PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=277-0I-692)

Interfaces in PDB 2vdc

THE 9.5 A RESOLUTION STRUCTURE OF GLUTAMATE SYNTHASE FROM CRYO-ELECTRON MICROSCOPY AND ITS OLIGOMERIZATION BEHAVIOR IN SOLUTION: FUNCTIONAL IMPLICATIONS.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`246`	`70`	`49043`	`◊`	D	`247`	`69`	`49063`	`2256.1`	`-7.0`	`0.423`	`29`	`19`	`0`	`0.000`
	`2`		E	`246`	`72`	`49041`	`◊`	F	`246`	`69`	`49055`	`2253.7`	`-6.9`	`0.425`	`29`	`19`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`246`	`70`	`49030`	`◊`	B	`246`	`69`	`49055`	`2248.3`	`-6.8`	`0.429`	`29`	`19`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`2252.7`	`-6.9`	`0.426`	`29`	`19`	`0`	`0.000`
2	`4`		C	`91`	`27`	`49043`	`◊`	K	`103`	`28`	`21846`	`906.4`	`-6.6`	`0.297`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		E	`89`	`27`	`49041`	`◊`	L	`101`	`28`	`21834`	`906.4`	`-6.5`	`0.299`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`91`	`27`	`49030`	`◊`	J	`102`	`28`	`21813`	`906.3`	`-6.7`	`0.295`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		F	`90`	`29`	`49055`	`◊`	I	`97`	`27`	`21849`	`901.2`	`-5.8`	`0.370`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		D	`90`	`29`	`49063`	`◊`	H	`98`	`27`	`21840`	`898.9`	`-5.9`	`0.364`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`90`	`29`	`49055`	`◊`	G	`96`	`27`	`21816`	`897.5`	`-5.8`	`0.362`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`902.8`	`-6.2`	`0.331`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
3	`10`		B	`101`	`33`	`49055`	`◊`	F	`82`	`18`	`49055`	`813.3`	`4.9`	`0.905`	`10`	`5`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`82`	`18`	`49055`	`◊`	D	`100`	`34`	`49063`	`812.3`	`5.0`	`0.908`	`10`	`5`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`81`	`18`	`49063`	`◊`	F	`102`	`34`	`49055`	`810.2`	`4.9`	`0.906`	`10`	`5`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`97`	`32`	`49030`	`◊`	C	`83`	`19`	`49043`	`788.5`	`2.4`	`0.775`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	`14`		C	`98`	`33`	`49043`	`◊`	E	`80`	`18`	`49041`	`788.1`	`2.4`	`0.773`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	`15`		A	`79`	`18`	`49030`	`◊`	E	`99`	`32`	`49041`	`787.8`	`2.4`	`0.772`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`800.0`	`3.7`	`0.840`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
4	`16`		J	`101`	`42`	`21813`	`◊`	[FAD]J:484	`52`	`1`	`1009`	`737.2`	`-6.9`	`0.510`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		I	`101`	`41`	`21849`	`◊`	[FAD]I:484	`53`	`1`	`1010`	`736.5`	`-6.9`	`0.507`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		K	`100`	`40`	`21846`	`◊`	[FAD]K:484	`52`	`1`	`1010`	`736.3`	`-6.8`	`0.501`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		G	`99`	`42`	`21816`	`◊`	[FAD]G:484	`51`	`1`	`1007`	`735.4`	`-6.9`	`0.503`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		H	`103`	`42`	`21840`	`◊`	[FAD]H:484	`52`	`1`	`1005`	`735.1`	`-6.9`	`0.510`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		L	`103`	`41`	`21834`	`◊`	[FAD]L:484	`53`	`1`	`1006`	`734.6`	`-6.9`	`0.509`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`735.8`	`-6.9`	`0.507`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
5	`22`		D	`65`	`32`	`49063`	`◊`	[FMN]D:2474	`31`	`1`	`609`	`432.1`	`-5.8`	`0.410`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		B	`64`	`32`	`49055`	`◊`	[FMN]B:2474	`31`	`1`	`609`	`432.0`	`-5.7`	`0.407`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		F	`64`	`32`	`49055`	`◊`	[FMN]F:2474	`31`	`1`	`608`	`430.8`	`-5.7`	`0.409`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		E	`65`	`31`	`49041`	`◊`	[FMN]E:2474	`31`	`1`	`597`	`427.0`	`-5.4`	`0.374`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`62`	`31`	`49043`	`◊`	[FMN]C:2474	`31`	`1`	`596`	`426.9`	`-5.5`	`0.373`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		A	`62`	`31`	`49030`	`◊`	[FMN]A:2474	`31`	`1`	`595`	`426.3`	`-5.5`	`0.368`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`429.2`	`-5.6`	`0.390`	`15`	`0`	`0`	`0.000`
6	`28`		B	`40`	`11`	`49055`	`◊`	H	`44`	`15`	`21840`	`387.6`	`1.9`	`0.746`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		F	`40`	`11`	`49055`	`◊`	G	`45`	`15`	`21816`	`387.4`	`1.9`	`0.751`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		D	`40`	`11`	`49063`	`◊`	I	`46`	`15`	`21849`	`386.4`	`1.9`	`0.757`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		C	`41`	`11`	`49043`	`◊`	J	`46`	`15`	`21813`	`367.8`	`0.6`	`0.722`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		E	`41`	`11`	`49041`	`◊`	K	`46`	`15`	`21846`	`367.6`	`0.6`	`0.719`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		A	`41`	`11`	`49030`	`◊`	L	`45`	`15`	`21834`	`366.4`	`0.6`	`0.715`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`377.2`	`1.2`	`0.735`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`34`		L	`29`	`17`	`21834`	`◊`	[SF4]L:482	`8`	`1`	`312`	`190.6`	`-21.0`	`0.487`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		J	`30`	`17`	`21813`	`◊`	[SF4]J:482	`8`	`1`	`310`	`189.7`	`-20.9`	`0.417`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		K	`29`	`17`	`21846`	`◊`	[SF4]K:482	`8`	`1`	`310`	`189.4`	`-20.8`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		H	`27`	`17`	`21840`	`◊`	[SF4]H:482	`8`	`1`	`310`	`189.3`	`-20.9`	`0.401`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		G	`30`	`17`	`21816`	`◊`	[SF4]G:482	`8`	`1`	`309`	`188.9`	`-20.8`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		I	`30`	`17`	`21849`	`◊`	[SF4]I:482	`8`	`1`	`309`	`188.7`	`-20.7`	`0.416`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`189.4`	`-20.9`	`0.425`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`40`		D	`33`	`16`	`49063`	`◊`	[AKG]D:2475	`10`	`1`	`294`	`174.9`	`0.7`	`0.413`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		B	`33`	`16`	`49055`	`◊`	[AKG]B:2475	`10`	`1`	`292`	`174.1`	`0.7`	`0.400`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		F	`33`	`16`	`49055`	`◊`	[AKG]F:2475	`10`	`1`	`294`	`174.0`	`0.7`	`0.398`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		C	`32`	`16`	`49043`	`◊`	[AKG]C:2475	`10`	`1`	`290`	`172.6`	`3.3`	`0.620`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		A	`32`	`16`	`49030`	`◊`	[AKG]A:2475	`10`	`1`	`291`	`172.5`	`3.2`	`0.620`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		E	`32`	`16`	`49041`	`◊`	[AKG]E:2475	`10`	`1`	`289`	`171.2`	`3.3`	`0.621`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`173.2`	`2.0`	`0.512`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
