PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=632-02-2FM)

Interfaces in PDB 2vl4 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.90 Å

STRUCTURAL AND BIOCHEMICAL EVIDENCE FOR A BOAT-LIKE TRANSITION STATE IN BETA-MANNOSIDASES

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`144`	`41`	`31835`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`138`	`40`	`31477`	`1296.9`	`-6.5`	`0.381`	`21`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`82`	`32`	`31835`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`87`	`35`	`31477`	`785.8`	`-2.0`	`0.534`	`11`	`2`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`65`	`19`	`31477`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`57`	`17`	`31835`	`539.1`	`-4.9`	`0.216`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`33`	`10`	`31835`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`34`	`12`	`31477`	`263.4`	`2.0`	`0.843`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`32`	`16`	`31477`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`31`	`9`	`31835`	`250.8`	`0.6`	`0.714`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
6	`6`		[MNM]A:1865	`11`	`1`	`293`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`13`	`31477`	`161.2`	`1.6`	`0.519`	`8`	`0`	`0`	`0.004`
	`7`		[MNM]B:1868	`11`	`1`	`297`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`13`	`31835`	`159.2`	`1.4`	`0.563`	`7`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`160.2`	`1.5`	`0.541`	`8`	`0`	`0`	`0.004`
7	`8`		[EDO]A:1873	`4`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`31477`	`126.6`	`3.9`	`0.532`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[EDO]B:1876	`4`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`31835`	`119.3`	`4.3`	`0.726`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[EDO]A:1877	`4`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`31477`	`116.9`	`4.3`	`0.736`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[EDO]B:1871	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`31835`	`116.8`	`4.2`	`0.739`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[EDO]A:1876	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`31477`	`116.7`	`4.0`	`0.667`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[EDO]B:1883	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`31835`	`115.4`	`3.9`	`0.660`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[EDO]A:1884	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`31477`	`114.3`	`2.7`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[EDO]B:1877	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`31835`	`109.7`	`2.6`	`0.422`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`112.0`	`2.7`	`0.424`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		[EDO]A:1869	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`31477`	`112.6`	`3.5`	`0.542`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		[EDO]A:1868	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`31477`	`112.6`	`3.8`	`0.472`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[EDO]B:1869	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`31835`	`112.4`	`3.7`	`0.460`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		[EDO]A:1867	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`31477`	`111.7`	`4.1`	`0.531`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		[EDO]B:1873	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`31835`	`111.7`	`3.6`	`0.557`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		[EDO]B:1890	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`31835`	`108.1`	`3.2`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[EDO]B:1870	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`31835`	`106.2`	`2.4`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[EDO]A:1871	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`31477`	`104.6`	`4.1`	`0.663`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		[EDO]A:1874	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`31477`	`104.2`	`3.4`	`0.489`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[EDO]A:1872	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`31477`	`104.0`	`4.0`	`0.642`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[EDO]A:1870	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`31477`	`103.6`	`3.2`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[EDO]A:1888	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`31477`	`103.6`	`3.6`	`0.552`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[EDO]B:1881	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`31835`	`103.5`	`4.1`	`0.664`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[EDO]B:1875	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`31835`	`102.7`	`3.3`	`0.472`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		[EDO]B:1872	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`31835`	`99.1`	`3.0`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[EDO]B:1874	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`31835`	`98.4`	`6.4`	`0.859`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		B	`16`	`7`	`31835`	`x`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`13`	`6`	`31835`	`97.5`	`2.7`	`0.921`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[EDO]B:1888	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31835`	`95.7`	`2.2`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[EDO]B:1893	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`31835`	`93.6`	`3.7`	`0.524`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[EDO]A:1875	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`31477`	`93.3`	`2.5`	`0.267`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[EDO]B:1880	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`31835`	`92.8`	`4.4`	`0.589`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[EDO]A:1866	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`31477`	`92.3`	`2.5`	`0.495`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[EDO]B:1882	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`31835`	`92.0`	`2.3`	`0.479`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[EDO]B:1879	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`31835`	`91.6`	`3.2`	`0.461`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[EDO]B:1891	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`31835`	`91.5`	`2.6`	`0.455`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		A	`10`	`3`	`31477`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`9`	`4`	`31477`	`86.2`	`-0.2`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[EDO]B:1878	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`31835`	`84.4`	`2.5`	`0.305`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[BR]A:1882	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`31477`	`83.2`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`44`		[BR]B:1887	`1`	`1`	`133`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`31835`	`81.3`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`82.3`	`-11.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
42	`45`		[BR]A:1878	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`31477`	`78.7`	`-12.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	`46`		[BR]B:1884	`1`	`1`	`133`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`31835`	`77.4`	`-11.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`78.1`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
43	`47`		[EDO]B:1895	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`31835`	`73.2`	`1.8`	`0.221`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[CL]A:1885	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`31477`	`73.1`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
45	`49`		[BR]A:1886	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`31477`	`72.4`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
