PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=224-9B-8BI)

Interfaces in PDB 3m1v crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.45 Å

STRUCTURAL INSIGHT INTO METHYL-COENZYME M REDUCTASE CHEMISTRY USING COENZYME B ANALOGUES

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`527`	`127`	`23012`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`525`	`128`	`23029`	`4769.3`	`-34.8`	`0.353`	`87`	`19`	`0`	`0.600`
2	`2`		F	`236`	`61`	`13851`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`261`	`70`	`18422`	`2383.1`	`-20.3`	`0.136`	`46`	`22`	`0`	`0.857`
	`3`		C	`236`	`61`	`13927`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`255`	`69`	`18333`	`2354.4`	`-21.2`	`0.116`	`43`	`26`	`0`	`0.857`
	*Average:*													`2368.8`	`-20.7`	`0.126`	`45`	`24`	`0`	`0.857`
3	`4`		F	`229`	`56`	`13851`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`271`	`62`	`23012`	`2310.2`	`-22.4`	`0.090`	`40`	`15`	`0`	`0.682`
	`5`		C	`230`	`55`	`13927`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`276`	`62`	`23029`	`2280.4`	`-22.0`	`0.108`	`39`	`13`	`0`	`0.682`
	*Average:*													`2295.3`	`-22.2`	`0.099`	`40`	`14`	`0`	`0.682`
4	`6`		E	`199`	`54`	`18422`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`252`	`75`	`23029`	`2117.5`	`-31.4`	`0.010`	`22`	`3`	`0`	`0.637`
	`7`		B	`198`	`54`	`18333`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`245`	`74`	`23012`	`2117.3`	`-31.3`	`0.009`	`20`	`3`	`0`	`0.637`
	*Average:*													`2117.4`	`-31.3`	`0.009`	`21`	`3`	`0`	`0.637`
5	`8`		E	`195`	`58`	`18422`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`199`	`58`	`18333`	`2029.1`	`-19.1`	`0.153`	`18`	`0`	`0`	`0.659`
6	`9`		B	`156`	`45`	`18333`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`130`	`34`	`23029`	`1195.8`	`-12.2`	`0.207`	`12`	`8`	`0`	`0.143`
	`10`		E	`158`	`45`	`18422`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`126`	`33`	`23012`	`1190.9`	`-12.6`	`0.184`	`12`	`6`	`0`	`0.143`
	*Average:*													`1193.4`	`-12.4`	`0.196`	`12`	`7`	`0`	`0.143`
7	`11`		F	`69`	`21`	`13851`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`20`	`23029`	`583.7`	`-0.9`	`0.636`	`9`	`6`	`0`	`0.048`
	`12`		C	`71`	`21`	`13927`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`72`	`20`	`23012`	`570.5`	`-1.1`	`0.639`	`8`	`6`	`0`	`0.048`
	*Average:*													`577.1`	`-1.0`	`0.637`	`9`	`6`	`0`	`0.048`
8	`13`		F	`35`	`9`	`13851`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`38`	`11`	`13927`	`303.7`	`-2.3`	`0.381`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
9	`14`		[F43]D:552	`37`	`1`	`1030`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`16`	`23012`	`301.0`	`-3.8`	`0.291`	`4`	`0`	`0`	`0.087`
	`15`		[F43]A:1	`40`	`1`	`1030`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`16`	`23029`	`300.9`	`-3.7`	`0.285`	`4`	`0`	`0`	`0.087`
	*Average:*													`301.0`	`-3.7`	`0.288`	`4`	`0`	`0`	`0.087`
10	`16`		[F43]A:1	`35`	`1`	`1030`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`16`	`23012`	`288.5`	`-3.8`	`0.353`	`7`	`0`	`0`	`0.111`
	`17`		[F43]D:552	`36`	`1`	`1030`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`23029`	`287.9`	`-3.8`	`0.366`	`7`	`0`	`0`	`0.111`
	*Average:*													`288.2`	`-3.8`	`0.360`	`7`	`0`	`0`	`0.111`
11	`18`		A	`30`	`7`	`23029`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`26`	`9`	`23012`	`256.5`	`-0.9`	`0.591`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
12	`19`		[F43]A:1	`18`	`1`	`1030`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`13851`	`192.4`	`0.4`	`0.735`	`7`	`0`	`0`	`0.043`
	`20`		[F43]D:552	`19`	`1`	`1030`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`12`	`13927`	`192.2`	`0.5`	`0.749`	`7`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`192.3`	`0.5`	`0.742`	`7`	`0`	`0`	`0.043`
13	`21`		B	`21`	`7`	`18333`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`23029`	`170.3`	`-0.6`	`0.483`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		A	`15`	`6`	`23029`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`19`	`8`	`18422`	`158.4`	`0.8`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		D	`16`	`6`	`23012`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`18`	`6`	`13851`	`135.3`	`-2.0`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		F	`13`	`3`	`13851`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`18333`	`124.3`	`-4.6`	`0.020`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`25`		C	`13`	`3`	`13927`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`18422`	`123.2`	`-4.5`	`0.025`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	*Average:*													`123.8`	`-4.6`	`0.023`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
17	`26`		[PEG]C:251	`7`	`1`	`262`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`13927`	`116.4`	`3.9`	`0.438`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		A	`16`	`5`	`23029`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`6`	`3`	`18333`	`105.7`	`2.4`	`0.915`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