9	`46`		H	`27`	`15`	`21840`	`◊`	[SF4]H:483	`8`	`1`	`309`	`171.9`	`-19.4`	`0.398`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		G	`26`	`15`	`21816`	`◊`	[SF4]G:483	`8`	`1`	`309`	`171.3`	`-19.3`	`0.397`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		I	`26`	`15`	`21849`	`◊`	[SF4]I:483	`8`	`1`	`308`	`170.8`	`-19.2`	`0.369`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		L	`27`	`15`	`21834`	`◊`	[SF4]L:483	`8`	`1`	`309`	`169.3`	`-19.1`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		J	`26`	`15`	`21813`	`◊`	[SF4]J:483	`8`	`1`	`309`	`168.9`	`-19.1`	`0.396`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		K	`26`	`15`	`21846`	`◊`	[SF4]K:483	`8`	`1`	`308`	`168.5`	`-19.0`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`170.1`	`-19.2`	`0.371`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`52`		B	`20`	`13`	`49055`	`◊`	[F3S]B:2476	`7`	`1`	`287`	`151.0`	`-16.6`	`0.342`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		D	`20`	`13`	`49063`	`◊`	[F3S]D:2476	`7`	`1`	`288`	`151.0`	`-16.6`	`0.341`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		F	`22`	`13`	`49055`	`◊`	[F3S]F:2476	`7`	`1`	`288`	`151.0`	`-16.6`	`0.403`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`151.0`	`-16.6`	`0.362`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
11	`55`		C	`20`	`13`	`49043`	`c`	[F3S]C:2476	`7`	`1`	`284`	`147.0`	`-16.9`	`0.355`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		E	`23`	`13`	`49041`	`c`	[F3S]E:2476	`7`	`1`	`283`	`146.6`	`-16.9`	`0.381`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		A	`20`	`13`	`49030`	`c`	[F3S]A:2476	`7`	`1`	`284`	`146.3`	`-16.8`	`0.367`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`146.6`	`-16.9`	`0.368`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
12	`58`		[FMN]B:2474	`12`	`1`	`609`	`◊`	[AKG]B:2475	`7`	`1`	`292`	`50.6`	`1.6`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[FMN]F:2474	`12`	`1`	`608`	`◊`	[AKG]F:2475	`7`	`1`	`294`	`50.4`	`1.6`	`0.593`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[FMN]D:2474	`12`	`1`	`609`	`◊`	[AKG]D:2475	`6`	`1`	`294`	`50.3`	`1.6`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[FMN]C:2474	`12`	`1`	`596`	`◊`	[AKG]C:2475	`7`	`1`	`290`	`49.5`	`1.6`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[FMN]A:2474	`12`	`1`	`595`	`◊`	[AKG]A:2475	`7`	`1`	`291`	`49.3`	`1.7`	`0.570`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[FMN]E:2474	`12`	`1`	`597`	`◊`	[AKG]E:2475	`7`	`1`	`289`	`49.0`	`1.6`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`49.9`	`1.6`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`64`		E	`4`	`3`	`49041`	`◊`	[SF4]L:483	`4`	`1`	`309`	`33.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		A	`4`	`3`	`49030`	`◊`	[SF4]J:483	`4`	`1`	`309`	`33.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		C	`4`	`3`	`49043`	`◊`	[SF4]K:483	`4`	`1`	`308`	`33.4`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		F	`4`	`3`	`49055`	`◊`	[SF4]I:483	`4`	`1`	`308`	`30.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		D	`4`	`3`	`49063`	`◊`	[SF4]H:483	`4`	`1`	`309`	`29.6`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		B	`4`	`3`	`49055`	`◊`	[SF4]G:483	`4`	`1`	`309`	`29.6`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`31.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`70`		J	`3`	`1`	`21813`	`◊`	[F3S]A:2476	`3`	`1`	`284`	`27.3`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		K	`3`	`1`	`21846`	`◊`	[F3S]C:2476	`3`	`1`	`284`	`27.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		L	`3`	`1`	`21834`	`◊`	[F3S]E:2476	`3`	`1`	`283`	`27.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`73`		H	`4`	`1`	`21840`	`◊`	[F3S]D:2476	`3`	`1`	`288`	`26.6`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		I	`4`	`1`	`21849`	`◊`	[F3S]F:2476	`3`	`1`	`288`	`26.4`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		G	`4`	`1`	`21816`	`◊`	[F3S]B:2476	`3`	`1`	`287`	`26.1`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`26.4`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe