PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=392-95-5FM)

Interfaces in PDB 2dns crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.40 Å

THE CRYSTAL STRUCTURE OF D-AMINO ACID AMIDASE FROM OCHROBACTRUM ANTHROPI SV3 COMPLEXED WITH D-PHENYLALANINE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`52`	`15`	`13543`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`53`	`12`	`13455`	`454.7`	`-1.6`	`0.481`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`57`	`14`	`13543`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`52`	`19`	`13630`	`436.4`	`-2.3`	`0.309`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`52`	`13`	`13583`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`52`	`18`	`13455`	`415.1`	`-1.9`	`0.349`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		F	`49`	`16`	`12736`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`52`	`11`	`13630`	`404.3`	`-2.2`	`0.394`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`5`		F	`49`	`13`	`12736`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`54`	`17`	`13543`	`397.7`	`-3.6`	`0.237`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		E	`51`	`16`	`13295`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`51`	`10`	`13455`	`394.3`	`-3.1`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		E	`51`	`13`	`13295`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`52`	`20`	`13583`	`382.4`	`-4.3`	`0.181`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`405.0`	`-2.9`	`0.302`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`8`		A	`56`	`15`	`13630`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`48`	`13`	`13295`	`413.3`	`0.2`	`0.669`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
	`9`		F	`44`	`11`	`12736`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`50`	`15`	`13455`	`392.3`	`-0.7`	`0.606`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`402.8`	`-0.3`	`0.638`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
4	`10`		D	`45`	`11`	`13583`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`42`	`13`	`13543`	`377.2`	`-3.5`	`0.208`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`11`		D	`42`	`15`	`13583`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`13`	`13630`	`372.7`	`1.4`	`0.764`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
6	`12`		A	`41`	`18`	`13630`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`46`	`16`	`13455`	`350.3`	`-0.5`	`0.556`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
7	`13`		C	`36`	`11`	`13455`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`34`	`11`	`13543`	`279.4`	`-0.2`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		D	`33`	`9`	`13583`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`9`	`13543`	`272.6`	`0.8`	`0.708`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
9	`15`		D	`30`	`12`	`13583`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`12`	`13455`	`242.5`	`0.9`	`0.734`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[BA]E:3016	`1`	`1`	`216`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`13295`	`125.2`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`17`		[BA]A:3003	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`13630`	`124.4`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`18`		[BA]F:3014	`1`	`1`	`216`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`12736`	`123.4`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`19`		[BA]B:3002	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`13543`	`119.2`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`20`		[BA]D:3015	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`13583`	`117.8`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`21`		[BA]C:3001	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`13455`	`117.6`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`121.3`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
11	`22`		F	`17`	`5`	`12736`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`14`	`4`	`13455`	`113.7`	`-0.8`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`23`		C	`12`	`4`	`13455`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`7`	`3`	`13295`	`97.2`	`-1.2`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		[BA]C:3005	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`13455`	`93.2`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
14	`25`		[BA]A:3018	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13630`	`84.2`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`26`		[BA]D:3017	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13583`	`75.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`27`		[BA]F:3006	`1`	`1`	`216`	`f`	C	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`10`	`4`	`13455`	`70.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	*Average:*													`76.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
15	`28`		[BA]C:3005	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13543`	`71.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`29`		[BA]A:3020	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`13630`	`69.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[BA]C:3009	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`13455`	`68.9`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`13583`	`66.7`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12736`	`64.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[BA]D:3012	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13583`	`59.4`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[BA]B:3019	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13543`	`57.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[BA]A:3007	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`12736`	`48.9`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13295`	`46.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[BA]C:3011	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13295`	`46.5`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[BA]C:3011	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13455`	`41.6`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[BA]C:3011	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13583`	`41.6`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[BA]A:3007	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13630`	`40.5`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[BA]C:3009	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13583`	`33.7`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[BA]A:3007	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13543`	`33.3`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13630`	`29.5`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.8`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`44`		[BA]A:3004	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13630`	`68.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
18	`45`		[BA]D:3013	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`13583`	`66.0`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
19	`46`		A	`9`	`3`	`13630`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`12736`	`59.6`	`0.7`	`0.738`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`47`		A	`6`	`2`	`13630`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`9`	`2`	`13583`	`56.9`	`-0.2`	`0.493`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
21	`48`		[BA]A:3004	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13583`	`55.7`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`49`		[BA]F:3006	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`12736`	`51.9`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`50`		F	`8`	`5`	`12736`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`4`	`13543`	`50.2`	`0.0`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`51`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]C:3011	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`42.9`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
25	`52`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]A:3007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`40.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
26	`53`		[BA]C:3011	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]C:3009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`39.3`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
27	`54`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]D:3012	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`38.3`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
28	`55`		[BA]B:3019	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]A:3020	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`38.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
29	`56`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]B:3019	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`37.5`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
30	`57`		[BA]D:3012	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]C:3009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`37.0`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
31	`58`		[BA]D:3013	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`13295`	`35.7`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`59`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]A:3020	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`34.9`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
33	`60`		[BA]B:3019	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`12736`	`34.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[BA]D:3012	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13295`	`34.0`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[BA]A:3020	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`13543`	`33.9`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[BA]B:3019	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13630`	`27.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[BA]D:3012	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13455`	`27.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[BA]F:3008	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13543`	`25.8`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[BA]C:3009	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`13295`	`23.3`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[BA]A:3020	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12736`	`21.9`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13455`	`9.5`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`26.3`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`69`		[BA]B:3019	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]A:3007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`33.9`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
35	`70`		E	`3`	`1`	`13295`	`◊`	F	x-1,y+1,z	`1_465`	`5`	`2`	`12736`	`32.9`	`-0.4`	`0.365`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`71`		[BA]A:3020	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]A:3007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`32.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
37	`72`		[BA]E:3010	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]C:3009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`31.3`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
38	`73`		[BA]D:3012	`1`	`1`	`216`	`f`	[BA]C:3011	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`29.1`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
39	`74`		F	`6`	`2`	`12736`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`6`	`3`	`13295`	`24.2`	`0.1`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`75`		B	`4`	`2`	`13543`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`2`	`13583`	`21.7`	`-0.1`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`76`		F	`1`	`1`	`12736`	`◊`	[BA]B:3002	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`216`	`15.4`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`77`		E	`1`	`1`	`13295`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`13455`	`11.8`	`0.0`	`0.503`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`78`		F	`1`	`1`	`12736`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`13295`	`10.7`	`-0.3`	`0.181`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`79`		[BA]A:3018	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13543`	`0.7`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`80`		A	`1`	`1`	`13630`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+2	`2_547`	`1`	`1`	`13295`	`0.3`	`-0.0`	`0.611`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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