PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=713-03-444)

Interfaces in PDB 1lvo crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.96 Å

STRUCTURE OF CORONAVIRUS MAIN PROTEINASE REVEALS COMBINATION OF A CHYMOTRYPSIN FOLD WITH AN EXTRA ALPHA- HELICAL DOMAIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`140`	`44`	`14057`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`136`	`45`	`14143`	`1271.4`	`-12.9`	`0.245`	`29`	`3`	`0`	`0.248`
	`2`		D	`146`	`44`	`14258`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`139`	`42`	`14200`	`1266.3`	`-12.3`	`0.287`	`27`	`2`	`0`	`0.248`
	`3`		F	`133`	`42`	`14123`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`143`	`43`	`13950`	`1252.1`	`-12.5`	`0.275`	`23`	`1`	`0`	`0.248`
	*Average:*													`1263.3`	`-12.5`	`0.269`	`26`	`2`	`0`	`0.248`
2	`4`		E	`63`	`15`	`13950`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`66`	`16`	`14258`	`610.5`	`-6.1`	`0.321`	`9`	`0`	`0`	`0.053`
	`5`		A	`60`	`15`	`14143`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`65`	`15`	`14200`	`596.6`	`-6.1`	`0.300`	`10`	`0`	`0`	`0.053`
	*Average:*													`603.6`	`-6.1`	`0.310`	`10`	`0`	`0`	`0.053`
3	`6`		E	`66`	`20`	`13950`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`66`	`20`	`14258`	`564.0`	`-5.6`	`0.374`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		F	`46`	`14`	`14123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`57`	`19`	`14200`	`455.5`	`-1.0`	`0.563`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		A	`44`	`12`	`14143`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`44`	`12`	`14123`	`390.7`	`0.8`	`0.792`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		A	`40`	`12`	`14143`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`41`	`15`	`14200`	`389.8`	`0.1`	`0.733`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		B	`34`	`10`	`14057`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`35`	`8`	`14200`	`303.0`	`-1.2`	`0.515`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
8	`11`		B	`32`	`8`	`14057`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`26`	`7`	`14258`	`279.6`	`3.0`	`0.908`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		E	`21`	`7`	`13950`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`26`	`8`	`14057`	`228.8`	`-2.3`	`0.324`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`13`		E	`26`	`7`	`13950`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`5`	`14057`	`225.3`	`0.7`	`0.684`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		B	`34`	`11`	`14057`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`30`	`11`	`13950`	`220.8`	`-2.8`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		B	`17`	`5`	`14057`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`25`	`10`	`14258`	`188.7`	`-1.1`	`0.481`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		F	`22`	`5`	`14123`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`22`	`7`	`14200`	`185.4`	`3.0`	`0.906`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		E	`24`	`7`	`13950`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`14143`	`181.4`	`0.0`	`0.667`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[MRD]D:4004	`7`	`1`	`275`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`14258`	`163.5`	`2.5`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[MRD]B:4002	`7`	`1`	`273`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`10`	`14057`	`163.1`	`2.9`	`0.494`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[MRD]E:4005	`7`	`1`	`273`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`29`	`10`	`13950`	`161.1`	`1.8`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[MRD]F:4006	`7`	`1`	`273`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`14123`	`158.5`	`0.9`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[MRD]A:4001	`7`	`1`	`277`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`14143`	`154.4`	`0.3`	`0.290`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
20	`23`		[MRD]C:4003	`7`	`1`	`274`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`14200`	`154.3`	`2.2`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		F	`19`	`4`	`14123`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`5`	`14258`	`143.3`	`-1.9`	`0.315`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[DIO]A:2004	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`14143`	`133.1`	`4.6`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		F	`12`	`6`	`14123`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`15`	`5`	`14258`	`126.9`	`-0.7`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[DIO]B:2007	`6`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`14057`	`125.8`	`3.3`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		A	`14`	`4`	`14143`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`19`	`6`	`14200`	`124.5`	`0.0`	`0.655`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`29`		[SO4]B:3020	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`14057`	`113.7`	`-16.4`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.155`
27	`30`		[DIO]E:2002	`6`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`13950`	`113.6`	`2.9`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`31`		[DIO]A:2005	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`14143`	`112.7`	`4.1`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`32`		[DIO]A:2006	`6`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14143`	`108.3`	`3.2`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`33`		[SO4]D:3021	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`14258`	`100.6`	`-14.7`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.116`
31	`34`		[SO4]D:3012	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`14258`	`97.6`	`-14.2`	`0.701`	`5`	`0`	`0`	`0.152`
	`35`		[SO4]A:3003	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`14143`	`97.5`	`-14.3`	`0.685`	`4`	`0`	`0`	`0.152`
	*Average:*													`97.6`	`-14.2`	`0.693`	`5`	`0`	`0`	`0.152`
32	`36`		[SO4]F:3010	`5`	`1`	`186`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`14123`	`97.4`	`-15.3`	`0.733`	`3`	`0`	`0`	`0.134`
33	`37`		[SO4]C:3005	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`14200`	`96.0`	`-13.9`	`0.696`	`4`	`0`	`0`	`0.101`
34	`38`		[SO4]B:3006	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`14057`	`94.6`	`-13.5`	`0.694`	`5`	`0`	`0`	`0.149`
35	`39`		F	`11`	`4`	`14123`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`14200`	`93.2`	`-0.7`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		[DIO]C:2009	`6`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`14258`	`93.0`	`3.2`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[SO4]E:3007	`5`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13950`	`92.5`	`-13.2`	`0.711`	`5`	`0`	`0`	`0.124`
38	`42`		[DIO]F:2003	`6`	`1`	`218`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14123`	`92.4`	`3.3`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`43`		[SO4]F:3024	`5`	`1`	`187`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14123`	`91.9`	`-12.9`	`0.873`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
40	`44`		[SO4]C:3023	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14200`	`91.5`	`-13.7`	`0.816`	`5`	`0`	`0`	`0.103`
41	`45`		A	`16`	`5`	`14143`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`9`	`3`	`14258`	`90.2`	`-0.1`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[DIO]E:2001	`5`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`13950`	`89.9`	`3.2`	`0.168`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		F	`9`	`3`	`14123`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14143`	`86.1`	`0.3`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[SO4]F:3019	`5`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14123`	`85.9`	`-12.1`	`0.786`	`1`	`0`	`0`	`0.101`
45	`49`		[SO4]E:3018	`5`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13950`	`84.5`	`-13.0`	`0.783`	`4`	`0`	`0`	`0.119`
46	`50`		[SO4]E:3013	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13950`	`84.3`	`-11.2`	`0.909`	`4`	`0`	`0`	`0.105`
47	`51`		[SO4]C:3015	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`14200`	`83.1`	`-11.0`	`0.896`	`6`	`0`	`0`	`0.088`
48	`52`		[DIO]C:2008	`6`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14200`	`83.0`	`3.2`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		[SO4]D:3017	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`14258`	`80.4`	`-10.7`	`0.902`	`7`	`0`	`0`	`0.106`
50	`54`		[SO4]D:3016	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14258`	`77.8`	`-10.6`	`0.830`	`4`	`0`	`0`	`0.095`
51	`55`		[SO4]A:3011	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`14143`	`77.1`	`-11.6`	`0.706`	`2`	`0`	`0`	`0.119`
52	`56`		B	`12`	`4`	`14057`	`◊`	C	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`8`	`4`	`14200`	`76.8`	`1.4`	`0.809`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
53	`57`		[SO4]A:3027	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`14143`	`76.4`	`-10.1`	`0.897`	`4`	`0`	`0`	`0.112`
54	`58`		[DIO]E:2002	`5`	`1`	`216`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`14123`	`74.9`	`1.3`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`59`		[DIO]A:2006	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14057`	`73.3`	`1.2`	`0.018`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`60`		A	`8`	`4`	`14143`	`f`	[DIO]C:2008	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`6`	`1`	`216`	`73.3`	`2.2`	`0.029`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`61`		[SO4]B:3026	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`14057`	`69.2`	`-8.8`	`0.910`	`2`	`0`	`0`	`0.092`
58	`62`		[SO4]A:3004	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14143`	`69.0`	`-7.5`	`0.965`	`2`	`0`	`0`	`0.080`
59	`63`		[SO4]D:3008	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14258`	`67.9`	`-8.4`	`0.926`	`3`	`0`	`0`	`0.075`
