PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=141-98-7A4)

Interfaces in PDB 2afh crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOTIDE-FREE AV2-AV1 COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`469`	`117`	`24329`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`459`	`126`	`19762`	`4456.7`	`-55.0`	`0.007`	`53`	`19`	`0`	`0.595`
	`2`		B	`474`	`117`	`24319`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`459`	`128`	`19789`	`4451.8`	`-54.9`	`0.007`	`56`	`18`	`0`	`0.595`
	*Average:*													`4454.2`	`-54.9`	`0.007`	`55`	`19`	`0`	`0.595`
2	`3`		D	`316`	`78`	`24329`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`312`	`80`	`24319`	`2943.5`	`-20.5`	`0.405`	`41`	`34`	`0`	`0.691`
3	`4`		F	`204`	`54`	`13167`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`191`	`56`	`13307`	`1823.0`	`-12.9`	`0.127`	`26`	`20`	`0`	`0.617`
4	`5`		D	`144`	`38`	`24329`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`151`	`39`	`19789`	`1290.5`	`-16.4`	`0.133`	`12`	`6`	`0`	`0.384`
	`6`		B	`141`	`36`	`24319`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`149`	`39`	`19762`	`1275.6`	`-16.6`	`0.126`	`13`	`6`	`0`	`0.384`
	*Average:*													`1283.1`	`-16.5`	`0.129`	`13`	`6`	`0`	`0.384`
5	`7`		F	`82`	`24`	`13167`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`70`	`22`	`24319`	`678.6`	`5.8`	`0.928`	`16`	`4`	`0`	`0.000`
6	`8`		F	`56`	`19`	`13167`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`41`	`11`	`19789`	`441.4`	`-5.1`	`0.219`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		A	`40`	`10`	`19789`	`◊`	C	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`33`	`11`	`19762`	`361.5`	`0.3`	`0.726`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
8	`10`		D	`44`	`20`	`24329`	`x`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`39`	`15`	`24329`	`322.4`	`2.2`	`0.870`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
9	`11`		[CFN]A:2496	`17`	`1`	`491`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`19789`	`316.2`	`-18.4`	`0.766`	`5`	`0`	`0`	`0.350`
	`12`		[CFN]C:3496	`17`	`1`	`491`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`47`	`17`	`19762`	`314.4`	`-18.4`	`0.775`	`5`	`0`	`0`	`0.350`
	*Average:*													`315.3`	`-18.4`	`0.770`	`5`	`0`	`0`	`0.350`
10	`13`		E	`30`	`9`	`13307`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`11`	`24319`	`286.3`	`-2.7`	`0.331`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		C	`26`	`9`	`19762`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`36`	`12`	`13307`	`267.7`	`-1.7`	`0.403`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
12	`15`		E	`36`	`12`	`13307`	`◊`	D	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`20`	`4`	`24329`	`243.7`	`-3.5`	`0.127`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
13	`16`		[PGE]B:5005	`10`	`1`	`345`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`8`	`24319`	`224.8`	`7.5`	`0.550`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[P6G]D:5009	`17`	`1`	`529`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`24329`	`222.5`	`-1.3`	`0.281`	`4`	`0`	`0`	`0.076`
15	`18`		E	`31`	`10`	`13307`	`◊`	C	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`21`	`9`	`19762`	`222.5`	`4.8`	`0.853`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
16	`19`		[PGE]D:5006	`10`	`1`	`335`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`34`	`8`	`24329`	`206.7`	`5.5`	`0.416`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[HCA]C:3494	`13`	`1`	`343`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`37`	`16`	`19762`	`203.9`	`2.0`	`0.503`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[HCA]A:2494	`13`	`1`	`344`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`16`	`19789`	`202.9`	`2.0`	`0.500`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`203.4`	`2.0`	`0.502`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		[1PE]B:5017	`15`	`1`	`452`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`11`	`24319`	`203.3`	`-0.8`	`0.494`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
19	`23`		B	`20`	`4`	`24319`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`7`	`24319`	`187.9`	`-0.5`	`0.617`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
20	`24`		[PGE]D:5010	`10`	`1`	`333`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`31`	`10`	`24329`	`184.6`	`3.5`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[PGE]A:5015	`10`	`1`	`349`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`19789`	`180.9`	`3.8`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[CLF]C:3498	`12`	`1`	`453`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`10`	`19762`	`180.0`	`-18.6`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	`27`		[CLF]B:2498	`12`	`1`	`452`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`19789`	`179.4`	`-18.3`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
	*Average:*													`179.7`	`-18.4`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.310`
23	`28`		[CLF]B:2498	`12`	`1`	`452`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`12`	`24319`	`179.0`	`-17.8`	`0.087`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
	`29`		[CLF]C:3498	`12`	`1`	`453`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`24329`	`177.4`	`-17.7`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
	*Average:*													`178.2`	`-17.8`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
24	`30`		[P6G]D:5009	`15`	`1`	`529`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`24`	`5`	`24329`	`177.8`	`2.7`	`0.628`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		[PGE]C:5011	`10`	`1`	`347`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`19762`	`175.7`	`5.8`	`0.378`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[PGE]C:5016	`9`	`1`	`331`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`19762`	`164.5`	`3.7`	`0.269`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[1PE]C:5013	`12`	`1`	`406`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`24319`	`156.2`	`-1.0`	`0.571`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
28	`34`		[PG4]E:5007	`12`	`1`	`384`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`13307`	`155.2`	`4.5`	`0.373`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[PG4]B:5014	`12`	`1`	`413`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`24319`	`153.3`	`3.4`	`0.254`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[PG4]B:5014	`13`	`1`	`413`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`13167`	`147.9`	`4.1`	`0.262`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		[PEG]D:5020	`7`	`1`	`259`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`24329`	`139.5`	`3.7`	`0.436`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		[TRS]B:5003	`7`	`1`	`251`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`24319`	`131.3`	`2.3`	`0.095`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[1PE]C:5013	`8`	`1`	`406`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`19762`	`126.3`	`-0.5`	`0.595`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
34	`40`		B	`16`	`6`	`24319`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`15`	`4`	`13167`	`125.4`	`1.1`	`0.765`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
35	`41`		[SF4]E:3290	`8`	`1`	`306`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`13167`	`125.0`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.256`
36	`42`		[SF4]E:3290	`8`	`1`	`306`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`13307`	`124.7`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.253`
37	`43`		[PGE]A:5012	`9`	`1`	`342`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`19789`	`114.1`	`3.5`	`0.221`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`44`		[PGE]D:5008	`8`	`1`	`336`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`24329`	`109.7`	`3.6`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		[PEG]B:5018	`7`	`1`	`261`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`24319`	`108.6`	`2.8`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		[PEG]D:5019	`7`	`1`	`248`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`24329`	`105.8`	`2.5`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		[TRS]C:5004	`6`	`1`	`251`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`19762`	`104.6`	`3.0`	`0.181`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		C	`12`	`3`	`19762`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`2`	`13167`	`81.6`	`-0.7`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		B	`12`	`4`	`24319`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`2`	`13307`	`78.3`	`0.1`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		A	`7`	`3`	`19789`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`4`	`24319`	`78.1`	`-0.9`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		D	`6`	`2`	`24329`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`3`	`13167`	`67.7`	`-0.3`	`0.529`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		[CFN]A:2496	`7`	`1`	`491`	`f`	[HCA]A:2494	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`344`	`66.1`	`-3.5`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	`53`		[CFN]C:3496	`7`	`1`	`491`	`f`	[HCA]C:3494	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`343`	`65.6`	`-3.5`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	*Average:*													`65.8`	`-3.5`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
47	`54`		[1PE]B:5017	`5`	`1`	`452`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`4`	`13307`	`60.4`	`1.5`	`0.730`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`55`		A	`6`	`2`	`19789`	`◊`	E	x-1/2,-y+3/2,-z	`4_465`	`5`	`3`	`13307`	`57.3`	`1.0`	`0.807`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
49	`56`		A	`10`	`3`	`19789`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`8`	`4`	`13307`	`56.2`	`0.4`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`57`		[NA]B:2492	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`24319`	`52.3`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.108`
51	`58`		E	`4`	`3`	`13307`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`19789`	`47.9`	`1.5`	`0.775`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`59`		[HCA]C:3494	`7`	`1`	`343`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`24329`	`45.5`	`1.2`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[HCA]A:2494	`7`	`1`	`344`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`24319`	`43.7`	`1.2`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`44.6`	`1.2`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`61`		[PEG]D:5020	`5`	`1`	`259`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`19789`	`42.1`	`-0.1`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
54	`62`		[PGE]D:5008	`3`	`1`	`336`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`19762`	`38.6`	`1.2`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		[PEG]D:5019	`3`	`1`	`248`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`19762`	`35.5`	`0.5`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		D	`4`	`1`	`24329`	`x`	D	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`24329`	`29.5`	`0.5`	`0.791`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
57	`65`		[CA]B:2491	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`24329`	`28.9`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
	`66`		[CA]D:2490	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`24319`	`27.6`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
	*Average:*													`28.3`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
58	`67`		[PEG]B:5018	`2`	`1`	`261`	`f`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`13307`	`28.5`	`1.1`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`68`		[PEG]D:5019	`2`	`1`	`248`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`24329`	`28.3`	`1.3`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`69`		[CA]D:2490	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`24329`	`25.7`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.151`
	`70`		[CA]B:2491	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`24319`	`25.5`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.151`
	*Average:*													`25.6`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.151`
61	`71`		[PGE]D:5008	`2`	`1`	`336`	`f`	D	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`24329`	`25.0`	`0.1`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		D	`3`	`3`	`24329`	`f`	[PGE]D:5006	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`335`	`23.3`	`0.6`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		[PGE]C:5016	`2`	`1`	`331`	`f`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`13307`	`18.4`	`0.4`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		[CA]B:2491	`1`	`1`	`85`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`19762`	`17.8`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`75`		[CA]D:2490	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`19789`	`17.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`17.7`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
65	`76`		C	`3`	`2`	`19762`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`24329`	`13.0`	`0.0`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`77`		[NA]B:2492	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19789`	`7.9`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
67	`78`		D	`1`	`1`	`24329`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`13307`	`3.8`	`-0.0`	`0.523`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`79`		A	`1`	`1`	`19789`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z	`4_465`	`1`	`1`	`13167`	`2.2`	`0.0`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`80`		C	`1`	`1`	`19762`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`19789`	`0.4`	`0.0`	`0.670`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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