PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=265-9K-915)

Interfaces in PDB 3dv0 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.50 Å

SNAPSHOTS OF CATALYSIS IN THE E1 SUBUNIT OF THE PYRUVATE DEHYDROGENASE MULTI-ENZYME COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`205`	`53`	`13467`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`219`	`55`	`13439`	`1996.1`	`-13.9`	`0.195`	`27`	`19`	`0`	`0.069`
	`2`		D	`209`	`53`	`13456`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`209`	`54`	`13265`	`1985.3`	`-14.2`	`0.189`	`28`	`18`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`1990.7`	`-14.1`	`0.192`	`28`	`19`	`0`	`0.069`
2	`3`		C	`192`	`54`	`17515`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`196`	`53`	`17589`	`1787.6`	`-23.9`	`0.060`	`25`	`0`	`0`	`0.503`
	`4`		G	`191`	`52`	`17878`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`190`	`52`	`17419`	`1783.0`	`-22.5`	`0.073`	`25`	`0`	`0`	`0.503`
	*Average:*													`1785.3`	`-23.2`	`0.067`	`25`	`0`	`0`	`0.503`
3	`5`		D	`184`	`52`	`13456`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`176`	`46`	`17515`	`1681.6`	`-22.6`	`0.021`	`20`	`4`	`0`	`0.153`
	`6`		B	`173`	`49`	`13265`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`174`	`46`	`17589`	`1671.7`	`-22.1`	`0.027`	`22`	`4`	`0`	`0.153`
	`7`		H	`175`	`51`	`13467`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`175`	`47`	`17878`	`1655.5`	`-20.5`	`0.034`	`21`	`4`	`0`	`0.153`
	`8`		F	`173`	`50`	`13439`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`177`	`45`	`17419`	`1647.5`	`-21.9`	`0.026`	`17`	`5`	`0`	`0.153`
	*Average:*													`1664.1`	`-21.8`	`0.027`	`20`	`4`	`0`	`0.153`
4	`9`		D	`138`	`40`	`13456`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`133`	`39`	`17589`	`1216.5`	`-13.9`	`0.079`	`15`	`1`	`0`	`0.098`
	`10`		H	`130`	`40`	`13467`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`128`	`38`	`17419`	`1213.2`	`-13.5`	`0.071`	`13`	`1`	`0`	`0.098`
	`11`		B	`135`	`41`	`13265`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`130`	`38`	`17515`	`1170.0`	`-13.6`	`0.066`	`16`	`1`	`0`	`0.098`
	`12`		F	`129`	`39`	`13439`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`129`	`39`	`17878`	`1164.6`	`-14.7`	`0.051`	`16`	`2`	`0`	`0.098`
	*Average:*													`1191.1`	`-13.9`	`0.066`	`15`	`1`	`0`	`0.098`
5	`13`		A	`101`	`36`	`17589`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`102`	`37`	`17515`	`906.3`	`0.5`	`0.803`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
6	`14`		H	`81`	`22`	`13467`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`84`	`21`	`13456`	`739.6`	`-2.0`	`0.593`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
7	`15`		H	`47`	`14`	`13467`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`44`	`14`	`13456`	`390.6`	`4.1`	`0.898`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
8	`16`		J	`41`	`9`	`2839`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`37`	`8`	`13467`	`350.1`	`-1.4`	`0.611`	`6`	`2`	`0`	`0.013`
	`17`		I	`36`	`9`	`2899`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`41`	`10`	`13265`	`317.8`	`-3.7`	`0.381`	`4`	`1`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`334.0`	`-2.6`	`0.496`	`5`	`2`	`0`	`0.013`
9	`18`		[TPW]G:1370	`26`	`1`	`589`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`49`	`19`	`17878`	`324.0`	`-2.3`	`0.533`	`11`	`0`	`0`	`0.227`
	`19`		[TPW]E:1370	`26`	`1`	`592`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`17419`	`322.9`	`-3.4`	`0.425`	`9`	`0`	`0`	`0.227`
	`20`		[TPW]C:1370	`26`	`1`	`592`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`47`	`18`	`17515`	`305.0`	`-3.4`	`0.410`	`9`	`0`	`0`	`0.227`
	`21`		[TPW]A:1370	`25`	`1`	`585`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`17589`	`298.8`	`-3.5`	`0.420`	`11`	`0`	`0`	`0.227`
	*Average:*													`312.7`	`-3.2`	`0.447`	`10`	`0`	`0`	`0.227`
10	`22`		G	`31`	`9`	`17878`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`35`	`10`	`17515`	`275.3`	`1.4`	`0.811`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
11	`23`		I	`22`	`7`	`2899`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`34`	`8`	`13456`	`254.2`	`-3.7`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
	`24`		J	`21`	`6`	`2839`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`31`	`8`	`13439`	`251.9`	`-3.9`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`253.1`	`-3.8`	`0.243`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
12	`25`		J	`26`	`7`	`2839`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`31`	`8`	`13456`	`222.9`	`-0.4`	`0.652`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
13	`26`		[TPW]E:1370	`18`	`1`	`592`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`13467`	`177.0`	`2.2`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[TPW]G:1370	`19`	`1`	`589`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`13439`	`167.2`	`2.2`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[TPW]A:1370	`18`	`1`	`585`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`13456`	`159.7`	`1.9`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[TPW]C:1370	`18`	`1`	`592`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`13265`	`155.3`	`1.7`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`164.8`	`2.0`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`30`		G	`22`	`9`	`17878`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`23`	`9`	`13265`	`171.4`	`0.4`	`0.687`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
15	`31`		A	`13`	`5`	`17589`	`◊`	I	x,y,z-1	`1_554`	`17`	`6`	`2899`	`160.1`	`1.8`	`0.876`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
16	`32`		E	`21`	`4`	`17419`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`19`	`4`	`17589`	`146.6`	`-0.5`	`0.607`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`33`		G	`18`	`8`	`17878`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`8`	`17515`	`136.0`	`1.3`	`0.804`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
18	`34`		F	`22`	`8`	`13439`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`17515`	`135.8`	`0.2`	`0.671`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
19	`35`		H	`20`	`7`	`13467`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`16`	`7`	`2899`	`125.6`	`0.5`	`0.761`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`36`		[K]H:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`13467`	`112.6`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.513`