60	`64`		B	`8`	`2`	`14057`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`6`	`3`	`14258`	`67.0`	`0.8`	`0.722`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
61	`65`		[SO4]C:3002	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14200`	`64.4`	`-8.3`	`0.825`	`2`	`0`	`0`	`0.059`
62	`66`		[SO4]A:3022	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14143`	`63.9`	`-8.7`	`0.766`	`2`	`0`	`0`	`0.091`
63	`67`		[SO4]F:3025	`4`	`1`	`187`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14123`	`63.3`	`-8.7`	`0.805`	`2`	`0`	`0`	`0.077`
64	`68`		[DIO]E:2001	`4`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14057`	`60.8`	`2.0`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`69`		A	`7`	`4`	`14143`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`10`	`4`	`14123`	`60.4`	`1.5`	`0.856`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`70`		[SO4]E:3009	`4`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13950`	`60.2`	`-7.0`	`0.906`	`2`	`0`	`0`	`0.063`
67	`71`		[SO4]D:3021	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14200`	`57.6`	`-7.9`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
68	`72`		A	`4`	`2`	`14143`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`14057`	`55.2`	`-0.9`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`73`		B	`6`	`3`	`14057`	`◊`	[SO4]D:3016	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`1`	`186`	`51.4`	`-4.5`	`0.953`	`2`	`0`	`0`	`0.041`
70	`74`		[SO4]C:3001	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14200`	`51.3`	`-7.0`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
71	`75`		[SO4]B:3014	`4`	`1`	`187`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`4`	`14258`	`50.7`	`-5.8`	`0.893`	`1`	`0`	`0`	`0.048`
72	`76`		[DIO]F:2003	`5`	`1`	`218`	`f`	[SO4]F:3019	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`48.7`	`-4.8`	`0.063`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
73	`77`		E	`4`	`2`	`13950`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`14123`	`48.7`	`0.3`	`0.599`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
74	`78`		[SO4]B:3014	`4`	`1`	`187`	`◊`	[SO4]D:3016	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`1`	`186`	`46.5`	`-10.5`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
75	`79`		[DIO]C:2009	`4`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14200`	`38.3`	`1.7`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`80`		E	`4`	`2`	`13950`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`14200`	`34.5`	`0.0`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`81`		[MRD]E:4005	`2`	`1`	`273`	`f`	D	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`1`	`1`	`14258`	`29.5`	`0.5`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`82`		[MRD]A:4001	`2`	`1`	`277`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`14200`	`27.8`	`0.4`	`0.181`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`83`		[SO4]B:3026	`2`	`1`	`187`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`4`	`2`	`13950`	`20.5`	`-2.5`	`0.836`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`84`		[SO4]B:3014	`1`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14057`	`19.1`	`-2.1`	`0.766`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
81	`85`		[DIO]E:2001	`2`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14143`	`16.8`	`0.5`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`86`		[DIO]B:2007	`2`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14143`	`15.4`	`0.6`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`87`		A	`1`	`1`	`14143`	`f`	[MRD]C:4003	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`274`	`11.7`	`-0.7`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
84	`88`		[SO4]B:3014	`4`	`1`	`187`	`◊`	[SO4]D:3017	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`1`	`186`	`9.9`	`-1.7`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
85	`89`		[MRD]B:4002	`1`	`1`	`273`	`f`	[DIO]B:2007	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`218`	`7.5`	`0.0`	`0.535`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`90`		[DIO]F:2003	`1`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14143`	`6.9`	`0.3`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`91`		[SO4]C:3015	`1`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`14258`	`5.9`	`-0.7`	`0.702`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
88	`92`		[SO4]C:3005	`1`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`14123`	`4.4`	`-0.5`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
89	`93`		[SO4]E:3013	`1`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14143`	`2.9`	`-0.3`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
90	`94`		[SO4]C:3001	`1`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14123`	`2.9`	`-0.3`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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