PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=554-PP-2DI)

Interfaces in PDB 3q39 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.25 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF P DOMAIN FROM NORWALK VIRUS STRAIN VIETNAM 026 IN COMPLEX WITH HBGA TYPE H2 (DIGLYCAN)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`177`	`51`	`13972`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`185`	`52`	`14528`	`1748.4`	`-13.8`	`0.402`	`29`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`41`	`11`	`13972`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`43`	`10`	`14528`	`375.2`	`0.4`	`0.816`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`18`	`4`	`13972`	`x`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`28`	`10`	`13972`	`246.3`	`-3.0`	`0.201`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`26`	`9`	`14528`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`18`	`4`	`14528`	`236.5`	`-3.7`	`0.127`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`241.4`	`-3.4`	`0.164`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		A	`17`	`5`	`14528`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`14`	`13972`	`212.3`	`2.5`	`0.870`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
5	`6`		[EDO]A:8	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`14528`	`116.2`	`3.4`	`0.483`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[EDO]A:21	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`14528`	`113.2`	`3.4`	`0.482`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		[EDO]A:3	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`14528`	`110.3`	`2.2`	`0.419`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[EDO]B:9	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`6`	`13972`	`109.5`	`3.5`	`0.504`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[EDO]B:18	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`11`	`13972`	`108.8`	`4.0`	`0.704`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[IMD]A:25	`5`	`1`	`198`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`14528`	`107.3`	`2.8`	`0.236`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[IMD]B:26	`5`	`1`	`197`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`13972`	`106.7`	`2.7`	`0.234`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`107.0`	`2.8`	`0.235`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[EDO]B:1	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`13972`	`105.9`	`2.3`	`0.406`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[EDO]A:19	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`14528`	`105.1`	`2.5`	`0.474`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[EDO]B:5	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`13972`	`104.7`	`2.1`	`0.434`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[EDO]A:12	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`14528`	`104.1`	`2.1`	`0.433`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`104.4`	`2.1`	`0.434`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[EDO]B:15	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`13972`	`100.1`	`3.0`	`0.535`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		A	`11`	`6`	`14528`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`3`	`13972`	`96.3`	`-0.7`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[FUC]A:1	`9`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14528`	`95.6`	`1.1`	`0.246`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[EDO]B:11	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`13972`	`91.1`	`2.5`	`0.292`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[EDO]B:20	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`13972`	`90.6`	`2.3`	`0.295`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[EDO]A:7	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14528`	`90.3`	`2.4`	`0.297`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		A	`13`	`4`	`14528`	`◊`	[GAL]A:2	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`1`	`303`	`90.3`	`2.0`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[EDO]A:13	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`14528`	`88.0`	`2.1`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		B	`13`	`5`	`13972`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`2`	`13972`	`87.0`	`-1.3`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[EDO]B:14	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`13972`	`85.1`	`2.0`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[EDO]A:6	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`14528`	`80.2`	`1.8`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`82.6`	`1.9`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[EDO]A:10	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14528`	`83.6`	`2.3`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		[IMD]A:24	`5`	`1`	`197`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`14528`	`81.8`	`3.0`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[EDO]A:4	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13972`	`81.7`	`2.1`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[IMD]B:23	`5`	`1`	`196`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13972`	`79.5`	`2.6`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[EDO]A:17	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`14528`	`79.0`	`1.3`	`0.190`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[EDO]A:17	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13972`	`78.5`	`0.8`	`0.175`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[EDO]A:22	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`14528`	`77.6`	`2.8`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[EDO]B:16	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`13972`	`72.3`	`2.0`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[EDO]A:10	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`13972`	`71.0`	`2.2`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[EDO]B:14	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14528`	`69.5`	`1.2`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[EDO]A:6	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13972`	`62.9`	`1.0`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.2`	`1.1`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		[FUC]A:1	`6`	`1`	`281`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13972`	`68.6`	`1.2`	`0.407`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		[EDO]A:854	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14528`	`65.4`	`1.1`	`0.783`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		[EDO]B:16	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14528`	`64.9`	`1.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		[GAL]A:2	`5`	`1`	`303`	`cf`	[FUC]A:1	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`281`	`60.0`	`2.2`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		A	`6`	`4`	`14528`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`2`	`14528`	`58.6`	`0.5`	`0.782`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		A	`8`	`2`	`14528`	`◊`	[FUC]A:1	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`281`	`47.0`	`0.8`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		[EDO]A:4	`2`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14528`	`38.8`	`1.1`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[EDO]A:22	`3`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13972`	`37.0`	`1.7`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[IMD]A:24	`2`	`1`	`197`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`13972`	`36.6`	`1.4`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`48`		[EDO]A:13	`2`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13972`	`35.9`	`0.5`	`0.843`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`49`		[IMD]B:23	`2`	`1`	`196`	`◊`	[EDO]A:22	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`34.9`	`1.6`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[EDO]A:854	`3`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13972`	`34.8`	`1.5`	`0.895`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[IMD]B:23	`3`	`1`	`196`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`14528`	`34.4`	`1.0`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		[EDO]A:3	`3`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`13972`	`33.6`	`0.5`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		[GAL]A:2	`3`	`1`	`303`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`13972`	`32.9`	`0.4`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[EDO]B:16	`3`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:854	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`31.3`	`1.4`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[EDO]B:1	`2`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14528`	`31.0`	`0.5`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`56`		[EDO]A:854	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:6	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`20.4`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`57`		[EDO]A:13	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:12	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`20.2`	`1.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`58`		[IMD]A:24	`2`	`1`	`197`	`f`	[EDO]A:22	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`187`	`17.7`	`0.8`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`59`		[IMD]B:26	`2`	`1`	`197`	`f`	[EDO]A:4	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`15.7`	`0.8`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`60`		[EDO]B:5	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:4	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`13.8`	`0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`61`		[IMD]A:25	`2`	`1`	`198`	`f`	[EDO]A:13	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`12.3`	`0.7`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`62`		[IMD]A:24	`2`	`1`	`197`	`f`	B	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`13972`	`7.5`	`0.2`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`63`		[GAL]A:2	`2`	`1`	`303`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`14528`	`7.5`	`0.2`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`64`		[EDO]B:14	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:3	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`5.4`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[EDO]B:1	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:6	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`5.3`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.4`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`66`		[EDO]A:12	`1`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13972`	`3.2`	`0.1`	`0.869`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[EDO]B:5	`1`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14528`	`2.3`	`0.1`	`0.854`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.8`	`0.1`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`68`		[EDO]B:1	`1`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:854	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`3.0`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`69`		[IMD]B:23	`1`	`1`	`196`	`f`	[GAL]A:2	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`303`	`1.2`	`0.1`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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