	`37`		[K]B:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`8`	`13265`	`112.5`	`-108.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.513`
	`38`		[K]F:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`13439`	`112.1`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.513`
	`39`		[K]D:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`13456`	`110.2`	`-108.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.513`
	*Average:*													`111.9`	`-108.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.513`
21	`40`		G	`12`	`6`	`17878`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`17419`	`104.4`	`0.9`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`41`		G	`15`	`7`	`17878`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`17`	`8`	`13265`	`87.5`	`0.0`	`0.653`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
23	`42`		[PYR]B:502	`6`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`17515`	`80.7`	`2.4`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`43`		F	`7`	`4`	`13439`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`17515`	`79.3`	`1.7`	`0.853`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
25	`44`		[PYR]D:502	`6`	`1`	`218`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`13456`	`72.0`	`1.6`	`0.845`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`45`		[PYR]D:502	`5`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17589`	`68.9`	`0.5`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`46`		[PYR]B:502	`6`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13265`	`62.6`	`0.5`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`47`		F	`5`	`2`	`13439`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`17589`	`51.7`	`1.6`	`0.898`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`48`		[PYR]D:502	`6`	`1`	`218`	`f`	[TPW]A:1370	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`585`	`49.4`	`1.3`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`49`		[PYR]B:502	`5`	`1`	`216`	`◊`	[TPW]C:1370	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`592`	`43.7`	`1.3`	`0.765`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`50`		[MG]G:1367	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`17878`	`38.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.181`
	`51`		[MG]E:1368	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`17419`	`37.9`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.181`
	`52`		[MG]A:1368	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`7`	`17589`	`36.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.181`
	`53`		[MG]C:1368	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`17515`	`36.7`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.181`
	*Average:*													`37.4`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.181`
32	`54`		[MG]B:1326	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13265`	`36.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`55`		[MG]G:1326	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`13467`	`15.5`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`25.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
33	`56`		[MG]G:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`17878`	`34.5`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`57`		[MG]G:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`17419`	`28.1`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`58`		[MG]B:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`17589`	`18.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`27.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
34	`59`		E	`4`	`2`	`17419`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`13439`	`32.7`	`2.0`	`0.945`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`60`		A	`2`	`1`	`17589`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`13265`	`11.0`	`0.4`	`0.795`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`21.9`	`1.2`	`0.870`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
35	`61`		[TPW]G:1370	`3`	`1`	`589`	`f`	[MG]G:1367	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.8`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	`62`		[TPW]E:1370	`6`	`1`	`592`	`f`	[MG]E:1368	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	`63`		[TPW]A:1370	`5`	`1`	`585`	`f`	[MG]A:1368	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	`64`		[TPW]C:1370	`4`	`1`	`592`	`f`	[MG]C:1368	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.1`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	*Average:*													`29.3`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
36	`65`		E	`3`	`1`	`17419`	`◊`	J	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`2839`	`27.6`	`-0.2`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`66`		[MG]B:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17515`	`27.6`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
38	`67`		H	`2`	`1`	`13467`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`17419`	`21.2`	`0.2`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`68`		H	`4`	`2`	`13467`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`17589`	`19.4`	`-0.3`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`69`		B	`1`	`1`	`13265`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`17515`	`7.6`	`0.1`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		A	`1`	`1`	`17589`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`13456`	`1.9`	`0.1`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.7`	`0.1`	`0.751`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`71`		[MG]G:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`13439`	`6.2`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	`72`		[MG]B:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`13456`	`0.5`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`3.3`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
42	`73`		A	`1`	`1`	`17589`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`17589`	`3.1`	`-0.1`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`74`		E	`1`	`1`	`17419`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`13265`	`0.9`	`0.0`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe