PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=191-J2-66E)

Interfaces in PDB 1o7d crystal.
Space symmetry group: P 61 2 2. Resolution: 2.70 Å

THE STRUCTURE OF THE BOVINE LYSOSOMAL A-MANNOSIDASE SUGGESTS A NOVEL MECHANISM FOR LOW PH ACTIVATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`252`	`47`	`8206`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`306`	`86`	`15252`	`2604.1`	`-41.1`	`0.228`	`31`	`1`	`1`	`0.578`
2	`2`		D	`155`	`39`	`13919`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`186`	`60`	`9944`	`1632.1`	`-19.0`	`0.203`	`19`	`8`	`0`	`1.000`
3	`3`		D	`180`	`51`	`13919`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`160`	`30`	`8206`	`1539.0`	`-14.3`	`0.613`	`24`	`8`	`0`	`1.000`
4	`4`		A	`132`	`42`	`15252`	`◊`	A	-x+y+1,y,-z+1/2	`11_655`	`132`	`42`	`15252`	`1257.1`	`-7.0`	`0.547`	`16`	`4`	`0`	`0.146`
5	`5`		C	`120`	`35`	`9944`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`101`	`24`	`8206`	`1129.1`	`-23.9`	`0.094`	`12`	`0`	`1`	`1.000`
6	`6`		E	`107`	`29`	`7728`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`121`	`33`	`15252`	`1105.0`	`-8.4`	`0.445`	`11`	`0`	`0`	`0.189`
7	`7`		C	`90`	`19`	`9944`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`114`	`32`	`15252`	`831.0`	`-11.0`	`0.197`	`6`	`2`	`0`	`0.384`
8	`8`		D	`83`	`24`	`13919`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`99`	`29`	`15252`	`802.9`	`-3.2`	`0.477`	`16`	`1`	`0`	`0.181`
9	`9`		E	`73`	`20`	`7728`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`90`	`22`	`8206`	`729.7`	`-8.3`	`0.445`	`7`	`0`	`0`	`0.459`
10	`10`		E	`74`	`20`	`7728`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`72`	`20`	`9944`	`649.5`	`-7.6`	`0.448`	`16`	`0`	`0`	`1.000`
11	`11`		E	`62`	`18`	`7728`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`65`	`18`	`13919`	`550.3`	`-1.7`	`0.667`	`5`	`8`	`0`	`0.349`
12	`12`		E	`52`	`15`	`7728`	`◊`	D	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`54`	`16`	`13919`	`439.7`	`-4.9`	`0.387`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		E	`37`	`13`	`7728`	`◊`	C	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`31`	`10`	`9944`	`269.9`	`-1.3`	`0.702`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
14	`14`		[NAG]D:1	`14`	`1`	`361`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`13919`	`157.7`	`3.4`	`0.304`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[TRS]A:2	`7`	`1`	`254`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`15252`	`117.0`	`2.4`	`0.284`	`6`	`0`	`0`	`0.007`
16	`16`		[NAG]D:2	`10`	`1`	`357`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`13919`	`113.8`	`2.3`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[NDG]C:1	`9`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`8206`	`99.8`	`0.6`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		[NAG]C:2	`11`	`1`	`360`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`8206`	`92.4`	`1.0`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[MAN]C:167	`6`	`1`	`291`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`9944`	`86.0`	`2.3`	`0.513`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		[NDG]C:1	`10`	`1`	`358`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`9944`	`83.4`	`2.2`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		[SO4]A:3001	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15252`	`82.3`	`-12.2`	`0.817`	`5`	`0`	`0`	`0.397`
22	`22`		[SO4]E:3002	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`7728`	`79.8`	`-11.7`	`0.774`	`4`	`0`	`0`	`0.922`
23	`23`		[NDG]C:1	`5`	`1`	`358`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`13919`	`79.5`	`2.2`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		[MAN]C:16	`7`	`1`	`290`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`9944`	`76.1`	`0.8`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		[NAG]D:3	`9`	`1`	`351`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13919`	`73.3`	`1.3`	`0.244`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		[MAN]C:166	`5`	`1`	`291`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`9944`	`72.9`	`1.6`	`0.538`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		[NDG]D:11	`8`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]D:1	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`72.9`	`2.3`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		[NDG]C:1	`6`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`360`	`69.8`	`1.7`	`0.065`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		[BMA]C:3	`9`	`1`	`289`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`9944`	`68.8`	`1.4`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		[MAN]C:13	`5`	`1`	`292`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`9944`	`67.6`	`1.6`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		[NAG]D:21	`7`	`1`	`352`	`cf`	[NAG]D:2	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`357`	`64.0`	`1.1`	`0.076`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[NAG]D:31	`7`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]D:3	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`351`	`62.4`	`1.3`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`63.2`	`1.2`	`0.086`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		[MAN]C:166	`8`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]C:16	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`62.7`	`2.7`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		[MAN]C:14	`6`	`1`	`294`	`cf`	[MAN]C:13	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`292`	`62.0`	`3.0`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		[MAN]C:167	`6`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]C:166	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`291`	`61.6`	`2.4`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		[NAG]C:2	`9`	`1`	`360`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`9944`	`60.9`	`0.6`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		[MAN]C:167	`7`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`15252`	`59.9`	`0.7`	`0.277`	`2`	`0`	`0`	`0.006`
37	`38`		A	`6`	`3`	`15252`	`◊`	C	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`8`	`6`	`9944`	`58.6`	`-0.8`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		[MAN]C:13	`7`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`289`	`56.6`	`2.7`	`0.223`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[NAG]A:1	`4`	`1`	`352`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`15252`	`56.3`	`1.6`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		[MAN]C:163	`7`	`1`	`293`	`cf`	[MAN]C:16	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`55.5`	`2.4`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[MAN]C:14	`3`	`1`	`294`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`9944`	`55.0`	`1.0`	`0.558`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[MAN]C:167	`6`	`1`	`291`	`◊`	A	-x+y+1,y,-z+1/2	`11_655`	`7`	`2`	`15252`	`54.5`	`0.5`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[BMA]C:3	`7`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`51.2`	`0.7`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		[MAN]C:16	`7`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`289`	`50.9`	`2.1`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[NAG]D:3	`3`	`1`	`351`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`8206`	`49.7`	`1.0`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		[NDG]D:11	`6`	`1`	`358`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13919`	`45.9`	`1.3`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		E	`8`	`3`	`7728`	`◊`	[NAG]D:2	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`5`	`1`	`357`	`45.4`	`0.8`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		[TRS]A:2	`5`	`1`	`254`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`9944`	`45.0`	`0.8`	`0.801`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`50`		[NAG]C:2	`5`	`1`	`360`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13919`	`40.5`	`1.3`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`51`		[NAG]D:21	`5`	`1`	`352`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`13919`	`40.0`	`0.4`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		[MAN]C:163	`2`	`1`	`293`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`13919`	`37.3`	`0.6`	`0.498`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		E	`4`	`2`	`7728`	`◊`	[NAG]D:21	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`5`	`1`	`352`	`37.1`	`1.1`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`54`		[TRS]A:2	`4`	`1`	`254`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13919`	`36.5`	`0.8`	`0.798`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		[ZN]A:3	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`15252`	`29.6`	`-19.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.549`
55	`56`		[MAN]C:167	`4`	`1`	`291`	`f`	[MAN]C:16	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`290`	`24.7`	`0.9`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`57`		[ZN]A:3	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`9944`	`23.4`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.282`
57	`58`		[MAN]C:14	`4`	`1`	`294`	`f`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`289`	`23.1`	`0.8`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`59`		[ZN]A:3	`1`	`1`	`98`	`f`	[TRS]A:2	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`254`	`22.2`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.273`
59	`60`		[NAG]D:2	`3`	`1`	`357`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`9944`	`22.1`	`0.6`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`61`		[MAN]C:13	`4`	`1`	`292`	`f`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`360`	`22.0`	`0.5`	`0.163`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`62`		[NAG]D:31	`1`	`1`	`357`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13919`	`21.8`	`0.4`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`63`		[NAG]D:31	`4`	`1`	`357`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8206`	`20.6`	`0.7`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`64`		[TRS]A:2	`2`	`1`	`254`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`8206`	`20.0`	`-0.1`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
64	`65`		[NAG]D:3	`4`	`1`	`351`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`15252`	`17.7`	`0.5`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`66`		[SO4]E:3002	`3`	`1`	`187`	`◊`	D	y,x-1,-z+1/3	`7_545`	`2`	`1`	`13919`	`17.3`	`-2.3`	`0.542`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`67`		[BMA]C:3	`4`	`1`	`289`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`8206`	`16.5`	`0.4`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`68`		[MAN]C:163	`2`	`1`	`293`	`f`	[BMA]C:3	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`289`	`15.1`	`0.7`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`69`		[MAN]C:16	`1`	`1`	`290`	`f`	[NAG]C:2	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`360`	`10.2`	`0.5`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`70`		C	`1`	`1`	`9944`	`◊`	A	-x+y+1,y,-z+1/2	`11_655`	`1`	`1`	`15252`	`3.9`	`-0.0`	`0.542`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`71`		[SO4]A:3001	`1`	`1`	`188`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7728`	`3.9`	`-0.5`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
71	`72`		[MAN]C:166	`1`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15252`	`1.4`	`-0.0`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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