PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=493-03-CP1)

Interfaces in PDB 1xpu crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 3.05 Å

STRUCTURAL MECHANISM OF INHIBITION OF THE RHO TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR BY THE ANTIBIOTIC 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)- DIHYDROBICYCLOMYCIN (FPDB)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`152`	`42`	`20270`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`201`	`53`	`20127`	`1571.9`	`5.1`	`0.882`	`22`	`12`	`0`	`0.193`
	`2`		F	`147`	`36`	`20091`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`186`	`53`	`19999`	`1552.6`	`6.1`	`0.894`	`20`	`15`	`0`	`0.193`
	`3`		C	`149`	`38`	`20127`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`194`	`56`	`20429`	`1547.8`	`3.9`	`0.789`	`16`	`13`	`0`	`0.193`
	`4`		B	`148`	`44`	`20429`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`188`	`53`	`20314`	`1534.1`	`3.6`	`0.846`	`21`	`16`	`0`	`0.193`
	`5`		E	`149`	`40`	`19999`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`192`	`54`	`20270`	`1514.2`	`1.9`	`0.739`	`16`	`14`	`0`	`0.193`
	*Average:*													`1544.1`	`4.1`	`0.830`	`19`	`14`	`0`	`0.193`
2	`6`		C	`66`	`16`	`20127`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`67`	`16`	`20127`	`698.0`	`-14.7`	`0.007`	`0`	`0`	`0`	`0.428`
3	`7`		F	`45`	`12`	`20091`	`◊`	F	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`43`	`12`	`20091`	`464.8`	`-6.4`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		[AGS]E:5600	`30`	`1`	`640`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`57`	`18`	`19999`	`404.6`	`-6.6`	`0.422`	`12`	`0`	`0`	`0.377`
	`9`		[AGS]D:4600	`29`	`1`	`642`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`54`	`14`	`20270`	`387.4`	`-6.9`	`0.305`	`9`	`0`	`0`	`0.377`
	`10`		[AGS]C:3600	`30`	`1`	`642`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`20127`	`371.9`	`-7.0`	`0.297`	`9`	`0`	`0`	`0.377`
	`11`		[AGS]B:2600	`29`	`1`	`639`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`20429`	`363.2`	`-5.8`	`0.405`	`9`	`0`	`0`	`0.377`
	`12`		[AGS]E:6600	`29`	`1`	`648`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`20091`	`356.7`	`-6.0`	`0.459`	`9`	`0`	`0`	`0.377`
	`13`		[AGS]A:1600	`26`	`1`	`645`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`17`	`20314`	`354.7`	`-5.5`	`0.365`	`8`	`0`	`0`	`0.377`
	*Average:*													`373.1`	`-6.3`	`0.375`	`9`	`0`	`0`	`0.377`
5	`14`		J	`35`	`2`	`757`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`57`	`18`	`20270`	`386.5`	`-1.3`	`0.704`	`9`	`0`	`0`	`0.036`
6	`15`		L	`33`	`2`	`744`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`20091`	`380.5`	`-3.9`	`0.561`	`6`	`0`	`0`	`0.529`
7	`16`		H	`35`	`2`	`752`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`14`	`20127`	`359.2`	`-3.8`	`0.555`	`8`	`0`	`0`	`0.428`
8	`17`		G	`34`	`2`	`737`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`16`	`20314`	`358.0`	`-3.7`	`0.559`	`6`	`0`	`0`	`0.394`
9	`18`		K	`33`	`2`	`731`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`52`	`16`	`19999`	`356.4`	`-2.4`	`0.517`	`7`	`0`	`0`	`0.035`
10	`19`		A	`34`	`12`	`20314`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`35`	`12`	`20314`	`334.7`	`0.8`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[FPD]F:6701	`27`	`1`	`586`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`44`	`15`	`20091`	`311.6`	`3.3`	`0.659`	`7`	`0`	`0`	`0.005`
	`21`		[FPD]E:5701	`26`	`1`	`588`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`44`	`13`	`19999`	`311.3`	`4.1`	`0.708`	`8`	`0`	`0`	`0.005`
	`22`		[FPD]D:4701	`25`	`1`	`590`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`20270`	`307.5`	`4.2`	`0.732`	`7`	`0`	`0`	`0.005`
	`23`		[FPD]B:2701	`27`	`1`	`580`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`20429`	`293.1`	`2.6`	`0.611`	`7`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`305.9`	`3.5`	`0.677`	`7`	`0`	`0`	`0.005`
12	`24`		M	`31`	`2`	`755`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`14`	`20429`	`311.2`	`-0.5`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`25`		[FPD]C:3701	`26`	`1`	`589`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`40`	`13`	`20127`	`310.4`	`4.5`	`0.734`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
14	`26`		F	`26`	`7`	`20091`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`23`	`7`	`20314`	`231.3`	`0.2`	`0.649`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
15	`27`		A	`23`	`10`	`20314`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`28`	`10`	`19999`	`219.3`	`1.0`	`0.711`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`28`		A	`32`	`11`	`20314`	`◊`	C	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`20`	`4`	`20127`	`217.5`	`-0.7`	`0.554`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
17	`29`		B	`18`	`6`	`20429`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`24`	`10`	`20091`	`189.5`	`1.3`	`0.738`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
18	`30`		D	`16`	`7`	`20270`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`17`	`7`	`20270`	`169.7`	`2.7`	`0.869`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		[FPD]E:5701	`17`	`1`	`588`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`20270`	`167.8`	`-0.1`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`32`		[FPD]D:4701	`17`	`1`	`590`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`20127`	`167.0`	`-0.1`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`33`		[FPD]B:2701	`15`	`1`	`580`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`20314`	`164.6`	`-0.1`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
	`34`		[FPD]F:6701	`14`	`1`	`586`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`19999`	`154.1`	`0.3`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`163.4`	`-0.0`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
20	`35`		[FPD]C:3701	`15`	`1`	`589`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`20429`	`165.9`	`-0.1`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`36`		E	`18`	`6`	`19999`	`◊`	C	-x,y,-z	`2_555`	`20`	`9`	`20127`	`160.7`	`3.7`	`0.912`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
22	`37`		C	`20`	`7`	`20127`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`8`	`19999`	`148.3`	`1.4`	`0.758`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
23	`38`		[AGS]E:6600	`14`	`1`	`648`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`19999`	`121.6`	`-3.0`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.247`
	`39`		[AGS]B:2600	`12`	`1`	`639`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`20314`	`105.0`	`-3.6`	`0.489`	`1`	`0`	`0`	`0.247`
	`40`		[AGS]E:5600	`11`	`1`	`640`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`20270`	`102.7`	`-3.6`	`0.447`	`2`	`0`	`0`	`0.247`
	`41`		[AGS]C:3600	`11`	`1`	`642`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`20429`	`87.7`	`-2.9`	`0.494`	`1`	`0`	`0`	`0.247`
	`42`		[AGS]D:4600	`10`	`1`	`642`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`20127`	`86.1`	`-3.0`	`0.488`	`1`	`0`	`0`	`0.247`
	*Average:*													`100.6`	`-3.2`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.247`
24	`43`		G	`14`	`2`	`737`	`◊`	F	-x,y,-z	`2_555`	`8`	`3`	`20091`	`104.3`	`-0.6`	`0.684`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
25	`44`		D	`7`	`2`	`20270`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`13`	`5`	`20127`	`89.8`	`0.7`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`45`		F	`11`	`3`	`20091`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`7`	`3`	`20429`	`87.6`	`0.1`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`46`		D	`11`	`4`	`20270`	`◊`	F	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`13`	`3`	`20091`	`83.7`	`0.1`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`47`		A	`9`	`4`	`20314`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`7`	`4`	`20270`	`73.2`	`-0.2`	`0.526`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`48`		[FPD]F:6701	`11`	`1`	`586`	`◊`	[AGS]E:6600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`648`	`62.2`	`0.2`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[FPD]B:2701	`10`	`1`	`580`	`◊`	[AGS]B:2600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`639`	`50.7`	`0.7`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[FPD]D:4701	`9`	`1`	`590`	`◊`	[AGS]D:4600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`642`	`48.6`	`1.0`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[FPD]E:5701	`7`	`1`	`588`	`◊`	[AGS]E:5600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`640`	`45.0`	`1.1`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.6`	`0.7`	`0.588`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`52`		M	`6`	`2`	`755`	`◊`	F	-x,y,-z	`2_555`	`8`	`4`	`20091`	`49.4`	`-1.6`	`0.465`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`53`		[FPD]C:3701	`7`	`1`	`589`	`◊`	[AGS]C:3600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`642`	`47.7`	`0.9`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`54`		[MG]A:1601	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`20314`	`41.7`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
	`55`		[MG]E:5601	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`19999`	`41.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
	`56`		[MG]B:2601	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`20429`	`39.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
	`57`		[MG]F:6601	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`20091`	`39.1`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
	`58`		[MG]D:4601	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`20270`	`38.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
	*Average:*													`40.1`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.359`
33	`59`		B	`6`	`2`	`20429`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`19999`	`40.3`	`0.5`	`0.749`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`60`		[MG]C:3601	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`20127`	`40.3`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.382`
35	`61`		A	`5`	`2`	`20314`	`◊`	D	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`5`	`3`	`20270`	`38.6`	`0.8`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`62`		[AGS]A:1600	`3`	`1`	`645`	`◊`	[MG]A:1601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`33.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`63`		[AGS]D:4600	`4`	`1`	`642`	`◊`	[MG]D:4601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.7`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`64`		[AGS]E:6600	`3`	`1`	`648`	`◊`	[MG]F:6601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.8`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`65`		[AGS]B:2600	`2`	`1`	`639`	`◊`	[MG]B:2601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.8`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`66`		[AGS]E:5600	`3`	`1`	`640`	`◊`	[MG]E:5601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`67`		[AGS]C:3600	`2`	`1`	`642`	`◊`	[MG]C:3601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`18.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	*Average:*													`25.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
37	`68`		B	`6`	`3`	`20429`	`◊`	D	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`4`	`1`	`20270`	`32.3`	`0.4`	`0.738`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
38	`69`		H	`3`	`1`	`752`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`4`	`2`	`19999`	`30.7`	`-1.7`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`70`		E	`3`	`1`	`19999`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`1`	`20270`	`25.4`	`0.5`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`71`		[FPD]F:6701	`3`	`1`	`586`	`f`	[MG]F:6601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.9`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
	`72`		[FPD]B:2701	`6`	`1`	`580`	`f`	[MG]B:2601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
	`73`		[FPD]D:4701	`6`	`1`	`590`	`f`	[MG]D:4601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.3`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
	`74`		[FPD]E:5701	`3`	`1`	`588`	`f`	[MG]E:5601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.8`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
	`75`		[FPD]C:3701	`3`	`1`	`589`	`f`	[MG]C:3601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
	*Average:*													`19.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
41	`76`		[MG]D:4601	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`20127`	`0.8`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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