PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=955-90-2CB)

Interfaces in PDB 2nx3 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

STRUCTURAL AND MECHANISTIC CHANGES ALONG AN ENGINEERED PATH FROM METALLO TO NON-METALLO KDO8P SYNTHASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`184`	`47`	`12003`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`183`	`46`	`12049`	`1779.9`	`-8.6`	`0.424`	`25`	`9`	`0`	`0.454`
	`2`		B	`186`	`49`	`12012`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`186`	`47`	`11895`	`1771.5`	`-8.4`	`0.498`	`28`	`10`	`0`	`0.454`
	`3`		D	`186`	`46`	`11949`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`187`	`46`	`11919`	`1771.0`	`-8.1`	`0.513`	`25`	`9`	`0`	`0.454`
	`4`		H	`185`	`47`	`12081`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`181`	`47`	`11882`	`1759.8`	`-8.1`	`0.494`	`28`	`10`	`0`	`0.454`
	`5`		F	`189`	`47`	`11911`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`182`	`48`	`11654`	`1757.4`	`-6.4`	`0.611`	`27`	`11`	`0`	`0.454`
	`6`		L	`181`	`45`	`12037`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`184`	`46`	`11948`	`1748.1`	`-7.7`	`0.481`	`26`	`8`	`0`	`0.454`
	*Average:*													`1764.6`	`-7.9`	`0.503`	`27`	`10`	`0`	`0.454`
2	`7`		C	`139`	`37`	`11919`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`137`	`37`	`12012`	`1355.5`	`-17.7`	`0.041`	`15`	`8`	`0`	`0.464`
	`8`		L	`136`	`37`	`12037`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`135`	`37`	`12049`	`1341.9`	`-15.5`	`0.066`	`16`	`8`	`0`	`0.464`
	`9`		K	`131`	`37`	`11948`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`135`	`37`	`12003`	`1340.9`	`-15.6`	`0.059`	`15`	`6`	`0`	`0.464`
	`10`		H	`133`	`37`	`12081`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`138`	`38`	`11654`	`1334.0`	`-15.1`	`0.094`	`15`	`8`	`0`	`0.464`
	`11`		D	`137`	`38`	`11949`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`136`	`37`	`11895`	`1331.5`	`-19.0`	`0.025`	`18`	`8`	`0`	`0.464`
	`12`		G	`137`	`37`	`11882`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`140`	`38`	`11911`	`1319.7`	`-16.4`	`0.064`	`18`	`7`	`0`	`0.464`
	*Average:*													`1337.2`	`-16.6`	`0.058`	`16`	`8`	`0`	`0.464`
3	`13`		[1NT]D:268	`25`	`1`	`534`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`53`	`24`	`11949`	`367.3`	`-10.1`	`0.666`	`23`	`0`	`0`	`0.364`
4	`14`		G	`28`	`6`	`11882`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`11`	`11895`	`281.5`	`0.5`	`0.692`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`15`		J	`25`	`8`	`12003`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`37`	`11`	`11882`	`259.4`	`0.2`	`0.562`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`270.5`	`0.3`	`0.627`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
5	`16`		J	`36`	`11`	`12003`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`27`	`8`	`11895`	`250.0`	`0.5`	`0.658`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
6	`17`		L	`30`	`7`	`12037`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`27`	`8`	`11949`	`247.8`	`-2.2`	`0.369`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
7	`18`		C	`30`	`8`	`11919`	`◊`	F	x-1,y,z-1	`1_454`	`28`	`7`	`11911`	`241.9`	`-1.8`	`0.437`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`19`		[A5P]K:269	`14`	`1`	`368`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`36`	`14`	`11948`	`224.3`	`-1.1`	`0.642`	`13`	`0`	`0`	`0.152`
	`20`		[A5P]C:269	`14`	`1`	`367`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`36`	`14`	`11919`	`216.9`	`-2.0`	`0.627`	`14`	`0`	`0`	`0.152`
	*Average:*													`220.6`	`-1.6`	`0.635`	`14`	`0`	`0`	`0.152`
9	`21`		[A5P]E:269	`14`	`1`	`357`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`39`	`15`	`11654`	`223.0`	`-1.1`	`0.670`	`11`	`0`	`0`	`0.129`
	`22`		[A5P]A:269	`14`	`1`	`358`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`14`	`11895`	`213.0`	`-1.8`	`0.603`	`9`	`0`	`0`	`0.129`
	*Average:*													`218.0`	`-1.5`	`0.637`	`10`	`0`	`0`	`0.129`
10	`23`		[A5P]I:269	`14`	`1`	`372`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`36`	`15`	`12049`	`218.6`	`-2.5`	`0.599`	`15`	`0`	`0`	`0.177`
11	`24`		[A5P]F:269	`14`	`1`	`357`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`36`	`15`	`11911`	`217.5`	`-1.8`	`0.605`	`14`	`0`	`0`	`0.171`
12	`25`		[A5P]L:269	`14`	`1`	`369`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`35`	`16`	`12037`	`216.4`	`-1.8`	`0.646`	`11`	`0`	`0`	`0.151`
	`26`		[A5P]G:269	`14`	`1`	`367`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`38`	`15`	`11882`	`215.0`	`-2.3`	`0.605`	`12`	`0`	`0`	`0.151`
	*Average:*													`215.7`	`-2.1`	`0.626`	`12`	`0`	`0`	`0.151`
13	`27`		[A5P]J:269	`14`	`1`	`371`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`37`	`15`	`12003`	`216.2`	`-2.3`	`0.614`	`14`	`0`	`0`	`0.184`
	`28`		[A5P]H:269	`14`	`1`	`368`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`37`	`17`	`12081`	`213.3`	`-1.6`	`0.626`	`13`	`0`	`0`	`0.184`
	`29`		[A5P]B:269	`14`	`1`	`367`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`15`	`12012`	`212.9`	`-2.6`	`0.583`	`15`	`0`	`0`	`0.184`
	*Average:*													`214.1`	`-2.2`	`0.608`	`14`	`0`	`0`	`0.184`
14	`30`		G	`21`	`7`	`11882`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`12012`	`201.4`	`1.9`	`0.782`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`31`		J	`24`	`9`	`12003`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`12081`	`196.5`	`2.3`	`0.769`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`32`		I	`17`	`6`	`12049`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`8`	`11895`	`181.9`	`0.1`	`0.443`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`193.3`	`1.4`	`0.665`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
15	`33`		I	`23`	`7`	`12049`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`6`	`12003`	`191.7`	`0.8`	`0.727`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`34`		G	`16`	`5`	`11882`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`6`	`12081`	`161.1`	`0.6`	`0.708`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`35`		B	`20`	`6`	`12012`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`11895`	`160.2`	`0.3`	`0.678`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`171.0`	`0.6`	`0.704`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
16	`36`		C	`21`	`7`	`11919`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`23`	`6`	`11654`	`189.9`	`-0.8`	`0.570`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		L	`18`	`7`	`12037`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`24`	`9`	`11919`	`162.8`	`0.2`	`0.626`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`176.3`	`-0.3`	`0.598`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`38`		D	`22`	`6`	`11949`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`12012`	`186.5`	`-3.8`	`0.135`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`39`		C	`21`	`6`	`11919`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11895`	`186.4`	`-3.6`	`0.145`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`40`		G	`21`	`6`	`11882`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11654`	`185.4`	`-3.9`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`41`		K	`20`	`6`	`11948`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`12049`	`185.1`	`-3.8`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`42`		L	`23`	`6`	`12037`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`12003`	`185.1`	`-3.7`	`0.145`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`43`		H	`21`	`6`	`12081`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`11911`	`179.2`	`-3.7`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	*Average:*													`184.6`	`-3.7`	`0.137`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
18	`44`		[PEP]J:268	`10`	`1`	`285`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`27`	`16`	`12003`	`172.6`	`-2.9`	`0.679`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`45`		[PEP]B:268	`10`	`1`	`284`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`15`	`12012`	`172.0`	`-3.0`	`0.695`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`46`		[PEP]K:268	`10`	`1`	`282`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`28`	`16`	`11948`	`171.4`	`-3.5`	`0.662`	`7`	`0`	`0`	`0.292`
	`47`		[PEP]E:268	`10`	`1`	`283`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`11654`	`170.9`	`-3.0`	`0.706`	`11`	`0`	`0`	`0.292`
	`48`		[PEP]A:268	`10`	`1`	`284`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`17`	`11895`	`170.8`	`-3.0`	`0.708`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`49`		[PEP]I:268	`10`	`1`	`283`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`28`	`16`	`12049`	`169.6`	`-3.1`	`0.685`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`50`		[PEP]H:268	`10`	`1`	`281`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`29`	`17`	`12081`	`168.8`	`-2.9`	`0.703`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`51`		[PEP]G:268	`10`	`1`	`284`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`26`	`16`	`11882`	`168.4`	`-2.8`	`0.713`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
	`52`		[PEP]C:268	`10`	`1`	`282`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`16`	`11919`	`168.1`	`-3.3`	`0.691`	`8`	`0`	`0`	`0.292`
	`53`		[PEP]L:268	`10`	`1`	`282`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`28`	`16`	`12037`	`165.3`	`-2.8`	`0.695`	`8`	`0`	`0`	`0.292`
	*Average:*													`169.8`	`-3.0`	`0.694`	`9`	`0`	`0`	`0.292`
19	`54`		[PEP]F:268	`10`	`1`	`282`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`25`	`15`	`11911`	`171.1`	`-3.1`	`0.670`	`9`	`0`	`0`	`0.153`
20	`55`		L	`12`	`5`	`12037`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`4`	`12003`	`136.8`	`2.3`	`0.805`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		C	`14`	`6`	`11919`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`11895`	`123.2`	`1.1`	`0.738`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`57`		G	`14`	`4`	`11882`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`4`	`11654`	`108.3`	`0.1`	`0.666`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`122.8`	`1.2`	`0.737`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
21	`58`		I	`8`	`4`	`12049`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`6`	`12081`	`91.4`	`1.6`	`0.805`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
	`59`		B	`16`	`8`	`12012`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`12081`	`91.0`	`1.8`	`0.839`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`60`		I	`15`	`6`	`12049`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`11`	`4`	`12012`	`90.1`	`1.8`	`0.850`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`90.8`	`1.8`	`0.831`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
22	`61`		I	`6`	`2`	`12049`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`11882`	`88.6`	`-1.2`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		H	`6`	`2`	`12081`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`11895`	`82.2`	`-1.5`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		J	`10`	`3`	`12003`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`5`	`2`	`12012`	`74.9`	`-0.6`	`0.473`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`81.9`	`-1.1`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`64`		[A5P]I:269	`5`	`1`	`372`	`f`	[PEP]I:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`283`	`53.2`	`1.5`	`0.850`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`65`		[A5P]H:269	`5`	`1`	`368`	`f`	[PEP]H:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`281`	`53.1`	`0.8`	`0.819`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	`66`		[A5P]B:269	`5`	`1`	`367`	`f`	[PEP]B:268	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`284`	`53.0`	`1.5`	`0.841`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	`67`		[A5P]J:269	`5`	`1`	`371`	`f`	[PEP]J:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`285`	`52.6`	`1.3`	`0.844`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`52.9`	`1.2`	`0.835`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
25	`68`		[A5P]G:269	`5`	`1`	`367`	`f`	[PEP]G:268	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`284`	`52.5`	`0.6`	`0.792`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
	`69`		[A5P]K:269	`5`	`1`	`368`	`f`	[PEP]K:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`282`	`51.5`	`0.6`	`0.792`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	`70`		[A5P]L:269	`5`	`1`	`369`	`f`	[PEP]L:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`282`	`50.3`	`1.1`	`0.824`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`51.4`	`0.8`	`0.802`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
26	`71`		[A5P]A:269	`5`	`1`	`358`	`f`	[PEP]A:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`284`	`51.7`	`0.6`	`0.784`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[A5P]E:269	`5`	`1`	`357`	`f`	[PEP]E:268	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`283`	`48.3`	`0.9`	`0.804`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.0`	`0.8`	`0.794`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`73`		[A5P]C:269	`4`	`1`	`367`	`f`	[PEP]C:268	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`282`	`51.2`	`0.8`	`0.808`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`74`		K	`7`	`3`	`11948`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`9`	`4`	`11654`	`50.8`	`-0.1`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`75`		[A5P]F:269	`4`	`1`	`357`	`f`	[PEP]F:268	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`282`	`46.7`	`0.8`	`0.811`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`76`		[A5P]G:269	`5`	`1`	`367`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12081`	`38.6`	`0.9`	`0.809`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		[A5P]L:269	`4`	`1`	`369`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11948`	`32.6`	`1.3`	`0.818`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.6`	`1.1`	`0.813`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`78`		[A5P]A:269	`8`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12012`	`37.2`	`0.8`	`0.792`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`79`		[A5P]C:269	`6`	`1`	`367`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11949`	`35.9`	`0.4`	`0.766`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
	`80`		[A5P]K:269	`4`	`1`	`368`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12037`	`33.3`	`1.3`	`0.830`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`34.6`	`0.8`	`0.798`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
33	`81`		[A5P]J:269	`7`	`1`	`371`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12049`	`34.6`	`0.2`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	`82`		[A5P]B:269	`7`	`1`	`367`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11895`	`34.2`	`0.3`	`0.779`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	`83`		[A5P]H:269	`7`	`1`	`368`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11882`	`29.0`	`0.6`	`0.790`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`32.6`	`0.3`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
34	`84`		[1NT]D:268	`8`	`1`	`534`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11919`	`32.2`	`0.6`	`0.941`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`85`		[A5P]E:269	`6`	`1`	`357`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11911`	`31.6`	`0.9`	`0.772`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`86`		[A5P]I:269	`7`	`1`	`372`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12003`	`31.5`	`0.4`	`0.777`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
37	`87`		[A5P]F:269	`7`	`1`	`357`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11654`	`29.6`	`1.1`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`88`		K	`2`	`1`	`11948`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`11949`	`15.4`	`-0.1`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`89`		L	`1`	`1`	`12037`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`11911`	`2.7`	`0.1`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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