PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=874-H5-0P8)

Interfaces in PDB 2g87 crystal.
Space symmetry group: P 41. Resolution: 2.60 Å

CRYSTALLOGRAPHIC MODEL OF BATHORHODOPSIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`83`	`23`	`15959`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`24`	`15815`	`724.4`	`-19.6`	`0.034`	`1`	`3`	`0`	`0.072`
2	`2`		B	`66`	`17`	`15959`	`◊`	A	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`65`	`20`	`15815`	`573.5`	`-0.4`	`0.980`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		[RET]B:1296	`19`	`1`	`556`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`24`	`15959`	`399.6`	`-1.4`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`4`		[RET]A:1296	`19`	`1`	`551`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`26`	`15815`	`399.1`	`-1.4`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`399.3`	`-1.4`	`0.650`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
4	`5`		B	`30`	`9`	`15959`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`30`	`8`	`15815`	`311.8`	`-4.1`	`0.594`	`4`	`0`	`0`	`0.019`
5	`6`		B	`25`	`5`	`15959`	`x`	B	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`31`	`10`	`15959`	`269.1`	`-0.1`	`0.905`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[PLM]B:1407	`16`	`1`	`553`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`15959`	`265.5`	`-0.1`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		[PLM]A:1410	`16`	`1`	`546`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`13`	`15815`	`257.0`	`-0.4`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
8	`9`		A	`31`	`11`	`15815`	`x`	A	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`25`	`7`	`15815`	`251.7`	`-1.3`	`0.864`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[PLM]A:1322	`14`	`1`	`552`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`15815`	`223.1`	`-2.1`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
10	`11`		[HTG]B:1509	`17`	`1`	`525`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`15959`	`217.6`	`0.8`	`0.139`	`3`	`0`	`0`	`0.002`
11	`12`		[HTG]A:1507	`16`	`1`	`524`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`15815`	`202.3`	`3.0`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[HTG]B:1506	`16`	`1`	`525`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`15959`	`196.3`	`3.4`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`199.3`	`3.2`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[HTG]B:1508	`13`	`1`	`514`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`15815`	`195.8`	`2.6`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[PLM]B:1322	`14`	`1`	`546`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`15959`	`176.7`	`-1.5`	`0.147`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
14	`16`		[PLM]A:1323	`11`	`1`	`553`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`15959`	`163.7`	`-3.4`	`0.137`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
15	`17`		[HTG]B:1508	`16`	`1`	`514`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`15959`	`159.2`	`2.7`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[PLM]B:1322	`10`	`1`	`546`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`15815`	`150.7`	`-1.3`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
17	`19`		[PLM]B:1323	`8`	`1`	`557`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`15815`	`142.6`	`-2.9`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
18	`20`		[NAG]B:605	`13`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`15959`	`135.0`	`3.3`	`0.379`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		[NAG]A:505	`11`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`15815`	`132.3`	`3.5`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[NAG]B:805	`11`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15959`	`130.8`	`2.8`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[PLM]A:1322	`11`	`1`	`552`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15959`	`130.7`	`-0.4`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
22	`24`		[HTG]B:1509	`12`	`1`	`525`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15815`	`123.8`	`1.8`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		B	`11`	`4`	`15959`	`◊`	[BMA]B:602	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`10`	`1`	`290`	`121.7`	`2.8`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[NAG]A:705	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`15815`	`121.4`	`1.9`	`0.298`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[HTO]B:1401	`8`	`1`	`328`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15815`	`114.2`	`3.1`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[HTO]B:1401	`10`	`1`	`328`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`15959`	`108.6`	`1.8`	`0.722`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		B	`7`	`3`	`15959`	`◊`	[BMA]B:603	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`9`	`1`	`295`	`100.2`	`1.9`	`0.378`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		[PLM]A:1410	`16`	`1`	`546`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15959`	`95.0`	`-0.4`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
29	`31`		[PLM]B:1407	`9`	`1`	`553`	`◊`	[PLM]A:1410	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`546`	`90.0`	`1.8`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[NAG]B:604	`8`	`1`	`360`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`10`	`4`	`15815`	`82.5`	`1.3`	`0.336`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[NAG]B:605	`7`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]B:604	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`360`	`82.2`	`2.3`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[PLM]A:1323	`6`	`1`	`553`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`15815`	`81.8`	`1.3`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[HG]A:903	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`15815`	`78.8`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.183`
	`36`		[HG]B:904	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15959`	`78.5`	`-26.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.183`
	*Average:*													`78.6`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.183`
34	`37`		[HG]A:905	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`15815`	`78.7`	`-27.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
	`38`		[HG]B:906	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15959`	`71.3`	`-27.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
	*Average:*													`75.0`	`-27.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.190`
35	`39`		[NAG]A:705	`7`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]A:704	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`365`	`78.3`	`2.1`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		B	`8`	`3`	`15959`	`◊`	[NAG]A:504	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`9`	`1`	`362`	`77.5`	`0.3`	`0.210`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[HG]B:902	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15959`	`75.9`	`-24.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	`42`		[HG]A:901	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15815`	`75.6`	`-24.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	*Average:*													`75.7`	`-24.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
38	`43`		[NAG]A:505	`7`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`362`	`75.5`	`1.9`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[NAG]B:805	`6`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`356`	`71.1`	`1.5`	`0.072`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		[PLM]B:1323	`8`	`1`	`557`	`f`	[PLM]B:1322	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`546`	`71.1`	`4.0`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[PLM]B:1323	`4`	`1`	`557`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15959`	`70.5`	`1.1`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[HTO]B:1401	`7`	`1`	`328`	`f`	[HTG]B:1509	x,y,z	`1_555`	`11`	`1`	`525`	`66.3`	`4.0`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`48`		[NAG]A:504	`6`	`1`	`362`	`cf`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`287`	`63.6`	`1.2`	`0.159`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`49`		B	`7`	`3`	`15959`	`◊`	[NAG]B:604	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`7`	`1`	`360`	`61.9`	`0.9`	`0.303`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		B	`7`	`3`	`15959`	`◊`	[NAG]A:705	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`5`	`1`	`359`	`61.6`	`1.6`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`173`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`15959`	`60.6`	`-0.1`	`0.887`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
47	`52`		[PLM]A:1323	`6`	`1`	`553`	`f`	[PLM]A:1322	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`552`	`57.4`	`3.1`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		[ACE]A:0	`3`	`1`	`172`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`15815`	`57.2`	`-0.3`	`0.883`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
49	`54`		[BMA]B:603	`6`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]B:604	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`360`	`56.6`	`1.1`	`0.144`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[BMA]B:603	`4`	`1`	`295`	`cf`	[BMA]B:602	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`55.6`	`2.2`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`56`		A	`6`	`2`	`15815`	`◊`	B	-y+1,x-1,z+1/4	`3_645`	`5`	`2`	`15959`	`55.2`	`1.2`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`57`		[HTG]B:1508	`5`	`1`	`514`	`◊`	[PLM]A:1410	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`546`	`54.2`	`0.3`	`0.147`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`58`		[ZN]A:2011	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15815`	`51.9`	`-30.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
	`59`		[ZN]B:956	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`15959`	`49.4`	`-29.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
	*Average:*													`50.6`	`-30.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
54	`60`		B	`8`	`5`	`15959`	`◊`	[NAG]A:505	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`5`	`1`	`356`	`45.8`	`0.8`	`0.377`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`61`		[NAG]B:805	`5`	`1`	`359`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`7`	`3`	`15815`	`44.1`	`0.7`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`62`		B	`3`	`1`	`15959`	`◊`	[MAN]A:503	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`5`	`1`	`287`	`43.5`	`0.1`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
57	`63`		[ZN]A:959	`1`	`1`	`98`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`15815`	`42.7`	`-25.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
58	`64`		[NAG]B:605	`4`	`1`	`357`	`◊`	[NAG]A:505	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`3`	`1`	`356`	`41.2`	`0.7`	`0.184`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
59	`65`		[ZN]B:958	`1`	`1`	`98`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`15959`	`40.4`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.173`
	`66`		[ZN]A:957	`1`	`1`	`98`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15815`	`38.7`	`-24.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.173`
	*Average:*													`39.5`	`-24.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.173`
60	`67`		[NAG]B:605	`4`	`1`	`357`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`7`	`3`	`15815`	`39.2`	`0.5`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`68`		[HTG]B:1509	`3`	`1`	`525`	`f`	[PLM]B:1322	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`546`	`38.0`	`2.1`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`69`		[HTG]B:1509	`2`	`1`	`525`	`◊`	A	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`3`	`2`	`15815`	`37.5`	`1.1`	`0.626`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
63	`70`		B	`3`	`1`	`15959`	`◊`	[ACE]A:0	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`3`	`1`	`172`	`36.6`	`-0.9`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
64	`71`		[PLM]B:1407	`5`	`1`	`553`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`15815`	`36.1`	`0.3`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`72`		[BMA]B:603	`3`	`1`	`295`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`2`	`1`	`15815`	`33.8`	`0.7`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`73`		[NAG]B:604	`4`	`1`	`360`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15959`	`33.7`	`1.1`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`74`		B	`4`	`1`	`15959`	`◊`	[NAG]A:704	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`2`	`1`	`365`	`33.1`	`0.4`	`0.582`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`75`		[ZN]B:958	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`3`	`1`	`15815`	`32.6`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	`76`		B	`3`	`1`	`15959`	`◊`	[ZN]A:957	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`1`	`1`	`98`	`32.2`	`-13.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	*Average:*													`32.4`	`-14.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
69	`77`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`173`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`3`	`1`	`15815`	`31.2`	`-0.9`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
70	`78`		[NAG]B:804	`2`	`1`	`356`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`4`	`1`	`15815`	`30.5`	`0.6`	`0.510`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
71	`79`		[ZN]A:959	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15959`	`30.0`	`-13.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
72	`80`		[NAG]A:504	`4`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`15815`	`25.5`	`0.9`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`81`		[ZN]B:956	`1`	`1`	`98`	`◊`	[NAG]A:705	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`2`	`1`	`359`	`25.2`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`82`		[NAG]B:805	`3`	`1`	`359`	`◊`	[ZN]A:2011	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`1`	`1`	`98`	`19.3`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	*Average:*													`22.3`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
74	`83`		[NAG]B:805	`3`	`1`	`359`	`f`	[ACE]B:0	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`173`	`23.0`	`0.8`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`84`		[NAG]B:604	`1`	`1`	`360`	`◊`	[NAG]A:505	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`3`	`1`	`356`	`14.0`	`0.9`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`85`		[NAG]A:705	`4`	`1`	`359`	`f`	[ACE]A:0	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`172`	`13.5`	`0.4`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`86`		[BMA]B:602	`1`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15959`	`13.2`	`0.4`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`87`		[NAG]B:605	`2`	`1`	`357`	`◊`	[NAG]A:504	-x+1,-y,z-1/2	`2_654`	`2`	`1`	`362`	`10.6`	`0.4`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`88`		[MAN]A:503	`3`	`1`	`287`	`◊`	A	-y+1,x,z+1/4	`3_655`	`5`	`2`	`15815`	`7.8`	`0.1`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`89`		[PLM]A:1410	`1`	`1`	`546`	`f`	[HG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`7.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
81	`90`		[BMA]B:603	`3`	`1`	`295`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15959`	`7.0`	`0.5`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`91`		[HTG]B:1508	`1`	`1`	`514`	`f`	[PLM]B:1407	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`553`	`5.4`	`0.1`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`92`		[NAG]B:804	`1`	`1`	`356`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15959`	`4.5`	`0.1`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`93`		[NAG]A:704	`2`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15815`	`3.6`	`0.1`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`94`		[PLM]B:1407	`2`	`1`	`553`	`f`	[HG]B:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`2.3`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
86	`95`		[HTG]B:1506	`1`	`1`	`525`	`f`	[NAG]B:805	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`359`	`0.7`	`0.0`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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