PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=114-IO-IJ8)

Interfaces in PDB 2dw2 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.70 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF VAP2 FROM CROTALUS ATROX VENOM (FORM 2-5 CRYSTAL)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`90`	`30`	`20850`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`99`	`30`	`20866`	`860.0`	`-4.4`	`0.473`	`13`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`64`	`22`	`20850`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`57`	`16`	`20850`	`537.1`	`-1.3`	`0.630`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`52`	`15`	`20866`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`62`	`21`	`20866`	`511.4`	`-1.9`	`0.554`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`524.2`	`-1.6`	`0.592`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
3	`4`		A	`42`	`12`	`20866`	`◊`	A	-x+1,y,-z+2	`2_657`	`42`	`12`	`20866`	`379.5`	`2.0`	`0.842`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`33`	`9`	`20850`	`◊`	B	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`34`	`10`	`20850`	`293.4`	`1.2`	`0.797`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`336.4`	`1.6`	`0.820`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		A	`37`	`13`	`20866`	`◊`	B	x,y-1,z-1	`1_544`	`37`	`12`	`20850`	`332.8`	`0.2`	`0.705`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		A	`35`	`14`	`20866`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`37`	`15`	`20850`	`323.1`	`-5.2`	`0.151`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		A	`27`	`10`	`20866`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+2	`4_547`	`24`	`9`	`20850`	`253.0`	`-0.7`	`0.526`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		A	`27`	`10`	`20866`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`26`	`11`	`20850`	`252.4`	`-0.6`	`0.535`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		B	`25`	`9`	`20850`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`28`	`9`	`20866`	`199.2`	`1.5`	`0.818`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[NAG]A:801	`12`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`20866`	`134.3`	`1.9`	`0.247`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[NAG]B:801	`13`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20850`	`128.4`	`1.4`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`131.3`	`1.7`	`0.202`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		A	`23`	`6`	`20866`	`◊`	[NAG]B:804	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`1`	`360`	`124.1`	`3.0`	`0.449`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]A:804	`9`	`1`	`361`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`7`	`20850`	`121.7`	`2.2`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`122.9`	`2.6`	`0.418`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		[NAG]B:806	`11`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`20866`	`106.2`	`0.7`	`0.141`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]A:806	`10`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`20850`	`98.3`	`0.7`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`102.3`	`0.7`	`0.151`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[MAN]B:805	`8`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]B:806	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`361`	`83.5`	`2.4`	`0.119`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[MAN]A:805	`8`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]A:806	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`359`	`83.1`	`2.4`	`0.119`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.3`	`2.4`	`0.119`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		[MAN]B:807	`8`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]B:808	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`77.9`	`2.5`	`0.158`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]A:802	`9`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]A:801	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`76.8`	`1.9`	`0.092`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]B:802	`10`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]B:801	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`357`	`75.1`	`1.9`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`76.0`	`1.9`	`0.085`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`22`		[MAN]A:807	`7`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]A:808	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`75.2`	`2.8`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		A	`11`	`4`	`20866`	`◊`	[NAG]B:806	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`1`	`361`	`72.1`	`1.0`	`0.330`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[NAG]A:806	`6`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`4`	`20850`	`71.4`	`0.7`	`0.251`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`71.7`	`0.9`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`25`		[MAN]A:805	`6`	`1`	`297`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`20850`	`66.1`	`-0.2`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[MAN]B:805	`6`	`1`	`295`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`20866`	`65.9`	`-0.2`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.0`	`-0.2`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]A:802	`9`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`20866`	`62.7`	`0.3`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[NAG]B:802	`8`	`1`	`361`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`20850`	`62.5`	`0.3`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.6`	`0.3`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`29`		[FUC]A:809	`8`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`20866`	`62.3`	`1.5`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		[NAG]B:806	`8`	`1`	`361`	`f`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`360`	`60.2`	`2.4`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[NAG]A:806	`7`	`1`	`359`	`f`	[NAG]A:804	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`361`	`55.1`	`2.2`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`57.6`	`2.3`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`32`		[BMA]A:803	`6`	`1`	`288`	`cf`	[NAG]A:804	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`361`	`59.7`	`1.4`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[BMA]B:803	`6`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`360`	`58.3`	`1.3`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.0`	`1.3`	`0.096`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`34`		[FUC]B:809	`7`	`1`	`282`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`20850`	`57.2`	`1.2`	`0.276`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		[NAG]B:808	`7`	`1`	`358`	`f`	[NAG]B:802	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`56.3`	`2.6`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[MAN]B:805	`7`	`1`	`295`	`cf`	[BMA]B:803	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`289`	`54.5`	`2.3`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[MAN]A:805	`7`	`1`	`297`	`cf`	[BMA]A:803	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`288`	`53.8`	`2.3`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.2`	`2.3`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`38`		[BMA]B:803	`7`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]B:802	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`53.6`	`0.8`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[BMA]A:803	`7`	`1`	`288`	`cf`	[NAG]A:802	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`363`	`51.8`	`0.8`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`52.7`	`0.8`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`40`		[FUC]A:809	`4`	`1`	`281`	`cf`	[NAG]A:801	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`363`	`53.4`	`2.4`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`41`		[NAG]A:808	`7`	`1`	`359`	`f`	[NAG]A:802	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`51.8`	`2.3`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`42`		[FUC]B:809	`5`	`1`	`282`	`cf`	[NAG]B:801	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`357`	`51.7`	`2.3`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		[ZN]A:700	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`20866`	`50.0`	`-35.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	`44`		[ZN]B:700	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`20850`	`49.4`	`-34.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	*Average:*													`49.7`	`-35.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
30	`45`		[MAN]B:805	`5`	`1`	`295`	`f`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`360`	`49.3`	`2.0`	`0.178`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[MAN]A:805	`4`	`1`	`297`	`f`	[NAG]A:804	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`47.5`	`1.9`	`0.189`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.4`	`1.9`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`47`		[MAN]B:807	`6`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]B:803	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`289`	`49.1`	`2.1`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[MAN]A:807	`6`	`1`	`294`	`cf`	[BMA]A:803	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`288`	`48.1`	`2.1`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.6`	`2.1`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`49`		[MAN]A:807	`5`	`1`	`294`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`5`	`20850`	`49.1`	`0.2`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`50`		[FUC]B:809	`4`	`1`	`282`	`f`	[NAG]B:802	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`45.2`	`1.9`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`51`		[CA]A:703	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`20866`	`43.5`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	`52`		[CA]B:713	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`20850`	`42.7`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`43.1`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
35	`53`		[CA]B:711	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`20850`	`43.3`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`54`		[CA]A:701	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`20866`	`42.7`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	*Average:*													`43.0`	`-12.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
36	`55`		[FUC]A:809	`4`	`1`	`281`	`f`	[NAG]A:802	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`43.1`	`1.7`	`0.172`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`56`		[BMA]A:803	`4`	`1`	`288`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`20866`	`41.8`	`0.9`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[BMA]B:803	`4`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`20850`	`38.9`	`0.9`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.3`	`0.9`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`58`		A	`8`	`5`	`20866`	`◊`	[MAN]B:807	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`290`	`39.4`	`0.0`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`59`		[MAN]A:807	`6`	`1`	`294`	`f`	[NAG]A:804	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`38.3`	`2.3`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[MAN]B:807	`6`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:804	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`31.9`	`1.9`	`0.197`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.1`	`2.1`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`61`		A	`5`	`1`	`20866`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`5`	`1`	`20866`	`30.2`	`-0.3`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		B	`3`	`1`	`20850`	`◊`	B	-x+1,y,-z+2	`2_657`	`3`	`1`	`20850`	`21.0`	`0.4`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.6`	`0.0`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`63`		[BMA]B:803	`4`	`1`	`289`	`f`	[NAG]B:808	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`358`	`28.4`	`1.3`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`64`		[BMA]A:803	`4`	`1`	`288`	`f`	[NAG]A:808	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`359`	`27.9`	`1.3`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`65`		[FUC]A:809	`1`	`1`	`281`	`◊`	[MAN]B:807	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`290`	`25.2`	`1.2`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`66`		[NAG]A:804	`5`	`1`	`361`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20866`	`24.8`	`0.9`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`67`		[NAG]B:804	`5`	`1`	`360`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20850`	`23.3`	`0.8`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`68`		[MAN]A:807	`4`	`1`	`294`	`◊`	[FUC]B:809	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`282`	`20.8`	`1.1`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`69`		[MAN]B:807	`3`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:802	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`361`	`20.8`	`0.8`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[MAN]A:807	`3`	`1`	`294`	`f`	[NAG]A:802	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`363`	`18.9`	`0.7`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`19.8`	`0.8`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`71`		[MAN]A:807	`4`	`1`	`294`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20866`	`19.8`	`0.4`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[MAN]B:807	`4`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20850`	`18.5`	`0.3`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`19.1`	`0.4`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`73`		[BMA]A:803	`3`	`1`	`288`	`f`	[NAG]A:806	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`18.7`	`0.0`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		[BMA]B:803	`3`	`1`	`289`	`f`	[NAG]B:806	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`361`	`18.6`	`0.0`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.6`	`0.0`	`0.117`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`75`		[NAG]B:808	`1`	`1`	`358`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20850`	`18.5`	`0.5`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`76`		A	`3`	`1`	`20866`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`20850`	`17.8`	`0.0`	`0.644`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`77`		[NAG]A:808	`1`	`1`	`359`	`◊`	[NAG]B:808	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`358`	`16.2`	`1.1`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`78`		[MAN]A:805	`2`	`1`	`297`	`f`	[NAG]A:802	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`363`	`15.3`	`0.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		[MAN]B:805	`1`	`1`	`295`	`f`	[NAG]B:802	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`361`	`12.4`	`0.5`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`13.9`	`0.5`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`80`		[MAN]A:807	`2`	`1`	`294`	`◊`	[NAG]B:802	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`361`	`12.3`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`81`		[NAG]A:808	`2`	`1`	`359`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20866`	`10.9`	`0.3`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`82`		[NAG]A:802	`1`	`1`	`363`	`◊`	[MAN]B:807	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`290`	`8.8`	`0.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`83`		[MAN]A:807	`1`	`1`	`294`	`◊`	[NAG]B:808	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`358`	`8.2`	`0.4`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		[NAG]A:808	`1`	`1`	`359`	`◊`	[MAN]B:807	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`290`	`2.7`	`0.1`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.5`	`0.2`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`85`		[NAG]A:804	`1`	`1`	`361`	`◊`	[NAG]B:804	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`360`	`4.3`	`0.3`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`86`		[NAG]A:808	`1`	`1`	`359`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`20850`	`1.5`	`0.0`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`87`		[NAG]A:808	`1`	`1`	`359`	`◊`	[FUC]B:809	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`282`	`0.9`	`0.1`	`0.169`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`88`		[BMA]A:803	`1`	`1`	`288`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`20850`	`0.5`	`0.0`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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