PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=152-03-422)

Interfaces in PDB 2gk1 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 3.25 Å

X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF NGT-BOUND HEXA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`166`	`39`	`20041`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`174`	`40`	`20295`	`1575.6`	`-16.6`	`0.209`	`23`	`7`	`0`	`1.000`
	`2`		F	`168`	`39`	`20143`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`178`	`40`	`20626`	`1573.3`	`-15.6`	`0.239`	`19`	`4`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`169`	`39`	`20079`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`168`	`38`	`20129`	`1544.7`	`-15.6`	`0.221`	`21`	`5`	`0`	`1.000`
	`4`		H	`161`	`39`	`20393`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`168`	`39`	`20248`	`1510.8`	`-15.7`	`0.215`	`17`	`5`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1551.1`	`-15.9`	`0.221`	`20`	`5`	`0`	`1.000`
2	`5`		H	`99`	`29`	`20393`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`95`	`29`	`20626`	`923.3`	`-8.7`	`0.276`	`4`	`3`	`0`	`0.470`
	`6`		F	`106`	`31`	`20143`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`103`	`32`	`20248`	`914.5`	`-8.3`	`0.362`	`7`	`4`	`0`	`0.470`
	`7`		B	`96`	`31`	`20079`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`98`	`31`	`20295`	`892.8`	`-6.0`	`0.422`	`8`	`4`	`0`	`0.470`
	`8`		D	`103`	`30`	`20041`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`97`	`28`	`20129`	`848.9`	`-5.6`	`0.497`	`5`	`4`	`0`	`0.470`
	*Average:*													`894.9`	`-7.1`	`0.389`	`6`	`4`	`0`	`0.470`
3	`9`		H	`52`	`12`	`20393`	`◊`	G	-x-1,y,-z+1	`2_456`	`64`	`20`	`20248`	`519.9`	`0.6`	`0.795`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
4	`10`		H	`54`	`17`	`20393`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`20143`	`481.3`	`-3.7`	`0.468`	`7`	`0`	`0`	`0.140`
	`11`		D	`49`	`16`	`20041`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`20079`	`461.2`	`-3.8`	`0.436`	`5`	`0`	`0`	`0.140`
	*Average:*													`471.3`	`-3.8`	`0.452`	`6`	`0`	`0`	`0.140`
5	`12`		G	`46`	`14`	`20248`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`20626`	`442.9`	`-4.0`	`0.390`	`4`	`0`	`0`	`0.134`
	`13`		C	`51`	`16`	`20295`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`43`	`14`	`20129`	`417.9`	`-4.2`	`0.387`	`4`	`0`	`0`	`0.134`
	*Average:*													`430.4`	`-4.1`	`0.388`	`4`	`0`	`0`	`0.134`
6	`14`		F	`48`	`13`	`20143`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`45`	`16`	`20129`	`438.0`	`-2.0`	`0.456`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`15`		G	`44`	`17`	`20248`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`53`	`18`	`20041`	`432.9`	`-2.2`	`0.333`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		A	`55`	`14`	`20129`	`x`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`40`	`11`	`20129`	`429.5`	`-0.4`	`0.755`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		H	`41`	`16`	`20393`	`◊`	H	-x-1,y,-z+1	`2_456`	`41`	`16`	`20393`	`381.8`	`1.2`	`0.829`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		[NGT]E:530	`14`	`1`	`357`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`47`	`15`	`20626`	`238.0`	`1.8`	`0.451`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[NGT]A:21	`14`	`1`	`357`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`20129`	`222.3`	`3.3`	`0.559`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`230.2`	`2.6`	`0.505`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[NGT]B:22	`14`	`1`	`362`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`41`	`14`	`20079`	`227.3`	`1.5`	`0.406`	`4`	`0`	`0`	`0.037`
12	`21`		[NGT]D:24	`14`	`1`	`358`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`41`	`12`	`20041`	`227.0`	`3.2`	`0.551`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		[NGT]F:26	`13`	`1`	`357`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`38`	`12`	`20143`	`223.8`	`3.3`	`0.585`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		[NGT]C:530	`13`	`1`	`356`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`41`	`13`	`20295`	`222.8`	`3.4`	`0.600`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		[NGT]G:533	`14`	`1`	`356`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`42`	`12`	`20248`	`222.5`	`2.3`	`0.490`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`25`		[NGT]H:28	`14`	`1`	`355`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`37`	`11`	`20393`	`218.9`	`2.5`	`0.512`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		E	`21`	`7`	`20626`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`24`	`7`	`20079`	`211.0`	`0.3`	`0.736`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		C	`28`	`12`	`20295`	`◊`	G	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`26`	`11`	`20248`	`197.0`	`-0.5`	`0.674`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[NAG]C:12	`14`	`1`	`356`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`20295`	`176.7`	`4.6`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		D	`25`	`10`	`20041`	`◊`	C	-x,y,-z	`2_555`	`17`	`8`	`20295`	`175.8`	`-1.2`	`0.539`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
21	`30`		B	`20`	`9`	`20079`	`◊`	E	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`21`	`9`	`20626`	`172.7`	`0.1`	`0.655`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		[NAG]G:530	`14`	`1`	`358`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`20248`	`172.3`	`4.0`	`0.424`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[NAG]A:4	`14`	`1`	`357`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`20129`	`164.1`	`3.9`	`0.393`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		D	`19`	`8`	`20041`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`19`	`8`	`20041`	`162.7`	`-2.1`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[NAG]E:17	`13`	`1`	`351`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`29`	`6`	`20626`	`161.5`	`4.7`	`0.502`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`35`		[NAG]H:26	`12`	`1`	`352`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`20393`	`159.7`	`3.2`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`36`		[NAG]B:7	`12`	`1`	`356`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`20079`	`149.5`	`3.1`	`0.381`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`37`		[NAG]F:19	`11`	`1`	`354`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`20143`	`148.3`	`3.7`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`38`		[NAG]D:15	`11`	`1`	`359`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`20041`	`139.0`	`2.4`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		G	`17`	`7`	`20248`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`16`	`6`	`20295`	`133.1`	`1.3`	`0.856`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		[NAG]C:10	`11`	`1`	`360`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`20295`	`132.8`	`3.3`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`41`		[NAG]G:21	`10`	`1`	`354`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`20248`	`127.5`	`3.4`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		[NAG]A:1	`9`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`20129`	`123.3`	`2.9`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`43`		C	`13`	`5`	`20295`	`◊`	H	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`11`	`3`	`20393`	`104.0`	`-1.6`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`44`		F	`7`	`4`	`20143`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`8`	`5`	`20041`	`83.4`	`-1.1`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`45`		G	`11`	`6`	`20248`	`◊`	G	-x-1,y,-z	`2_455`	`10`	`5`	`20248`	`82.2`	`0.2`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`46`		[NAG]A:5	`9`	`1`	`354`	`cf`	[NAG]A:4	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`357`	`75.5`	`1.9`	`0.115`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		[NAG]F:20	`8`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]F:19	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`354`	`74.7`	`1.9`	`0.140`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[NAG]C:13	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]C:12	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`356`	`73.7`	`1.8`	`0.108`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[NAG]E:18	`9`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]E:17	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`351`	`69.9`	`1.5`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`71.8`	`1.7`	`0.102`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[NAG]G:22	`8`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]G:21	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`354`	`73.2`	`1.9`	`0.121`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[NAG]A:2	`9`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]A:1	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`356`	`70.3`	`1.5`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]B:8	`7`	`1`	`353`	`cf`	[NAG]B:7	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`356`	`64.8`	`1.0`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.6`	`1.3`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`53`		[NAG]H:27	`7`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]H:26	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`352`	`70.2`	`1.6`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`54`		[NAG]D:16	`7`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]D:15	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`69.8`	`1.6`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`55`		[BMA]B:9	`7`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]B:8	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`353`	`69.2`	`1.1`	`0.110`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
45	`56`		[NAG]C:11	`9`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]C:10	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`68.4`	`1.4`	`0.089`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`57`		[NAG]G:531	`7`	`1`	`355`	`cf`	[NAG]G:530	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`67.4`	`1.8`	`0.133`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`58`		[BMA]G:532	`7`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]G:531	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`355`	`65.5`	`1.2`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`59`		[BMA]A:3	`5`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]A:2	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`356`	`65.5`	`1.4`	`0.156`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`60`		[BMA]A:6	`6`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:5	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`354`	`64.7`	`1.3`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`61`		[BMA]C:14	`8`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]C:13	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`62.0`	`1.7`	`0.131`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`62`		[NAG]G:531	`7`	`1`	`355`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`20248`	`60.2`	`1.5`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`63`		[NAG]C:13	`7`	`1`	`360`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`20295`	`55.3`	`1.2`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`64`		F	`5`	`3`	`20143`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`20079`	`54.9`	`-0.2`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`65`		[NAG]A:5	`7`	`1`	`354`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20129`	`42.5`	`1.2`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`66`		[NGT]H:28	`3`	`1`	`355`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`20248`	`34.4`	`0.7`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`67`		B	`9`	`2`	`20079`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`4`	`1`	`20129`	`31.3`	`-0.7`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`68`		G	`3`	`1`	`20248`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`5`	`2`	`20295`	`28.6`	`-0.0`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`69`		[NGT]E:530	`2`	`1`	`357`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20143`	`26.9`	`0.8`	`0.618`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[NGT]A:21	`2`	`1`	`357`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20079`	`18.8`	`0.6`	`0.582`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`22.8`	`0.7`	`0.600`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`71`		[NAG]F:20	`3`	`1`	`357`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`20143`	`25.4`	`0.5`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`72`		[NAG]D:16	`4`	`1`	`357`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`20041`	`21.9`	`0.2`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`73`		[NAG]A:2	`3`	`1`	`356`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20129`	`21.5`	`0.2`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`74`		[NGT]B:22	`2`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20129`	`20.7`	`0.6`	`0.552`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		[NGT]D:24	`2`	`1`	`358`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20295`	`15.2`	`0.5`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.9`	`0.5`	`0.555`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
63	`76`		B	`4`	`2`	`20079`	`◊`	H	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`2`	`20393`	`20.5`	`0.9`	`0.898`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`77`		[NGT]C:530	`1`	`1`	`356`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`20041`	`20.4`	`0.5`	`0.625`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
65	`78`		[NGT]F:26	`2`	`1`	`357`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20626`	`20.0`	`0.6`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`79`		[NAG]H:27	`5`	`1`	`359`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20393`	`20.0`	`-0.0`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`80`		E	`3`	`1`	`20626`	`◊`	[NAG]D:16	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`357`	`13.0`	`0.4`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`81`		F	`2`	`1`	`20143`	`◊`	E	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`20626`	`12.8`	`0.4`	`0.797`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`82`		[NGT]G:533	`1`	`1`	`356`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`20393`	`12.4`	`0.5`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`83`		[NAG]E:18	`2`	`1`	`357`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`20626`	`10.5`	`0.3`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`84`		[NAG]C:11	`2`	`1`	`356`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20295`	`10.0`	`-0.0`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
72	`85`		E	`1`	`1`	`20626`	`◊`	[NAG]B:8	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`353`	`9.6`	`0.1`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`86`		[NAG]C:13	`3`	`1`	`360`	`◊`	G	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`20248`	`8.8`	`0.1`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`87`		E	`1`	`1`	`20626`	`◊`	[BMA]B:9	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`1`	`1`	`297`	`1.9`	`0.0`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`88`		E	`1`	`1`	`20626`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z+1	`4_446`	`1`	`1`	`20041`	`0.7`	`-0.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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