PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=664-94-F28)

Interfaces in PDB 2nug crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 1.70 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE III FROM AQUIFEX AEOLICUS COMPLEXED WITH DS-RNA AT 1.7-ANGSTROM RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`126`	`34`	`13041`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`122`	`35`	`12967`	`1242.2`	`-11.1`	`0.116`	`16`	`6`	`0`	`0.201`
2	`2`		F	`57`	`10`	`2657`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`59`	`10`	`2665`	`491.0`	`-4.1`	`0.967`	`18`	`0`	`0`	`0.438`
	`3`		E	`58`	`10`	`2659`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`60`	`10`	`2686`	`488.8`	`-4.3`	`0.969`	`18`	`0`	`0`	`0.438`
	*Average:*													`489.9`	`-4.2`	`0.968`	`18`	`0`	`0`	`0.438`
3	`4`		C	`50`	`7`	`2686`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`54`	`19`	`13041`	`463.8`	`-8.8`	`0.632`	`7`	`0`	`0`	`0.229`
	`5`		D	`49`	`7`	`2665`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`53`	`18`	`12967`	`462.0`	`-8.0`	`0.666`	`11`	`0`	`0`	`0.229`
	*Average:*													`462.9`	`-8.4`	`0.649`	`9`	`0`	`0`	`0.229`
4	`6`		C	`49`	`7`	`2686`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`21`	`12967`	`455.0`	`-7.3`	`0.588`	`9`	`0`	`0`	`0.213`
	`7`		D	`45`	`7`	`2665`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`52`	`22`	`13041`	`434.6`	`-9.0`	`0.412`	`8`	`0`	`0`	`0.213`
	*Average:*													`444.8`	`-8.1`	`0.500`	`9`	`0`	`0`	`0.213`
5	`8`		A	`47`	`15`	`12967`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`44`	`12`	`13041`	`432.2`	`-0.5`	`0.486`	`3`	`5`	`0`	`0.000`
6	`9`		E	`46`	`6`	`2659`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`53`	`14`	`13041`	`426.1`	`-4.2`	`0.705`	`6`	`0`	`0`	`0.091`
	`10`		F	`44`	`6`	`2657`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`14`	`12967`	`395.9`	`-4.6`	`0.603`	`5`	`0`	`0`	`0.091`
	*Average:*													`411.0`	`-4.4`	`0.654`	`6`	`0`	`0`	`0.091`
7	`11`		A	`46`	`13`	`12967`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`40`	`11`	`13041`	`385.2`	`0.1`	`0.501`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
8	`12`		B	`34`	`6`	`13041`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`38`	`7`	`12967`	`307.5`	`-1.3`	`0.449`	`3`	`0`	`0`	`0.020`
9	`13`		F	`35`	`7`	`2657`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`13041`	`269.3`	`-2.9`	`0.761`	`4`	`0`	`0`	`0.104`
	`14`		E	`33`	`7`	`2659`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`12967`	`241.0`	`-3.6`	`0.686`	`4`	`0`	`0`	`0.104`
	*Average:*													`255.1`	`-3.3`	`0.724`	`4`	`0`	`0`	`0.104`
10	`15`		A	`25`	`8`	`12967`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`25`	`8`	`12967`	`235.4`	`4.7`	`0.903`	`6`	`8`	`0`	`0.000`
11	`16`		D	`13`	`3`	`2665`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`2686`	`124.4`	`-0.7`	`0.798`	`6`	`0`	`0`	`0.019`
12	`17`		F	`18`	`1`	`2657`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`1`	`2686`	`111.6`	`0.1`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	`18`		E	`18`	`1`	`2659`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`1`	`2665`	`110.6`	`0.1`	`0.897`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`111.1`	`0.1`	`0.896`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
13	`19`		F	`10`	`3`	`2657`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`3`	`2659`	`98.7`	`-2.5`	`0.638`	`6`	`0`	`0`	`0.191`
14	`20`		D	`13`	`1`	`2665`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`1`	`2659`	`98.4`	`-0.3`	`0.809`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`21`		F	`11`	`1`	`2657`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`14`	`1`	`2686`	`91.5`	`-1.0`	`0.783`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`94.9`	`-0.7`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
15	`22`		[MG]B:518	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`13041`	`57.4`	`-6.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
16	`23`		[MG]B:509	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`13041`	`48.5`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`24`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`12967`	`48.3`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`48.4`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
17	`25`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`12967`	`44.0`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
	`26`		[MG]B:510	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13041`	`43.6`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
	*Average:*													`43.8`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
18	`27`		[MG]F:511	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2657`	`43.6`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.543`
	`28`		[MG]E:505	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2659`	`42.8`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.543`
	*Average:*													`43.2`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.543`
19	`29`		[MG]D:514	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`2665`	`39.3`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
	`30`		[MG]C:515	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`2686`	`34.0`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
	*Average:*													`36.7`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
20	`31`		[MG]A:517	`1`	`1`	`98`	`f`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`11`	`4`	`13041`	`38.7`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
21	`32`		[MG]B:508	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`13041`	`34.3`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
	`33`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`12967`	`33.8`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
	*Average:*													`34.0`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
22	`34`		B	`5`	`2`	`13041`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`2659`	`33.7`	`-0.4`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`35`		F	`1`	`1`	`2657`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`12967`	`14.5`	`-0.5`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`24.1`	`-0.5`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
23	`36`		[MG]A:506	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`12967`	`33.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
	`37`		[MG]B:512	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13041`	`30.5`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
	*Average:*													`31.9`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
