PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=934-01-3E6)

Interfaces in PDB 2dbr crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.61 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF GLYOXYLATE REDUCTASE (PH0597) FROM PYROCOCCUS HORIKOSHII OT3, COMPLEXED WITH NADP (P1)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`380`	`84`	`17148`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`375`	`84`	`17276`	`3629.0`	`-32.3`	`0.017`	`50`	`11`	`0`	`0.345`
	`2`		B	`381`	`83`	`16960`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`383`	`86`	`16931`	`3593.4`	`-33.6`	`0.024`	`45`	`13`	`0`	`0.345`
	`3`		F	`380`	`84`	`16954`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`371`	`83`	`16788`	`3580.3`	`-33.9`	`0.018`	`47`	`12`	`0`	`0.345`
	*Average:*													`3600.9`	`-33.3`	`0.020`	`47`	`12`	`0`	`0.345`
2	`4`		[NAP]A:401	`46`	`1`	`926`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`93`	`33`	`16931`	`670.9`	`-3.2`	`0.455`	`14`	`0`	`0`	`0.161`
	`5`		[NAP]B:402	`48`	`1`	`919`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`92`	`35`	`16960`	`663.6`	`-5.0`	`0.267`	`16`	`0`	`0`	`0.161`
	`6`		[NAP]F:406	`48`	`1`	`924`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`89`	`31`	`16954`	`663.2`	`-4.5`	`0.321`	`21`	`0`	`0`	`0.161`
	`7`		[NAP]C:403	`48`	`1`	`910`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`93`	`37`	`17276`	`663.1`	`-4.7`	`0.299`	`14`	`0`	`0`	`0.161`
	`8`		[NAP]E:405	`48`	`1`	`924`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`94`	`34`	`16788`	`660.3`	`-4.7`	`0.328`	`18`	`0`	`0`	`0.161`
	`9`		[NAP]D:404	`48`	`1`	`931`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`91`	`35`	`17148`	`657.7`	`-3.3`	`0.361`	`19`	`0`	`0`	`0.161`
	*Average:*													`663.1`	`-4.2`	`0.339`	`17`	`0`	`0`	`0.161`
3	`10`		C	`63`	`19`	`17276`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`52`	`13`	`16931`	`561.8`	`-0.2`	`0.460`	`9`	`7`	`0`	`0.000`
	`11`		D	`67`	`19`	`17148`	`◊`	B	x,y-1,z-1	`1_544`	`50`	`12`	`16960`	`557.8`	`0.9`	`0.583`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`559.8`	`0.3`	`0.522`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
4	`12`		E	`48`	`14`	`16788`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`14`	`17276`	`406.9`	`4.7`	`0.862`	`4`	`7`	`0`	`0.000`
5	`13`		F	`44`	`13`	`16954`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`15`	`16931`	`388.9`	`0.9`	`0.635`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
6	`14`		E	`32`	`10`	`16788`	`◊`	B	x-1,y-1,z-1	`1_444`	`42`	`11`	`16960`	`320.2`	`2.5`	`0.781`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`15`		D	`27`	`8`	`17148`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`21`	`5`	`16960`	`202.1`	`-1.6`	`0.384`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
8	`16`		E	`23`	`7`	`16788`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`22`	`7`	`17148`	`162.7`	`2.2`	`0.762`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
9	`17`		D	`18`	`6`	`17148`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`13`	`3`	`16931`	`119.7`	`-0.7`	`0.480`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
10	`18`		F	`13`	`3`	`16954`	`x`	F	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`4`	`16954`	`115.1`	`-0.7`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		[SO4]D:504	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`17148`	`115.1`	`-14.4`	`0.869`	`4`	`0`	`0`	`0.100`
12	`20`		A	`17`	`5`	`16931`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`3`	`16931`	`113.7`	`1.6`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`21`		E	`16`	`8`	`16788`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`8`	`17276`	`111.2`	`2.2`	`0.758`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
14	`22`		[SO4]C:502	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17276`	`98.0`	`-13.5`	`0.871`	`4`	`0`	`0`	`0.094`
15	`23`		F	`10`	`3`	`16954`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`3`	`17148`	`97.1`	`1.2`	`0.757`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
16	`24`		[SO4]A:501	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`16931`	`94.9`	`-12.7`	`0.863`	`5`	`0`	`0`	`0.092`
17	`25`		[SO4]B:503	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`16960`	`94.3`	`-12.4`	`0.850`	`5`	`0`	`0`	`0.091`
18	`26`		[SO4]F:506	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`16954`	`93.5`	`-12.9`	`0.798`	`3`	`0`	`0`	`0.087`
19	`27`		[SO4]F:512	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`16954`	`93.2`	`-15.2`	`0.468`	`6`	`0`	`0`	`0.109`
20	`28`		[SO4]E:505	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`16788`	`90.9`	`-12.6`	`0.817`	`4`	`0`	`0`	`0.087`
21	`29`		[SO4]A:507	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`16931`	`90.6`	`-14.0`	`0.695`	`5`	`0`	`0`	`0.100`
22	`30`		[SO4]D:510	`5`	`1`	`189`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`17148`	`90.2`	`-14.1`	`0.505`	`4`	`0`	`0`	`0.098`
23	`31`		[SO4]C:508	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`17276`	`89.0`	`-14.4`	`0.519`	`5`	`0`	`0`	`0.102`
24	`32`		[SO4]E:511	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`16788`	`88.8`	`-14.0`	`0.610`	`4`	`0`	`0`	`0.096`
25	`33`		C	`13`	`5`	`17276`	`◊`	F	x-1,y+1,z	`1_465`	`7`	`2`	`16954`	`88.4`	`0.4`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`34`		[SO4]B:509	`5`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`16960`	`88.0`	`-14.1`	`0.562`	`3`	`0`	`0`	`0.096`
27	`35`		F	`7`	`3`	`16954`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`4`	`16931`	`69.3`	`1.2`	`0.798`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`36`		A	`10`	`3`	`16931`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`16960`	`60.8`	`1.5`	`0.821`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
29	`37`		C	`4`	`1`	`17276`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`16960`	`59.2`	`-2.0`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`38`		E	`9`	`5`	`16788`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`16954`	`55.8`	`1.6`	`0.828`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		F	`8`	`2`	`16954`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`17148`	`55.4`	`1.4`	`0.790`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
32	`40`		[NAP]A:401	`9`	`1`	`926`	`f`	[SO4]A:507	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`53.9`	`-7.3`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
33	`41`		[NAP]C:403	`10`	`1`	`910`	`f`	[SO4]C:508	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`188`	`52.5`	`-7.0`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
34	`42`		[NAP]E:405	`9`	`1`	`924`	`f`	[SO4]E:511	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`187`	`51.5`	`-7.2`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
35	`43`		[NAP]B:402	`9`	`1`	`919`	`f`	[SO4]B:509	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`188`	`51.2`	`-6.8`	`0.611`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
36	`44`		[NAP]D:404	`9`	`1`	`931`	`f`	[SO4]D:510	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`189`	`50.4`	`-7.0`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
37	`45`		[NAP]F:406	`9`	`1`	`924`	`f`	[SO4]F:512	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`188`	`47.6`	`-6.6`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
38	`46`		F	`8`	`3`	`16954`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`17276`	`44.0`	`1.1`	`0.768`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
39	`47`		F	`5`	`2`	`16954`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17276`	`43.6`	`0.4`	`0.696`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`48`		D	`4`	`3`	`17148`	`◊`	[NAP]B:402	x,y-1,z-1	`1_544`	`4`	`1`	`919`	`37.2`	`1.5`	`0.775`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[NAP]A:401	`4`	`1`	`926`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`17276`	`36.1`	`1.0`	`0.752`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.7`	`1.2`	`0.764`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
41	`50`		C	`4`	`2`	`17276`	`◊`	B	x-1,y-1,z-1	`1_444`	`5`	`3`	`16960`	`35.1`	`1.9`	`0.892`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`51`		[NAP]B:402	`2`	`1`	`919`	`f`	[SO4]B:503	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`187`	`23.4`	`-4.0`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
43	`52`		E	`3`	`1`	`16788`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`17148`	`21.3`	`-0.2`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`53`		[NAP]A:401	`3`	`1`	`926`	`f`	[SO4]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`188`	`21.1`	`-3.4`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
45	`54`		[NAP]D:404	`4`	`1`	`931`	`f`	[SO4]D:504	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`187`	`19.0`	`-2.9`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
46	`55`		[SO4]B:509	`3`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`16931`	`17.7`	`-1.9`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
47	`56`		E	`2`	`1`	`16788`	`◊`	B	x,y-1,z-1	`1_544`	`2`	`1`	`16960`	`13.8`	`0.3`	`0.708`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`57`		[NAP]F:406	`4`	`1`	`924`	`f`	[SO4]F:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`188`	`13.8`	`-1.9`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
49	`58`		[SO4]D:510	`2`	`1`	`189`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17276`	`13.6`	`-1.5`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
50	`59`		[NAP]E:405	`5`	`1`	`924`	`f`	[SO4]E:505	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`12.2`	`-1.4`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
51	`60`		[SO4]F:512	`1`	`1`	`188`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`16788`	`10.0`	`-1.1`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
52	`61`		[SO4]C:508	`2`	`1`	`188`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`17148`	`9.9`	`-1.1`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
53	`62`		[SO4]E:511	`1`	`1`	`187`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`16954`	`9.9`	`-0.9`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
54	`63`		[NAP]D:404	`2`	`1`	`931`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`17276`	`8.3`	`0.2`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[NAP]B:402	`1`	`1`	`919`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16931`	`8.0`	`0.2`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAP]A:401	`1`	`1`	`926`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16960`	`5.3`	`0.1`	`0.669`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[NAP]E:405	`1`	`1`	`924`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16954`	`5.1`	`0.1`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[NAP]C:403	`1`	`1`	`910`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17148`	`5.0`	`0.1`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[NAP]F:406	`1`	`1`	`924`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16788`	`1.7`	`0.0`	`0.626`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.6`	`0.1`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`69`		D	`1`	`1`	`17148`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`16954`	`6.9`	`0.1`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`70`		[SO4]A:507	`3`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`16960`	`6.8`	`-0.5`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
57	`71`		[NAP]C:403	`3`	`1`	`910`	`f`	[SO4]C:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`6.6`	`-0.8`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
58	`72`		C	`1`	`1`	`17276`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`17148`	`0.2`	`0.0`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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