PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=146-IO-3DE)

Interfaces in PDB 2iso crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA- DIFLUOROMETHYLENE TRIPHOSPHATE

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`79`	`8`	`3781`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`27`	`17052`	`679.6`	`-3.8`	`0.462`	`14`	`0`	`0`	`0.106`
`2`		P	`42`	`9`	`2202`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`42`	`10`	`3781`	`431.7`	`-6.0`	`0.521`	`24`	`0`	`0`	`1.000`
`3`		D	`35`	`3`	`1373`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`16`	`17052`	`365.0`	`-7.3`	`0.390`	`9`	`0`	`0`	`0.113`
`4`		[GFF]A:338	`31`	`1`	`604`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`18`	`17052`	`307.1`	`2.2`	`0.529`	`7`	`0`	`0`	`0.010`
`5`		A	`23`	`9`	`17052`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`10`	`17052`	`241.0`	`4.5`	`0.923`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
`6`		P	`27`	`3`	`2202`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`16`	`17052`	`232.5`	`-6.4`	`0.217`	`4`	`0`	`0`	`0.088`
`7`		D	`23`	`5`	`1373`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`24`	`5`	`3781`	`232.2`	`-3.7`	`0.542`	`16`	`0`	`0`	`1.000`
`8`		A	`25`	`9`	`17052`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`26`	`10`	`17052`	`226.5`	`-2.3`	`0.202`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
`9`		A	`31`	`8`	`17052`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`8`	`17052`	`224.5`	`2.0`	`0.760`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
`10`		A	`26`	`9`	`17052`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`2`	`2202`	`198.9`	`1.9`	`0.575`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`17`	`8`	`17052`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`19`	`2`	`3781`	`164.2`	`-0.2`	`0.575`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`12`		A	`13`	`8`	`17052`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`14`	`6`	`17052`	`128.1`	`3.0`	`0.878`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
`13`		[DOC]P:10	`9`	`1`	`422`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`17052`	`118.8`	`0.7`	`0.366`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
`14`		D	`15`	`1`	`1373`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`3`	`17052`	`112.0`	`2.5`	`0.867`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		[DOC]P:10	`14`	`1`	`422`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`2202`	`111.1`	`2.6`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		A	`14`	`6`	`17052`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`10`	`3`	`17052`	`102.6`	`-0.6`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		T	`13`	`2`	`3781`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`12`	`3`	`17052`	`90.7`	`-0.6`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		[DOC]P:10	`12`	`1`	`422`	`◊`	[GFF]A:338	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`604`	`90.3`	`2.5`	`0.381`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		[GFF]A:338	`8`	`1`	`604`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`3781`	`74.3`	`1.0`	`0.581`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
`20`		[CL]A:343	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17052`	`73.4`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.131`
`21`		[CL]A:345	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`17052`	`72.8`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
`22`		[CL]A:346	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`17052`	`68.1`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
`23`		[CL]A:344	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17052`	`64.2`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
`24`		[DOC]P:10	`5`	`1`	`422`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3781`	`60.0`	`0.1`	`0.429`	`3`	`0`	`0`	`0.081`
`25`		[NA]A:342	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17052`	`59.9`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.098`
`26`		[NA]A:341	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17052`	`57.1`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
`27`		A	`7`	`2`	`17052`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`8`	`2`	`3781`	`54.7`	`-1.6`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`28`		[NA]A:340	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`17052`	`38.4`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
`29`		[NA]A:341	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2202`	`34.2`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
`30`		[MG]A:339	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`17052`	`32.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
`31`		D	`3`	`1`	`1373`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`3`	`1`	`3781`	`31.8`	`-0.0`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`32`		[NA]A:342	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1373`	`31.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
`33`		[GFF]A:338	`5`	`1`	`604`	`f`	[MG]A:339	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.3`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
`34`		[GFF]A:338	`6`	`1`	`604`	`f`	[NA]A:340	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`29.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
`35`		[DOC]P:10	`6`	`1`	`422`	`◊`	[NA]A:340	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`26.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
`36`		A	`4`	`3`	`17052`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`3781`	`24.1`	`-1.1`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`37`		[CL]A:344	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1373`	`14.8`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
`38`		[NA]A:340	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:339	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
`39`		[CL]A:346	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3781`	`6.7`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
`40`		A	`1`	`1`	`17052`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`17052`	`5.1`	`-0.2`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`41`		[CL]A:344	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3781`	`5.0`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
`42`		A	`1`	`1`	`17052`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2202`	`2.3`	`-0.1`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`43`		A	`1`	`1`	`17052`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`17052`	`0.2`	`0.0`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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