PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=513-93-225)

Interfaces in PDB 2xdc crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.70 Å

STRUCTURE OF LINEAR GRAMICIDIN D OBTAINED USING TYPE I CRYSTALS GROWN IN A LIPID CUBIC PHASE.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`146`	`16`	`3227`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`132`	`17`	`3408`	`1247.7`	`-12.7`	`0.465`	`31`	`0`	`0`	`0.899`
	`2`		D	`117`	`15`	`2555`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`114`	`16`	`2657`	`1046.2`	`-11.6`	`0.982`	`24`	`0`	`0`	`0.899`
	`3`		F	`114`	`15`	`2558`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`107`	`15`	`2474`	`1000.8`	`-13.0`	`1.000`	`25`	`0`	`0`	`0.899`
	*Average:*													`1098.3`	`-12.4`	`0.816`	`27`	`0`	`0`	`0.899`
2	`4`		B	`22`	`6`	`3227`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`7`	`2657`	`233.3`	`-5.1`	`0.349`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		E	`13`	`5`	`2474`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`3408`	`158.2`	`-2.9`	`0.437`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`195.7`	`-4.0`	`0.393`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
3	`6`		F	`21`	`4`	`2558`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`3`	`3227`	`216.9`	`-2.5`	`0.675`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		A	`24`	`4`	`3408`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`3`	`2555`	`154.9`	`-1.4`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`185.9`	`-2.0`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		B	`20`	`3`	`3227`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`4`	`2555`	`195.0`	`-3.0`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		F	`4`	`2`	`2558`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`3408`	`16.8`	`-0.5`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`105.9`	`-1.8`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`10`		C	`21`	`3`	`2657`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`3`	`3227`	`185.8`	`2.5`	`0.922`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		E	`13`	`3`	`2474`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`16`	`3`	`3408`	`142.9`	`-3.8`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`164.3`	`-0.7`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`12`		E	`16`	`6`	`2474`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`2`	`3227`	`164.2`	`-2.0`	`0.730`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`11`	`2`	`3408`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`2`	`2657`	`94.0`	`0.0`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`129.1`	`-1.0`	`0.660`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		A	`16`	`2`	`3408`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`14`	`5`	`3408`	`126.0`	`2.5`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		E	`15`	`3`	`2474`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`4`	`3227`	`123.9`	`-3.7`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`6`	`4`	`2555`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`3227`	`106.7`	`-1.1`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		F	`9`	`6`	`2558`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`12`	`4`	`3408`	`100.8`	`-2.8`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`110.5`	`-2.6`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		A	`21`	`3`	`3408`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`13`	`1`	`3227`	`108.6`	`1.2`	`0.711`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`19`		F	`11`	`5`	`2558`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`14`	`4`	`3227`	`103.2`	`-1.6`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		D	`8`	`4`	`2555`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`3408`	`48.3`	`-1.0`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`75.7`	`-1.3`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`21`		A	`12`	`3`	`3408`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`9`	`3`	`2474`	`94.5`	`-0.0`	`0.701`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		C	`3`	`1`	`2657`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`2`	`3227`	`43.9`	`-1.2`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.2`	`-0.6`	`0.535`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`23`		C	`9`	`2`	`2657`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`13`	`4`	`2555`	`89.0`	`-1.2`	`0.710`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		F	`12`	`4`	`2558`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`2`	`2474`	`88.0`	`-1.2`	`0.877`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`88.5`	`-1.2`	`0.794`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`25`		B	`8`	`2`	`3227`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`13`	`4`	`2474`	`88.7`	`-1.5`	`0.664`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`13`	`4`	`2657`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`2`	`3408`	`85.3`	`-1.4`	`0.520`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`87.0`	`-1.4`	`0.592`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`27`		D	`10`	`3`	`2555`	`x`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`9`	`2`	`2555`	`87.8`	`-1.1`	`0.881`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		F	`8`	`2`	`2558`	`x`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`10`	`3`	`2558`	`84.4`	`-1.0`	`0.870`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`86.1`	`-1.1`	`0.875`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`29`		[ETA]C:16	`4`	`1`	`197`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`2555`	`84.7`	`-0.2`	`0.819`	`4`	`0`	`0`	`0.078`
16	`30`		[ETA]A:16	`4`	`1`	`196`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`3`	`3408`	`84.5`	`0.0`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`31`		[ETA]B:16	`3`	`1`	`195`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3227`	`38.9`	`-0.3`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`61.7`	`-0.1`	`0.650`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
17	`32`		[ETA]E:16	`4`	`1`	`197`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`2558`	`84.1`	`-0.0`	`0.821`	`4`	`0`	`0`	`0.068`
18	`33`		C	`7`	`3`	`2657`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`3408`	`79.3`	`-2.3`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`34`		A	`15`	`2`	`3408`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`11`	`1`	`2558`	`69.3`	`0.5`	`0.846`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`35`		A	`10`	`2`	`3408`	`◊`	[ETA]B:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`1`	`195`	`64.4`	`1.4`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`36`		[ETA]A:16	`4`	`1`	`196`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`3227`	`59.6`	`0.1`	`0.722`	`4`	`0`	`0`	`0.090`
	`37`		[ETA]B:16	`4`	`1`	`195`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`3408`	`57.2`	`0.1`	`0.660`	`4`	`0`	`0`	`0.090`
	*Average:*													`58.4`	`0.1`	`0.691`	`4`	`0`	`0`	`0.090`
22	`38`		A	`5`	`1`	`3408`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`2`	`2657`	`52.1`	`0.9`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`39`		F	`6`	`3`	`2558`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`2657`	`51.8`	`-0.1`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		E	`3`	`1`	`2474`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`2555`	`21.6`	`-0.7`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.7`	`-0.4`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`41`		[NA]A:1018	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`2`	`3408`	`50.5`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.188`
25	`42`		[ETA]C:16	`3`	`1`	`197`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2657`	`49.4`	`-0.2`	`0.632`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
26	`43`		[ETA]E:16	`3`	`1`	`197`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2474`	`49.1`	`-0.2`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
27	`44`		A	`8`	`3`	`3408`	`◊`	[ETA]F:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`1`	`196`	`47.6`	`0.2`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`45`		A	`6`	`1`	`3408`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`5`	`1`	`2657`	`45.7`	`-0.3`	`0.596`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`46`		C	`8`	`2`	`2657`	`◊`	[ETA]C:16	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`3`	`1`	`197`	`43.3`	`-0.1`	`0.639`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`47`		[ETA]E:16	`3`	`1`	`197`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`8`	`2`	`2474`	`42.8`	`-0.3`	`0.689`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`48`		A	`6`	`2`	`3408`	`◊`	[ETA]D:16	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`195`	`41.6`	`1.4`	`0.807`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`49`		F	`3`	`2`	`2558`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2657`	`40.9`	`-1.3`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		E	`4`	`1`	`2474`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`2555`	`39.5`	`-1.3`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.2`	`-1.3`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`51`		B	`9`	`3`	`3227`	`◊`	[ETA]F:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`1`	`196`	`39.7`	`-0.5`	`0.601`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`52`		[ETA]D:16	`3`	`1`	`195`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`11`	`3`	`3408`	`39.3`	`-0.5`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`53`		[ETA]F:16	`3`	`1`	`196`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`2474`	`37.2`	`-0.1`	`0.697`	`1`	`0`	`0`	`0.018`
36	`54`		[ETA]F:16	`4`	`1`	`196`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`2558`	`37.0`	`-0.1`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
37	`55`		[ETA]D:16	`4`	`1`	`195`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`2555`	`36.7`	`-0.1`	`0.768`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
38	`56`		E	`3`	`2`	`2474`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2657`	`36.6`	`0.3`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		E	`2`	`1`	`2474`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`2657`	`5.0`	`-0.2`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.8`	`0.1`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`58`		[ETA]D:16	`3`	`1`	`195`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`2657`	`35.1`	`-0.1`	`0.642`	`1`	`0`	`0`	`0.024`
40	`59`		A	`3`	`1`	`3408`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`2`	`2555`	`33.3`	`0.5`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`60`		[NA]A:1018	`1`	`1`	`125`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`1`	`2558`	`22.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NA]A:1018	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`2555`	`21.5`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`22.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`62`		B	`7`	`2`	`3227`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`3`	`2`	`2558`	`21.4`	`-0.1`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		D	`3`	`2`	`2555`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`2`	`3408`	`18.9`	`-0.0`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.2`	`-0.1`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`64`		[ETA]D:16	`2`	`1`	`195`	`◊`	[ETA]B:16	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`195`	`21.3`	`-0.6`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`65`		[ETA]A:16	`2`	`1`	`196`	`◊`	[ETA]F:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`196`	`21.1`	`-0.6`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`66`		F	`5`	`2`	`2558`	`◊`	[ETA]F:16	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`196`	`17.5`	`0.1`	`0.777`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`67`		[ETA]D:16	`4`	`1`	`195`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`2`	`2555`	`16.4`	`0.0`	`0.784`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`68`		[ETA]D:16	`1`	`1`	`195`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`3227`	`8.8`	`-0.2`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`69`		[ETA]A:16	`1`	`1`	`196`	`◊`	[ETA]B:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`195`	`8.4`	`-0.3`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`70`		[ETA]E:16	`2`	`1`	`197`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`2558`	`3.7`	`-0.1`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		D	`1`	`1`	`2555`	`◊`	[ETA]C:16	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`197`	`0.9`	`-0.0`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.3`	`-0.1`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`72`		[NA]A:1018	`1`	`1`	`125`	`◊`	[ETA]F:16	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`196`	`3.2`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		[NA]A:1018	`1`	`1`	`125`	`◊`	[ETA]D:16	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`195`	`1.4`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.3`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`74`		E	`1`	`1`	`2474`	`◊`	[ETA]A:16	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`196`	`2.2`	`-0.0`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		[ETA]B:16	`1`	`1`	`195`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2657`	`1.6`	`-0.0`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.9`	`-0.0`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`76`		E	`1`	`1`	`2474`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`2558`	`1.1`	`-0.0`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe