PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=552-23-PF4)

Interfaces in PDB 3ojc crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.75 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A PUTATIVE ASP/GLU RACEMASE FROM YERSINIA PESTIS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`151`	`35`	`10360`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`149`	`32`	`10660`	`1397.8`	`-13.3`	`0.139`	`23`	`8`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`142`	`32`	`10717`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`143`	`33`	`10940`	`1366.1`	`-14.8`	`0.076`	`20`	`8`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1382.0`	`-14.0`	`0.107`	`22`	`8`	`0`	`1.000`
2	`3`		D	`69`	`20`	`10717`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`22`	`10660`	`615.0`	`-7.1`	`0.137`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`60`	`18`	`10940`	`x`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`52`	`15`	`10940`	`511.0`	`1.3`	`0.787`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`38`	`11`	`10360`	`x`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`50`	`17`	`10360`	`389.8`	`2.3`	`0.799`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`450.4`	`1.8`	`0.793`	`10`	`4`	`0`	`0.000`
4	`6`		D	`35`	`9`	`10717`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`41`	`14`	`10360`	`365.5`	`0.1`	`0.670`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
5	`7`		A	`40`	`11`	`10660`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`40`	`11`	`10940`	`349.8`	`0.5`	`0.697`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		B	`33`	`11`	`10940`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`10660`	`282.0`	`-2.1`	`0.347`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
7	`9`		B	`29`	`9`	`10940`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`30`	`9`	`10717`	`215.7`	`-1.9`	`0.412`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`10`		A	`16`	`4`	`10660`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`5`	`10360`	`133.4`	`-1.8`	`0.299`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`174.6`	`-1.8`	`0.356`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
8	`11`		D	`28`	`8`	`10717`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+3/2	`3_746`	`22`	`6`	`10360`	`197.7`	`-0.9`	`0.513`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		[HEZ]B:240	`8`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`13`	`10940`	`190.9`	`3.5`	`0.041`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		C	`17`	`7`	`10360`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10940`	`151.0`	`-0.4`	`0.469`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		[HEZ]B:237	`8`	`1`	`291`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`10940`	`141.0`	`4.5`	`0.003`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[HEZ]B:235	`8`	`1`	`288`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`10940`	`136.0`	`3.2`	`0.010`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[HEZ]D:232	`8`	`1`	`291`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`10717`	`135.3`	`3.4`	`0.014`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[HEZ]B:239	`8`	`1`	`285`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`10940`	`130.9`	`4.6`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[HEZ]B:238	`8`	`1`	`290`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`10940`	`124.6`	`3.1`	`0.014`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[HEZ]A:237	`7`	`1`	`285`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`10660`	`123.8`	`3.8`	`0.023`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[HEZ]C:233	`8`	`1`	`288`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`10360`	`122.3`	`4.2`	`0.024`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[HEZ]D:235	`8`	`1`	`288`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`10717`	`122.2`	`4.4`	`0.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[HEZ]B:234	`8`	`1`	`286`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`10940`	`122.2`	`3.8`	`0.049`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[HEZ]A:235	`8`	`1`	`286`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`10660`	`120.0`	`3.2`	`0.007`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[HEZ]C:235	`8`	`1`	`289`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`10360`	`117.3`	`3.2`	`0.635`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[HEZ]A:236	`8`	`1`	`293`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`10660`	`114.0`	`3.3`	`0.833`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[HEZ]C:236	`8`	`1`	`288`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`10360`	`114.0`	`2.7`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[HEZ]C:234	`6`	`1`	`288`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`17`	`5`	`10360`	`105.4`	`3.1`	`0.012`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		[HEZ]B:233	`8`	`1`	`287`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10940`	`103.1`	`3.0`	`0.635`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`29`		[HEZ]D:234	`6`	`1`	`287`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`10717`	`101.6`	`2.8`	`0.009`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`30`		[HEZ]B:236	`7`	`1`	`288`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`10940`	`97.4`	`2.6`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`31`		A	`13`	`7`	`10660`	`◊`	B	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`7`	`2`	`10940`	`92.4`	`0.3`	`0.687`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`32`		[HEZ]C:232	`7`	`1`	`289`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10360`	`85.6`	`2.5`	`0.670`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`33`		[HEZ]D:233	`6`	`1`	`291`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`10717`	`84.9`	`2.3`	`0.682`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`34`		[HEZ]B:236	`5`	`1`	`288`	`f`	[HEZ]B:233	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`287`	`69.0`	`3.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`35`		C	`6`	`2`	`10360`	`◊`	D	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`9`	`5`	`10717`	`68.6`	`-0.4`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`36`		[HEZ]D:233	`5`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10940`	`65.9`	`2.1`	`0.793`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`37`		A	`8`	`2`	`10660`	`f`	[HEZ]B:235	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`8`	`1`	`288`	`65.7`	`2.1`	`0.819`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`38`		[HEZ]B:237	`6`	`1`	`291`	`f`	[HEZ]B:235	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`288`	`58.7`	`2.8`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`39`		[HEZ]C:234	`5`	`1`	`288`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`10360`	`57.8`	`1.7`	`0.728`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`40`		[HEZ]C:234	`5`	`1`	`288`	`f`	[HEZ]C:232	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`289`	`51.7`	`3.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`41`		[CA]B:232	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10940`	`47.5`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.612`
	`42`		[CA]A:232	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`10660`	`47.5`	`-12.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.612`
	*Average:*													`47.5`	`-12.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.612`
39	`43`		[HEZ]D:235	`4`	`1`	`288`	`f`	C	-x+2,y-1/2,-z+3/2	`3_746`	`9`	`4`	`10360`	`46.6`	`1.0`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[HEZ]B:233	`6`	`1`	`287`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`10717`	`44.7`	`1.6`	`0.901`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`45`		[HEZ]A:237	`3`	`1`	`285`	`f`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`3`	`10360`	`44.6`	`1.2`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[HEZ]C:232	`3`	`1`	`289`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10660`	`43.6`	`0.9`	`0.743`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		[HEZ]C:236	`5`	`1`	`288`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`5`	`2`	`10360`	`42.7`	`1.6`	`0.865`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[HEZ]A:237	`4`	`1`	`285`	`◊`	[HEZ]C:236	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`3`	`1`	`288`	`42.6`	`2.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		B	`5`	`3`	`10940`	`◊`	[HEZ]D:234	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`287`	`42.3`	`1.6`	`0.931`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`50`		[CA]A:233	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`10660`	`40.6`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
47	`51`		[CA]A:234	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10660`	`39.7`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.233`
48	`52`		D	`8`	`5`	`10717`	`x`	D	-x+2,y-1/2,-z+3/2	`3_746`	`4`	`2`	`10717`	`36.4`	`0.4`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		B	`5`	`3`	`10940`	`f`	[HEZ]D:234	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`3`	`1`	`287`	`36.1`	`0.9`	`0.869`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`54`		A	`3`	`1`	`10660`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`4`	`1`	`10660`	`34.4`	`0.1`	`0.661`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`55`		[HEZ]B:236	`2`	`1`	`288`	`f`	[HEZ]B:234	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`286`	`34.0`	`1.3`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`56`		[HEZ]C:234	`2`	`1`	`288`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`10660`	`33.9`	`0.3`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`57`		[HEZ]C:235	`3`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10940`	`31.5`	`0.1`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`58`		A	`4`	`2`	`10660`	`◊`	D	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`4`	`2`	`10717`	`29.5`	`1.3`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`59`		B	`4`	`3`	`10940`	`◊`	D	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`8`	`5`	`10717`	`28.8`	`0.2`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		A	`1`	`1`	`10660`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`1`	`1`	`10360`	`1.9`	`0.0`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.4`	`0.1`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`61`		[HEZ]A:235	`2`	`1`	`286`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10717`	`28.2`	`0.2`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`62`		[CA]A:233	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`4`	`2`	`10940`	`25.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`63`		[HEZ]C:235	`2`	`1`	`289`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`10717`	`23.5`	`0.5`	`0.825`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`64`		[HEZ]A:237	`2`	`1`	`285`	`f`	[HEZ]A:236	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`293`	`23.1`	`0.6`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`65`		[HEZ]B:238	`1`	`1`	`290`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10360`	`18.0`	`-0.0`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
61	`66`		[HEZ]A:236	`4`	`1`	`293`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`4`	`3`	`10360`	`17.7`	`0.7`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`67`		[CA]A:234	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`4`	`2`	`10940`	`17.3`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`68`		[HEZ]A:237	`2`	`1`	`285`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`2`	`2`	`10360`	`17.1`	`0.8`	`0.920`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`69`		[HEZ]D:232	`3`	`1`	`291`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10660`	`14.0`	`0.0`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`70`		A	`2`	`2`	`10660`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`2`	`1`	`10360`	`10.4`	`0.1`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`71`		A	`3`	`2`	`10660`	`f`	[HEZ]C:236	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`2`	`1`	`288`	`9.8`	`0.4`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`72`		[HEZ]B:236	`2`	`1`	`288`	`f`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`1`	`1`	`10940`	`9.1`	`0.2`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`73`		[HEZ]B:234	`1`	`1`	`286`	`f`	[HEZ]B:233	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`287`	`0.3`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe