PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=513-92-KDG)

Interfaces in PDB 1twc crystal.
Space symmetry group: I 2 2 2. Resolution: 3.00 Å

RNA POLYMERASE II COMPLEXED WITH GTP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`821`	`204`	`54408`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`855`	`234`	`70587`	`8117.1`	`-91.1`	`0.005`	`86`	`14`	`0`	`0.554`
2	`2`		E	`244`	`58`	`13325`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`270`	`79`	`70587`	`2387.0`	`-16.0`	`0.340`	`19`	`9`	`0`	`0.207`
3	`3`		K	`197`	`46`	`8894`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`203`	`53`	`16587`	`2075.6`	`-35.1`	`0.019`	`10`	`7`	`0`	`1.000`
4	`4`		B	`228`	`62`	`54408`	`◊`	B	-x+1,-y,z	`2_655`	`229`	`62`	`54408`	`1985.7`	`-19.3`	`0.206`	`16`	`0`	`0`	`0.946`
5	`5`		F	`196`	`50`	`5760`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`206`	`53`	`70587`	`1867.7`	`-16.4`	`0.419`	`17`	`6`	`0`	`0.339`
6	`6`		C	`187`	`42`	`16587`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`191`	`47`	`54408`	`1626.9`	`-8.5`	`0.495`	`29`	`13`	`0`	`0.390`
7	`7`		H	`179`	`43`	`8868`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`159`	`48`	`70587`	`1583.7`	`-20.5`	`0.071`	`16`	`4`	`0`	`0.221`
8	`8`		I	`165`	`40`	`9445`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`160`	`40`	`70587`	`1497.9`	`-13.9`	`0.216`	`25`	`3`	`0`	`0.258`
9	`9`		J	`142`	`32`	`4812`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`178`	`55`	`54408`	`1489.2`	`-17.7`	`0.163`	`14`	`2`	`0`	`0.970`
10	`10`		I	`149`	`36`	`9445`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`145`	`35`	`54408`	`1364.1`	`-14.2`	`0.196`	`11`	`2`	`0`	`0.300`
11	`11`		L	`96`	`25`	`4810`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`126`	`36`	`54408`	`1109.0`	`-3.7`	`0.594`	`19`	`12`	`0`	`0.215`
12	`12`		J	`98`	`26`	`4812`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`107`	`34`	`16587`	`994.0`	`-5.7`	`0.541`	`11`	`7`	`0`	`0.194`
13	`13`		K	`98`	`26`	`8894`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`109`	`27`	`70587`	`988.1`	`-9.8`	`0.327`	`4`	`3`	`0`	`0.033`
14	`14`		L	`50`	`8`	`4810`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`73`	`20`	`16587`	`537.8`	`-0.9`	`0.665`	`12`	`7`	`0`	`0.113`
15	`15`		E	`59`	`16`	`13325`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`59`	`18`	`70587`	`504.2`	`2.5`	`0.856`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
16	`16`		I	`50`	`14`	`9445`	`◊`	A	-x+3/2,y-1/2,-z+1/2	`7_645`	`56`	`15`	`70587`	`492.6`	`0.4`	`0.628`	`11`	`4`	`0`	`0.000`
17	`17`		K	`43`	`13`	`8894`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`53`	`16`	`54408`	`452.9`	`-1.1`	`0.638`	`3`	`4`	`0`	`0.026`
18	`18`		B	`55`	`20`	`54408`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`39`	`13`	`70587`	`409.2`	`-4.2`	`0.363`	`4`	`1`	`0`	`0.026`
19	`19`		A	`46`	`15`	`70587`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`41`	`17`	`70587`	`382.0`	`-2.3`	`0.529`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		C	`39`	`10`	`16587`	`◊`	A	-x+1,y,-z	`3_655`	`45`	`11`	`70587`	`370.1`	`-1.5`	`0.509`	`6`	`1`	`0`	`0.012`
21	`21`		C	`40`	`11`	`16587`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`38`	`13`	`70587`	`335.5`	`-2.9`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
22	`22`		B	`34`	`11`	`54408`	`◊`	B	-x+2,-y,z	`2_755`	`34`	`11`	`54408`	`292.8`	`-1.0`	`0.590`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
23	`23`		[GTP]B:3008	`20`	`1`	`637`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`54408`	`198.1`	`0.6`	`0.659`	`3`	`0`	`0`	`0.100`
24	`24`		K	`19`	`7`	`8894`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`8868`	`195.8`	`-1.2`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
25	`25`		K	`19`	`5`	`8894`	`◊`	C	-x+2,y,-z	`3_755`	`28`	`6`	`16587`	`185.0`	`-2.0`	`0.493`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		E	`29`	`7`	`13325`	`◊`	I	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`21`	`6`	`9445`	`175.3`	`-0.9`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		H	`16`	`4`	`8868`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`4`	`16587`	`163.5`	`-1.4`	`0.373`	`1`	`1`	`0`	`0.005`
28	`28`		F	`18`	`6`	`5760`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`14`	`3`	`70587`	`154.8`	`-1.1`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		L	`16`	`4`	`4810`	`◊`	L	-x+1,y,-z	`3_655`	`16`	`4`	`4810`	`151.6`	`-0.0`	`0.617`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
