PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=262-03-APB)

Interfaces in PDB 2q7y crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.95 Å

STRUCTURE OF THE ENDOGENOUS INKT CELL LIGAND IGB3 BOUND TO MCD1D

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`124`	`28`	`6243`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`131`	`41`	`15182`	`1158.2`	`-14.9`	`0.131`	`14`	`7`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`116`	`28`	`6279`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`126`	`41`	`15229`	`1149.6`	`-15.8`	`0.106`	`12`	`6`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1153.9`	`-15.3`	`0.118`	`13`	`7`	`0`	`1.000`
2	`3`		[IGC]A:601	`36`	`1`	`1007`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`88`	`35`	`15182`	`652.1`	`-3.3`	`0.311`	`3`	`0`	`0`	`1.000`
	`4`		[IGC]C:602	`33`	`1`	`1201`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`81`	`33`	`15229`	`638.4`	`-4.0`	`0.255`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`645.3`	`-3.7`	`0.283`	`5`	`0`	`0`	`1.000`
3	`5`		C	`53`	`15`	`15229`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`53`	`14`	`6279`	`483.3`	`-6.3`	`0.249`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`48`	`14`	`15182`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`51`	`13`	`6243`	`465.7`	`-5.1`	`0.258`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`474.5`	`-5.7`	`0.254`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
4	`7`		[PLM]A:701	`18`	`1`	`559`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`25`	`15182`	`409.4`	`-0.6`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.135`
	`8`		[PLM]C:702	`18`	`1`	`557`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`61`	`25`	`15229`	`398.5`	`-0.9`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.135`
	*Average:*													`403.9`	`-0.8`	`0.195`	`0`	`0`	`0`	`0.135`
5	`9`		C	`36`	`11`	`15229`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`15182`	`395.4`	`-2.0`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		A	`36`	`12`	`15182`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`44`	`11`	`15182`	`384.2`	`-4.7`	`0.221`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		C	`40`	`11`	`15229`	`x`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`40`	`10`	`15229`	`358.5`	`-4.1`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		A	`22`	`10`	`15182`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`28`	`10`	`15229`	`241.7`	`-0.5`	`0.657`	`1`	`2`	`0`	`0.052`
9	`13`		A	`21`	`8`	`15182`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`8`	`15229`	`210.9`	`1.7`	`0.713`	`4`	`0`	`0`	`0.002`
10	`14`		B	`18`	`7`	`6243`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`15229`	`172.9`	`-0.5`	`0.593`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		[NAG]A:511	`13`	`1`	`367`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`15182`	`157.3`	`3.3`	`0.353`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]C:502	`13`	`1`	`367`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`15229`	`155.8`	`3.3`	`0.355`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`156.5`	`3.3`	`0.354`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[NAG]A:501	`11`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`15182`	`145.6`	`5.5`	`0.582`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]C:501	`11`	`1`	`361`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`15229`	`134.6`	`5.3`	`0.583`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`140.1`	`5.4`	`0.583`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		A	`16`	`6`	`15182`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`13`	`5`	`6279`	`141.8`	`0.8`	`0.756`	`2`	`2`	`0`	`0.016`
14	`20`		[NAG]A:500	`11`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`15182`	`126.9`	`3.2`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		C	`13`	`4`	`15229`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`17`	`6`	`15182`	`126.4`	`-0.2`	`0.657`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
16	`22`		[MAN]A:515	`9`	`1`	`292`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`16`	`6`	`15229`	`112.4`	`2.1`	`0.362`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[NAG]C:500	`11`	`1`	`358`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`15229`	`109.6`	`2.0`	`0.257`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[NAG]A:501	`9`	`1`	`363`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`11`	`5`	`15229`	`86.7`	`1.2`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[NAG]C:503	`8`	`1`	`359`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`15229`	`86.4`	`1.5`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`26`		[NAG]A:512	`8`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`15182`	`84.7`	`0.7`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`27`		A	`8`	`3`	`15182`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`15182`	`80.4`	`1.0`	`0.821`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		C	`2`	`2`	`15229`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`15229`	`6.0`	`0.1`	`0.669`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`43.2`	`0.5`	`0.745`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`29`		[BMA]A:513	`7`	`1`	`290`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`9`	`4`	`15229`	`77.6`	`1.4`	`0.298`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