24	`38`		[MG]B:507	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`13041`	`32.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	`39`		[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`12967`	`32.3`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	*Average:*													`32.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
25	`40`		[MG]A:517	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`12967`	`32.3`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`41`		[MG]C:519	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`2686`	`31.1`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	`42`		[MG]D:516	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`2665`	`30.3`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	*Average:*													`30.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
27	`43`		[MG]F:513	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`2657`	`28.6`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.265`
	`44`		[MG]F:513	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`3`	`2659`	`26.0`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.265`
	*Average:*													`27.3`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.265`
28	`45`		[MG]B:507	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2686`	`26.8`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
	`46`		[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2665`	`26.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
	*Average:*													`26.4`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
29	`47`		[MG]B:508	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2657`	`19.4`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	`48`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2659`	`19.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	*Average:*													`19.4`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
30	`49`		[MG]B:512	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2665`	`18.6`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`50`		[MG]A:506	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2686`	`17.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	*Average:*													`17.9`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
31	`51`		[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2659`	`17.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	`52`		[MG]B:507	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2657`	`16.9`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`17.1`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
32	`53`		[MG]B:509	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2657`	`16.9`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	`54`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2659`	`15.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`16.0`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
33	`55`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`13041`	`16.4`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	`56`		[MG]B:510	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`12967`	`15.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`15.8`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
34	`57`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2659`	`15.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	`58`		[MG]B:510	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2657`	`14.9`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`15.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
35	`59`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.8`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
36	`60`		[MG]B:509	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
37	`61`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
38	`62`		[MG]B:508	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.3`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
39	`63`		[MG]C:519	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2657`	`9.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`64`		[MG]D:516	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2659`	`9.0`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`9.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
40	`65`		[MG]B:508	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2686`	`5.7`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`66`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2665`	`5.5`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`67`		[MG]B:509	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2686`	`0.2`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`3.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
41	`68`		D	`1`	`1`	`2665`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`1`	`1`	`12967`	`4.9`	`-0.2`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`69`		B	`1`	`1`	`13041`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`1`	`1`	`13041`	`2.8`	`0.2`	`0.777`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`70`		[MG]B:510	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`2.2`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
44	`71`		[MG]F:511	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]B:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`2.1`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
45	`72`		[MG]D:516	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12967`	`1.8`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
46	`73`		[MG]E:505	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]A:503	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.7`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
47	`74`		[MG]D:514	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2657`	`1.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`75`		[MG]C:515	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2659`	`0.7`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`1.1`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
48	`76`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.5`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
49	`77`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.4`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
50	`78`		[MG]B:509	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.2`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
51	`79`		[MG]B:518	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2665`	`1.0`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
52	`80`		[MG]C:519	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2665`	`0.3`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`81`		[MG]E:505	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12967`	`0.1`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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