PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=936-04-GG2)

Interfaces in PDB 2ib5 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.80 Å

STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF A BLUE CHROMOPROTEIN AND ITS YELLOW MUTANT FROM THE SEA ANEMONE CNIDOPUS JAPONICUS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`187`	`47`	`10659`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`186`	`48`	`10663`	`1793.7`	`-17.4`	`0.141`	`26`	`8`	`0`	`0.587`
	`2`		H	`185`	`46`	`10593`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`188`	`47`	`10688`	`1780.9`	`-19.2`	`0.103`	`23`	`8`	`0`	`0.587`
	`3`		G	`186`	`47`	`10674`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`187`	`47`	`10498`	`1769.8`	`-20.1`	`0.078`	`23`	`8`	`0`	`0.587`
	`4`		D	`185`	`45`	`10595`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`192`	`47`	`10657`	`1767.6`	`-19.2`	`0.104`	`25`	`8`	`0`	`0.587`
	*Average:*													`1778.0`	`-19.0`	`0.106`	`24`	`8`	`0`	`0.587`
2	`5`		H	`125`	`31`	`10593`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`119`	`32`	`10674`	`1056.5`	`-8.6`	`0.314`	`17`	`0`	`0`	`0.471`
	`6`		D	`126`	`33`	`10595`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`122`	`33`	`10659`	`1053.3`	`-9.7`	`0.268`	`17`	`0`	`0`	`0.471`
	`7`		F	`118`	`30`	`10498`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`121`	`32`	`10688`	`1043.7`	`-9.1`	`0.286`	`17`	`0`	`0`	`0.471`
	`8`		B	`128`	`31`	`10663`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`120`	`30`	`10657`	`1016.8`	`-8.9`	`0.313`	`15`	`0`	`0`	`0.471`
	*Average:*													`1042.6`	`-9.1`	`0.295`	`17`	`0`	`0`	`0.471`
3	`9`		C	`46`	`15`	`10659`	`◊`	G	x-1,y,z-1	`1_454`	`37`	`12`	`10674`	`379.5`	`2.0`	`0.809`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		H	`39`	`11`	`10593`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`44`	`13`	`10498`	`361.0`	`0.9`	`0.753`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`42`	`12`	`10663`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`40`	`11`	`10595`	`337.9`	`-0.9`	`0.606`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`349.5`	`0.0`	`0.679`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
5	`12`		E	`36`	`8`	`10688`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`40`	`8`	`10663`	`354.2`	`-0.1`	`0.665`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`13`		C	`34`	`12`	`10659`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`31`	`12`	`10498`	`270.3`	`-0.1`	`0.658`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		C	`36`	`14`	`10659`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`34`	`13`	`10595`	`262.9`	`0.6`	`0.632`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		E	`33`	`13`	`10688`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`35`	`12`	`10498`	`261.5`	`-1.2`	`0.539`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`16`		C	`32`	`9`	`10659`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`11`	`10657`	`229.2`	`-0.3`	`0.618`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`17`		E	`24`	`7`	`10688`	`◊`	G	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`8`	`10674`	`220.0`	`-0.9`	`0.477`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`224.6`	`-0.6`	`0.547`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`18`		B	`19`	`8`	`10663`	`◊`	G	x,y,z-1	`1_554`	`18`	`5`	`10674`	`166.6`	`-0.9`	`0.488`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		H	`23`	`7`	`10593`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`10663`	`165.7`	`-0.5`	`0.598`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`20`		E	`15`	`3`	`10688`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`10659`	`132.6`	`-0.9`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`149.1`	`-0.7`	`0.496`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
12	`21`		H	`18`	`6`	`10593`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`6`	`10657`	`124.1`	`-1.4`	`0.419`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		G	`13`	`6`	`10674`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`10657`	`102.1`	`-0.2`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		F	`7`	`3`	`10498`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10595`	`69.5`	`-1.1`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`85.8`	`-0.7`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`24`		[PO4]H:2014	`5`	`1`	`188`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`10593`	`72.1`	`-3.4`	`0.872`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
	`25`		[PO4]B:2010	`5`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10663`	`69.4`	`-3.3`	`0.871`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
	*Average:*													`70.7`	`-3.3`	`0.871`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
15	`26`		[PO4]E:2013	`5`	`1`	`187`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`10593`	`70.9`	`-4.3`	`0.687`	`3`	`0`	`0`	`0.142`
16	`27`		[PO4]D:2012	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10595`	`68.4`	`-3.3`	`0.863`	`1`	`0`	`0`	`0.088`
17	`28`		[PO4]G:2016	`5`	`1`	`187`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10674`	`67.9`	`-3.1`	`0.875`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
18	`29`		[PO4]A:2009	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`10657`	`67.5`	`-3.2`	`0.874`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
19	`30`		[PO4]F:2015	`5`	`1`	`188`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`10498`	`65.4`	`-3.2`	`0.874`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
20	`31`		[PO4]B:2011	`5`	`1`	`187`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10659`	`64.4`	`-2.8`	`0.903`	`1`	`0`	`0`	`0.064`
21	`32`		[PO4]A:2009	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`10595`	`59.0`	`-3.6`	`0.564`	`1`	`0`	`0`	`0.096`
22	`33`		A	`8`	`3`	`10657`	`◊`	G	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`4`	`10674`	`57.8`	`0.3`	`0.677`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`34`		[PO4]A:2004	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`10657`	`56.9`	`-2.9`	`0.741`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
	`35`		[PO4]G:2006	`4`	`1`	`186`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`10674`	`51.9`	`-3.0`	`0.691`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
	*Average:*													`54.4`	`-2.9`	`0.716`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
24	`36`		[PO4]B:2010	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10659`	`56.1`	`-3.5`	`0.488`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
	`37`		[PO4]H:2014	`5`	`1`	`188`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10688`	`50.5`	`-3.1`	`0.499`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`53.3`	`-3.3`	`0.494`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
25	`38`		[PO4]B:2011	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10663`	`55.9`	`-3.5`	`0.526`	`1`	`0`	`0`	`0.120`
26	`39`		[PO4]F:2007	`5`	`1`	`187`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10498`	`55.4`	`-3.1`	`0.616`	`1`	`0`	`0`	`0.094`
27	`40`		[PO4]B:2002	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10663`	`55.3`	`-3.2`	`0.624`	`1`	`0`	`0`	`0.109`
28	`41`		[PO4]H:2005	`5`	`1`	`187`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`10593`	`55.2`	`-3.2`	`0.634`	`1`	`0`	`0`	`0.091`
29	`42`		[PO4]F:2008	`4`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10498`	`54.3`	`-3.0`	`0.711`	`1`	`0`	`0`	`0.092`
	`43`		[PO4]D:2003	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10595`	`52.7`	`-3.0`	`0.692`	`1`	`0`	`0`	`0.092`
	*Average:*													`53.5`	`-3.0`	`0.702`	`1`	`0`	`0`	`0.092`
30	`44`		[PO4]A:2001	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10595`	`53.3`	`-3.0`	`0.623`	`1`	`0`	`0`	`0.081`
31	`45`		[PO4]E:2013	`5`	`1`	`187`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10688`	`53.1`	`-2.0`	`0.925`	`1`	`0`	`0`	`0.047`
32	`46`		[PO4]A:2004	`5`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10663`	`52.9`	`-2.9`	`0.702`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
	`47`		[PO4]G:2006	`4`	`1`	`186`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10593`	`51.7`	`-3.0`	`0.700`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
	*Average:*													`52.3`	`-2.9`	`0.701`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
33	`48`		[PO4]A:2001	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10657`	`51.3`	`-2.6`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
34	`49`		[PO4]D:2012	`5`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10657`	`51.2`	`-3.2`	`0.495`	`1`	`0`	`0`	`0.055`
35	`50`		[PO4]D:2003	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10659`	`51.0`	`-2.8`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.091`
	`51`		[PO4]F:2008	`4`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10688`	`49.7`	`-3.0`	`0.652`	`1`	`0`	`0`	`0.091`
	*Average:*													`50.3`	`-2.9`	`0.678`	`1`	`0`	`0`	`0.091`
36	`52`		[PO4]F:2015	`5`	`1`	`188`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10674`	`50.4`	`-3.2`	`0.545`	`1`	`0`	`0`	`0.092`
37	`53`		[PO4]G:2016	`5`	`1`	`187`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10498`	`49.1`	`-3.0`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.091`
38	`54`		[PO4]B:2002	`4`	`1`	`187`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10659`	`48.2`	`-2.6`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
39	`55`		[PO4]F:2007	`4`	`1`	`187`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10674`	`46.9`	`-2.6`	`0.647`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
40	`56`		[PO4]H:2005	`4`	`1`	`187`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10688`	`44.2`	`-2.5`	`0.611`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
41	`57`		[PO4]H:2005	`4`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]G:2006	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`30.2`	`-2.9`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
42	`58`		[PO4]F:2008	`4`	`1`	`185`	`f`	[PO4]F:2007	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`29.9`	`-2.8`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
43	`59`		[PO4]D:2003	`4`	`1`	`185`	`f`	[PO4]A:2001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`29.3`	`-2.7`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
44	`60`		[PO4]B:2002	`4`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]A:2004	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`29.1`	`-2.7`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
45	`61`		[PO4]G:2016	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10657`	`28.8`	`-0.3`	`0.961`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
46	`62`		H	`3`	`1`	`10593`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`10595`	`27.7`	`-0.7`	`0.212`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`63`		[PO4]G:2006	`4`	`1`	`186`	`◊`	[PO4]F:2007	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`26.4`	`-2.4`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
48	`64`		[PO4]H:2005	`4`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]F:2008	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`26.3`	`-2.4`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
49	`65`		[PO4]A:2004	`4`	`1`	`186`	`◊`	[PO4]A:2001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`25.5`	`-2.4`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
50	`66`		[PO4]D:2003	`4`	`1`	`185`	`◊`	[PO4]B:2002	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`25.4`	`-2.4`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
51	`67`		[PO4]G:2006	`3`	`1`	`186`	`◊`	[PO4]F:2008	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`22.7`	`-2.1`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	`68`		[PO4]D:2003	`3`	`1`	`185`	`◊`	[PO4]A:2004	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`21.9`	`-2.0`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`22.3`	`-2.1`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
52	`69`		G	`4`	`3`	`10674`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`10688`	`21.5`	`0.3`	`0.738`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		H	`5`	`3`	`10593`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`10498`	`20.4`	`0.3`	`0.730`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		C	`4`	`3`	`10659`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`10657`	`19.8`	`0.3`	`0.743`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		D	`4`	`3`	`10595`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`10663`	`18.1`	`0.3`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.0`	`0.3`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`73`		H	`1`	`1`	`10593`	`◊`	G	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`1`	`10674`	`16.9`	`0.6`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`74`		E	`3`	`2`	`10688`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10595`	`13.4`	`0.1`	`0.647`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		G	`2`	`1`	`10674`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10663`	`10.4`	`0.0`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`11.9`	`0.1`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`76`		[PO4]H:2005	`1`	`1`	`187`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10674`	`12.3`	`-0.5`	`0.835`	`1`	`0`	`0`	`0.024`
56	`77`		[PO4]F:2007	`1`	`1`	`187`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10688`	`11.9`	`-0.5`	`0.835`	`1`	`0`	`0`	`0.025`
57	`78`		[PO4]B:2002	`1`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10657`	`11.1`	`-0.5`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
58	`79`		[PO4]A:2001	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10659`	`10.9`	`-0.4`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
59	`80`		C	`4`	`2`	`10659`	`◊`	G	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`2`	`10674`	`9.9`	`0.1`	`0.654`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`81`		[PO4]D:2003	`1`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10657`	`5.9`	`-0.2`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
61	`82`		[PO4]B:2002	`1`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]A:2001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`4.6`	`-0.5`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
62	`83`		[PO4]H:2005	`1`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]F:2007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`4.5`	`-0.5`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
63	`84`		[PO4]H:2005	`1`	`1`	`187`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10498`	`4.4`	`-0.2`	`0.797`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
64	`85`		[PO4]B:2002	`1`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10595`	`4.4`	`-0.2`	`0.802`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
65	`86`		C	`1`	`1`	`10659`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`10657`	`4.3`	`0.2`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`87`		[PO4]A:2001	`1`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10663`	`4.3`	`-0.2`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`88`		[PO4]F:2007	`1`	`1`	`187`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10593`	`4.2`	`-0.2`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`89`		B	`1`	`1`	`10663`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`10595`	`3.6`	`0.1`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`90`		B	`1`	`1`	`10663`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`10657`	`2.6`	`0.1`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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