23	`30`		[NAG]A:512	`10`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:511	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`367`	`73.7`	`2.0`	`0.091`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`31`		[NAG]A:502	`10`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`73.1`	`1.7`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`32`		[NAG]C:503	`10`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`367`	`71.4`	`1.7`	`0.083`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`33`		[BMA]A:513	`6`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]A:512	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`362`	`63.8`	`1.4`	`0.143`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`34`		[NAG]A:511	`9`	`1`	`367`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`15182`	`63.0`	`0.3`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[NAG]C:502	`9`	`1`	`367`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`15229`	`56.9`	`0.6`	`0.189`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`60.0`	`0.5`	`0.160`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`36`		[NAG]A:511	`5`	`1`	`367`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`6243`	`58.9`	`1.8`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[NAG]C:502	`5`	`1`	`367`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`6279`	`58.2`	`1.8`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`58.5`	`1.8`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`38`		[MAN]A:514	`6`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]A:513	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`58.3`	`2.6`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		[NAG]A:502	`3`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15182`	`56.2`	`0.8`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		[MAN]A:515	`6`	`1`	`292`	`f`	[NAG]A:512	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`54.9`	`1.9`	`0.174`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`41`		[IGC]C:602	`5`	`1`	`1201`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`6279`	`54.5`	`0.6`	`0.607`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		[MAN]A:515	`6`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]A:513	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`290`	`52.9`	`2.2`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`43`		[NAG]A:502	`5`	`1`	`365`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`3`	`15229`	`47.7`	`1.0`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`44`		[PLM]C:702	`4`	`1`	`557`	`f`	[IGC]C:602	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1201`	`45.5`	`-1.0`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.226`
	`45`		[PLM]A:701	`4`	`1`	`559`	`f`	[IGC]A:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1007`	`42.2`	`-1.0`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.226`
	*Average:*													`43.8`	`-1.0`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.226`
36	`46`		[NAG]C:503	`7`	`1`	`359`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`15229`	`45.4`	`1.1`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[MAN]A:514	`3`	`1`	`292`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`2`	`15229`	`42.9`	`1.5`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		[NAG]C:501	`7`	`1`	`361`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`3`	`1`	`15182`	`42.0`	`1.0`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		B	`4`	`1`	`6243`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`7`	`3`	`15182`	`39.0`	`-0.6`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[IGC]A:601	`5`	`1`	`1007`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`15182`	`37.5`	`0.9`	`0.745`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[IGC]C:602	`5`	`1`	`1201`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`7`	`2`	`15229`	`36.4`	`-0.1`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		A	`2`	`2`	`15182`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`4`	`6279`	`32.8`	`0.6`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[NAG]A:512	`4`	`1`	`362`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`15182`	`27.5`	`0.7`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		D	`4`	`2`	`6279`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6243`	`26.6`	`-0.8`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`55`		[MAN]A:514	`3`	`1`	`292`	`f`	[NAG]A:512	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`362`	`17.7`	`0.6`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`56`		B	`2`	`1`	`6243`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`6279`	`16.8`	`-0.5`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
47	`57`		[MAN]A:515	`1`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15182`	`12.8`	`0.3`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`58`		A	`2`	`1`	`15182`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`15229`	`11.7`	`0.4`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`59`		D	`3`	`1`	`6279`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`1`	`1`	`15229`	`10.4`	`-0.2`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`60`		[BMA]A:513	`1`	`1`	`290`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15182`	`8.0`	`0.2`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`61`		[NAG]A:500	`1`	`1`	`358`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`15229`	`4.6`	`0.2`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`62`		[NAG]A:512	`2`	`1`	`362`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`6243`	`3.9`	`0.1`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`63`		[NAG]A:512	`1`	`1`	`362`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`15229`	`3.4`	`0.0`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`64`		[NAG]C:503	`2`	`1`	`359`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`6279`	`2.1`	`0.1`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`65`		[NAG]C:500	`1`	`1`	`358`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`15229`	`1.5`	`0.1`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`66`		[MAN]A:515	`1`	`1`	`292`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15182`	`0.3`	`0.0`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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