30	`30`		F	`14`	`5`	`5760`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`54408`	`138.5`	`0.8`	`0.770`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		L	`19`	`6`	`4810`	`◊`	B	-x+1,y,-z	`3_655`	`15`	`5`	`54408`	`135.4`	`0.0`	`0.632`	`2`	`2`	`0`	`0.003`
32	`32`		[GTP]B:3008	`19`	`1`	`637`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`70587`	`133.8`	`-0.7`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
33	`33`		A	`19`	`6`	`70587`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`12`	`5`	`13325`	`113.7`	`-0.8`	`0.513`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
34	`34`		F	`13`	`5`	`5760`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13325`	`95.1`	`-0.1`	`0.652`	`0`	`1`	`0`	`0.002`
35	`35`		L	`13`	`5`	`4810`	`◊`	L	-x+1,-y,z	`2_655`	`13`	`5`	`4810`	`83.0`	`-1.1`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
36	`36`		B	`10`	`4`	`54408`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`7`	`2`	`13325`	`79.3`	`-1.0`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		C	`8`	`4`	`16587`	`◊`	B	-x+1,y,-z	`3_655`	`7`	`3`	`54408`	`62.4`	`0.9`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		[ZN]A:3008	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`70587`	`49.0`	`-39.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.534`
39	`39`		B	`6`	`4`	`54408`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`4`	`2`	`70587`	`46.7`	`-0.5`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		L	`2`	`1`	`4810`	`◊`	L	x,-y,-z	`4_555`	`2`	`1`	`4810`	`41.8`	`-1.3`	`0.114`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
41	`41`		[MN]A:3009	`1`	`1`	`123`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`70587`	`40.3`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
42	`42`		[GTP]B:3008	`4`	`1`	`637`	`◊`	[MN]A:3009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`39.4`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
43	`43`		[GTP]B:3008	`7`	`1`	`637`	`◊`	[MN]A:3010	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`38.6`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
44	`44`		[MN]A:3010	`1`	`1`	`123`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`54408`	`36.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`45`		[MN]A:3009	`1`	`1`	`123`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`54408`	`12.5`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`24.3`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
45	`46`		[MN]A:3010	`1`	`1`	`123`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`70587`	`31.4`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
46	`47`		B	`3`	`1`	`54408`	`◊`	B	-x+1,y,-z	`3_655`	`3`	`1`	`54408`	`20.2`	`0.6`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		E	`2`	`1`	`13325`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`54408`	`14.7`	`0.6`	`0.869`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		[MN]A:3010	`1`	`1`	`123`	`f`	[MN]A:3009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`14.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
49	`50`		L	`1`	`1`	`4810`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`8894`	`14.5`	`-0.1`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`51`		A	`2`	`2`	`70587`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`54408`	`13.2`	`0.4`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		L	`1`	`1`	`4810`	`◊`	B	-x+1,-y,z	`2_655`	`1`	`1`	`54408`	`11.4`	`-0.1`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		[ZN]C:3002	`1`	`1`	`98`	`f`	A	-x+1,y,-z	`3_655`	`1`	`1`	`70587`	`9.9`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
53	`54`		L	`2`	`2`	`4810`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4812`	`6.0`	`0.0`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		H	`2`	`1`	`8868`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`54408`	`5.7`	`-0.1`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`56`		[ZN]B:3007	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`70587`	`1.2`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
56	`57`		C	`1`	`1`	`16587`	`◊`	C	-x+2,y,-z	`3_755`	`1`	`1`	`16587`	`0.6`	`-0.0`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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