19	`28`		B	`11`	`4`	`18333`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`23012`	`103.8`	`-0.2`	`0.497`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
20	`29`		[ACT]A:555	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`23029`	`101.8`	`0.0`	`0.759`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
21	`30`		[F43]A:1	`15`	`1`	`1030`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18422`	`94.7`	`-0.1`	`0.496`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
	`31`		[F43]D:552	`15`	`1`	`1030`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18333`	`93.8`	`-0.1`	`0.517`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`94.2`	`-0.1`	`0.507`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
22	`32`		D	`9`	`3`	`23012`	`x`	D	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`13`	`3`	`23012`	`91.4`	`1.7`	`0.853`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
23	`33`		E	`13`	`5`	`18422`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`23029`	`90.3`	`-1.8`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`34`		[EDO]F:251	`4`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`13851`	`89.8`	`2.5`	`0.281`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
25	`35`		A	`11`	`4`	`23029`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`9`	`3`	`23012`	`84.5`	`0.9`	`0.786`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
26	`36`		[EDO]F:252	`4`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`13851`	`79.1`	`1.9`	`0.226`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[PEG]A:557	`6`	`1`	`257`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`23029`	`75.6`	`1.9`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[COM]A:554	`7`	`1`	`261`	`f`	[F43]D:552	x,y,z	`1_555`	`20`	`1`	`1030`	`74.8`	`-1.5`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
	`39`		[COM]D:554	`7`	`1`	`262`	`f`	[F43]A:1	x,y,z	`1_555`	`19`	`1`	`1030`	`74.7`	`-1.5`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
	*Average:*													`74.7`	`-1.5`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
29	`40`		E	`9`	`6`	`18422`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`5`	`23012`	`73.5`	`1.4`	`0.843`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
30	`41`		[ACT]C:1	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`13927`	`72.6`	`0.1`	`0.731`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`42`		[COM]A:554	`7`	`1`	`261`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`23029`	`72.2`	`-1.0`	`0.360`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
	`43`		[COM]D:554	`7`	`1`	`262`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`23012`	`71.9`	`-1.0`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`72.1`	`-1.0`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
32	`44`		[EDO]D:555	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`23012`	`67.5`	`1.5`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`45`		[ACT]A:556	`4`	`1`	`182`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18422`	`58.2`	`-1.1`	`0.390`	`1`	`0`	`0`	`0.075`
	`46`		[ACT]B:446	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18333`	`58.1`	`-1.1`	`0.432`	`1`	`0`	`0`	`0.075`
	*Average:*													`58.2`	`-1.1`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.075`
34	`47`		[ACT]A:556	`4`	`1`	`182`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`23012`	`58.2`	`-1.0`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`48`		[ACT]B:446	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`23029`	`58.0`	`-1.0`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`58.1`	`-1.0`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
35	`49`		[COM]D:554	`6`	`1`	`262`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`18422`	`53.6`	`-0.3`	`0.480`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	`50`		[COM]A:554	`6`	`1`	`261`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`18333`	`53.1`	`-0.3`	`0.463`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`53.4`	`-0.3`	`0.471`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
36	`51`		[ACT]C:1	`3`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`23029`	`51.8`	`-0.6`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
37	`52`		[MG]F:250	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`13851`	`46.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	`53`		[MG]C:250	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`13927`	`46.0`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	*Average:*													`46.2`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
38	`54`		[MG]A:552	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`23029`	`43.2`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
39	`55`		[MG]B:445	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`18333`	`42.2`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
40	`56`		F	`5`	`1`	`13851`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`6`	`3`	`23012`	`40.9`	`-0.0`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		[MG]D:551	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`23012`	`36.6`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	`58`		[MG]A:551	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`23029`	`35.1`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	*Average:*													`35.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
42	`59`		[ZN]A:558	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`23029`	`36.1`	`-19.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.232`
	`60`		[ZN]A:558	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`23012`	`36.1`	`-19.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.232`
	*Average:*													`36.1`	`-19.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.232`
43	`61`		[ACT]A:555	`3`	`1`	`183`	`f`	[MG]A:552	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`33.3`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
44	`62`		[COM]A:554	`5`	`1`	`261`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`13927`	`31.3`	`0.4`	`0.648`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[COM]D:554	`5`	`1`	`262`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`13851`	`31.2`	`0.4`	`0.642`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`31.2`	`0.4`	`0.645`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
45	`64`		[MG]E:444	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`18422`	`29.5`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
46	`65`		F	`3`	`1`	`13851`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`4`	`2`	`18333`	`28.8`	`0.5`	`0.780`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`66`		[MG]B:444	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`18333`	`27.8`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
48	`67`		[ACT]A:556	`3`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`23029`	`25.8`	`1.0`	`0.833`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[ACT]B:446	`3`	`1`	`182`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`23012`	`25.2`	`1.0`	`0.915`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.5`	`1.0`	`0.874`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`69`		E	`4`	`2`	`18422`	`◊`	[MG]E:444	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`98`	`23.6`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`70`		F	`4`	`1`	`13851`	`◊`	[MG]C:250	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`98`	`19.7`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[MG]F:250	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`13927`	`19.3`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`19.5`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`72`		C	`5`	`2`	`13927`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`2`	`18333`	`18.0`	`0.6`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`73`		[MG]D:1	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`13851`	`16.3`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`74`		A	`3`	`1`	`23029`	`◊`	[MG]D:1	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`1`	`1`	`98`	`16.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
54	`75`		D	`2`	`1`	`23012`	`f`	[MG]D:1	-x+1,y-1/2,-z-1	`2_644`	`1`	`1`	`98`	`15.5`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
55	`76`		[MG]D:1	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`23012`	`15.3`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`77`		[COM]A:554	`4`	`1`	`261`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`23012`	`14.3`	`-0.1`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	`78`		[COM]D:554	`4`	`1`	`262`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`23029`	`13.6`	`-0.1`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`14.0`	`-0.1`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
57	`79`		A	`3`	`1`	`23029`	`◊`	[MG]B:444	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`98`	`14.2`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`80`		[MG]A:552	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:551	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
59	`81`		A	`2`	`1`	`23029`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`13927`	`11.3`	`0.2`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`82`		E	`3`	`1`	`18422`	`◊`	[MG]D:551	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`98`	`10.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`83`		E	`1`	`1`	`18422`	`x`	E	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`18422`	`5.5`	`0.3`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`84`		[ACT]C:1	`1`	`1`	`183`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`23012`	`0.3`	`-0.0`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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