PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=228-01-HC2)

Interfaces in PDB 3ccb crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.49 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DPP4 IN COMPLEX WITH A BENZIMIDAZOLE DERIVATIVE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`241`	`61`	`30862`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`236`	`62`	`31263`	`2205.2`	`-16.2`	`0.156`	`46`	`12`	`0`	`1.000`
	`2`		B	`238`	`61`	`31268`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`238`	`62`	`30833`	`2184.7`	`-16.4`	`0.160`	`45`	`12`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2195.0`	`-16.3`	`0.158`	`46`	`12`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`70`	`19`	`31263`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`55`	`12`	`31268`	`537.4`	`0.7`	`0.607`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`51`	`18`	`31263`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`62`	`21`	`30833`	`462.6`	`3.8`	`0.739`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
4	`5`		B	`38`	`14`	`31268`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`43`	`14`	`30833`	`418.7`	`3.7`	`0.901`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
5	`6`		D	`35`	`9`	`30862`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`38`	`15`	`31268`	`315.6`	`2.3`	`0.680`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[B2Y]A:800	`14`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`37`	`14`	`30833`	`222.3`	`1.3`	`0.314`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
	`8`		[B2Y]C:800	`14`	`1`	`364`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`31263`	`219.9`	`1.3`	`0.273`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
	`9`		[B2Y]D:800	`14`	`1`	`360`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`30862`	`219.0`	`1.4`	`0.313`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
	`10`		[B2Y]B:800	`14`	`1`	`364`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`14`	`31268`	`218.0`	`1.2`	`0.275`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`219.8`	`1.3`	`0.294`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
7	`11`		D	`21`	`7`	`30862`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`18`	`8`	`31268`	`181.6`	`-1.1`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.267`
8	`12`		B	`18`	`6`	`31268`	`x`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`20`	`5`	`31268`	`169.7`	`-1.0`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[NAG]D:802	`12`	`1`	`363`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`30862`	`161.6`	`4.5`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]A:804	`11`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`30833`	`161.1`	`4.8`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`161.3`	`4.6`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[NAG]A:808	`10`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`30833`	`160.1`	`3.5`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[NAG]C:803	`11`	`1`	`365`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`31263`	`155.6`	`4.6`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[NAG]B:804	`12`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`31268`	`151.5`	`3.9`	`0.407`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.5`	`4.2`	`0.474`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		[NAG]A:801	`10`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`30833`	`140.3`	`4.4`	`0.556`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		[NAG]C:802	`11`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`31263`	`138.0`	`3.8`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]B:802	`10`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`31268`	`129.4`	`4.9`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]D:801	`9`	`1`	`363`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`30862`	`121.2`	`4.8`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[NAG]A:802	`8`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`30833`	`118.8`	`4.3`	`0.654`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.1`	`4.7`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		[NAG]C:801	`9`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`31263`	`124.8`	`4.4`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		[NAG]A:803	`10`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`30833`	`124.6`	`3.1`	`0.400`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]B:803	`11`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`31268`	`122.3`	`3.3`	`0.410`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.4`	`3.2`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		B	`11`	`5`	`31268`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`17`	`6`	`30862`	`123.3`	`-0.1`	`0.569`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]B:806	`13`	`1`	`356`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`31268`	`112.2`	`2.6`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[NAG]A:806	`12`	`1`	`357`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`30833`	`111.8`	`2.7`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		D	`14`	`4`	`30862`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`8`	`30833`	`105.9`	`1.0`	`0.759`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		[NAG]D:804	`8`	`1`	`355`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`30862`	`97.1`	`1.7`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		[NAG]B:801	`9`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`31268`	`96.0`	`2.2`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		C	`8`	`2`	`31263`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`11`	`4`	`30833`	`88.8`	`-1.2`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		D	`6`	`2`	`30862`	`x`	D	-x-2,y-1/2,-z-1	`2_344`	`7`	`3`	`30862`	`74.6`	`-1.3`	`0.167`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[NAG]A:805	`8`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:804	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`73.3`	`1.7`	`0.113`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[NAG]C:804	`9`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]C:803	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`365`	`72.6`	`1.9`	`0.112`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`73.0`	`1.8`	`0.113`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		[NAG]B:805	`10`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`70.6`	`1.9`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[NAG]A:807	`9`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]A:806	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`357`	`70.3`	`1.4`	`0.051`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[NAG]D:803	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]D:802	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`69.8`	`1.7`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`39`		A	`11`	`4`	`30833`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`12`	`5`	`31263`	`65.8`	`0.0`	`0.600`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
30	`40`		[NAG]A:805	`4`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`30833`	`47.3`	`0.9`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		[NAG]C:804	`4`	`1`	`365`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`31263`	`44.8`	`1.2`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[NAG]B:805	`3`	`1`	`358`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`31268`	`41.0`	`1.0`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		D	`4`	`2`	`30862`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`3`	`31263`	`39.0`	`0.2`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		[NAG]D:803	`4`	`1`	`360`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`30862`	`37.2`	`0.6`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		[NAG]A:807	`2`	`1`	`361`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`30833`	`27.2`	`0.0`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		C	`1`	`1`	`31263`	`◊`	[NAG]A:807	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`361`	`24.8`	`1.0`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[NAG]B:801	`1`	`1`	`359`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`30833`	`13.1`	`0.6`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		C	`4`	`2`	`31263`	`◊`	[NAG]A:806	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`357`	`9.2`	`0.2`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		B	`2`	`2`	`31268`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`31263`	`3.2`	`0.1`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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