PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=215-09-KBO)

Interfaces in PDB 3gi0 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.80 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A CHEMICALLY SYNTHESIZED 203 AMINO ACID 'COVALENT DIMER' [L-ALA51,D-ALA51'] HIV-1 PROTEASE MOLECULE COMPLEXED WITH JG- 365 INHIBITOR

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`862`	`182`	`10081`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`863`	`181`	`9975`	`5715.8`	`-4.8`	`0.690`	`354`	`39`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`64`	`17`	`10081`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`68`	`19`	`9975`	`291.7`	`-3.9`	`0.128`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`67`	`19`	`9975`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`68`	`19`	`9975`	`289.6`	`-3.5`	`0.157`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		C	`44`	`5`	`896`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`86`	`34`	`10081`	`274.7`	`-1.4`	`0.488`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		D	`45`	`5`	`899`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`91`	`34`	`9975`	`265.0`	`-1.0`	`0.523`	`15`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`269.9`	`-1.2`	`0.506`	`14`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		C	`44`	`5`	`896`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`90`	`34`	`9975`	`272.0`	`-1.3`	`0.508`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		D	`45`	`5`	`899`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`87`	`34`	`10081`	`267.4`	`-1.1`	`0.504`	`14`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`269.7`	`-1.2`	`0.506`	`14`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		A	`68`	`17`	`9975`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`53`	`15`	`10081`	`233.6`	`-1.9`	`0.277`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
7	`9`		B	`52`	`16`	`10081`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`55`	`18`	`10081`	`229.7`	`-2.7`	`0.170`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		A	`67`	`17`	`9975`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`52`	`14`	`9975`	`229.7`	`-2.0`	`0.266`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
9	`11`		B	`68`	`18`	`10081`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`51`	`13`	`9975`	`226.2`	`-2.0`	`0.266`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
10	`12`		B	`68`	`18`	`10081`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`51`	`13`	`10081`	`226.0`	`-2.0`	`0.266`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
11	`13`		A	`52`	`16`	`9975`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`55`	`18`	`10081`	`225.7`	`-2.6`	`0.176`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		B	`50`	`16`	`10081`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`13`	`9975`	`184.2`	`-1.0`	`0.402`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		B	`50`	`16`	`10081`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`13`	`10081`	`184.2`	`-1.0`	`0.401`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		A	`47`	`16`	`9975`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`13`	`9975`	`181.3`	`-1.1`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`182.8`	`-1.0`	`0.398`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		A	`47`	`16`	`9975`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`13`	`10081`	`181.3`	`-1.1`	`0.393`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		B	`19`	`6`	`10081`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`25`	`10`	`9975`	`140.0`	`0.3`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		D	`35`	`5`	`899`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`35`	`5`	`896`	`131.5`	`-0.5`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		B	`20`	`6`	`10081`	`◊`	A	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`25`	`8`	`9975`	`117.1`	`-1.1`	`0.351`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
18	`21`		A	`20`	`6`	`9975`	`◊`	A	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`25`	`8`	`9975`	`117.1`	`-1.1`	`0.352`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
19	`22`		B	`17`	`5`	`10081`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`28`	`9`	`10081`	`112.3`	`-0.9`	`0.411`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
20	`23`		A	`17`	`5`	`9975`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`28`	`9`	`10081`	`112.3`	`-0.9`	`0.412`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
21	`24`		B	`12`	`5`	`10081`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`15`	`6`	`10081`	`93.7`	`0.1`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[VME]D:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`10081`	`77.9`	`-0.8`	`0.670`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[VME]C:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`9975`	`75.5`	`-0.6`	`0.681`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`76.7`	`-0.7`	`0.675`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		[VME]D:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`9975`	`76.9`	`-0.8`	`0.680`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[VME]C:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`10081`	`75.4`	`-0.6`	`0.683`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`76.1`	`-0.7`	`0.681`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		[VME]D:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`896`	`65.6`	`-0.7`	`0.670`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[VME]C:7	`9`	`1`	`305`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`899`	`59.5`	`-0.9`	`0.578`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.6`	`-0.8`	`0.624`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		A	`17`	`5`	`9975`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`12`	`5`	`10081`	`58.3`	`-0.9`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		B	`17`	`5`	`10081`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`12`	`5`	`9975`	`58.3`	`-0.9`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		A	`17`	`5`	`9975`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`12`	`5`	`9975`	`58.3`	`-0.9`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`34`		B	`17`	`5`	`10081`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`12`	`5`	`10081`	`58.3`	`-0.9`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[ACE]C:1	`3`	`1`	`172`	`c`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`896`	`41.9`	`-0.3`	`0.746`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[ACE]D:1	`3`	`1`	`171`	`c`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`899`	`40.8`	`-0.2`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		[VME]D:7	`5`	`1`	`305`	`c`	[ACE]C:1	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`172`	`37.7`	`-0.7`	`0.820`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		A	`8`	`3`	`9975`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`7`	`5`	`9975`	`35.3`	`0.4`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[VME]C:7	`6`	`1`	`305`	`c`	[ACE]D:1	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`171`	`33.1`	`-0.4`	`0.853`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		[VME]D:7	`6`	`1`	`305`	`c`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`899`	`28.8`	`-0.3`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[VME]C:7	`6`	`1`	`305`	`c`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`896`	`27.6`	`-0.3`	`0.538`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`28.2`	`-0.3`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[ACE]D:1	`3`	`1`	`171`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`9975`	`27.4`	`-0.1`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`43`		[ACE]D:1	`3`	`1`	`171`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`10081`	`27.4`	`-0.1`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		[ACE]C:1	`3`	`1`	`172`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`10081`	`22.7`	`0.4`	`0.900`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`45`		[ACE]C:1	`3`	`1`	`172`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9975`	`22.6`	`0.4`	`0.901`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		D	`2`	`1`	`899`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`10081`	`9.3`	`-0.3`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		D	`2`	`1`	`899`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`9975`	`9.3`	`-0.3`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		[VME]C:7	`1`	`1`	`305`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`10081`	`5.2`	`-0.2`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		[VME]C:7	`1`	`1`	`305`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`9975`	`5.2`	`-0.2`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`50`		A	`1`	`1`	`9975`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`1`	`1`	`10081`	`2.2`	`0.0`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`51`		[ACE]C:1	`1`	`1`	`172`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`10081`	`1.1`	`-0.0`	`0.679`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`52`		[ACE]C:1	`1`	`1`	`172`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`9975`	`1.1`	`-0.0`	`0.680`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`53`		[ACE]D:1	`2`	`1`	`171`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`896`	`0.7`	`-0.0`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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