`	`515`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10789`	`58.3`	`-2.6`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.107`
	*Average:*													`66.3`	`-2.1`	`0.357`	`1`	`0`	`0`	`0.107`
28	`31`		[NFX]F:101	`14`	`1`	`515`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`1722`	`73.9`	`-0.8`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
29	`32`		[NFX]H:101	`4`	`1`	`511`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`23131`	`53.4`	`0.8`	`0.823`	`1`	`2`	`0`	`0.002`
	`33`		[NFX]F:101	`3`	`1`	`515`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`23182`	`37.7`	`0.3`	`0.737`	`1`	`1`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`45.6`	`0.5`	`0.780`	`1`	`2`	`0`	`0.002`
30	`34`		[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`23131`	`50.6`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.446`
	`35`		[MG]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`23182`	`50.0`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.446`
	*Average:*													`50.3`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.446`
31	`36`		[MG]C:701	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`10789`	`45.6`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.242`
	`37`		[MG]D:701	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10504`	`45.3`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.242`
	*Average:*													`45.5`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.242`
32	`38`		E	`9`	`1`	`1722`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`23182`	`42.5`	`0.6`	`0.677`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[NFX]H:101	`3`	`1`	`511`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`23182`	`39.7`	`0.3`	`0.751`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
	`40`		[NFX]F:101	`3`	`1`	`515`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`23131`	`38.4`	`0.2`	`0.709`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`39.1`	`0.3`	`0.730`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
34	`41`		[NFX]H:101	`3`	`1`	`511`	`f`	[MG]B:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`37.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	`42`		[NFX]F:101	`5`	`1`	`515`	`f`	[MG]A:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`34.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	*Average:*													`35.7`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
35	`43`		G	`7`	`1`	`1734`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`23131`	`22.5`	`0.1`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`44`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`23182`	`21.9`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	`45`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`23131`	`19.3`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`20.6`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
37	`46`		[MG]D:701	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1734`	`20.6`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
38	`47`		G	`3`	`1`	`1734`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2766`	`20.6`	`-1.2`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
39	`48`		[MG]C:701	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1722`	`18.2`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
40	`49`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`1722`	`17.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
41	`50`		H	`1`	`1`	`2818`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1722`	`15.6`	`-0.5`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
42	`51`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`2766`	`14.3`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
43	`52`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`2818`	`9.5`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
44	`53`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2766`	`9.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
45	`54`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`1734`	`9.0`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
46	`55`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2818`	`8.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
47	`56`		H	`1`	`1`	`2818`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`23131`	`6.6`	`-0.1`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
48	`57`		B	`1`	`1`	`23182`	`◊`	A	-y+1,x-y+1,z+1/3	`2_665`	`2`	`1`	`23131`	`5.9`	`-0.1`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`58`		F	`1`	`1`	`2766`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`23182`	`3.8`	`0.0`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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