PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=776-95-DLG)

Interfaces in PDB 1vqk crystal.
Space symmetry group: C 2 2 21. Resolution: 2.30 Å

THE STRUCTURE OF CCDA-PHE-CAP-BIO BOUND TO THE A SITE OF THE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		0	`824`	`139`	`366421`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`748`	`164`	`18389`	`7203.9`	`-133.0`	`0.722`	`166`	`0`	`0`	`0.128`
`2`		0	`754`	`143`	`366421`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`606`	`135`	`12414`	`6271.0`	`-119.0`	`0.636`	`141`	`0`	`0`	`0.195`
`3`		0	`736`	`118`	`366421`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`613`	`131`	`14233`	`6140.6`	`-115.5`	`0.624`	`131`	`0`	`0`	`0.237`
`4`		0	`642`	`111`	`366421`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`522`	`128`	`14337`	`5399.8`	`-86.5`	`0.756`	`113`	`0`	`0`	`0.105`
`5`		0	`483`	`96`	`366421`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`391`	`93`	`10672`	`4185.1`	`-80.9`	`0.597`	`102`	`0`	`0`	`0.109`
`6`		0	`515`	`108`	`366421`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`376`	`81`	`11377`	`4058.1`	`-67.2`	`0.617`	`95`	`0`	`0`	`0.104`
`7`		0	`490`	`93`	`366421`	`◊`	Y	x,y,z	`1_555`	`378`	`86`	`10433`	`4017.3`	`-71.9`	`0.747`	`85`	`0`	`0`	`0.101`
`8`		0	`382`	`67`	`366421`	`◊`	R	x,y,z	`1_555`	`324`	`81`	`8469`	`3103.7`	`-54.6`	`0.588`	`65`	`0`	`0`	`0.088`
`9`		0	`365`	`60`	`366421`	`◊`	3	x,y,z	`1_555`	`314`	`69`	`7730`	`3031.9`	`-63.6`	`0.268`	`52`	`0`	`0`	`0.088`
`10`		0	`377`	`77`	`366421`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`269`	`54`	`4889`	`2875.3`	`-55.3`	`0.669`	`58`	`0`	`0`	`0.089`
`11`		0	`340`	`59`	`366421`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`271`	`67`	`8114`	`2814.4`	`-38.6`	`0.852`	`61`	`0`	`0`	`0.081`
`12`		0	`317`	`56`	`366421`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`277`	`61`	`9316`	`2630.4`	`-48.4`	`0.497`	`46`	`0`	`0`	`0.085`
`13`		0	`293`	`57`	`366421`	`◊`	Q	x,y,z	`1_555`	`253`	`60`	`6654`	`2481.5`	`-52.3`	`0.532`	`62`	`0`	`0`	`0.092`
`14`		0	`268`	`48`	`366421`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`256`	`68`	`8464`	`2408.6`	`-36.0`	`0.646`	`42`	`0`	`0`	`0.072`
`15`		0	`323`	`52`	`366421`	`◊`	2	x,y,z	`1_555`	`228`	`44`	`5062`	`2369.5`	`-30.5`	`0.569`	`28`	`0`	`0`	`0.067`
`16`		9	`272`	`43`	`19950`	`◊`	N	x,y,z	`1_555`	`242`	`65`	`10873`	`2289.4`	`-36.0`	`0.889`	`56`	`0`	`0`	`0.868`
`17`		0	`236`	`39`	`366421`	`◊`	W	x,y,z	`1_555`	`212`	`55`	`8188`	`2046.6`	`-38.5`	`0.352`	`39`	`0`	`0`	`0.070`
`18`		0	`228`	`45`	`366421`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`192`	`49`	`7229`	`1898.2`	`-31.9`	`0.720`	`47`	`0`	`0`	`0.077`
`19`		0	`216`	`31`	`366421`	`◊`	O	x,y,z	`1_555`	`183`	`51`	`6484`	`1838.1`	`-26.2`	`0.748`	`43`	`0`	`0`	`0.070`
`20`		0	`205`	`41`	`366421`	`◊`	X	x,y,z	`1_555`	`157`	`37`	`5106`	`1680.0`	`-26.7`	`0.698`	`34`	`0`	`0`	`0.065`
`21`		0	`204`	`36`	`366421`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`163`	`44`	`10198`	`1652.1`	`-24.3`	`0.351`	`22`	`0`	`0`	`0.053`
`22`		9	`142`	`20`	`19950`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`121`	`32`	`9517`	`1261.2`	`-20.1`	`0.653`	`14`	`0`	`0`	`0.041`
`23`		0	`172`	`33`	`366421`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`119`	`34`	`5626`	`1251.3`	`-13.9`	`0.710`	`23`	`0`	`0`	`0.037`
`24`		0	`126`	`19`	`366421`	`◊`	N	x,y,z	`1_555`	`120`	`31`	`10873`	`1115.3`	`-8.0`	`0.409`	`11`	`0`	`0`	`0.015`
