PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=527-04-ME2)

Interfaces in PDB 1mms crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.57 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOMAL PROTEIN L11-RNA COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`133`	`23`	`8274`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`128`	`36`	`7817`	`1220.7`	`-19.0`	`0.803`	`22`	`0`	`0`	`0.176`
2	`2`		D	`110`	`18`	`8274`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`102`	`30`	`4521`	`1023.9`	`-19.1`	`0.615`	`23`	`0`	`0`	`0.215`
3	`3`		D	`30`	`3`	`8274`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`31`	`3`	`8274`	`212.7`	`4.6`	`0.990`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		D	`32`	`2`	`8274`	`◊`	C	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`31`	`2`	`8274`	`199.0`	`5.1`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`19`	`6`	`4521`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`26`	`7`	`8274`	`169.5`	`-2.0`	`0.726`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
6	`6`		B	`16`	`4`	`4521`	`◊`	A	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`15`	`7`	`7817`	`134.7`	`0.2`	`0.652`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`13`	`4`	`4521`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`17`	`5`	`8274`	`118.5`	`-2.0`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		D	`9`	`2`	`8274`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`8`	`4`	`7817`	`79.3`	`-1.8`	`0.450`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
9	`9`		[MMC]C:230	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`8274`	`71.9`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`10`		[MMC]D:332	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`8274`	`70.8`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`71.4`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
10	`11`		[MMC]A:415	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`7817`	`70.3`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
11	`12`		[MMC]D:347	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`8274`	`69.0`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	`13`		[MMC]C:227	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`8274`	`68.5`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	*Average:*													`68.8`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
12	`14`		[MMC]A:416	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`7817`	`67.2`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
13	`15`		[CD]C:202	`1`	`1`	`112`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`8274`	`65.1`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`16`		[CD]D:302	`1`	`1`	`112`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`8274`	`64.1`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	*Average:*													`64.6`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
14	`17`		[MG]C:257	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`8274`	`62.4`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	`18`		[MG]D:380	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`8274`	`61.8`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	*Average:*													`62.1`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
15	`19`		A	`6`	`2`	`7817`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`10`	`2`	`8274`	`61.1`	`-0.4`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		[MG]C:215	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`8274`	`60.4`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`21`		[MG]D:375	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`8274`	`59.2`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	*Average:*													`59.8`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
17	`22`		[MG]C:210	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`8274`	`58.9`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`23`		[MG]D:385	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`8274`	`56.6`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	*Average:*													`57.8`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
18	`24`		A	`6`	`3`	`7817`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`9`	`3`	`8274`	`57.8`	`-1.6`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[CD]C:201	`1`	`1`	`112`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`8274`	`57.3`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	`26`		[CD]D:390	`1`	`1`	`112`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`8274`	`56.0`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	*Average:*													`56.6`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
20	`27`		[CD]A:413	`1`	`1`	`112`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`7817`	`57.2`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
21	`28`		B	`4`	`2`	`4521`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`4`	`2`	`7817`	`56.8`	`1.1`	`0.807`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
22	`29`		[MMC]D:451	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`8274`	`55.6`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	`30`		[MMC]A:448	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8274`	`43.1`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`49.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
23	`31`		[MG]D:326	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`8274`	`52.2`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`32`		[MG]C:226	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`8274`	`52.0`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	*Average:*													`52.1`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
24	`33`		A	`7`	`4`	`7817`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`5`	`2`	`7817`	`51.4`	`1.7`	`0.877`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
25	`34`		[MG]D:365	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`8274`	`49.6`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
	`35`		[MG]C:437	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`8274`	`45.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
	*Average:*													`47.7`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
26	`36`		[MMC]A:448	`1`	`1`	`137`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7817`	`49.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
27	`37`		[CD]A:414	`1`	`1`	`112`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`7817`	`48.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
28	`38`		[MG]C:223	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`8274`	`45.6`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
29	`39`		[CD]D:311	`1`	`1`	`112`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8274`	`45.5`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`40`		[CD]C:211	`1`	`1`	`112`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8274`	`44.9`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`45.2`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
30	`41`		[MG]D:360	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8274`	`44.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
31	`42`		[MG]C:273	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`8274`	`42.5`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
	`43`		[MG]D:397	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`8274`	`41.4`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
	*Average:*													`41.9`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
32	`44`		[MG]D:318	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`8274`	`40.8`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
33	`45`		[MG]C:228	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8274`	`40.4`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
34	`46`		D	`6`	`1`	`8274`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`7817`	`37.4`	`0.3`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`47`		[MG]D:354	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`8274`	`37.0`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	`48`		[MG]C:225	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8274`	`34.8`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	*Average:*													`35.9`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
36	`49`		[CD]C:211	`1`	`1`	`112`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8274`	`35.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[CD]D:311	`1`	`1`	`112`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8274`	`33.9`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`34.7`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		[CD]A:414	`1`	`1`	`112`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`8274`	`34.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
38	`52`		[MG]A:214	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`7817`	`31.9`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
39	`53`		B	`3`	`1`	`4521`	`◊`	[MG]A:214	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`1`	`1`	`98`	`30.8`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`54`		B	`3`	`1`	`4521`	`◊`	[CD]C:211	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`1`	`1`	`112`	`19.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
41	`55`		[MG]A:214	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`8274`	`19.1`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`56`		D	`3`	`2`	`8274`	`◊`	[MG]C:225	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`98`	`18.9`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[MG]D:354	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`3`	`2`	`8274`	`14.2`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`16.5`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`58`		B	`5`	`1`	`4521`	`◊`	[CD]A:413	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`1`	`1`	`112`	`16.3`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`59`		[MG]A:214	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`7817`	`14.4`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`60`		[MG]D:380	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:326	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
46	`61`		[MG]C:257	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:226	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.7`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
47	`62`		[CD]D:390	`1`	`1`	`112`	`f`	[MG]D:318	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.1`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
48	`63`		[MG]C:226	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:210	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`4.2`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
49	`64`		A	`1`	`1`	`7817`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`1`	`1`	`8274`	`3.8`	`0.1`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`65`		[MG]D:385	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:326	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`3.3`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
51	`66`		[MMC]A:416	`1`	`1`	`137`	`f`	[MMC]A:415	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`2.9`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
52	`67`		[MMC]C:230	`1`	`1`	`137`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7817`	`0.3`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe