PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=281-9J-7F3)

Interfaces in PDB 1xsl crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH A ONE NUCLEOTIDE DNA GAP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`67`	`23`	`16390`	`◊`	E	-x,-y,z	`2_555`	`68`	`23`	`16390`	`598.4`	`-8.9`	`0.144`	`2`	`4`	`0`	`0.002`
2	`2`		J	`72`	`9`	`2595`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`77`	`24`	`16484`	`583.5`	`-0.3`	`0.716`	`10`	`0`	`0`	`0.112`
	`3`		F	`74`	`9`	`2598`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`71`	`22`	`16390`	`582.7`	`-0.6`	`0.708`	`10`	`0`	`0`	`0.112`
	`4`		N	`70`	`9`	`2596`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`75`	`24`	`16936`	`577.7`	`1.2`	`0.731`	`10`	`0`	`0`	`0.112`
	`5`		B	`71`	`9`	`2601`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`22`	`17039`	`573.3`	`1.0`	`0.737`	`10`	`0`	`0`	`0.112`
	*Average:*													`579.3`	`0.3`	`0.723`	`10`	`0`	`0`	`0.112`
3	`6`		I	`54`	`16`	`16484`	`◊`	E	-x,-y+1,z	`2_565`	`56`	`14`	`16390`	`532.7`	`-2.3`	`0.536`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		M	`50`	`13`	`16936`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`53`	`14`	`17039`	`496.6`	`-3.5`	`0.399`	`4`	`0`	`1`	`0.000`
	*Average:*													`514.6`	`-2.9`	`0.467`	`5`	`0`	`1`	`0.000`
4	`8`		D	`35`	`3`	`1148`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`18`	`17039`	`397.7`	`-7.7`	`0.410`	`8`	`0`	`0`	`0.593`
	`9`		P	`35`	`3`	`1157`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`52`	`17`	`16936`	`385.7`	`-8.5`	`0.346`	`10`	`0`	`0`	`0.593`
	*Average:*													`391.7`	`-8.1`	`0.378`	`9`	`0`	`0`	`0.593`
5	`10`		L	`34`	`3`	`1155`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`55`	`17`	`16484`	`386.0`	`-8.4`	`0.372`	`11`	`0`	`0`	`0.604`
	`11`		H	`36`	`3`	`1150`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`54`	`17`	`16390`	`384.3`	`-8.0`	`0.400`	`9`	`0`	`0`	`0.604`
	*Average:*													`385.2`	`-8.2`	`0.386`	`10`	`0`	`0`	`0.604`
6	`12`		A	`45`	`21`	`17039`	`◊`	M	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`45`	`15`	`16936`	`371.4`	`0.7`	`0.721`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`13`		G	`41`	`4`	`1498`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`50`	`22`	`16390`	`368.7`	`-5.9`	`0.438`	`12`	`0`	`0`	`0.468`
	`14`		O	`39`	`4`	`1499`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`50`	`21`	`16936`	`363.8`	`-6.1`	`0.403`	`11`	`0`	`0`	`0.468`
	`15`		C	`39`	`4`	`1503`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`52`	`23`	`17039`	`363.2`	`-5.9`	`0.418`	`12`	`0`	`0`	`0.468`
	`16`		K	`41`	`4`	`1498`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`48`	`21`	`16484`	`362.8`	`-6.8`	`0.377`	`12`	`0`	`0`	`0.468`
	*Average:*													`364.6`	`-6.2`	`0.409`	`12`	`0`	`0`	`0.468`
8	`17`		M	`35`	`10`	`16936`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`35`	`9`	`17039`	`337.3`	`-1.7`	`0.492`	`5`	`0`	`0`	`0.028`
	`18`		I	`37`	`11`	`16484`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`38`	`11`	`16390`	`333.7`	`-2.3`	`0.470`	`4`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`335.5`	`-2.0`	`0.481`	`5`	`0`	`0`	`0.028`
9	`19`		G	`28`	`6`	`1498`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`2598`	`287.2`	`-3.4`	`0.483`	`18`	`0`	`0`	`0.761`
	`20`		O	`29`	`6`	`1499`	`◊`	N	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`2596`	`287.0`	`-3.1`	`0.497`	`18`	`0`	`0`	`0.761`
	`21`		K	`28`	`6`	`1498`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`2595`	`286.5`	`-3.1`	`0.501`	`18`	`0`	`0`	`0.761`
	`22`		C	`29`	`6`	`1503`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`2601`	`286.3`	`-3.6`	`0.475`	`19`	`0`	`0`	`0.761`
	*Average:*													`286.7`	`-3.3`	`0.489`	`18`	`0`	`0`	`0.761`
10	`23`		A	`26`	`9`	`17039`	`◊`	M	x,y-1,z	`1_545`	`32`	`12`	`16936`	`250.6`	`-2.9`	`0.298`	`1`	`1`	`0`	`0.001`
11	`24`		E	`26`	`10`	`16390`	`◊`	M	-x,-y+1,z-1	`2_564`	`25`	`10`	`16936`	`233.4`	`-1.6`	`0.398`	`1`	`2`	`0`	`0.001`
	`25`		I	`18`	`7`	`16484`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`23`	`10`	`17039`	`186.5`	`-1.3`	`0.443`	`1`	`1`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`209.9`	`-1.4`	`0.420`	`1`	`2`	`0`	`0.001`
12	`26`		P	`20`	`4`	`1157`	`◊`	N	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`2596`	`191.6`	`-1.9`	`0.539`	`14`	`0`	`0`	`0.006`
	`27`		D	`20`	`4`	`1148`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`2601`	`191.1`	`-2.9`	`0.486`	`14`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`191.3`	`-2.4`	`0.512`	`14`	`0`	`0`	`0.006`
13	`28`		H	`20`	`4`	`1150`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`2598`	`191.0`	`-2.2`	`0.531`	`14`	`0`	`0`	`0.306`
	`29`		L	`19`	`4`	`1155`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`2595`	`189.8`	`-2.2`	`0.523`	`14`	`0`	`0`	`0.306`
	*Average:*													`190.4`	`-2.2`	`0.527`	`14`	`0`	`0`	`0.306`
14	`30`		G	`21`	`2`	`1498`	`◊`	I	-x,-y+1,z	`2_565`	`18`	`6`	`16484`	`160.1`	`2.8`	`0.803`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		K	`18`	`2`	`1498`	`◊`	E	-x,-y+1,z	`2_565`	`18`	`7`	`16390`	`148.3`	`0.8`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		C	`18`	`2`	`1503`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`16936`	`140.7`	`0.9`	`0.662`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		O	`18`	`2`	`1499`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`17039`	`137.0`	`1.0`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`146.5`	`1.4`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`34`		J	`21`	`4`	`2595`	`◊`	E	-x,-y+1,z	`2_565`	`11`	`5`	`16390`	`121.4`	`-1.4`	`0.530`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		N	`17`	`4`	`2596`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`17039`	`113.8`	`-1.2`	`0.489`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		B	`17`	`4`	`2601`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`16936`	`113.1`	`-0.4`	`0.530`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		F	`12`	`3`	`2598`	`◊`	I	-x,-y+1,z	`2_565`	`10`	`4`	`16484`	`73.3`	`-1.5`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`105.4`	`-1.1`	`0.496`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`38`		I	`12`	`5`	`16484`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17039`	`121.1`	`-0.5`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		M	`15`	`5`	`16936`	`◊`	E	-x,-y+1,z	`2_565`	`13`	`6`	`16390`	`107.5`	`-1.0`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`114.3`	`-0.8`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`40`		A	`12`	`6`	`17039`	`◊`	I	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`14`	`4`	`16484`	`117.4`	`1.4`	`0.798`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`41`		E	`15`	`5`	`16390`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17039`	`101.0`	`0.0`	`0.613`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`42`		E	`14`	`5`	`16390`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`11`	`3`	`17039`	`100.7`	`-1.2`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`43`		P	`13`	`1`	`1157`	`◊`	B	-x,-y+1,z	`2_565`	`12`	`1`	`2601`	`98.9`	`2.2`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`44`		L	`14`	`1`	`1155`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`2598`	`97.3`	`2.1`	`0.758`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		H	`15`	`1`	`1150`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`2595`	`93.7`	`2.1`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`95.5`	`2.1`	`0.763`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`46`		D	`14`	`1`	`1148`	`◊`	N	-x,-y+1,z	`2_565`	`10`	`1`	`2596`	`96.0`	`2.0`	`0.754`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`47`		[CAC]D:950	`5`	`1`	`229`	`◊`	P	-x,-y+1,z	`2_565`	`9`	`2`	`1157`	`64.1`	`1.4`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`48`		[NA]E:962	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`16390`	`59.9`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.447`
	`49`		[NA]I:963	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`16484`	`58.7`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.447`
	`50`		[NA]M:964	`1`	`1`	`125`	`f`	M	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`16936`	`57.8`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.447`
	`51`		[NA]A:961	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17039`	`57.7`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.447`
	*Average:*													`58.5`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.447`
25	`52`		P	`8`	`1`	`1157`	`◊`	D	-x,-y+1,z	`2_565`	`8`	`1`	`1148`	`54.9`	`-0.4`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`53`		[CAC]D:950	`5`	`1`	`229`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`1148`	`51.4`	`0.4`	`0.046`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`54`		L	`8`	`1`	`1155`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`1150`	`50.9`	`-0.5`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
28	`55`		A	`3`	`1`	`17039`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`3`	`1`	`17039`	`39.3`	`-0.6`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		E	`3`	`1`	`16390`	`◊`	E	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`16390`	`33.6`	`-0.4`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		I	`2`	`1`	`16484`	`◊`	I	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`16484`	`12.2`	`0.1`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		M	`2`	`1`	`16936`	`◊`	M	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`16936`	`6.8`	`0.1`	`0.686`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`23.0`	`-0.2`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`59`		[NA]J:965	`1`	`1`	`125`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`2595`	`38.5`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.302`
	`60`		[NA]N:966	`1`	`1`	`125`	`f`	N	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`2596`	`33.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.302`
	*Average:*													`36.1`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.302`
30	`61`		[NA]A:961	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1503`	`35.8`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.206`
	`62`		[NA]I:963	`1`	`1`	`125`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`1498`	`35.6`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.206`
	`63`		[NA]M:964	`1`	`1`	`125`	`◊`	O	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1499`	`35.1`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.206`
	`64`		[NA]E:962	`1`	`1`	`125`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1498`	`32.9`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.206`
	*Average:*													`34.9`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.206`
31	`65`		[MG]B:991	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`2601`	`29.8`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.241`
	`66`		[MG]F:992	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`2598`	`27.2`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.241`
	*Average:*													`28.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.241`
32	`67`		I	`3`	`1`	`16484`	`x`	I	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`2`	`1`	`16484`	`29.7`	`-0.4`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`68`		[NA]N:966	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`1157`	`27.7`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	`69`		[NA]J:965	`1`	`1`	`125`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`1155`	`17.8`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	*Average:*													`22.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
34	`70`		[MG]H:993	`1`	`1`	`98`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`1155`	`22.5`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	`71`		[MG]H:993	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`1150`	`21.0`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	*Average:*													`21.8`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
35	`72`		M	`3`	`1`	`16936`	`◊`	M	-x,-y+2,z	`2_575`	`3`	`1`	`16936`	`21.7`	`0.3`	`0.756`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`73`		J	`3`	`1`	`2595`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2598`	`18.8`	`-1.3`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	`74`		N	`3`	`1`	`2596`	`◊`	B	-x,-y+1,z	`2_565`	`3`	`1`	`2601`	`17.8`	`-1.3`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`18.3`	`-1.3`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
37	`75`		P	`3`	`1`	`1157`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`17039`	`18.7`	`-0.2`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`76`		H	`3`	`1`	`1150`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16484`	`16.9`	`-0.1`	`0.600`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`77`		L	`3`	`1`	`1155`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16390`	`16.8`	`-0.2`	`0.593`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`17.5`	`-0.2`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
38	`78`		[CAC]D:950	`1`	`1`	`229`	`◊`	N	-x,-y+1,z	`2_565`	`1`	`1`	`2596`	`18.3`	`0.6`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`79`		I	`4`	`3`	`16484`	`◊`	N	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`2596`	`18.2`	`-0.2`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		J	`4`	`1`	`2595`	`◊`	M	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`3`	`16936`	`17.3`	`-0.0`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.7`	`-0.1`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`81`		[MG]B:991	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`1148`	`18.1`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	`82`		[MG]F:992	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`1150`	`17.8`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	*Average:*													`17.9`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
41	`83`		B	`3`	`1`	`2601`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16484`	`15.8`	`-0.3`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		F	`3`	`1`	`2598`	`◊`	M	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`16936`	`8.4`	`0.1`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`12.1`	`-0.1`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`85`		D	`3`	`1`	`1148`	`◊`	M	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`16936`	`15.2`	`-0.1`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`86`		[CAC]D:950	`3`	`1`	`229`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2601`	`11.7`	`0.5`	`0.195`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`87`		[CAC]D:950	`1`	`1`	`229`	`◊`	M	-x,-y+1,z	`2_565`	`3`	`1`	`16936`	`7.6`	`0.1`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`88`		[MG]H:993	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2598`	`1.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
46	`89`		[CAC]D:950	`1`	`1`	`229`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17039`	`1.5`	`0.0`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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