`25`		0	`115`	`19`	`366421`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`124`	`40`	`9517`	`1085.2`	`-11.4`	`0.890`	`19`	`0`	`0`	`0.031`
`26`		Z	`111`	`31`	`5626`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`111`	`34`	`14233`	`1037.6`	`-14.7`	`0.016`	`17`	`2`	`0`	`0.031`
`27`		9	`115`	`21`	`19950`	`◊`	0	x,y,z	`1_555`	`141`	`35`	`366421`	`1030.1`	`-24.2`	`0.954`	`11`	`0`	`0`	`0.045`
`28`		0	`126`	`26`	`366421`	`◊`	S	x,y,z	`1_555`	`96`	`31`	`5183`	`990.4`	`-17.2`	`0.748`	`22`	`0`	`0`	`0.042`
`29`		0	`114`	`21`	`366421`	`◊`	V	x,y,z	`1_555`	`113`	`28`	`4547`	`983.9`	`-13.4`	`0.769`	`25`	`0`	`0`	`0.038`
`30`		0	`108`	`18`	`366421`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`97`	`28`	`4414`	`913.5`	`-18.4`	`0.544`	`16`	`0`	`0`	`0.040`
`31`		M	`75`	`20`	`12414`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`70`	`18`	`6152`	`704.4`	`-9.0`	`0.038`	`9`	`4`	`0`	`0.015`
`32`		0	`87`	`15`	`366421`	`◊`	U	x,y,z	`1_555`	`69`	`19`	`3958`	`697.3`	`-9.9`	`0.788`	`10`	`0`	`0`	`0.020`
`33`		0	`67`	`10`	`366421`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`57`	`20`	`6152`	`621.8`	`-13.2`	`0.478`	`17`	`0`	`0`	`0.028`
`34`		9	`68`	`11`	`19950`	`◊`	W	x,y,z	`1_555`	`51`	`16`	`8188`	`542.8`	`-8.0`	`0.689`	`7`	`0`	`0`	`0.014`
`35`		Q	`56`	`14`	`6654`	`◊`	N	x,y,z	`1_555`	`57`	`16`	`10873`	`516.6`	`-8.1`	`0.053`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		U	`48`	`15`	`3958`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`52`	`16`	`7229`	`513.4`	`-8.0`	`0.050`	`7`	`1`	`0`	`0.012`
`37`		4	`45`	`4`	`1023`	`◊`	0	x,y,z	`1_555`	`78`	`15`	`366421`	`512.7`	`-5.0`	`0.858`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
`38`		0	`56`	`9`	`366421`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`50`	`13`	`2743`	`470.8`	`-6.4`	`0.787`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
`39`		K	`35`	`12`	`7229`	`◊`	K	-x+1,y,-z+1/2	`3_655`	`36`	`12`	`7229`	`372.5`	`0.1`	`0.478`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
`40`		[1MA]0:628	`22`	`1`	`504`	`cf`	0	x,y,z	`1_555`	`51`	`11`	`366421`	`328.7`	`-1.8`	`0.778`	`5`	`0`	`0`	`0.006`
`41`		V	`35`	`10`	`4547`	`◊`	S	x,y,z	`1_555`	`36`	`10`	`5183`	`327.9`	`-4.3`	`0.164`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
`42`		[OMG]0:2588	`24`	`1`	`510`	`cf`	0	x,y,z	`1_555`	`45`	`7`	`366421`	`289.4`	`-2.9`	`0.774`	`2`	`0`	`0`	`0.006`
`43`		K	`27`	`9`	`7229`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`11`	`18389`	`279.0`	`-2.2`	`0.258`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`44`		[OMU]0:2587	`21`	`1`	`455`	`cf`	0	x,y,z	`1_555`	`48`	`11`	`366421`	`278.6`	`-1.1`	`0.834`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
`45`		J	`29`	`6`	`8464`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`10198`	`275.3`	`-3.2`	`0.138`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
`46`		2	`31`	`7`	`5062`	`◊`	S	x,y,z	`1_555`	`32`	`8`	`5183`	`265.6`	`-2.9`	`0.217`	`2`	`1`	`0`	`0.006`
`47`		[UR3]0:2619	`21`	`1`	`452`	`cf`	0	x,y,z	`1_555`	`41`	`8`	`366421`	`260.9`	`-0.9`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
`48`		9	`32`	`7`	`19950`	`◊`	Q	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`6654`	`258.4`	`-2.8`	`0.742`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
`49`		[PSU]0:2621	`19`	`1`	`427`	`cf`	0	x,y,z	`1_555`	`42`	`8`	`366421`	`249.5`	`-2.2`	`0.669`	`3`	`0`	`0`	`0.005`
`50`		J	`29`	`10`	`8464`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`18389`	`237.6`	`0.6`	`0.529`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
`51`		N	`31`	`9`	`10873`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`9517`	`225.0`	`1.2`	`0.660`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`52`		O	`17`	`4`	`6484`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`14337`	`181.9`	`-1.4`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`53`		U	`15`	`4`	`3958`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`18389`	`171.9`	`-1.4`	`0.336`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
`54`		2	`22`	`5`	`5062`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`4889`	`166.1`	`-2.2`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
`55`		0	`22`	`6`	`366421`	`◊`	V	x,-y+1,-z	`4_565`	`15`	`6`	`4547`	`164.8`	`-3.7`	`0.373`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`56`		9	`26`	`3`	`19950`	`◊`	0	x-1/2,y-1/2,z	`5_445`	`19`	`2`	`366421`	`162.8`	`-0.5`	`0.910`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`57`		1	`15`	`4`	`4889`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`14337`	`160.3`	`-1.2`	`0.375`	`3`	`4`	`0`	`0.002`
`58`		3	`14`	`4`	`7730`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`12414`	`157.0`	`-2.6`	`0.141`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
`59`		0	`16`	`2`	`366421`	`x`	0	x-1/2,y-1/2,z	`5_445`	`19`	`4`	`366421`	`152.6`	`-5.7`	`0.523`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`60`		[K]0:9002	`1`	`1`	`216`	`f`	0	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`366421`	`132.6`	`-85.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
`61`		9	`15`	`4`	`19950`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`9316`	`124.2`	`0.6`	`0.741`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`62`		[K]0:9001	`1`	`1`	`216`	`f`	0	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`366421`	`121.6`	`-104.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.162`
`63`		[ACA]4:78	`4`	`1`	`197`	`◊`	0	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`366421`	`114.5`	`4.2`	`0.243`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`64`		0	`20`	`3`	`366421`	`◊`	0	-x+1,y,-z+1/2	`3_655`	`20`	`3`	`366421`	`113.4`	`1.2`	`0.950`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`65`		N	`15`	`7`	`10873`	`◊`	0	x-1/2,y-1/2,z	`5_445`	`16`	`2`	`366421`	`113.2`	`-2.5`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`66`		O	`19`	`7`	`6484`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11377`	`111.8`	`-0.1`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`67`		0	`19`	`6`	`366421`	`◊`	E	-x,y,-z+1/2	`3_555`	`12`	`4`	`10198`	`99.2`	`-0.3`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`68`		[OMG]0:2588	`14`	`1`	`510`	`cf`	[OMU]0:2587	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`455`	`91.1`	`-0.6`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`69`		[CL]0:9305	`1`	`1`	`125`	`f`	0	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`366421`	`88.3`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
`70`		T	`16`	`5`	`8114`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14337`	`82.7`	`-1.0`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`71`		[UR3]0:2619	`10`	`1`	`452`	`◊`	4	x,y,z	`1_555`	`12`	`2`	`1023`	`80.8`	`1.8`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`72`		[OMG]0:2588	`5`	`1`	`510`	`◊`	4	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`1023`	`79.1`	`2.1`	`0.760`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
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