PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=153-H6-GB4)

Interfaces in PDB 2xdd crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 3.20 Å

A PROCESSED NON-CODING RNA REGULATES A BACTERIAL ANTIVIRAL SYSTEM

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`115`	`15`	`6790`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`119`	`33`	`8832`	`1047.2`	`-8.1`	`0.685`	`20`	`0`	`0`	`0.276`
	`2`		H	`115`	`15`	`6784`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`122`	`34`	`8800`	`1040.3`	`-9.1`	`0.675`	`23`	`0`	`0`	`0.276`
	`3`		G	`112`	`15`	`6786`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`121`	`34`	`8815`	`1040.0`	`-7.1`	`0.688`	`21`	`0`	`0`	`0.276`
	*Average:*													`1042.5`	`-8.1`	`0.683`	`21`	`0`	`0`	`0.276`
2	`4`		F	`104`	`15`	`6790`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`110`	`35`	`8815`	`965.6`	`-14.8`	`0.588`	`13`	`0`	`0`	`0.253`
	`5`		G	`111`	`15`	`6786`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`111`	`35`	`8800`	`949.2`	`-15.2`	`0.598`	`13`	`0`	`0`	`0.253`
	`6`		H	`111`	`15`	`6784`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`110`	`36`	`8832`	`936.8`	`-12.5`	`0.642`	`11`	`0`	`0`	`0.253`
	*Average:*													`950.6`	`-14.2`	`0.609`	`12`	`0`	`0`	`0.253`
3	`7`		A	`39`	`13`	`8800`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`37`	`14`	`8832`	`312.9`	`3.8`	`0.895`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		[A23]F:32	`25`	`1`	`492`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`53`	`17`	`8832`	`302.3`	`0.0`	`0.447`	`9`	`0`	`0`	`0.065`
	`9`		[A23]G:32	`24`	`1`	`480`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`55`	`18`	`8815`	`299.4`	`1.2`	`0.498`	`11`	`0`	`0`	`0.065`
	`10`		[A23]H:32	`25`	`1`	`477`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`18`	`8800`	`295.8`	`1.4`	`0.467`	`11`	`0`	`0`	`0.065`
	*Average:*													`299.2`	`0.9`	`0.471`	`10`	`0`	`0`	`0.065`
5	`11`		E	`31`	`10`	`8815`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`33`	`10`	`8800`	`294.9`	`-2.8`	`0.287`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
6	`12`		G	`23`	`2`	`6786`	`◊`	H	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`23`	`4`	`6784`	`175.2`	`-3.6`	`0.730`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
7	`13`		E	`20`	`8`	`8815`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`20`	`8`	`8815`	`173.5`	`0.6`	`0.700`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		B	`20`	`7`	`8832`	`◊`	B	-x,y,-z-1	`2_554`	`19`	`6`	`8832`	`163.3`	`0.0`	`0.620`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`15`		E	`14`	`6`	`8815`	`◊`	H	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`19`	`5`	`6784`	`136.9`	`-2.4`	`0.622`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
10	`16`		H	`18`	`2`	`6784`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`18`	`5`	`8800`	`136.2`	`-3.5`	`0.461`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		F	`17`	`3`	`6790`	`◊`	F	-x,y,-z-1	`2_554`	`17`	`3`	`6790`	`106.0`	`-5.4`	`0.532`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		[A23]H:32	`10`	`1`	`477`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`6784`	`89.6`	`1.0`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[A23]F:32	`12`	`1`	`492`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`6790`	`89.4`	`0.8`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[A23]G:32	`14`	`1`	`480`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`6786`	`87.9`	`0.0`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`89.0`	`0.6`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`21`		[ZN]G:1034	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`6786`	`61.0`	`-36.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.285`
	`22`		[ZN]H:1033	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`6784`	`51.9`	`-29.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.285`
	*Average:*													`56.5`	`-32.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.285`
14	`23`		A	`6`	`3`	`8800`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`4`	`8800`	`58.6`	`-0.3`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		[ZN]E:1163	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`8815`	`47.4`	`-21.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	`25`		[ZN]A:1163	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8800`	`43.2`	`-20.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	`26`		[ZN]B:1163	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8832`	`42.5`	`-19.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	*Average:*													`44.4`	`-20.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
16	`27`		[ZN]G:1033	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`6786`	`44.9`	`-23.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.362`
	`28`		[ZN]H:1032	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`6784`	`43.0`	`-22.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.362`
	`29`		[ZN]F:1032	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`6790`	`42.2`	`-22.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.362`
	*Average:*													`43.4`	`-22.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.362`
17	`30`		[ZN]G:1032	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`6786`	`44.8`	`-25.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.195`
	`31`		[ZN]H:1035	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`6784`	`42.6`	`-23.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.195`
	*Average:*													`43.7`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.195`
18	`32`		G	`7`	`3`	`6786`	`x`	G	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`2`	`6786`	`41.7`	`-2.1`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`33`		[ZN]H:1034	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`2`	`6784`	`40.6`	`-21.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.134`
20	`34`		[ZN]H:1034	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`8832`	`40.3`	`-18.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
21	`35`		[A23]H:32	`4`	`1`	`477`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6786`	`38.2`	`0.1`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[A23]F:32	`4`	`1`	`492`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6784`	`33.4`	`1.3`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.8`	`0.7`	`0.523`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`37`		[ZN]F:1032	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`8815`	`36.1`	`-16.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
	`38`		[ZN]H:1032	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`8832`	`30.0`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
	`39`		[ZN]G:1033	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`8800`	`28.8`	`-12.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
	*Average:*													`31.6`	`-13.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
23	`40`		[A23]G:32	`4`	`1`	`480`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6790`	`34.9`	`0.4`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`41`		F	`3`	`1`	`6790`	`◊`	B	-x,y,-z-1	`2_554`	`3`	`1`	`8832`	`32.9`	`1.0`	`0.835`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`42`		[ZN]A:1164	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`8832`	`30.2`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
26	`43`		[ZN]A:1164	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`8800`	`29.3`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
27	`44`		A	`4`	`1`	`8800`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`4`	`1`	`8832`	`28.1`	`-0.4`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`45`		A	`4`	`2`	`8800`	`◊`	H	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`3`	`1`	`6784`	`27.9`	`-1.1`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`46`		G	`4`	`2`	`6786`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`7`	`2`	`8800`	`24.3`	`-1.1`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`47`		F	`2`	`2`	`6790`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`4`	`8832`	`19.8`	`-1.2`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`48`		F	`8`	`1`	`6790`	`◊`	E	-x,y,-z-1	`2_554`	`3`	`2`	`8815`	`16.7`	`0.4`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`49`		G	`3`	`1`	`6786`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`4_544`	`2`	`2`	`8832`	`13.9`	`0.0`	`0.632`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`50`		[ZN]H:1035	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]H:1032	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.2`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
34	`51`		E	`1`	`1`	`8815`	`x`	E	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`8815`	`9.7`	`0.2`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`52`		G	`2`	`2`	`6786`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`2`	`8815`	`4.9`	`-0.2`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`53`		F	`1`	`1`	`6790`	`x`	F	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`6790`	`3.6`	`0.0`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`54`		[ZN]E:1163	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6790`	`3.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
38	`55`		[ZN]G:1033	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]G:1032	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`2.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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