PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=389-9J-48K)

Interfaces in PDB 3o4f crystal.
Space symmetry group: P 43. Resolution: 2.90 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SPERMIDINE SYNTHASE FROM E. COLI

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`180`	`49`	`12129`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`169`	`49`	`12820`	`1675.2`	`-21.9`	`0.069`	`23`	`4`	`0`	`0.000`
	`2`		D	`169`	`49`	`12495`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`173`	`48`	`13052`	`1666.1`	`-23.3`	`0.028`	`22`	`2`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`172`	`49`	`12539`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`172`	`49`	`12950`	`1653.8`	`-24.2`	`0.030`	`21`	`2`	`0`	`0.000`
	`4`		F	`170`	`49`	`12406`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`170`	`49`	`12988`	`1627.9`	`-23.9`	`0.030`	`22`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1655.8`	`-23.3`	`0.039`	`22`	`3`	`0`	`0.000`
2	`5`		E	`86`	`27`	`12988`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`90`	`27`	`12950`	`885.2`	`-9.1`	`0.238`	`9`	`6`	`0`	`0.119`
	`6`		G	`85`	`26`	`12820`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`86`	`27`	`13052`	`866.4`	`-8.9`	`0.232`	`10`	`6`	`0`	`0.119`
	*Average:*													`875.8`	`-9.0`	`0.235`	`10`	`6`	`0`	`0.119`
3	`7`		D	`46`	`12`	`12495`	`◊`	H	-y,x,z-1/4	`3_554`	`46`	`13`	`12129`	`439.9`	`-2.7`	`0.479`	`6`	`11`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`46`	`13`	`13052`	`◊`	G	-y,x,z-1/4	`3_554`	`45`	`12`	`12820`	`433.5`	`-1.2`	`0.676`	`4`	`7`	`0`	`0.000`
	`9`		F	`50`	`15`	`12406`	`◊`	B	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`46`	`14`	`12539`	`431.7`	`-3.4`	`0.422`	`5`	`8`	`0`	`0.000`
	`10`		E	`44`	`12`	`12988`	`◊`	A	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`45`	`12`	`12950`	`421.8`	`-0.7`	`0.727`	`6`	`9`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`431.7`	`-2.0`	`0.576`	`5`	`9`	`0`	`0.000`
4	`11`		D	`36`	`14`	`12495`	`◊`	A	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`42`	`15`	`12950`	`369.7`	`-4.0`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		C	`45`	`14`	`13052`	`◊`	B	-y,x,z-1/4	`3_554`	`42`	`14`	`12539`	`328.6`	`-1.9`	`0.562`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`349.2`	`-2.9`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		D	`36`	`10`	`12495`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`12539`	`338.0`	`0.6`	`0.758`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
6	`14`		F	`29`	`12`	`12406`	`◊`	G	-y+1,x-1,z-1/4	`3_644`	`37`	`11`	`12820`	`332.6`	`-2.0`	`0.475`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`15`		E	`25`	`6`	`12988`	`◊`	H	-y+1,x,z-1/4	`3_654`	`21`	`9`	`12129`	`203.3`	`0.6`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		F	`20`	`7`	`12406`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`12950`	`160.4`	`-1.1`	`0.472`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`17`		H	`16`	`5`	`12129`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`13052`	`146.6`	`-1.5`	`0.360`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`18`		G	`16`	`5`	`12820`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`12495`	`140.7`	`-1.1`	`0.450`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`19`		E	`18`	`4`	`12988`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`12539`	`139.4`	`-1.3`	`0.412`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`146.8`	`-1.2`	`0.423`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
9	`20`		[SO4]F:292	`5`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`12406`	`117.8`	`-15.1`	`0.842`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
10	`21`		[SO4]C:293	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`13052`	`115.2`	`-14.6`	`0.838`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
11	`22`		[SO4]G:290	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`12820`	`111.5`	`-15.5`	`0.594`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
12	`23`		[SO4]G:291	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`12820`	`103.1`	`-14.0`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
13	`24`		[SO4]G:293	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`12820`	`87.8`	`-9.1`	`0.974`	`2`	`0`	`0`	`0.064`
14	`25`		[SO4]A:290	`5`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`12950`	`85.0`	`-8.7`	`0.961`	`3`	`0`	`0`	`0.086`
15	`26`		[SO4]F:290	`5`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`12406`	`84.6`	`-9.0`	`0.956`	`3`	`0`	`0`	`0.025`
16	`27`		[SO4]C:290	`5`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`13052`	`84.4`	`-9.0`	`0.937`	`1`	`0`	`0`	`0.060`
17	`28`		[SO4]B:289	`5`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`12539`	`81.8`	`-8.5`	`0.950`	`4`	`0`	`0`	`0.044`
18	`29`		[SO4]H:289	`5`	`1`	`183`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`12129`	`81.6`	`-8.7`	`0.950`	`4`	`0`	`0`	`0.060`
19	`30`		[SO4]E:291	`5`	`1`	`183`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`12988`	`81.5`	`-8.7`	`0.964`	`3`	`0`	`0`	`0.085`
20	`31`		[SO4]D:290	`5`	`1`	`182`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12495`	`80.7`	`-8.3`	`0.957`	`3`	`0`	`0`	`0.034`
21	`32`		[SO4]G:292	`5`	`1`	`185`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`12820`	`76.1`	`-11.1`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
22	`33`		[SO4]E:292	`5`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`12988`	`75.9`	`-11.4`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
23	`34`		[SO4]A:291	`5`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`12950`	`75.7`	`-11.3`	`0.725`	`2`	`0`	`0`	`0.104`
24	`35`		[SO4]D:291	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12495`	`73.2`	`-9.8`	`0.889`	`1`	`0`	`0`	`0.036`
25	`36`		[SO4]C:294	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`13052`	`72.7`	`-11.1`	`0.661`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
26	`37`		[SO4]C:294	`5`	`1`	`185`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`12820`	`71.7`	`-10.3`	`0.741`	`5`	`0`	`0`	`0.080`
27	`38`		[SO4]A:292	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`12988`	`71.5`	`-10.4`	`0.612`	`6`	`0`	`0`	`0.111`
28	`39`		[SO4]C:291	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`13052`	`71.4`	`-10.7`	`0.734`	`4`	`0`	`0`	`0.079`
29	`40`		[SO4]C:291	`5`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12820`	`71.2`	`-10.8`	`0.671`	`2`	`0`	`0`	`0.074`
30	`41`		[SO4]E:290	`5`	`1`	`180`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`12950`	`70.6`	`-9.9`	`0.748`	`4`	`0`	`0`	`0.099`
31	`42`		[SO4]E:290	`5`	`1`	`180`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12988`	`70.5`	`-10.9`	`0.677`	`2`	`0`	`0`	`0.100`
32	`43`		[SO4]A:292	`5`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12950`	`70.3`	`-11.1`	`0.646`	`2`	`0`	`0`	`0.102`
33	`44`		[SO4]F:291	`5`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`12406`	`65.3`	`-8.3`	`0.817`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
34	`45`		[SO4]C:292	`4`	`1`	`184`	`f`	B	-y,x,z-1/4	`3_554`	`8`	`4`	`12539`	`53.9`	`-6.5`	`0.792`	`3`	`0`	`0`	`0.033`
35	`46`		[SO4]H:290	`4`	`1`	`184`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`12129`	`53.5`	`-6.1`	`0.915`	`2`	`0`	`0`	`0.040`
36	`47`		H	`9`	`3`	`12129`	`◊`	G	-y,x,z-1/4	`3_554`	`3`	`1`	`12820`	`49.1`	`2.0`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		B	`6`	`2`	`12539`	`◊`	A	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`2`	`1`	`12950`	`39.8`	`2.1`	`0.961`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		C	`2`	`1`	`13052`	`◊`	D	-y,x,z-1/4	`3_554`	`1`	`1`	`12495`	`23.1`	`1.7`	`0.977`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		E	`1`	`1`	`12988`	`◊`	F	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`1`	`1`	`12406`	`1.8`	`-0.1`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`28.5`	`1.4`	`0.825`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		[SO4]E:289	`4`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`12988`	`48.4`	`-5.0`	`0.943`	`2`	`0`	`0`	`0.050`
38	`52`		[SO4]A:289	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`12950`	`46.9`	`-4.9`	`0.957`	`1`	`0`	`0`	`0.045`
39	`53`		[SO4]D:289	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`12495`	`46.3`	`-4.7`	`0.950`	`2`	`0`	`0`	`0.020`
40	`54`		[SO4]G:289	`4`	`1`	`183`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`12820`	`46.2`	`-4.5`	`0.961`	`2`	`0`	`0`	`0.035`
41	`55`		[SO4]C:289	`4`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`13052`	`45.7`	`-4.7`	`0.944`	`3`	`0`	`0`	`0.039`
42	`56`		[SO4]F:289	`5`	`1`	`183`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`12406`	`45.5`	`-5.4`	`0.956`	`1`	`0`	`0`	`0.014`
43	`57`		[SO4]B:290	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`12539`	`45.2`	`-4.4`	`0.949`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
44	`58`		[SO4]C:292	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`13052`	`39.0`	`-4.7`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`59`		[SO4]A:291	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`12539`	`33.2`	`-3.2`	`0.930`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`60`		[SO4]D:292	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`12495`	`30.8`	`-3.0`	`0.914`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
47	`61`		[SO4]G:291	`4`	`1`	`184`	`f`	[SO4]G:290	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`26.4`	`-5.8`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
48	`62`		[SO4]D:291	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12539`	`17.2`	`-1.9`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`63`		C	`2`	`1`	`13052`	`◊`	[SO4]G:292	-y,x,z-1/4	`3_554`	`1`	`1`	`185`	`7.8`	`-1.1`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`64`		[SO4]A:292	`1`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12539`	`4.6`	`-0.6`	`0.584`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`65`		[SO4]C:291	`1`	`1`	`186`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12129`	`3.1`	`-0.4`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`66`		[SO4]G:290	`1`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13052`	`2.9`	`-0.3`	`0.858`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
53	`67`		F	`1`	`1`	`12406`	`◊`	[SO4]A:291	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`1`	`1`	`183`	`1.1`	`-0.1`	`0.834`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`68`		[SO4]E:292	`1`	`1`	`184`	`◊`	A	-y,x-1,z-1/4	`3_544`	`1`	`1`	`12950`	`1.0`	`-0.1`	`0.708`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`69`		[SO4]C:294	`1`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12495`	`0.5`	`-0.1`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`70`		[SO4]E:290	`1`	`1`	`180`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12406`	`0.2`	`-0.0`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe