PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=662-H0-050)

Interfaces in PDB 2hvh crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.49 Å

DDCTP:O6MEG PAIR IN THE POLYMERASE ACTIVE SITE (0 POSITION)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`105`	`10`	`2679`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`119`	`42`	`27714`	`969.0`	`-5.3`	`0.553`	`15`	`0`	`0`	`0.278`
	`2`		C	`101`	`10`	`2675`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`111`	`39`	`28082`	`947.7`	`-6.6`	`0.546`	`14`	`0`	`0`	`0.278`
	*Average:*													`958.3`	`-6.0`	`0.549`	`15`	`0`	`0`	`0.278`
2	`3`		D	`89`	`23`	`27714`	`x`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`94`	`26`	`27714`	`803.6`	`1.0`	`0.549`	`14`	`6`	`0`	`0.000`
3	`4`		D	`96`	`23`	`27714`	`◊`	A	-x+5/2,-y,z-1/2	`2_754`	`90`	`20`	`28082`	`788.9`	`-4.2`	`0.285`	`9`	`1`	`0`	`0.000`
4	`5`		B	`65`	`6`	`1935`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`78`	`27`	`28082`	`642.7`	`-11.1`	`0.231`	`12`	`0`	`0`	`0.364`
	`6`		E	`66`	`6`	`1903`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`73`	`25`	`27714`	`636.7`	`-10.6`	`0.266`	`13`	`0`	`0`	`0.364`
	*Average:*													`639.7`	`-10.9`	`0.249`	`13`	`0`	`0`	`0.364`
5	`7`		D	`69`	`21`	`27714`	`◊`	A	-x+5/2,-y-1,z-1/2	`2_744`	`70`	`20`	`28082`	`617.8`	`-4.5`	`0.221`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		D	`71`	`22`	`27714`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`64`	`16`	`28082`	`591.2`	`3.8`	`0.761`	`7`	`5`	`0`	`0.000`
7	`9`		A	`53`	`14`	`28082`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`49`	`16`	`27714`	`463.6`	`-1.1`	`0.454`	`6`	`3`	`0`	`0.035`
8	`10`		F	`37`	`9`	`2679`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`40`	`8`	`1903`	`369.4`	`-4.6`	`0.559`	`22`	`0`	`0`	`1.000`
	`11`		C	`39`	`9`	`2675`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`8`	`1935`	`367.1`	`-4.8`	`0.565`	`23`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`368.3`	`-4.7`	`0.562`	`23`	`0`	`0`	`1.000`
9	`12`		[SUC]A:877	`22`	`1`	`458`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`17`	`28082`	`312.4`	`2.4`	`0.440`	`7`	`0`	`0`	`0.017`
10	`13`		[DCT]A:883	`26`	`1`	`557`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`28082`	`305.7`	`-0.2`	`0.459`	`10`	`0`	`0`	`0.104`
	`14`		[DCT]D:881	`25`	`1`	`541`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`19`	`27714`	`299.5`	`-0.2`	`0.431`	`8`	`0`	`0`	`0.104`
	*Average:*													`302.6`	`-0.2`	`0.445`	`9`	`0`	`0`	`0.104`
11	`15`		[SUC]D:877	`21`	`1`	`454`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`45`	`17`	`27714`	`304.2`	`3.9`	`0.540`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		[6OG]C:3	`22`	`1`	`509`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`12`	`28082`	`228.7`	`-1.7`	`0.311`	`3`	`0`	`0`	`0.066`
	`17`		[6OG]F:3	`22`	`1`	`510`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`33`	`13`	`27714`	`227.3`	`-1.5`	`0.311`	`3`	`0`	`0`	`0.066`
	*Average:*													`228.0`	`-1.6`	`0.311`	`3`	`0`	`0`	`0.066`
13	`18`		[SUC]A:878	`16`	`1`	`483`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`7`	`28082`	`224.9`	`1.2`	`0.391`	`3`	`0`	`0`	`0.002`
14	`19`		D	`26`	`10`	`27714`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`28`	`10`	`28082`	`198.7`	`4.9`	`0.923`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
15	`20`		[DDG]B:29	`16`	`1`	`460`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`12`	`28082`	`185.7`	`1.8`	`0.454`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[DDG]E:29	`16`	`1`	`463`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`27714`	`183.4`	`2.0`	`0.472`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`184.6`	`1.9`	`0.463`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		[6OG]C:3	`17`	`1`	`509`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`2`	`2675`	`165.9`	`2.8`	`0.704`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[6OG]F:3	`17`	`1`	`510`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`2`	`2679`	`164.5`	`2.5`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`165.2`	`2.7`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`24`		B	`20`	`3`	`1935`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`18`	`3`	`1903`	`159.9`	`-1.5`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
18	`25`		A	`17`	`7`	`28082`	`x`	A	-x+3,y-1/2,-z+1/2	`3_845`	`20`	`6`	`28082`	`109.4`	`0.9`	`0.675`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		C	`14`	`1`	`2675`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`13`	`1`	`2679`	`99.7`	`1.8`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[SO4]D:880	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`27714`	`95.0`	`-13.4`	`0.610`	`1`	`0`	`0`	`0.244`
21	`28`		[DDG]E:29	`15`	`1`	`463`	`◊`	[DCT]D:881	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`541`	`90.3`	`3.1`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[DDG]B:29	`15`	`1`	`460`	`◊`	[DCT]A:883	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`557`	`89.6`	`2.7`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`90.0`	`2.9`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`30`		[SO4]A:882	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`15`	`5`	`27714`	`85.8`	`-11.0`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
23	`31`		[DDG]B:29	`14`	`1`	`460`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`1935`	`85.7`	`1.4`	`0.459`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[DDG]E:29	`13`	`1`	`463`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`1903`	`85.0`	`1.5`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`85.4`	`1.5`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		[DDG]E:29	`13`	`1`	`463`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`2`	`2679`	`83.7`	`1.6`	`0.481`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[DDG]B:29	`11`	`1`	`460`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`2`	`2675`	`82.9`	`1.5`	`0.509`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.3`	`1.5`	`0.495`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
25	`35`		[SO4]A:880	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`28082`	`73.7`	`-9.6`	`0.671`	`1`	`0`	`0`	`0.224`
26	`36`		A	`8`	`5`	`28082`	`x`	A	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`9`	`4`	`28082`	`73.2`	`-0.8`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		D	`6`	`3`	`27714`	`x`	D	-x+3,y-1/2,-z-1/2	`3_844`	`9`	`3`	`27714`	`60.5`	`-0.5`	`0.434`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.8`	`-0.7`	`0.400`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
27	`38`		[SO4]D:879	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`27714`	`72.5`	`-9.3`	`0.885`	`4`	`0`	`0`	`0.195`
28	`39`		[SO4]A:881	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`28082`	`71.5`	`-9.0`	`0.860`	`3`	`0`	`0`	`0.228`
29	`40`		[SO4]A:881	`5`	`1`	`185`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`9`	`5`	`27714`	`70.9`	`-9.2`	`0.844`	`2`	`0`	`0`	`0.086`
30	`41`		B	`5`	`1`	`1935`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`7`	`1`	`2679`	`51.1`	`0.1`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		C	`6`	`1`	`2675`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`1`	`1903`	`49.9`	`0.1`	`0.564`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.5`	`0.1`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`43`		[6OG]F:3	`3`	`1`	`510`	`◊`	[DCT]D:881	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`541`	`50.9`	`0.3`	`0.469`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
	`44`		[6OG]C:3	`4`	`1`	`509`	`◊`	[DCT]A:883	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`557`	`50.8`	`0.4`	`0.496`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`50.9`	`0.3`	`0.482`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
32	`45`		[MN]A:879	`1`	`1`	`123`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`28082`	`46.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`46`		[MN]D:878	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`27714`	`46.5`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	*Average:*													`46.6`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
33	`47`		D	`2`	`1`	`27714`	`◊`	[SO4]D:879	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`3`	`1`	`186`	`42.3`	`-4.1`	`0.976`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`48`		[DCT]D:881	`5`	`1`	`541`	`f`	[MN]D:878	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`40.2`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	`49`		[DCT]A:883	`8`	`1`	`557`	`f`	[MN]A:879	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`37.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	*Average:*													`38.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
35	`50`		[DCT]D:881	`5`	`1`	`541`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`2679`	`28.9`	`0.1`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[DCT]A:883	`4`	`1`	`557`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`2675`	`27.9`	`0.2`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`28.4`	`0.1`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`52`		[SUC]A:878	`2`	`1`	`483`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`27714`	`25.7`	`1.3`	`0.711`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`53`		[6OG]F:3	`4`	`1`	`510`	`◊`	[DDG]E:29	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`463`	`25.5`	`0.1`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[6OG]C:3	`4`	`1`	`509`	`◊`	[DDG]B:29	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`460`	`21.0`	`0.1`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`23.3`	`0.1`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`55`		B	`1`	`1`	`1935`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`3`	`2`	`27714`	`22.9`	`-0.6`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		A	`3`	`2`	`28082`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`1903`	`20.4`	`0.8`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`21.7`	`0.1`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`57`		[DDG]E:29	`1`	`1`	`463`	`◊`	[MN]D:878	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`3.0`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[DDG]B:29	`1`	`1`	`460`	`◊`	[MN]A:879	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`2.1`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.5`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
40	`59`		D	`1`	`1`	`27714`	`◊`	[SUC]A:878	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`483`	`2.2`	`0.1`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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