46	`50`		[EDO]B:1892	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`31835`	`72.2`	`1.2`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`51`		[BR]A:1880	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`31477`	`70.4`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
48	`52`		[EDO]A:1887	`3`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`31477`	`66.2`	`1.7`	`0.239`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		[BR]A:1881	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`31477`	`65.5`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`54`		[BR]B:1886	`1`	`1`	`133`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`31835`	`64.5`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`65.0`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
50	`55`		[CL]B:1894	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`31835`	`65.2`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
51	`56`		[BR]B:1885	`1`	`1`	`133`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`31835`	`64.7`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`57`		[BR]A:1883	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`31477`	`64.2`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`64.5`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
52	`58`		[CL]B:1889	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`31835`	`61.9`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
53	`59`		[BR]A:1879	`1`	`1`	`133`	`f`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`9`	`5`	`31835`	`57.4`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
54	`60`		[CL]B:1896	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`31835`	`54.9`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
55	`61`		[EDO]B:1880	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`31477`	`54.4`	`1.1`	`0.755`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`62`		[CL]A:1889	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`31477`	`53.6`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
57	`63`		[EDO]B:1888	`3`	`1`	`184`	`f`	A	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`31477`	`51.9`	`1.2`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`64`		[EDO]A:1866	`4`	`1`	`184`	`f`	[MNM]A:1865	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`293`	`47.8`	`1.3`	`0.548`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
59	`65`		[EDO]A:1887	`2`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`31835`	`47.0`	`1.3`	`0.609`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`66`		[BR]A:1879	`1`	`1`	`133`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`31477`	`47.0`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`67`		[EDO]B:1882	`4`	`1`	`185`	`f`	[MNM]B:1868	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`297`	`44.4`	`1.1`	`0.615`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
62	`68`		[CL]B:1896	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`31477`	`42.8`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`69`		B	`8`	`3`	`31835`	`f`	[EDO]A:1870	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`183`	`42.8`	`1.0`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`70`		[EDO]B:1891	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]B:1878	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`28.0`	`0.7`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
65	`71`		[EDO]A:1888	`3`	`1`	`182`	`f`	[EDO]A:1875	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`27.3`	`1.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`72`		[CL]B:1889	`1`	`1`	`125`	`f`	[EDO]B:1891	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`26.1`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
67	`73`		[EDO]B:1882	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:1877	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`23.6`	`1.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`74`		[BR]A:1880	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]A:1888	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`182`	`20.2`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`75`		[BR]B:1885	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]B:1891	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`13.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`16.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
69	`76`		[EDO]A:1873	`3`	`1`	`187`	`f`	[EDO]A:1867	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`186`	`18.0`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`77`		[EDO]A:1884	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:1866	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`17.9`	`1.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`78`		[EDO]B:1877	`2`	`1`	`183`	`f`	[MNM]B:1868	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`297`	`17.4`	`1.1`	`0.653`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`79`		[BR]A:1880	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]A:1875	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`15.8`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
73	`80`		[CL]B:1889	`1`	`1`	`125`	`f`	[EDO]B:1878	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`13.5`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
74	`81`		[EDO]B:1872	`1`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`31477`	`11.8`	`0.3`	`0.911`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`82`		[EDO]A:1884	`1`	`1`	`183`	`f`	[MNM]A:1865	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`293`	`11.2`	`0.7`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`83`		A	`2`	`1`	`31477`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`31835`	`10.5`	`-0.0`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`84`		[BR]B:1884	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]B:1892	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`10.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
78	`85`		[BR]A:1883	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]A:1875	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`10.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
79	`86`		[BR]B:1886	`1`	`1`	`133`	`f`	[EDO]B:1879	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`8.7`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
80	`87`		[BR]A:1882	`1`	`1`	`133`	`f`	[BR]A:1878	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`133`	`8.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
81	`88`		[BR]B:1887	`1`	`1`	`133`	`f`	[BR]B:1884	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`133`	`8.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
82	`89`		[EDO]B:1892	`1`	`1`	`186`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`31477`	`7.7`	`0.1`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`90`		[BR]A:1882	`1`	`1`	`133`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`31835`	`5.0`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`91`		[EDO]B:1872	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:1869	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`3.4`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`92`		[EDO]B:1875	`1`	`1`	`183`	`f`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`31477`	`3.4`	`0.1`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`93`		B	`2`	`1`	`31835`	`f`	[EDO]A:1874	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`185`	`2.8`	`0.0`	`0.695`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`94`		[EDO]B:1883	`1`	`1`	`186`	`f`	[EDO]B:1874	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`2.7`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`95`		[EDO]A:1877	`1`	`1`	`187`	`f`	[EDO]A:1867	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`1.0`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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