PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=219-02-BP3)

Interfaces in PDB 3lrm crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.70 Å

STRUCTURE OF ALFA-GALACTOSIDASE FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE WITH RAFFINOSE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`122`	`31`	`17736`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`131`	`36`	`17792`	`1181.3`	`-9.5`	`0.145`	`12`	`7`	`0`	`0.000`
	`2`		D	`122`	`32`	`17755`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`125`	`35`	`17737`	`1141.6`	`-9.4`	`0.147`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`125`	`34`	`17755`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`122`	`32`	`17792`	`1140.0`	`-9.4`	`0.146`	`13`	`6`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`121`	`32`	`17737`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`123`	`34`	`17736`	`1131.1`	`-9.3`	`0.148`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1148.5`	`-9.4`	`0.147`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
2	`5`		A	`28`	`10`	`17792`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`47`	`13`	`17736`	`288.2`	`1.4`	`0.750`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`6`		[SUC]D:9001	`21`	`1`	`477`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`17755`	`252.0`	`-0.3`	`0.124`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		[SUC]C:9001	`21`	`1`	`464`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`39`	`15`	`17737`	`250.6`	`-0.1`	`0.161`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		[SUC]A:9001	`21`	`1`	`465`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`34`	`12`	`17792`	`244.1`	`-0.2`	`0.133`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`247.4`	`-0.2`	`0.147`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		[SUC]B:9001	`21`	`1`	`453`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`11`	`17736`	`235.5`	`0.4`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		C	`21`	`9`	`17737`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`26`	`8`	`17792`	`198.5`	`-2.3`	`0.254`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		[NAG]B:5001	`12`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`10`	`17736`	`177.4`	`4.1`	`0.424`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[NAG]D:5001	`11`	`1`	`366`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`17755`	`177.4`	`3.9`	`0.447`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[GLA]B:9002	`11`	`1`	`294`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`15`	`17736`	`176.6`	`3.0`	`0.407`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[GLA]A:9002	`11`	`1`	`294`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`17792`	`175.8`	`2.9`	`0.415`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[GLA]C:9002	`11`	`1`	`295`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`17737`	`174.7`	`3.1`	`0.422`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`175.7`	`3.0`	`0.415`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[NAG]C:5001	`12`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`17737`	`176.0`	`4.4`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		[GLA]D:9002	`11`	`1`	`295`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`17755`	`175.6`	`3.0`	`0.421`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		[NAG]A:5001	`11`	`1`	`365`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`17792`	`174.5`	`4.3`	`0.490`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		B	`21`	`7`	`17736`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`19`	`6`	`17792`	`164.3`	`-0.6`	`0.508`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]B:2001	`10`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`17736`	`159.3`	`4.5`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		[NAG]C:2001	`11`	`1`	`365`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`17737`	`157.6`	`4.7`	`0.521`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[NAG]A:2001	`12`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`17792`	`154.6`	`4.6`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[NAG]D:2001	`12`	`1`	`361`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`17755`	`150.3`	`4.2`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`154.2`	`4.5`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		[NAG]A:4001	`12`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`17792`	`123.8`	`1.1`	`0.127`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]D:4001	`11`	`1`	`361`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`17755`	`119.4`	`2.5`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`121.6`	`1.8`	`0.216`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[NAG]B:4001	`12`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`17736`	`122.7`	`1.2`	`0.138`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]C:4001	`12`	`1`	`363`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`17737`	`120.7`	`2.3`	`0.252`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		C	`11`	`3`	`17737`	`x`	C	-x-1/2,-y-1,z-1/2	`2_444`	`10`	`5`	`17737`	`113.0`	`0.1`	`0.552`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[SUC]A:9001	`9`	`1`	`465`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17736`	`107.3`	`0.5`	`0.394`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[SUC]C:9001	`10`	`1`	`464`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17755`	`102.2`	`1.0`	`0.432`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`104.8`	`0.8`	`0.413`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[NAG]A:3001	`9`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`17792`	`104.3`	`3.7`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[NAG]B:3001	`7`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17736`	`92.9`	`3.2`	`0.590`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`98.6`	`3.5`	`0.552`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		C	`8`	`2`	`17737`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`12`	`4`	`17792`	`103.8`	`-1.0`	`0.310`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
23	`34`		[NAG]C:3001	`9`	`1`	`363`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17737`	`103.6`	`3.6`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`35`		[SUC]B:9001	`10`	`1`	`453`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17737`	`99.4`	`0.6`	`0.431`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		D	`14`	`5`	`17755`	`x`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`15`	`5`	`17755`	`96.3`	`0.5`	`0.689`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`37`		[NAG]A:3001	`10`	`1`	`363`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`17736`	`89.8`	`0.8`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[NAG]C:3001	`9`	`1`	`363`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`17755`	`88.2`	`0.7`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[NAG]B:3001	`11`	`1`	`362`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`17737`	`86.9`	`0.8`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`88.3`	`0.8`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		[NAG]B:3002	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]B:3001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`362`	`86.6`	`2.8`	`0.120`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		[NAG]C:3002	`10`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]C:3001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`83.2`	`2.9`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`42`		[NAG]A:3002	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:3001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`82.1`	`2.4`	`0.101`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		[NAG]D:5002	`8`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]D:5001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`366`	`78.3`	`1.8`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		[NAG]A:5002	`8`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:5001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`365`	`75.4`	`2.0`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		[GLA]C:9002	`8`	`1`	`295`	`cf`	[SUC]C:9001	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`464`	`70.6`	`1.9`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[GLA]A:9002	`7`	`1`	`294`	`cf`	[SUC]A:9001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`465`	`69.0`	`1.9`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.8`	`1.9`	`0.242`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`47`		[GLA]D:9002	`7`	`1`	`295`	`cf`	[SUC]D:9001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`477`	`69.8`	`2.8`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`48`		[NAG]B:5002	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]B:5001	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`69.3`	`2.0`	`0.103`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`49`		[NAG]A:3002	`10`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17792`	`68.6`	`1.5`	`0.221`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`50`		[GLA]B:9002	`7`	`1`	`294`	`cf`	[SUC]B:9001	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`453`	`67.8`	`3.0`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		D	`9`	`4`	`17755`	`◊`	[NAG]D:4001	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`7`	`1`	`361`	`64.0`	`1.0`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		D	`8`	`4`	`17755`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`4`	`1`	`17736`	`62.8`	`0.9`	`0.750`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
39	`53`		[SUC]D:9001	`6`	`1`	`477`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`17792`	`59.3`	`1.0`	`0.554`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
40	`54`		[NAG]B:3002	`8`	`1`	`362`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`17736`	`59.0`	`1.9`	`0.290`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]C:3002	`7`	`1`	`364`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`17737`	`55.8`	`1.6`	`0.377`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`57.4`	`1.7`	`0.334`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`56`		[NAG]D:5002	`8`	`1`	`364`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`17755`	`45.1`	`0.7`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`57`		[NAG]C:4001	`6`	`1`	`363`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`2`	`17792`	`42.9`	`0.0`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`58`		[NAG]C:2001	`7`	`1`	`365`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`3`	`1`	`17792`	`42.9`	`0.9`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`59`		C	`3`	`3`	`17737`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`4`	`3`	`17792`	`38.8`	`-0.4`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`60`		[NAG]A:5002	`3`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`17792`	`32.8`	`0.4`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`61`		D	`3`	`2`	`17755`	`◊`	C	-x-1/2,-y-1,z-1/2	`2_444`	`6`	`2`	`17737`	`31.6`	`0.2`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`62`		[NAG]A:3002	`4`	`1`	`362`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`17736`	`20.7`	`0.7`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`63`		C	`6`	`1`	`17737`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`17755`	`18.6`	`0.2`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`64`		[NAG]B:5002	`6`	`1`	`362`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`17736`	`15.3`	`0.3`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`65`		[NAG]C:3002	`3`	`1`	`364`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`17755`	`12.4`	`0.5`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`66`		D	`1`	`1`	`17755`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17736`	`6.0`	`-0.2`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		C	`1`	`1`	`17737`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17792`	`4.3`	`-0.1`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.2`	`-0.2`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`68`		[NAG]B:3002	`2`	`1`	`362`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`17737`	`4.3`	`0.2`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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